MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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61502	NC_011080	CAT	2	6	3346664	3346669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445763
61503	NC_011080	CCTTT	2	10	3346731	3346740	0 %	60 %	0 %	40 %	194445763
61504	NC_011080	CAG	2	6	3346844	3346849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445763
61505	NC_011080	CAG	2	6	3346868	3346873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445763
61506	NC_011080	ATGT	2	8	3346927	3346934	25 %	50 %	25 %	0 %	194445763
61507	NC_011080	CTG	3	9	3346958	3346966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445763
61508	NC_011080	TGA	2	6	3346968	3346973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445763
61509	NC_011080	GCG	2	6	3346974	3346979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445763
61510	NC_011080	CCA	2	6	3347217	3347222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446703
61511	NC_011080	ACC	2	6	3347237	3347242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446703
61512	NC_011080	GC	5	10	3347280	3347289	0 %	0 %	50 %	50 %	194446703
61513	NC_011080	TCG	2	6	3347300	3347305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446703
61514	NC_011080	TCA	2	6	3347352	3347357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446703
61515	NC_011080	CCG	2	6	3347381	3347386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446703
61516	NC_011080	CG	3	6	3347385	3347390	0 %	0 %	50 %	50 %	194446703
61517	NC_011080	CGC	2	6	3347397	3347402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446703
61518	NC_011080	GC	3	6	3347411	3347416	0 %	0 %	50 %	50 %	194446703
61519	NC_011080	CGCA	2	8	3347476	3347483	25 %	0 %	25 %	50 %	194446703
61520	NC_011080	GCG	2	6	3347501	3347506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446703
61521	NC_011080	GGT	2	6	3347515	3347520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446703
61522	NC_011080	GTT	2	6	3347575	3347580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446703
61523	NC_011080	CCA	2	6	3347583	3347588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446703
61524	NC_011080	GCT	2	6	3347604	3347609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446703
61525	NC_011080	ACG	2	6	3347611	3347616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446703
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61528	NC_011080	A	7	7	3348362	3348368	100 %	0 %	0 %	0 %	194443406
61529	NC_011080	TGC	2	6	3348447	3348452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443406
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61534	NC_011080	CTG	2	6	3348681	3348686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443024
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61536	NC_011080	GC	3	6	3348798	3348803	0 %	0 %	50 %	50 %	194443024
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61542	NC_011080	CTTT	2	8	3349210	3349217	0 %	75 %	0 %	25 %	194445581
61543	NC_011080	GC	3	6	3349221	3349226	0 %	0 %	50 %	50 %	194445581
61544	NC_011080	GTC	2	6	3349319	3349324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445581
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61549	NC_011080	CTG	2	6	3349625	3349630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445581
61550	NC_011080	A	6	6	3349655	3349660	100 %	0 %	0 %	0 %	194445581
61551	NC_011080	GAT	2	6	3349754	3349759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444047
61552	NC_011080	CAT	2	6	3349776	3349781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444047
61553	NC_011080	CGC	2	6	3349850	3349855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444047
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61555	NC_011080	GCG	3	9	3349914	3349922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444047
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61963	NC_011080	AG	3	6	3370719	3370724	50 %	0 %	50 %	0 %	194443550
61964	NC_011080	CGC	2	6	3370788	3370793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443550
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61966	NC_011080	TTC	2	6	3370818	3370823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443550
61967	NC_011080	CGC	2	6	3370830	3370835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443550
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61974	NC_011080	TCA	2	6	3371249	3371254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443550
61975	NC_011080	GC	3	6	3371331	3371336	0 %	0 %	50 %	50 %	194443550
61976	NC_011080	GCT	2	6	3371486	3371491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443550
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61991	NC_011080	CGC	2	6	3372474	3372479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443923
61992	NC_011080	CCG	2	6	3372485	3372490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443923
61993	NC_011080	GTG	2	6	3372538	3372543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443923
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61999	NC_011080	CAAGC	2	10	3372852	3372861	40 %	0 %	20 %	40 %	194443923
62000	NC_011080	AAC	2	6	3373063	3373068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194443923

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