MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011080	CAG	3	9	51627	51635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445592
1002	NC_011080	CAG	2	6	51714	51719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445592
1003	NC_011080	GTA	2	6	51758	51763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445592
1004	NC_011080	ATG	2	6	51770	51775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445592
1005	NC_011080	AAC	2	6	51853	51858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194445592
1006	NC_011080	TTG	2	6	52281	52286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444108
1007	NC_011080	AGC	2	6	52346	52351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444108
1008	NC_011080	GCA	2	6	52395	52400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444108
1009	NC_011080	TGA	2	6	52438	52443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444108
1010	NC_011080	CAT	2	6	52451	52456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444108
1011	NC_011080	GC	3	6	52503	52508	0 %	0 %	50 %	50 %	194444108
1012	NC_011080	GCG	2	6	52728	52733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444305
1013	NC_011080	TCT	2	6	52773	52778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444305
1014	NC_011080	TCA	2	6	52786	52791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444305
1015	NC_011080	TTAACC	2	12	52805	52816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444305
1016	NC_011080	CATA	2	8	52880	52887	50 %	25 %	0 %	25 %	194442807
1017	NC_011080	TCAG	2	8	52891	52898	25 %	25 %	25 %	25 %	194442807
1018	NC_011080	GT	3	6	52910	52915	0 %	50 %	50 %	0 %	194442807
1019	NC_011080	GAA	2	6	52980	52985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194442807
1020	NC_011080	GGT	3	9	53006	53014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442807
1021	NC_011080	GCG	2	6	53113	53118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442807
1022	NC_011080	TGTGC	2	10	53126	53135	0 %	40 %	40 %	20 %	194442807
1023	NC_011080	CGC	2	6	53148	53153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442807
1024	NC_011080	CTG	2	6	53190	53195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442807
1025	NC_011080	GAT	2	6	53232	53237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442807
1026	NC_011080	CG	3	6	53256	53261	0 %	0 %	50 %	50 %	194442807
1027	NC_011080	TTA	2	6	53274	53279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194442807
1028	NC_011080	GGC	2	6	53337	53342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442807
1029	NC_011080	AGT	2	6	53352	53357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442807
1030	NC_011080	CTG	2	6	53409	53414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442807
1031	NC_011080	CGA	2	6	53453	53458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442807
1032	NC_011080	TGGC	2	8	53605	53612	0 %	25 %	50 %	25 %	194442807
1033	NC_011080	CAA	2	6	53619	53624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194442807
1034	NC_011080	CTG	2	6	53637	53642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442807
1035	NC_011080	AGC	2	6	53707	53712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442807
1036	NC_011080	TGA	2	6	53726	53731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442807
1037	NC_011080	T	6	6	53775	53780	0 %	100 %	0 %	0 %	194442807
1038	NC_011080	TGA	2	6	53844	53849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442276
1039	NC_011080	GCG	2	6	53898	53903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442276
1040	NC_011080	GAT	3	9	53945	53953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442276
1041	NC_011080	CAT	2	6	53962	53967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442276
1042	NC_011080	A	6	6	53978	53983	100 %	0 %	0 %	0 %	194442276
1043	NC_011080	A	7	7	53987	53993	100 %	0 %	0 %	0 %	194442276
1044	NC_011080	ATG	2	6	54006	54011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442276
1045	NC_011080	GCA	2	6	54030	54035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442276
1046	NC_011080	CAT	2	6	54337	54342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442276
1047	NC_011080	CG	3	6	54344	54349	0 %	0 %	50 %	50 %	194442276
1048	NC_011080	GCGGAA	2	12	54431	54442	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	194442276
1049	NC_011080	CTG	2	6	54752	54757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442276
1050	NC_011080	CTG	2	6	55001	55006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442276
1051	NC_011080	GC	3	6	55017	55022	0 %	0 %	50 %	50 %	194442276
1052	NC_011080	A	6	6	55035	55040	100 %	0 %	0 %	0 %	194442276
1053	NC_011080	GCA	2	6	55042	55047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442276
1054	NC_011080	CG	3	6	55091	55096	0 %	0 %	50 %	50 %	194442276
1055	NC_011080	AAG	2	6	55125	55130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194442276
1056	NC_011080	GCT	2	6	55297	55302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442276
1057	NC_011080	GGC	2	6	55321	55326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442276
1058	NC_011080	GTG	2	6	55372	55377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442276
1059	NC_011080	GTTTG	2	10	55448	55457	0 %	60 %	40 %	0 %	194442276
1060	NC_011080	CCA	2	6	55467	55472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442276
1061	NC_011080	TCC	2	6	55565	55570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194442276
1062	NC_011080	TGA	2	6	55572	55577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442276
1063	NC_011080	CGC	2	6	55686	55691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442276
1064	NC_011080	TGA	2	6	55698	55703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442276
1065	NC_011080	TCG	2	6	55807	55812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442276
1066	NC_011080	CG	3	6	55825	55830	0 %	0 %	50 %	50 %	194442276
1067	NC_011080	CTG	2	6	55835	55840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442276
1068	NC_011080	TGG	2	6	55893	55898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442276
1069	NC_011080	GCA	2	6	55936	55941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442276
1070	NC_011080	CAT	2	6	56038	56043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442276
1071	NC_011080	CG	3	6	56080	56085	0 %	0 %	50 %	50 %	194442276
1072	NC_011080	TGA	2	6	56164	56169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442276
1073	NC_011080	ACG	2	6	56226	56231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442276
1074	NC_011080	GTT	2	6	56233	56238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194442276
1075	NC_011080	GAA	2	6	56255	56260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194442276
1076	NC_011080	CAA	2	6	56308	56313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194442276
1077	NC_011080	AAG	2	6	56405	56410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194442276
1078	NC_011080	G	6	6	56479	56484	0 %	0 %	100 %	0 %	194442276
1079	NC_011080	TGA	3	9	56488	56496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442276
1080	NC_011080	GCT	2	6	56571	56576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442276
1081	NC_011080	CACTA	2	10	56579	56588	40 %	20 %	0 %	40 %	194442276
1082	NC_011080	AAC	2	6	56661	56666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194442276
1083	NC_011080	TGA	2	6	56678	56683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442276
1084	NC_011080	GTA	2	6	56725	56730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446803
1085	NC_011080	GCA	2	6	56753	56758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446803
1086	NC_011080	TCC	2	6	56768	56773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194446803
1087	NC_011080	GCG	2	6	56870	56875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446803
1088	NC_011080	TGA	2	6	56933	56938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446803
1089	NC_011080	ATC	2	6	56989	56994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446803
1090	NC_011080	GGC	2	6	56995	57000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446803
1091	NC_011080	GC	3	6	56999	57004	0 %	0 %	50 %	50 %	194446803
1092	NC_011080	TGT	2	6	57039	57044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446803
1093	NC_011080	CGGCG	2	10	57117	57126	0 %	0 %	60 %	40 %	194446803
1094	NC_011080	TTCAC	2	10	57372	57381	20 %	40 %	0 %	40 %	194446160
1095	NC_011080	GAT	2	6	57392	57397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446160
1096	NC_011080	CGG	2	6	57405	57410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446160
1097	NC_011080	AGCC	2	8	57432	57439	25 %	0 %	25 %	50 %	194446160
1098	NC_011080	AGC	3	9	57480	57488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446160
1099	NC_011080	AAG	2	6	57501	57506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194446160
1100	NC_011080	AAAG	2	8	57511	57518	75 %	0 %	25 %	0 %	194446160
1101	NC_011080	CGC	2	6	57538	57543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446160
1102	NC_011080	GGC	2	6	57598	57603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446160
1103	NC_011080	ATGG	2	8	57644	57651	25 %	25 %	50 %	0 %	194446160
1104	NC_011080	TTG	2	6	57848	57853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443769
1105	NC_011080	GC	3	6	57875	57880	0 %	0 %	50 %	50 %	194443769
1106	NC_011080	TCT	2	6	57995	58000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443769
1107	NC_011080	GC	4	8	58105	58112	0 %	0 %	50 %	50 %	194443769
1108	NC_011080	GAA	2	6	58126	58131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443769
1109	NC_011080	G	6	6	58201	58206	0 %	0 %	100 %	0 %	194443769
1110	NC_011080	TGG	2	6	58214	58219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443769
1111	NC_011080	TGAT	2	8	58316	58323	25 %	50 %	25 %	0 %	194443769
1112	NC_011080	TCG	2	6	58349	58354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443769
1113	NC_011080	ACT	2	6	58384	58389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443769
1114	NC_011080	GTG	2	6	58432	58437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443769
1115	NC_011080	TGG	2	6	58439	58444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443769
1116	NC_011080	TCTAAC	2	12	58462	58473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443769
1117	NC_011080	GAA	2	6	58502	58507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443769
1118	NC_011080	CGA	2	6	58521	58526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443769
1119	NC_011080	GCG	2	6	58528	58533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443769
1120	NC_011080	AGG	2	6	58541	58546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194443769
1121	NC_011080	GCC	2	6	58561	58566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443769
1122	NC_011080	CTG	2	6	58580	58585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443769
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1124	NC_011080	GAA	2	6	58675	58680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443769
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1498	NC_011080	CAT	2	6	77540	77545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446768
1499	NC_011080	CGATG	2	10	77567	77576	20 %	20 %	40 %	20 %	194446768
1500	NC_011080	CGG	2	6	77693	77698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446768

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