MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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88502	NC_011080	GGT	2	6	4808459	4808464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444102
88503	NC_011080	TGG	2	6	4808465	4808470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444102
88504	NC_011080	TCG	2	6	4808473	4808478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444102
88505	NC_011080	AGC	3	9	4808479	4808487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444102
88506	NC_011080	CGG	2	6	4808527	4808532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444102
88507	NC_011080	CGC	2	6	4808537	4808542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444102
88508	NC_011080	CAG	2	6	4808591	4808596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444102
88509	NC_011080	CGT	2	6	4808627	4808632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444102
88510	NC_011080	GT	3	6	4808782	4808787	0 %	50 %	50 %	0 %	194444102
88511	NC_011080	GC	3	6	4808844	4808849	0 %	0 %	50 %	50 %	194444102
88512	NC_011080	ATG	2	6	4808881	4808886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444102
88513	NC_011080	GCA	2	6	4808888	4808893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444102
88514	NC_011080	GAA	2	6	4808946	4808951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444102
88515	NC_011080	CGG	2	6	4808985	4808990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444102
88516	NC_011080	TCG	2	6	4809275	4809280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443158
88517	NC_011080	CTG	2	6	4809295	4809300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443158
88518	NC_011080	CG	3	6	4809315	4809320	0 %	0 %	50 %	50 %	194443158
88519	NC_011080	AGC	2	6	4809338	4809343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443158
88520	NC_011080	GATG	2	8	4809387	4809394	25 %	25 %	50 %	0 %	194443158
88521	NC_011080	GAT	2	6	4809405	4809410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443158
88522	NC_011080	CGA	2	6	4809465	4809470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443158
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88524	NC_011080	GC	3	6	4809510	4809515	0 %	0 %	50 %	50 %	194443158
88525	NC_011080	CGT	2	6	4809574	4809579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443158
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88532	NC_011080	CGCC	2	8	4809999	4810006	0 %	0 %	25 %	75 %	194443158
88533	NC_011080	TGA	2	6	4810028	4810033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443158
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88537	NC_011080	GTA	2	6	4810556	4810561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443158
88538	NC_011080	GC	3	6	4810582	4810587	0 %	0 %	50 %	50 %	194443158
88539	NC_011080	TGG	2	6	4810606	4810611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443158
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88550	NC_011080	GCA	2	6	4811166	4811171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443158
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88552	NC_011080	ATCTGC	2	12	4811336	4811347	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	194444790
88553	NC_011080	TTA	2	6	4811350	4811355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444790
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88555	NC_011080	ATT	2	6	4811407	4811412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444790
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88581	NC_011080	TGGG	2	8	4812806	4812813	0 %	25 %	75 %	0 %	194445147
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88600	NC_011080	ACGTG	2	10	4814110	4814119	20 %	20 %	40 %	20 %	194443788
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88605	NC_011080	A	6	6	4814271	4814276	100 %	0 %	0 %	0 %	194443788
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.