MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011080	CGG	2	6	284144	284149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446048
5502	NC_011080	TAT	2	6	284188	284193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446048
5503	NC_011080	CG	3	6	284194	284199	0 %	0 %	50 %	50 %	194446048
5504	NC_011080	GTAT	3	12	284315	284326	25 %	50 %	25 %	0 %	194446048
5505	NC_011080	GCG	2	6	284338	284343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446048
5506	NC_011080	GGC	2	6	284415	284420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446048
5507	NC_011080	TGC	2	6	284444	284449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446048
5508	NC_011080	CACT	2	8	284556	284563	25 %	25 %	0 %	50 %	194446048
5509	NC_011080	TCG	2	6	284730	284735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443070
5510	NC_011080	GTC	2	6	284825	284830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443070
5511	NC_011080	GC	4	8	284851	284858	0 %	0 %	50 %	50 %	194443070
5512	NC_011080	AGC	2	6	285028	285033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443070
5513	NC_011080	CAA	2	6	285205	285210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194443070
5514	NC_011080	AGT	2	6	285247	285252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443070
5515	NC_011080	GGC	2	6	285293	285298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443070
5516	NC_011080	CGAT	2	8	285306	285313	25 %	25 %	25 %	25 %	194443070
5517	NC_011080	TCT	2	6	285381	285386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443070
5518	NC_011080	TTCA	2	8	285440	285447	25 %	50 %	0 %	25 %	194443070
5519	NC_011080	CGC	2	6	285457	285462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443070
5520	NC_011080	CAG	2	6	285467	285472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443070
5521	NC_011080	CCA	2	6	285475	285480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443070
5522	NC_011080	CAG	2	6	285512	285517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443070
5523	NC_011080	T	6	6	285529	285534	0 %	100 %	0 %	0 %	194443070
5524	NC_011080	CCA	2	6	285556	285561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443070
5525	NC_011080	CGC	2	6	285614	285619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443070
5526	NC_011080	GC	3	6	285621	285626	0 %	0 %	50 %	50 %	194443070
5527	NC_011080	GCG	2	6	285634	285639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443070
5528	NC_011080	CGC	2	6	285706	285711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443070
5529	NC_011080	GCC	2	6	285746	285751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443070
5530	NC_011080	CG	3	6	285776	285781	0 %	0 %	50 %	50 %	194443070
5531	NC_011080	TCA	2	6	285886	285891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443070
5532	NC_011080	CG	3	6	285898	285903	0 %	0 %	50 %	50 %	194443070
5533	NC_011080	TCA	2	6	285933	285938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443070
5534	NC_011080	GAA	2	6	285959	285964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443070
5535	NC_011080	CTT	2	6	286021	286026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443070
5536	NC_011080	GCA	2	6	286075	286080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443070
5537	NC_011080	CT	3	6	286110	286115	0 %	50 %	0 %	50 %	194443070
5538	NC_011080	GGCT	2	8	286127	286134	0 %	25 %	50 %	25 %	194443070
5539	NC_011080	GTT	2	6	286169	286174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443070
5540	NC_011080	CACG	2	8	286183	286190	25 %	0 %	25 %	50 %	194443070
5541	NC_011080	T	6	6	286202	286207	0 %	100 %	0 %	0 %	194443070
5542	NC_011080	TA	3	6	286237	286242	50 %	50 %	0 %	0 %	194443070
5543	NC_011080	ATC	2	6	286263	286268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443070
5544	NC_011080	GC	3	6	286272	286277	0 %	0 %	50 %	50 %	194443070
5545	NC_011080	TGG	2	6	286287	286292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443070
5546	NC_011080	TGT	2	6	286357	286362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443070
5547	NC_011080	AAAT	2	8	286614	286621	75 %	25 %	0 %	0 %	194443910
5548	NC_011080	CGT	2	6	286651	286656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443910
5549	NC_011080	GGC	3	9	286726	286734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443910
5550	NC_011080	CCA	2	6	286776	286781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443910
5551	NC_011080	CCA	2	6	286794	286799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443910
5552	NC_011080	CT	3	6	286829	286834	0 %	50 %	0 %	50 %	194443910
5553	NC_011080	GCC	2	6	286959	286964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443910
5554	NC_011080	GCC	2	6	286966	286971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443910
5555	NC_011080	TGA	2	6	286982	286987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443910
5556	NC_011080	CGC	2	6	287073	287078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443910
5557	NC_011080	GACCA	2	10	287089	287098	40 %	0 %	20 %	40 %	194443910
5558	NC_011080	GCT	2	6	287167	287172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443910
5559	NC_011080	AGC	2	6	287222	287227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444394
5560	NC_011080	GCA	2	6	287258	287263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444394
5561	NC_011080	GC	3	6	287310	287315	0 %	0 %	50 %	50 %	194444394
5562	NC_011080	CGC	2	6	287363	287368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444394
5563	NC_011080	AAC	2	6	287528	287533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194444394
5564	NC_011080	ATA	2	6	287575	287580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444394
5565	NC_011080	CGC	2	6	287712	287717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444076
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5568	NC_011080	CTGG	2	8	287887	287894	0 %	25 %	50 %	25 %	194444076
5569	NC_011080	TGA	2	6	287907	287912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444076
5570	NC_011080	GCG	2	6	287955	287960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444076
5571	NC_011080	CAA	2	6	287970	287975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194444076
5572	NC_011080	CGA	2	6	287997	288002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444076
5573	NC_011080	GCA	3	9	288063	288071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444076
5574	NC_011080	GGTCG	2	10	288091	288100	0 %	20 %	60 %	20 %	194444076
5575	NC_011080	GATTT	2	10	288143	288152	20 %	60 %	20 %	0 %	194444076
5576	NC_011080	T	7	7	288150	288156	0 %	100 %	0 %	0 %	194444076
5577	NC_011080	TTTC	2	8	288345	288352	0 %	75 %	0 %	25 %	194444076
5578	NC_011080	TGC	2	6	288380	288385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444076
5579	NC_011080	TTTGAA	2	12	288493	288504	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	194444076
5580	NC_011080	TAAA	2	8	288597	288604	75 %	25 %	0 %	0 %	194444542
5581	NC_011080	TCA	2	6	288635	288640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444542
5582	NC_011080	GCC	2	6	288690	288695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444542
5583	NC_011080	GCC	2	6	288708	288713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444542
5584	NC_011080	ACCAG	2	10	288763	288772	40 %	0 %	20 %	40 %	194444542
5585	NC_011080	GCG	2	6	288812	288817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444542
5586	NC_011080	TCGC	2	8	288827	288834	0 %	25 %	25 %	50 %	194444542
5587	NC_011080	AAC	2	6	288865	288870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194444542
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5589	NC_011080	GGCGC	2	10	288898	288907	0 %	0 %	60 %	40 %	194444542
5590	NC_011080	ATT	2	6	288958	288963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444542
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5592	NC_011080	CAG	2	6	288987	288992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444542
5593	NC_011080	GAT	2	6	288993	288998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444542
5594	NC_011080	ACC	2	6	289024	289029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444542
5595	NC_011080	AG	3	6	289032	289037	50 %	0 %	50 %	0 %	194444542
5596	NC_011080	GAA	2	6	289125	289130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444542
5597	NC_011080	CAT	2	6	289185	289190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444542
5598	NC_011080	TCT	2	6	289262	289267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445458
5599	NC_011080	TG	3	6	289268	289273	0 %	50 %	50 %	0 %	194445458
5600	NC_011080	CCGC	2	8	289310	289317	0 %	0 %	25 %	75 %	194445458
5601	NC_011080	GC	3	6	289329	289334	0 %	0 %	50 %	50 %	194445458
5602	NC_011080	ATA	2	6	289337	289342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194445458
5603	NC_011080	ACG	2	6	289360	289365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445458
5604	NC_011080	CG	3	6	289364	289369	0 %	0 %	50 %	50 %	194445458
5605	NC_011080	AGC	2	6	289379	289384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445458
5606	NC_011080	GCA	2	6	289419	289424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445458
5607	NC_011080	GCG	2	6	289521	289526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445458
5608	NC_011080	GAC	2	6	289659	289664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445458
5609	NC_011080	GTC	2	6	289700	289705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445458
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5611	NC_011080	TGG	2	6	289722	289727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445458
5612	NC_011080	CG	3	6	289765	289770	0 %	0 %	50 %	50 %	194445458
5613	NC_011080	CCG	2	6	289796	289801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445458
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5621	NC_011080	A	8	8	290541	290548	100 %	0 %	0 %	0 %	194446119
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5745	NC_011080	TCG	2	6	303065	303070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448967499
5746	NC_011080	CGT	2	6	303114	303119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448967499
5747	NC_011080	CCAT	2	8	303120	303127	25 %	25 %	0 %	50 %	448967499
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5985	NC_011080	GC	3	6	314936	314941	0 %	0 %	50 %	50 %	194445862
5986	NC_011080	GGCCG	2	10	315021	315030	0 %	0 %	60 %	40 %	194445862
5987	NC_011080	CTGGCG	2	12	315058	315069	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	194445862
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5989	NC_011080	AGG	2	6	315125	315130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194445862
5990	NC_011080	GC	3	6	315155	315160	0 %	0 %	50 %	50 %	194445862
5991	NC_011080	C	6	6	315160	315165	0 %	0 %	0 %	100 %	194445862
5992	NC_011080	GTG	2	6	315188	315193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445862
5993	NC_011080	TGC	2	6	315233	315238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445862
5994	NC_011080	CGA	2	6	315240	315245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445862
5995	NC_011080	GGA	2	6	315309	315314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194445862
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5997	NC_011080	TCA	2	6	315383	315388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445862
5998	NC_011080	TG	3	6	315395	315400	0 %	50 %	50 %	0 %	194445862
5999	NC_011080	CGG	2	6	315473	315478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445862
6000	NC_011080	TGG	2	6	315566	315571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445862

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