MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011080	TATTT	2	10	25427	25436	20 %	80 %	0 %	0 %	194443678
502	NC_011080	AAAT	2	8	25467	25474	75 %	25 %	0 %	0 %	194443678
503	NC_011080	TATT	2	8	25520	25527	25 %	75 %	0 %	0 %	194443678
504	NC_011080	TAC	2	6	25624	25629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443678
505	NC_011080	A	6	6	25660	25665	100 %	0 %	0 %	0 %	194443678
506	NC_011080	CCG	2	6	25684	25689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443678
507	NC_011080	ACG	2	6	25759	25764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443678
508	NC_011080	ATG	2	6	25788	25793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443678
509	NC_011080	TCTG	2	8	25924	25931	0 %	50 %	25 %	25 %	194446095
510	NC_011080	GGC	2	6	25981	25986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446095
511	NC_011080	ACG	2	6	26063	26068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446095
512	NC_011080	GC	3	6	26076	26081	0 %	0 %	50 %	50 %	194446095
513	NC_011080	GCCT	2	8	26105	26112	0 %	25 %	25 %	50 %	194446095
514	NC_011080	GGC	3	9	26173	26181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446095
515	NC_011080	GCC	2	6	26216	26221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446095
516	NC_011080	GCA	2	6	26242	26247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446095
517	NC_011080	GGC	2	6	26272	26277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446095
518	NC_011080	GGC	2	6	26390	26395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446095
519	NC_011080	ACT	2	6	26463	26468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446095
520	NC_011080	GCG	2	6	26487	26492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446095
521	NC_011080	AGCGAC	2	12	26501	26512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446095
522	NC_011080	GCA	2	6	26515	26520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446095
523	NC_011080	ATT	2	6	26599	26604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446095
524	NC_011080	CCTT	2	8	26611	26618	0 %	50 %	0 %	50 %	194446095
525	NC_011080	GAC	2	6	26642	26647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446095
526	NC_011080	CAT	2	6	26740	26745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446095
527	NC_011080	GCC	2	6	26761	26766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446095
528	NC_011080	CCG	2	6	26799	26804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446095
529	NC_011080	GCG	2	6	26808	26813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446095
530	NC_011080	CCG	2	6	26874	26879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446095
531	NC_011080	GGC	2	6	26901	26906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446095
532	NC_011080	GCG	2	6	26915	26920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446095
533	NC_011080	AGT	2	6	26945	26950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446095
534	NC_011080	TCAG	2	8	26970	26977	25 %	25 %	25 %	25 %	194446095
535	NC_011080	GCG	2	6	27066	27071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446095
536	NC_011080	ATA	2	6	27135	27140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194446095
537	NC_011080	GAT	2	6	27254	27259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446095
538	NC_011080	ATT	2	6	27336	27341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446095
539	NC_011080	TAT	2	6	27350	27355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446095
540	NC_011080	AGG	2	6	27359	27364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194446095
541	NC_011080	TTA	2	6	27417	27422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446095
542	NC_011080	TGA	2	6	27451	27456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446095
543	NC_011080	TTG	2	6	27467	27472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446095
544	NC_011080	ACA	2	6	27522	27527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446095
545	NC_011080	GAT	2	6	27611	27616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446095
546	NC_011080	CTG	2	6	27710	27715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446095
547	NC_011080	ACA	2	6	27735	27740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446095
548	NC_011080	GCG	2	6	27777	27782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446095
549	NC_011080	CAG	2	6	27857	27862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446095
550	NC_011080	GCG	2	6	27879	27884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446095
551	NC_011080	TGG	2	6	27888	27893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446095
552	NC_011080	AGCC	2	8	27917	27924	25 %	0 %	25 %	50 %	194446095
553	NC_011080	CG	3	6	28006	28011	0 %	0 %	50 %	50 %	194446095
554	NC_011080	GGT	2	6	28021	28026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446095
555	NC_011080	ACA	2	6	28037	28042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446095
556	NC_011080	TGA	2	6	28084	28089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446095
557	NC_011080	TGA	2	6	28099	28104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446095
558	NC_011080	CCGA	2	8	28124	28131	25 %	0 %	25 %	50 %	194446095
559	NC_011080	GC	3	6	28134	28139	0 %	0 %	50 %	50 %	194446095
560	NC_011080	GC	3	6	28170	28175	0 %	0 %	50 %	50 %	194446095
561	NC_011080	ACGGTG	2	12	28226	28237	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	194446095
562	NC_011080	TTG	2	6	28260	28265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446095
563	NC_011080	GCGTC	2	10	28350	28359	0 %	20 %	40 %	40 %	194446095
564	NC_011080	ATC	2	6	28362	28367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446095
565	NC_011080	TC	3	6	28366	28371	0 %	50 %	0 %	50 %	194446095
566	NC_011080	TCC	2	6	28373	28378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194446095
567	NC_011080	ACA	2	6	28396	28401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446095
568	NC_011080	CTG	2	6	28442	28447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446333
569	NC_011080	GT	3	6	28484	28489	0 %	50 %	50 %	0 %	194446333
570	NC_011080	ATTA	2	8	28517	28524	50 %	50 %	0 %	0 %	194446333
571	NC_011080	A	6	6	28584	28589	100 %	0 %	0 %	0 %	194446333
572	NC_011080	GT	3	6	28613	28618	0 %	50 %	50 %	0 %	194446333
573	NC_011080	CCG	2	6	28620	28625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446333
574	NC_011080	TTC	2	6	28753	28758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194446333
575	NC_011080	GGCG	2	8	28759	28766	0 %	0 %	75 %	25 %	194446333
576	NC_011080	ATG	2	6	28803	28808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446333
577	NC_011080	TCG	2	6	28884	28889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446333
578	NC_011080	CCG	2	6	28938	28943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446333
579	NC_011080	A	6	6	29111	29116	100 %	0 %	0 %	0 %	194446333
580	NC_011080	ATG	2	6	29277	29282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446333
581	NC_011080	ACA	2	6	29357	29362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446333
582	NC_011080	GAC	2	6	29495	29500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444519
583	NC_011080	AAC	2	6	29623	29628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194444519
584	NC_011080	ATG	2	6	29805	29810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444519
585	NC_011080	AAT	2	6	29831	29836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444519
586	NC_011080	GGT	2	6	29845	29850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444519
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591	NC_011080	CT	3	6	30098	30103	0 %	50 %	0 %	50 %	194445269
592	NC_011080	GCA	2	6	30216	30221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445269
593	NC_011080	GCG	2	6	30228	30233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445269
594	NC_011080	GCG	2	6	30254	30259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445269
595	NC_011080	AG	3	6	30367	30372	50 %	0 %	50 %	0 %	194445269
596	NC_011080	CG	3	6	30424	30429	0 %	0 %	50 %	50 %	194445269
597	NC_011080	GGC	2	6	30443	30448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445269
598	NC_011080	AT	3	6	30525	30530	50 %	50 %	0 %	0 %	194444078
599	NC_011080	TGCT	2	8	30534	30541	0 %	50 %	25 %	25 %	194444078
600	NC_011080	TATC	2	8	30590	30597	25 %	50 %	0 %	25 %	194444078
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602	NC_011080	CGC	2	6	30733	30738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444078
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604	NC_011080	GC	3	6	30756	30761	0 %	0 %	50 %	50 %	194444078
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608	NC_011080	CGC	2	6	30839	30844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444078
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610	NC_011080	GCA	2	6	30941	30946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444078
611	NC_011080	ATCTG	2	10	30958	30967	20 %	40 %	20 %	20 %	194444078
612	NC_011080	TTACG	2	10	31013	31022	20 %	40 %	20 %	20 %	194444078
613	NC_011080	TTA	2	6	31029	31034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444078
614	NC_011080	GC	3	6	31046	31051	0 %	0 %	50 %	50 %	194444078
615	NC_011080	TAT	2	6	31263	31268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444351
616	NC_011080	TAT	2	6	31270	31275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444351
617	NC_011080	GTTGGC	2	12	31305	31316	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	194444351
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619	NC_011080	CGG	2	6	31382	31387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444351
620	NC_011080	GTCA	2	8	31399	31406	25 %	25 %	25 %	25 %	194444351
621	NC_011080	CGC	2	6	31467	31472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444351
622	NC_011080	CAG	2	6	31495	31500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444351
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626	NC_011080	GTG	2	6	31603	31608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444351
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628	NC_011080	T	6	6	31715	31720	0 %	100 %	0 %	0 %	194444351
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