MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae G54 chromosome

Total Repeats: 35754

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011072	GAT	2	6	180076	180081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398606
3002	NC_011072	ATT	2	6	180108	180113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194398606
3003	NC_011072	GTT	2	6	180147	180152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194398606
3004	NC_011072	A	6	6	180318	180323	100 %	0 %	0 %	0 %	194397994
3005	NC_011072	AGTTA	2	10	180349	180358	40 %	40 %	20 %	0 %	194397994
3006	NC_011072	AAG	2	6	180379	180384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397994
3007	NC_011072	GA	3	6	180392	180397	50 %	0 %	50 %	0 %	194397994
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3009	NC_011072	A	7	7	180746	180752	100 %	0 %	0 %	0 %	194397658
3010	NC_011072	TGGT	2	8	180786	180793	0 %	50 %	50 %	0 %	194397658
3011	NC_011072	A	6	6	180803	180808	100 %	0 %	0 %	0 %	194397658
3012	NC_011072	GAA	2	6	180880	180885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397658
3013	NC_011072	GAT	2	6	180923	180928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397658
3014	NC_011072	CAG	2	6	180935	180940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194397658
3015	NC_011072	ACAA	2	8	180943	180950	75 %	0 %	0 %	25 %	194397658
3016	NC_011072	TTAC	2	8	180951	180958	25 %	50 %	0 %	25 %	194397658
3017	NC_011072	T	6	6	180970	180975	0 %	100 %	0 %	0 %	194397658
3018	NC_011072	CAA	2	6	180989	180994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194397658
3019	NC_011072	TGA	2	6	181009	181014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397658
3020	NC_011072	TGGAG	2	10	181039	181048	20 %	20 %	60 %	0 %	194397658
3021	NC_011072	CTT	2	6	181064	181069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194397658
3022	NC_011072	GGA	2	6	181075	181080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194397658
3023	NC_011072	AAC	2	6	181162	181167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194397658
3024	NC_011072	AAG	2	6	181199	181204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397658
3025	NC_011072	GAA	2	6	181225	181230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397658
3026	NC_011072	AT	3	6	181270	181275	50 %	50 %	0 %	0 %	194397658
3027	NC_011072	AGAT	2	8	181279	181286	50 %	25 %	25 %	0 %	194397658
3028	NC_011072	GAA	2	6	181411	181416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397095
3029	NC_011072	A	6	6	181447	181452	100 %	0 %	0 %	0 %	194397095
3030	NC_011072	TAA	2	6	181569	181574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194397095
3031	NC_011072	AAATC	2	10	181581	181590	60 %	20 %	0 %	20 %	194397095
3032	NC_011072	TGA	2	6	181605	181610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397095
3033	NC_011072	CTA	2	6	181632	181637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194397095
3034	NC_011072	ATC	2	6	181756	181761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194398342
3035	NC_011072	GAA	2	6	181771	181776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398342
3036	NC_011072	CG	3	6	181880	181885	0 %	0 %	50 %	50 %	194398342
3037	NC_011072	AGA	2	6	181917	181922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398342
3038	NC_011072	T	6	6	181924	181929	0 %	100 %	0 %	0 %	194398342
3039	NC_011072	ACA	2	6	181963	181968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194398342
3040	NC_011072	GCT	2	6	181972	181977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194398342
3041	NC_011072	TTGA	2	8	181987	181994	25 %	50 %	25 %	0 %	194398342
3042	NC_011072	AGC	2	6	182043	182048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194398342
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3044	NC_011072	TAGA	2	8	182072	182079	50 %	25 %	25 %	0 %	194398342
3045	NC_011072	ACCACG	2	12	182120	182131	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	194397768
3046	NC_011072	TAG	2	6	182153	182158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397768
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3050	NC_011072	TCAT	2	8	182296	182303	25 %	50 %	0 %	25 %	194397768
3051	NC_011072	AGA	2	6	182346	182351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397768
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3053	NC_011072	GAA	2	6	182377	182382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397768
3054	NC_011072	GGA	2	6	182400	182405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194397768
3055	NC_011072	TAAAAA	2	12	182543	182554	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	194398301
3056	NC_011072	CAGT	2	8	182555	182562	25 %	25 %	25 %	25 %	194398301
3057	NC_011072	AGA	2	6	182880	182885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397996
3058	NC_011072	GCA	2	6	182937	182942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194397996
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3062	NC_011072	GCAGAC	2	12	183133	183144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194397996
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3064	NC_011072	TTA	2	6	183277	183282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194397996
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3070	NC_011072	CAGG	2	8	183517	183524	25 %	0 %	50 %	25 %	194397996
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3074	NC_011072	TGA	2	6	183678	183683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397996
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3082	NC_011072	CAG	3	9	184305	184313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194397409
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3089	NC_011072	GAT	2	6	184614	184619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397409
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3092	NC_011072	ATC	2	6	184957	184962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194397295
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3099	NC_011072	TCA	2	6	185195	185200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194397295
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3103	NC_011072	AGA	2	6	185346	185351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397295
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3106	NC_011072	ATTG	2	8	185565	185572	25 %	50 %	25 %	0 %	194397295
3107	NC_011072	TGG	2	6	185595	185600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194397295
3108	NC_011072	GA	3	6	185635	185640	50 %	0 %	50 %	0 %	194397295
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3119	NC_011072	AT	3	6	186236	186241	50 %	50 %	0 %	0 %	194397295
3120	NC_011072	CTAA	2	8	186420	186427	50 %	25 %	0 %	25 %	194396754
3121	NC_011072	GAA	2	6	186429	186434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194396754
3122	NC_011072	ATGAT	2	10	186439	186448	40 %	40 %	20 %	0 %	194396754
3123	NC_011072	A	6	6	186510	186515	100 %	0 %	0 %	0 %	194396754
3124	NC_011072	GT	3	6	186601	186606	0 %	50 %	50 %	0 %	194398472
3125	NC_011072	GTAGA	2	10	186610	186619	40 %	20 %	40 %	0 %	194398472
3126	NC_011072	CAT	2	6	186675	186680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194398472
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3148	NC_011072	CTAT	2	8	187873	187880	25 %	50 %	0 %	25 %	194398472
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3372	NC_011072	AAC	2	6	199171	199176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194397047
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3489	NC_011072	A	6	6	205635	205640	100 %	0 %	0 %	0 %	408843741
3490	NC_011072	CGT	2	6	205682	205687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194398129
3491	NC_011072	TAA	2	6	205735	205740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194398129
3492	NC_011072	TCA	2	6	205787	205792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194398129
3493	NC_011072	GCT	2	6	205838	205843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194398129
3494	NC_011072	GCT	3	9	205859	205867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194398129
3495	NC_011072	TGC	2	6	205954	205959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194398129
3496	NC_011072	CA	3	6	206004	206009	50 %	0 %	0 %	50 %	194398129
3497	NC_011072	TCC	2	6	206020	206025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194398129
3498	NC_011072	ATC	2	6	206044	206049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194398129
3499	NC_011072	TGA	2	6	206122	206127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194396717
3500	NC_011072	CT	3	6	206194	206199	0 %	50 %	0 %	50 %	194396717

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