MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011080	GC	3	6	231826	231831	0 %	0 %	50 %	50 %	194444741
4502	NC_011080	A	7	7	231868	231874	100 %	0 %	0 %	0 %	194444741
4503	NC_011080	CAATAT	2	12	231932	231943	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	194443658
4504	NC_011080	CTGTC	2	10	231999	232008	0 %	40 %	20 %	40 %	194443658
4505	NC_011080	AAG	2	6	232045	232050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443658
4506	NC_011080	GC	3	6	232094	232099	0 %	0 %	50 %	50 %	194443658
4507	NC_011080	TAA	3	9	232274	232282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194443670
4508	NC_011080	ATA	2	6	232303	232308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194443670
4509	NC_011080	ATT	2	6	232313	232318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443670
4510	NC_011080	T	7	7	232317	232323	0 %	100 %	0 %	0 %	194443670
4511	NC_011080	TAA	2	6	232331	232336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194443670
4512	NC_011080	A	6	6	232335	232340	100 %	0 %	0 %	0 %	194443670
4513	NC_011080	AAAT	2	8	232352	232359	75 %	25 %	0 %	0 %	194443670
4514	NC_011080	A	8	8	232378	232385	100 %	0 %	0 %	0 %	194443670
4515	NC_011080	T	6	6	232398	232403	0 %	100 %	0 %	0 %	194443670
4516	NC_011080	T	9	9	232405	232413	0 %	100 %	0 %	0 %	194443665
4517	NC_011080	AAAT	2	8	232431	232438	75 %	25 %	0 %	0 %	194443665
4518	NC_011080	TA	3	6	232454	232459	50 %	50 %	0 %	0 %	194443665
4519	NC_011080	T	7	7	232481	232487	0 %	100 %	0 %	0 %	194443665
4520	NC_011080	T	7	7	232510	232516	0 %	100 %	0 %	0 %	194443665
4521	NC_011080	CTTG	2	8	232528	232535	0 %	50 %	25 %	25 %	194443665
4522	NC_011080	TTTG	2	8	232537	232544	0 %	75 %	25 %	0 %	194443665
4523	NC_011080	T	6	6	232545	232550	0 %	100 %	0 %	0 %	194443665
4524	NC_011080	TAT	2	6	232567	232572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443665
4525	NC_011080	TAAA	2	8	232591	232598	75 %	25 %	0 %	0 %	194443665
4526	NC_011080	CAG	2	6	232817	232822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444316
4527	NC_011080	TGC	2	6	232836	232841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444316
4528	NC_011080	TGC	2	6	232875	232880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444316
4529	NC_011080	CGA	2	6	232950	232955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444316
4530	NC_011080	CAC	2	6	233058	233063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444316
4531	NC_011080	AAG	2	6	233069	233074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444316
4532	NC_011080	CGG	3	9	233145	233153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444316
4533	NC_011080	ACC	2	6	233186	233191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444316
4534	NC_011080	GCG	3	9	233254	233262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444316
4535	NC_011080	CAG	2	6	233334	233339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444316
4536	NC_011080	A	6	6	233468	233473	100 %	0 %	0 %	0 %	194442854
4537	NC_011080	GTG	2	6	233498	233503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442854
4538	NC_011080	GAT	2	6	233585	233590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442854
4539	NC_011080	TC	3	6	233602	233607	0 %	50 %	0 %	50 %	194442854
4540	NC_011080	ATC	2	6	233646	233651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442854
4541	NC_011080	TTA	2	6	233694	233699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194442854
4542	NC_011080	ATA	2	6	233712	233717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442854
4543	NC_011080	GCT	2	6	233764	233769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442854
4544	NC_011080	ATT	2	6	233891	233896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194442854
4545	NC_011080	TAT	2	6	233970	233975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194442854
4546	NC_011080	ATG	2	6	234015	234020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442854
4547	NC_011080	GGTG	2	8	234055	234062	0 %	25 %	75 %	0 %	194442854
4548	NC_011080	GC	3	6	234085	234090	0 %	0 %	50 %	50 %	194442854
4549	NC_011080	GGCG	2	8	234192	234199	0 %	0 %	75 %	25 %	194442854
4550	NC_011080	GGC	2	6	234278	234283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442854
4551	NC_011080	CGA	2	6	234295	234300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442854
4552	NC_011080	AT	3	6	234339	234344	50 %	50 %	0 %	0 %	194442854
4553	NC_011080	GC	3	6	234353	234358	0 %	0 %	50 %	50 %	194442854
4554	NC_011080	GCGG	2	8	234387	234394	0 %	0 %	75 %	25 %	194442854
4555	NC_011080	GAA	2	6	234482	234487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194442854
4556	NC_011080	GGC	2	6	234611	234616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442854
4557	NC_011080	CCT	2	6	234636	234641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194442854
4558	NC_011080	CGG	2	6	234670	234675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442854
4559	NC_011080	GCT	2	6	234733	234738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442854
4560	NC_011080	TGA	2	6	234853	234858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442854
4561	NC_011080	GAA	2	6	234899	234904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194442854
4562	NC_011080	TGA	2	6	235180	235185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442854
4563	NC_011080	CAA	2	6	235219	235224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194442854
4564	NC_011080	ACA	3	9	235260	235268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194442854
4565	NC_011080	CG	3	6	235331	235336	0 %	0 %	50 %	50 %	194442854
4566	NC_011080	CTA	2	6	235360	235365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442854
4567	NC_011080	TCA	2	6	235369	235374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442854
4568	NC_011080	CGG	2	6	235432	235437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442854
4569	NC_011080	GCG	2	6	235452	235457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442854
4570	NC_011080	GCACC	2	10	235486	235495	20 %	0 %	20 %	60 %	194442854
4571	NC_011080	CGG	2	6	235504	235509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442854
4572	NC_011080	GCT	2	6	235516	235521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442854
4573	NC_011080	TA	3	6	235575	235580	50 %	50 %	0 %	0 %	194442854
4574	NC_011080	ACT	2	6	235620	235625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442854
4575	NC_011080	CT	3	6	235680	235685	0 %	50 %	0 %	50 %	194442854
4576	NC_011080	CGC	2	6	235727	235732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442854
4577	NC_011080	A	6	6	235751	235756	100 %	0 %	0 %	0 %	194442854
4578	NC_011080	GGC	2	6	235784	235789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442854
4579	NC_011080	CGC	2	6	235791	235796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442854
4580	NC_011080	ACA	2	6	235815	235820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194442854
4581	NC_011080	GCC	2	6	235821	235826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442854
4582	NC_011080	GCG	2	6	235931	235936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442854
4583	NC_011080	TGC	2	6	235977	235982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442854
4584	NC_011080	TCA	2	6	236000	236005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442854
4585	NC_011080	GCG	2	6	236056	236061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442854
4586	NC_011080	CT	3	6	236087	236092	0 %	50 %	0 %	50 %	194442854
4587	NC_011080	ATG	2	6	236131	236136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443324
4588	NC_011080	TGC	2	6	236168	236173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443324
4589	NC_011080	GGC	2	6	236182	236187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443324
4590	NC_011080	GCC	2	6	236203	236208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443324
4591	NC_011080	TCG	2	6	236354	236359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443324
4592	NC_011080	T	6	6	236456	236461	0 %	100 %	0 %	0 %	194443324
4593	NC_011080	CCG	2	6	236482	236487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443324
4594	NC_011080	T	6	6	236540	236545	0 %	100 %	0 %	0 %	194443324
4595	NC_011080	CCGC	2	8	236547	236554	0 %	0 %	25 %	75 %	194443324
4596	NC_011080	GCA	2	6	236577	236582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443324
4597	NC_011080	TAC	2	6	236650	236655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443324
4598	NC_011080	GTG	2	6	236656	236661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443324
4599	NC_011080	CCAG	2	8	236695	236702	25 %	0 %	25 %	50 %	194443324
4600	NC_011080	GC	3	6	236807	236812	0 %	0 %	50 %	50 %	194443324
4601	NC_011080	ACA	2	6	236840	236845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194443324
4602	NC_011080	GCCGC	2	10	237022	237031	0 %	0 %	40 %	60 %	194444755
4603	NC_011080	CGG	2	6	237045	237050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444755
4604	NC_011080	GAC	2	6	237075	237080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444755
4605	NC_011080	GC	3	6	237257	237262	0 %	0 %	50 %	50 %	194444755
4606	NC_011080	GCG	2	6	237305	237310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444755
4607	NC_011080	AAT	2	6	237346	237351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444755
4608	NC_011080	TGG	3	9	237395	237403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444755
4609	NC_011080	A	7	7	237414	237420	100 %	0 %	0 %	0 %	194444755
4610	NC_011080	G	6	6	237440	237445	0 %	0 %	100 %	0 %	194445266
4611	NC_011080	CGC	2	6	237499	237504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445266
4612	NC_011080	CTG	2	6	237555	237560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445266
4613	NC_011080	TAA	2	6	237563	237568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194445266
4614	NC_011080	GTGA	2	8	237672	237679	25 %	25 %	50 %	0 %	194445266
4615	NC_011080	CGG	3	9	237688	237696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445266
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4617	NC_011080	TGAA	2	8	237775	237782	50 %	25 %	25 %	0 %	194445266
4618	NC_011080	GGC	2	6	237843	237848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445266
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4620	NC_011080	TGG	2	6	237990	237995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443734
4621	NC_011080	TCG	2	6	238049	238054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443734
4622	NC_011080	TTC	2	6	238379	238384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443734
4623	NC_011080	ATG	2	6	238414	238419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443734
4624	NC_011080	ATA	2	6	238423	238428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444241
4625	NC_011080	TGC	2	6	238442	238447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444241
4626	NC_011080	CAC	2	6	238509	238514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444241
4627	NC_011080	TAT	2	6	238519	238524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444241
4628	NC_011080	TTA	2	6	238761	238766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444241
4629	NC_011080	TGGC	2	8	238810	238817	0 %	25 %	50 %	25 %	194444241
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4631	NC_011080	AAC	2	6	238953	238958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194444241
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4638	NC_011080	TCT	2	6	239419	239424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444494
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4640	NC_011080	GAA	2	6	239502	239507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444494
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4647	NC_011080	GCC	2	6	239731	239736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444494
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4652	NC_011080	ACG	2	6	239881	239886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444494
4653	NC_011080	GTA	2	6	239889	239894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444494
4654	NC_011080	TCA	2	6	239930	239935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444494
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4662	NC_011080	GC	3	6	240179	240184	0 %	0 %	50 %	50 %	194444494
4663	NC_011080	CAG	2	6	240201	240206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444494
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4677	NC_011080	CGGCG	2	10	241359	241368	0 %	0 %	60 %	40 %	194442592
4678	NC_011080	CT	3	6	241375	241380	0 %	50 %	0 %	50 %	194442592
4679	NC_011080	GCG	2	6	241381	241386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442592
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4684	NC_011080	ATT	2	6	241597	241602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194442592
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4736	NC_011080	CCG	2	6	243966	243971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446798
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4740	NC_011080	CGGG	2	8	244063	244070	0 %	0 %	75 %	25 %	194446798
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4743	NC_011080	AAGC	2	8	244117	244124	50 %	0 %	25 %	25 %	194446798
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4987	NC_011080	CGA	2	6	255661	255666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443962
4988	NC_011080	CAC	2	6	255776	255781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443962
4989	NC_011080	AGGC	2	8	255828	255835	25 %	0 %	50 %	25 %	194443962
4990	NC_011080	GTT	2	6	255847	255852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443962
4991	NC_011080	GGT	2	6	255893	255898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443962
4992	NC_011080	T	6	6	255967	255972	0 %	100 %	0 %	0 %	194443962
4993	NC_011080	GC	3	6	256553	256558	0 %	0 %	50 %	50 %	194442333
4994	NC_011080	CAT	2	6	256572	256577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442333
4995	NC_011080	CTGAA	2	10	256619	256628	40 %	20 %	20 %	20 %	194442333
4996	NC_011080	AAGCG	2	10	256683	256692	40 %	0 %	40 %	20 %	194442333
4997	NC_011080	GCT	2	6	256702	256707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442333
4998	NC_011080	TTC	2	6	256723	256728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194442333
4999	NC_011080	GCTG	2	8	256739	256746	0 %	25 %	50 %	25 %	194442333
5000	NC_011080	AAGA	2	8	256846	256853	75 %	0 %	25 %	0 %	194442333

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