MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011080	CG	3	6	77761	77766	0 %	0 %	50 %	50 %	194446768
1502	NC_011080	CTC	2	6	77774	77779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194446768
1503	NC_011080	GCC	2	6	77823	77828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446768
1504	NC_011080	TGA	2	6	77860	77865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446768
1505	NC_011080	CGG	2	6	77876	77881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446768
1506	NC_011080	CCT	2	6	77893	77898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194446768
1507	NC_011080	ACC	2	6	77979	77984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446768
1508	NC_011080	TCGG	2	8	77994	78001	0 %	25 %	50 %	25 %	194446768
1509	NC_011080	CAG	2	6	78027	78032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446768
1510	NC_011080	CGA	2	6	78101	78106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446768
1511	NC_011080	CCG	2	6	78128	78133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446768
1512	NC_011080	CTGG	2	8	78369	78376	0 %	25 %	50 %	25 %	194446768
1513	NC_011080	GCG	2	6	78453	78458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446768
1514	NC_011080	GCGAA	2	10	78508	78517	40 %	0 %	40 %	20 %	194446768
1515	NC_011080	CCGT	2	8	78519	78526	0 %	25 %	25 %	50 %	194446768
1516	NC_011080	CGG	3	9	78551	78559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446768
1517	NC_011080	ACT	2	6	78592	78597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446768
1518	NC_011080	CAT	2	6	78644	78649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446768
1519	NC_011080	CGG	2	6	78782	78787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446768
1520	NC_011080	GC	5	10	78807	78816	0 %	0 %	50 %	50 %	194446768
1521	NC_011080	CG	3	6	78867	78872	0 %	0 %	50 %	50 %	194446768
1522	NC_011080	CTGAAG	2	12	78909	78920	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	194446768
1523	NC_011080	TGG	2	6	78991	78996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446768
1524	NC_011080	CTT	2	6	79003	79008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194446768
1525	NC_011080	CGG	2	6	79075	79080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446768
1526	NC_011080	TGC	2	6	79105	79110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446768
1527	NC_011080	TGA	2	6	79124	79129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446768
1528	NC_011080	GTGGAC	2	12	79140	79151	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	194446768
1529	NC_011080	GGC	2	6	79182	79187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446768
1530	NC_011080	GGCG	2	8	79208	79215	0 %	0 %	75 %	25 %	194446768
1531	NC_011080	CAG	2	6	79287	79292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446768
1532	NC_011080	TGA	2	6	79330	79335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446768
1533	NC_011080	GCG	2	6	79392	79397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446768
1534	NC_011080	CGTAC	2	10	79398	79407	20 %	20 %	20 %	40 %	194446768
1535	NC_011080	GGC	2	6	79448	79453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446768
1536	NC_011080	GC	3	6	79452	79457	0 %	0 %	50 %	50 %	194446768
1537	NC_011080	TAC	2	6	79515	79520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446768
1538	NC_011080	GTG	2	6	79533	79538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446768
1539	NC_011080	CAA	2	6	79547	79552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446768
1540	NC_011080	CCA	2	6	79666	79671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446768
1541	NC_011080	GAA	2	6	79673	79678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194446768
1542	NC_011080	GCT	2	6	79691	79696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446768
1543	NC_011080	TCCG	2	8	79698	79705	0 %	25 %	25 %	50 %	194446768
1544	NC_011080	GTG	2	6	79725	79730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446768
1545	NC_011080	CGC	2	6	79736	79741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446768
1546	NC_011080	GCT	2	6	79745	79750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446768
1547	NC_011080	CCAC	2	8	79774	79781	25 %	0 %	0 %	75 %	194446768
1548	NC_011080	GTC	2	6	79846	79851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446768
1549	NC_011080	TAT	2	6	79892	79897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446768
1550	NC_011080	ACC	2	6	79902	79907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446768
1551	NC_011080	CGC	2	6	79914	79919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446768
1552	NC_011080	CGC	2	6	79944	79949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446768
1553	NC_011080	GC	3	6	79951	79956	0 %	0 %	50 %	50 %	194446768
1554	NC_011080	CGG	2	6	79991	79996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446768
1555	NC_011080	ACG	2	6	80004	80009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446768
1556	NC_011080	TG	3	6	80359	80364	0 %	50 %	50 %	0 %	513538150
1557	NC_011080	GAT	2	6	80408	80413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513538150
1558	NC_011080	TTGT	2	8	80521	80528	0 %	75 %	25 %	0 %	513538150
1559	NC_011080	GAT	2	6	80537	80542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513538150
1560	NC_011080	TGCCAG	2	12	80568	80579	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	513538150
1561	NC_011080	GAAA	2	8	80643	80650	75 %	0 %	25 %	0 %	513538150
1562	NC_011080	C	6	6	80688	80693	0 %	0 %	0 %	100 %	513538150
1563	NC_011080	GAT	2	6	80723	80728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513538150
1564	NC_011080	CGTC	2	8	80854	80861	0 %	25 %	25 %	50 %	194445217
1565	NC_011080	CGGT	2	8	80876	80883	0 %	25 %	50 %	25 %	194445217
1566	NC_011080	TTC	2	6	80885	80890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445217
1567	NC_011080	GTA	2	6	81004	81009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445217
1568	NC_011080	CG	3	6	81010	81015	0 %	0 %	50 %	50 %	194445217
1569	NC_011080	CAG	2	6	81029	81034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445217
1570	NC_011080	TTGCC	2	10	81035	81044	0 %	40 %	20 %	40 %	194445217
1571	NC_011080	GGC	2	6	81077	81082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445217
1572	NC_011080	CT	3	6	81090	81095	0 %	50 %	0 %	50 %	194445217
1573	NC_011080	CGTCC	2	10	81145	81154	0 %	20 %	20 %	60 %	194445217
1574	NC_011080	CAC	2	6	81155	81160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194445217
1575	NC_011080	GGTATC	2	12	81212	81223	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	194445217
1576	NC_011080	AGCC	2	8	81262	81269	25 %	0 %	25 %	50 %	194445217
1577	NC_011080	CAC	2	6	81389	81394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194445217
1578	NC_011080	TCT	2	6	81598	81603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445453
1579	NC_011080	CGC	2	6	81635	81640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445453
1580	NC_011080	CTT	2	6	81659	81664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445453
1581	NC_011080	CG	3	6	81684	81689	0 %	0 %	50 %	50 %	194445453
1582	NC_011080	GTT	2	6	81737	81742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445453
1583	NC_011080	CG	4	8	81752	81759	0 %	0 %	50 %	50 %	194445453
1584	NC_011080	CTT	2	6	81815	81820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445453
1585	NC_011080	GCA	2	6	81872	81877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445453
1586	NC_011080	CGC	3	9	81896	81904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445453
1587	NC_011080	CCG	2	6	81974	81979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445453
1588	NC_011080	CCG	2	6	81997	82002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445453
1589	NC_011080	GCC	2	6	82074	82079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445453
1590	NC_011080	CAGC	2	8	82132	82139	25 %	0 %	25 %	50 %	194445453
1591	NC_011080	CGC	2	6	82157	82162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445453
1592	NC_011080	GGTC	2	8	82261	82268	0 %	25 %	50 %	25 %	194445453
1593	NC_011080	ACTC	2	8	82313	82320	25 %	25 %	0 %	50 %	194445453
1594	NC_011080	T	8	8	82386	82393	0 %	100 %	0 %	0 %	194443937
1595	NC_011080	ATT	2	6	82395	82400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443937
1596	NC_011080	TCA	2	6	82548	82553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443937
1597	NC_011080	ACCA	2	8	82571	82578	50 %	0 %	0 %	50 %	194443937
1598	NC_011080	ATA	2	6	82611	82616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194443937
1599	NC_011080	CGC	2	6	82648	82653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443937
1600	NC_011080	CATCCT	2	12	82696	82707	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	194443937
1601	NC_011080	CGG	2	6	82840	82845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443937
1602	NC_011080	TCG	2	6	82863	82868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443937
1603	NC_011080	CGT	2	6	82917	82922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443937
1604	NC_011080	AAT	2	6	82943	82948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194443937
1605	NC_011080	CAG	2	6	82982	82987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443937
1606	NC_011080	GAT	2	6	83062	83067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443937
1607	NC_011080	GCG	2	6	83085	83090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443937
1608	NC_011080	ATC	2	6	83112	83117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443937
1609	NC_011080	CGG	2	6	83212	83217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443937
1610	NC_011080	GCG	2	6	83232	83237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443937
1611	NC_011080	TCA	2	6	83286	83291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443937
1612	NC_011080	CAC	2	6	83354	83359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443937
1613	NC_011080	GGT	2	6	83375	83380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443937
1614	NC_011080	CCG	2	6	83401	83406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443937
1615	NC_011080	GCT	2	6	83500	83505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443937
1616	NC_011080	CAGA	2	8	83513	83520	50 %	0 %	25 %	25 %	194443937
1617	NC_011080	CAG	2	6	83591	83596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443937
1618	NC_011080	TTC	2	6	83630	83635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443937
1619	NC_011080	A	6	6	83767	83772	100 %	0 %	0 %	0 %	194443937
1620	NC_011080	GTC	2	6	83885	83890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443937
1621	NC_011080	GGC	2	6	84070	84075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442451
1622	NC_011080	GTT	2	6	84121	84126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194442451
1623	NC_011080	ATG	2	6	84140	84145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442451
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1625	NC_011080	GT	4	8	84299	84306	0 %	50 %	50 %	0 %	194442451
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1875	NC_011080	GAC	2	6	98676	98681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446537
1876	NC_011080	CAGGCG	2	12	98688	98699	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	194446537
1877	NC_011080	TGGCA	2	10	98722	98731	20 %	20 %	40 %	20 %	194446537
1878	NC_011080	ATCT	2	8	98773	98780	25 %	50 %	0 %	25 %	194446332
1879	NC_011080	CGG	2	6	98786	98791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446332
1880	NC_011080	CGT	2	6	98928	98933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446332
1881	NC_011080	TGT	2	6	98939	98944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446332
1882	NC_011080	GC	3	6	98988	98993	0 %	0 %	50 %	50 %	194446332
1883	NC_011080	GGC	3	9	99004	99012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446332
1884	NC_011080	TGG	2	6	99023	99028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446332
1885	NC_011080	GCG	2	6	99032	99037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446332
1886	NC_011080	TCTGT	2	10	99048	99057	0 %	60 %	20 %	20 %	194446332
1887	NC_011080	AATG	2	8	99141	99148	50 %	25 %	25 %	0 %	194446332
1888	NC_011080	TGG	2	6	99227	99232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446332
1889	NC_011080	GAT	2	6	99234	99239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446332
1890	NC_011080	CTG	2	6	99244	99249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446332
1891	NC_011080	GCC	2	6	99250	99255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446332
1892	NC_011080	GCG	2	6	99257	99262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446332
1893	NC_011080	CCA	2	6	99266	99271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446332
1894	NC_011080	TGG	2	6	99323	99328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446332
1895	NC_011080	TGC	2	6	99329	99334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446332
1896	NC_011080	GCGCT	2	10	99358	99367	0 %	20 %	40 %	40 %	194446332
1897	NC_011080	CG	3	6	99372	99377	0 %	0 %	50 %	50 %	194446332
1898	NC_011080	GGCG	2	8	99483	99490	0 %	0 %	75 %	25 %	194446332
1899	NC_011080	CTG	2	6	99493	99498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446332
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1902	NC_011080	TGG	2	6	99608	99613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446332
1903	NC_011080	CTG	2	6	99631	99636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446332
1904	NC_011080	TTG	2	6	99637	99642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446332
1905	NC_011080	TTA	2	6	99733	99738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446332
1906	NC_011080	GGCGC	2	10	99772	99781	0 %	0 %	60 %	40 %	194446332
1907	NC_011080	GGC	2	6	99846	99851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446332
1908	NC_011080	TGC	2	6	99869	99874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446332
1909	NC_011080	GC	3	6	99907	99912	0 %	0 %	50 %	50 %	194446332
1910	NC_011080	CGA	2	6	99927	99932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446332
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1914	NC_011080	GCGAC	2	10	100085	100094	20 %	0 %	40 %	40 %	194446332
1915	NC_011080	GCG	2	6	100123	100128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446332
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1921	NC_011080	TGG	2	6	100403	100408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446332
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1932	NC_011080	GCG	2	6	101057	101062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445577
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1957	NC_011080	AC	3	6	103119	103124	50 %	0 %	0 %	50 %	194446536
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1959	NC_011080	CTG	2	6	103180	103185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446536
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1985	NC_011080	TCA	2	6	104515	104520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444526
1986	NC_011080	GC	3	6	104620	104625	0 %	0 %	50 %	50 %	194444526
1987	NC_011080	CCCAA	2	10	104692	104701	40 %	0 %	0 %	60 %	194444526
1988	NC_011080	CGC	2	6	104747	104752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444526
1989	NC_011080	GGT	2	6	104762	104767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444526
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1991	NC_011080	GC	3	6	104810	104815	0 %	0 %	50 %	50 %	194444526
1992	NC_011080	CTG	2	6	104816	104821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444526
1993	NC_011080	TTC	2	6	104967	104972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444526
1994	NC_011080	CTG	2	6	105050	105055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444526
1995	NC_011080	CTT	2	6	105106	105111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444526
1996	NC_011080	CAA	2	6	105112	105117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194444526
1997	NC_011080	CGT	2	6	105139	105144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444526
1998	NC_011080	CTT	2	6	105253	105258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444526
1999	NC_011080	CGA	2	6	105279	105284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444526
2000	NC_011080	TTG	2	6	105291	105296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444526

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