MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011080	AAC	2	6	256984	256989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194442333
5002	NC_011080	GAA	2	6	257155	257160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194442333
5003	NC_011080	TAA	2	6	257179	257184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442333
5004	NC_011080	ATG	2	6	257496	257501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443244
5005	NC_011080	A	6	6	257508	257513	100 %	0 %	0 %	0 %	194443244
5006	NC_011080	CTGA	2	8	257517	257524	25 %	25 %	25 %	25 %	194443244
5007	NC_011080	GCG	2	6	257583	257588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443244
5008	NC_011080	A	6	6	257589	257594	100 %	0 %	0 %	0 %	194443244
5009	NC_011080	GCT	2	6	257607	257612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443244
5010	NC_011080	GACT	2	8	257675	257682	25 %	25 %	25 %	25 %	194443244
5011	NC_011080	CGC	2	6	257732	257737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443244
5012	NC_011080	GAA	2	6	257784	257789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443244
5013	NC_011080	TCG	2	6	257834	257839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443244
5014	NC_011080	GC	3	6	257886	257891	0 %	0 %	50 %	50 %	194443244
5015	NC_011080	GCAA	2	8	257961	257968	50 %	0 %	25 %	25 %	194443244
5016	NC_011080	CTG	2	6	257998	258003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443244
5017	NC_011080	GAAA	2	8	258062	258069	75 %	0 %	25 %	0 %	194443244
5018	NC_011080	GAA	2	6	258098	258103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443244
5019	NC_011080	CTG	2	6	258171	258176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443244
5020	NC_011080	GACT	2	8	258245	258252	25 %	25 %	25 %	25 %	194443244
5021	NC_011080	GCA	2	6	258255	258260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443244
5022	NC_011080	TGC	2	6	258266	258271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443244
5023	NC_011080	GCG	2	6	258484	258489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444852
5024	NC_011080	TGGTG	2	10	258587	258596	0 %	40 %	60 %	0 %	194444852
5025	NC_011080	GGT	2	6	258603	258608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444852
5026	NC_011080	CGCC	2	8	258737	258744	0 %	0 %	25 %	75 %	194444852
5027	NC_011080	CTG	2	6	258807	258812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444852
5028	NC_011080	TAA	2	6	258815	258820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444852
5029	NC_011080	TCTG	2	8	258833	258840	0 %	50 %	25 %	25 %	194444852
5030	NC_011080	TTC	2	6	258858	258863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444852
5031	NC_011080	GGC	2	6	259040	259045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444852
5032	NC_011080	GC	3	6	259105	259110	0 %	0 %	50 %	50 %	194444852
5033	NC_011080	CGT	2	6	259113	259118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444852
5034	NC_011080	GTG	2	6	259119	259124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444852
5035	NC_011080	AAG	2	6	259135	259140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444852
5036	NC_011080	AAT	2	6	259156	259161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444852
5037	NC_011080	CTG	2	6	259412	259417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445385
5038	NC_011080	AGA	2	6	259483	259488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445385
5039	NC_011080	GCC	2	6	259612	259617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445385
5040	NC_011080	GAA	2	6	259625	259630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445385
5041	NC_011080	CGT	2	6	259631	259636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445385
5042	NC_011080	CGTC	2	8	259696	259703	0 %	25 %	25 %	50 %	194445385
5043	NC_011080	CTG	2	6	259730	259735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445385
5044	NC_011080	TCG	2	6	259765	259770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445385
5045	NC_011080	GAA	2	6	259778	259783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445385
5046	NC_011080	GCG	2	6	259823	259828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445385
5047	NC_011080	AAG	2	6	259839	259844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445385
5048	NC_011080	TGAT	2	8	259862	259869	25 %	50 %	25 %	0 %	194445385
5049	NC_011080	GCA	2	6	260048	260053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448967497
5050	NC_011080	GTG	2	6	260062	260067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448967497
5051	NC_011080	TGG	2	6	260102	260107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448967497
5052	NC_011080	CGC	2	6	260153	260158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448967497
5053	NC_011080	AAT	2	6	260202	260207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448967497
5054	NC_011080	CAG	2	6	260212	260217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448967497
5055	NC_011080	CAG	2	6	260248	260253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448967497
5056	NC_011080	GGC	2	6	260268	260273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448967497
5057	NC_011080	TGA	2	6	260277	260282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448967497
5058	NC_011080	GGC	2	6	260298	260303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448967497
5059	NC_011080	GGC	2	6	260337	260342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448967497
5060	NC_011080	CTG	2	6	260365	260370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448967497
5061	NC_011080	GCGG	2	8	260396	260403	0 %	0 %	75 %	25 %	448967497
5062	NC_011080	GCA	2	6	260426	260431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448967497
5063	NC_011080	TGG	2	6	260562	260567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448967497
5064	NC_011080	GTC	2	6	260624	260629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448967497
5065	NC_011080	CCA	2	6	260672	260677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448967497
5066	NC_011080	TGA	2	6	260678	260683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448967497
5067	NC_011080	ATCC	2	8	260752	260759	25 %	25 %	0 %	50 %	448967497
5068	NC_011080	TCAT	2	8	260768	260775	25 %	50 %	0 %	25 %	448967497
5069	NC_011080	ATGGC	2	10	260854	260863	20 %	20 %	40 %	20 %	448967497
5070	NC_011080	GC	3	6	260882	260887	0 %	0 %	50 %	50 %	448967497
5071	NC_011080	GC	3	6	260912	260917	0 %	0 %	50 %	50 %	448967497
5072	NC_011080	GC	3	6	260927	260932	0 %	0 %	50 %	50 %	448967497
5073	NC_011080	GGC	2	6	260991	260996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448967497
5074	NC_011080	ACG	2	6	260998	261003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448967497
5075	NC_011080	GGAT	2	8	261101	261108	25 %	25 %	50 %	0 %	448967497
5076	NC_011080	CG	3	6	261156	261161	0 %	0 %	50 %	50 %	448967497
5077	NC_011080	TGT	2	6	261515	261520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446733
5078	NC_011080	ATGG	2	8	261583	261590	25 %	25 %	50 %	0 %	194446733
5079	NC_011080	GTCC	2	8	261654	261661	0 %	25 %	25 %	50 %	194446733
5080	NC_011080	TGC	2	6	261678	261683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446733
5081	NC_011080	TAG	2	6	261720	261725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446733
5082	NC_011080	ACCG	2	8	261737	261744	25 %	0 %	25 %	50 %	194446733
5083	NC_011080	TG	3	6	261777	261782	0 %	50 %	50 %	0 %	194446733
5084	NC_011080	TAT	2	6	261834	261839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446733
5085	NC_011080	ATA	2	6	261908	261913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194446733
5086	NC_011080	CGG	2	6	261945	261950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446733
5087	NC_011080	GCTG	2	8	261996	262003	0 %	25 %	50 %	25 %	194446733
5088	NC_011080	TGC	2	6	262007	262012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446733
5089	NC_011080	TGA	2	6	262026	262031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446733
5090	NC_011080	AG	3	6	262032	262037	50 %	0 %	50 %	0 %	194446733
5091	NC_011080	ACTTT	2	10	262149	262158	20 %	60 %	0 %	20 %	194446733
5092	NC_011080	CGT	2	6	262231	262236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446733
5093	NC_011080	CGG	2	6	262239	262244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446733
5094	NC_011080	TGA	2	6	262257	262262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446733
5095	NC_011080	T	7	7	262343	262349	0 %	100 %	0 %	0 %	194443234
5096	NC_011080	GCC	2	6	262353	262358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443234
5097	NC_011080	ATT	2	6	262372	262377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443234
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5099	NC_011080	TGGC	2	8	262453	262460	0 %	25 %	50 %	25 %	194443234
5100	NC_011080	TG	3	6	262466	262471	0 %	50 %	50 %	0 %	194443234
5101	NC_011080	TTG	2	6	262498	262503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443234
5102	NC_011080	ATC	2	6	262511	262516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443234
5103	NC_011080	ACA	2	6	262517	262522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194443234
5104	NC_011080	TGG	2	6	262567	262572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443234
5105	NC_011080	CTG	2	6	262585	262590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443234
5106	NC_011080	CGG	2	6	262610	262615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443234
5107	NC_011080	GC	3	6	262698	262703	0 %	0 %	50 %	50 %	194443234
5108	NC_011080	ATT	2	6	262803	262808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443234
5109	NC_011080	CGG	2	6	262866	262871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443234
5110	NC_011080	GGC	2	6	262962	262967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443234
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5112	NC_011080	TGT	2	6	263114	263119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443234
5113	NC_011080	TCA	2	6	263185	263190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444218
5114	NC_011080	CGT	2	6	263301	263306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444218
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5116	NC_011080	GC	3	6	263378	263383	0 %	0 %	50 %	50 %	194444218
5117	NC_011080	CGT	2	6	263406	263411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444218
5118	NC_011080	GC	3	6	263441	263446	0 %	0 %	50 %	50 %	194444218
5119	NC_011080	ATT	2	6	263451	263456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444218
5120	NC_011080	CTGG	2	8	263501	263508	0 %	25 %	50 %	25 %	194444218
5121	NC_011080	ATC	2	6	263514	263519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444218
5122	NC_011080	TGC	2	6	263570	263575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444218
5123	NC_011080	CAG	2	6	263679	263684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444218
5124	NC_011080	ACG	2	6	263685	263690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444218
5125	NC_011080	TCT	2	6	263784	263789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444218
5126	NC_011080	CGTTAG	2	12	263965	263976	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	194444218
5127	NC_011080	GTG	2	6	264063	264068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444218
5128	NC_011080	ATT	2	6	264075	264080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444218
5129	NC_011080	TGA	2	6	264163	264168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444218
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5132	NC_011080	CTG	2	6	264369	264374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444218
5133	NC_011080	GGGC	2	8	264398	264405	0 %	0 %	75 %	25 %	194444218
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5135	NC_011080	TC	3	6	264493	264498	0 %	50 %	0 %	50 %	194444218
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5140	NC_011080	CTC	2	6	264664	264669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194443720
5141	NC_011080	ATG	2	6	264701	264706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443720
5142	NC_011080	CAC	2	6	264918	264923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443720
5143	NC_011080	GTC	2	6	264997	265002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443720
5144	NC_011080	CGC	2	6	265004	265009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443720
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5149	NC_011080	CGT	2	6	265158	265163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443720
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5151	NC_011080	CTA	2	6	265221	265226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443720
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5153	NC_011080	CG	3	6	265496	265501	0 %	0 %	50 %	50 %	194443720
5154	NC_011080	CTT	2	6	265716	265721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443720
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5159	NC_011080	TCT	2	6	266003	266008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443720
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5167	NC_011080	GGT	2	6	266500	266505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443720
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5180	NC_011080	TCG	2	6	267410	267415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444752
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5184	NC_011080	TGG	2	6	267496	267501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444752
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5190	NC_011080	TAC	2	6	267854	267859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446270
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5194	NC_011080	TCCAG	2	10	268096	268105	20 %	20 %	20 %	40 %	194446270
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5199	NC_011080	CGT	2	6	268301	268306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446270
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5203	NC_011080	CTG	2	6	268528	268533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446270
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5231	NC_011080	GGC	2	6	269962	269967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443198
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5237	NC_011080	CATT	2	8	270310	270317	25 %	50 %	0 %	25 %	194443198
5238	NC_011080	CCGT	2	8	270326	270333	0 %	25 %	25 %	50 %	194443198
5239	NC_011080	ATGCC	2	10	270468	270477	20 %	20 %	20 %	40 %	194443198
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5241	NC_011080	CG	3	6	270501	270506	0 %	0 %	50 %	50 %	194443198
5242	NC_011080	TGC	2	6	270612	270617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443198
5243	NC_011080	CGC	2	6	270668	270673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443198
5244	NC_011080	A	6	6	270684	270689	100 %	0 %	0 %	0 %	194443198
5245	NC_011080	GC	3	6	270740	270745	0 %	0 %	50 %	50 %	194443198
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5363	NC_011080	CGT	2	6	276141	276146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444763
5364	NC_011080	TGA	2	6	276157	276162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444763
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5366	NC_011080	GGC	2	6	276394	276399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443133
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5483	NC_011080	CAG	2	6	283216	283221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445048
5484	NC_011080	GC	3	6	283235	283240	0 %	0 %	50 %	50 %	194445048
5485	NC_011080	CGA	2	6	283328	283333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445048
5486	NC_011080	AAT	2	6	283369	283374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194445048
5487	NC_011080	CG	3	6	283470	283475	0 %	0 %	50 %	50 %	194446732
5488	NC_011080	GGT	2	6	283485	283490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446732
5489	NC_011080	GCCA	2	8	283584	283591	25 %	0 %	25 %	50 %	194446732
5490	NC_011080	GAT	2	6	283605	283610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446732
5491	NC_011080	TCATTA	2	12	283615	283626	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	194446732
5492	NC_011080	CGC	2	6	283758	283763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446732
5493	NC_011080	TCT	2	6	283785	283790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194446732
5494	NC_011080	TCG	2	6	283814	283819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446732
5495	NC_011080	GGC	2	6	283965	283970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446048
5496	NC_011080	GCA	2	6	283986	283991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446048
5497	NC_011080	GCG	2	6	284000	284005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446048
5498	NC_011080	TGC	2	6	284006	284011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446048
5499	NC_011080	TGA	2	6	284072	284077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446048
5500	NC_011080	GAA	2	6	284101	284106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194446048

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