MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae G54 chromosome

Total Repeats: 35754

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011072	ATA	2	6	59947	59952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194398622
1002	NC_011072	T	6	6	59955	59960	0 %	100 %	0 %	0 %	194398622
1003	NC_011072	TCA	2	6	59965	59970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194398622
1004	NC_011072	ATC	2	6	60006	60011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194398622
1005	NC_011072	CTT	4	12	60179	60190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194398622
1006	NC_011072	GTT	2	6	60216	60221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194398622
1007	NC_011072	TTG	2	6	60264	60269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194398622
1008	NC_011072	GA	3	6	60291	60296	50 %	0 %	50 %	0 %	194398622
1009	NC_011072	CTT	2	6	60314	60319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194398622
1010	NC_011072	TGCT	2	8	60378	60385	0 %	50 %	25 %	25 %	194398622
1011	NC_011072	AGC	2	6	60495	60500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194398622
1012	NC_011072	TACCA	2	10	60501	60510	40 %	20 %	0 %	40 %	194398622
1013	NC_011072	GAT	2	6	60513	60518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398622
1014	NC_011072	GT	3	6	60560	60565	0 %	50 %	50 %	0 %	194398622
1015	NC_011072	GTA	2	6	60633	60638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398622
1016	NC_011072	CAT	2	6	60644	60649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194398622
1017	NC_011072	TAG	2	6	60681	60686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398622
1018	NC_011072	AGA	2	6	60690	60695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398622
1019	NC_011072	ACC	2	6	60717	60722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194398622
1020	NC_011072	GAT	2	6	60738	60743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398622
1021	NC_011072	GTA	2	6	60780	60785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398622
1022	NC_011072	CGT	2	6	60791	60796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194398622
1023	NC_011072	CGAG	2	8	60835	60842	25 %	0 %	50 %	25 %	194398622
1024	NC_011072	CAT	2	6	60947	60952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194398622
1025	NC_011072	TCA	2	6	60961	60966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194398622
1026	NC_011072	AGC	2	6	61005	61010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194398622
1027	NC_011072	TTC	2	6	61081	61086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194398622
1028	NC_011072	TAA	2	6	61261	61266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194398622
1029	NC_011072	CAT	2	6	61364	61369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194398622
1030	NC_011072	GAT	2	6	61419	61424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398622
1031	NC_011072	GTT	2	6	61433	61438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194398622
1032	NC_011072	GCA	2	6	61510	61515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194398622
1033	NC_011072	TTCCT	2	10	61518	61527	0 %	60 %	0 %	40 %	194398622
1034	NC_011072	T	6	6	61569	61574	0 %	100 %	0 %	0 %	194398622
1035	NC_011072	CTT	2	6	61634	61639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194398622
1036	NC_011072	CTT	2	6	61655	61660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194398622
1037	NC_011072	TTA	2	6	61669	61674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194398622
1038	NC_011072	CAG	2	6	61688	61693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194398622
1039	NC_011072	AACT	2	8	61733	61740	50 %	25 %	0 %	25 %	194398622
1040	NC_011072	TCT	2	6	61756	61761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194398622
1041	NC_011072	GTTTCT	2	12	61798	61809	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	194398622
1042	NC_011072	GAT	2	6	61870	61875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398622
1043	NC_011072	ATGG	2	8	61896	61903	25 %	25 %	50 %	0 %	194398622
1044	NC_011072	GGTT	2	8	61906	61913	0 %	50 %	50 %	0 %	194398622
1045	NC_011072	GTA	3	9	61918	61926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398622
1046	NC_011072	GCT	2	6	61987	61992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194398622
1047	NC_011072	TGT	2	6	62023	62028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194398622
1048	NC_011072	TCT	2	6	62352	62357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194397376
1049	NC_011072	GTA	2	6	62393	62398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397376
1050	NC_011072	TTC	2	6	62549	62554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194397376
1051	NC_011072	TCA	2	6	62562	62567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194397376
1052	NC_011072	TAGA	2	8	62604	62611	50 %	25 %	25 %	0 %	194397376
1053	NC_011072	AT	3	6	62646	62651	50 %	50 %	0 %	0 %	194397376
1054	NC_011072	GTA	2	6	62720	62725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397376
1055	NC_011072	ATC	2	6	62804	62809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194397376
1056	NC_011072	TTCCTT	2	12	62878	62889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194397376
1057	NC_011072	AAC	2	6	62936	62941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194397376
1058	NC_011072	GAT	2	6	63020	63025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397376
1059	NC_011072	T	6	6	63030	63035	0 %	100 %	0 %	0 %	194397376
1060	NC_011072	GAT	2	6	63442	63447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397614
1061	NC_011072	CATT	2	8	63489	63496	25 %	50 %	0 %	25 %	194397614
1062	NC_011072	TCC	2	6	63507	63512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194397614
1063	NC_011072	CGTC	2	8	63688	63695	0 %	25 %	25 %	50 %	194397614
1064	NC_011072	AT	3	6	63783	63788	50 %	50 %	0 %	0 %	194397614
1065	NC_011072	CTA	2	6	63804	63809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194397614
1066	NC_011072	TTG	2	6	63841	63846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194397614
1067	NC_011072	TGG	2	6	63852	63857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194397614
1068	NC_011072	ATG	2	6	63868	63873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397614
1069	NC_011072	TGA	2	6	64095	64100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397614
1070	NC_011072	TGGT	2	8	64143	64150	0 %	50 %	50 %	0 %	194397614
1071	NC_011072	GGT	2	6	64255	64260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194397614
1072	NC_011072	GAA	2	6	64351	64356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397614
1073	NC_011072	AAG	2	6	64387	64392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397614
1074	NC_011072	ATG	2	6	64393	64398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397614
1075	NC_011072	AG	3	6	64443	64448	50 %	0 %	50 %	0 %	194397614
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1080	NC_011072	AGA	3	9	64608	64616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397614
1081	NC_011072	CAGA	2	8	64690	64697	50 %	0 %	25 %	25 %	194397614
1082	NC_011072	T	6	6	64712	64717	0 %	100 %	0 %	0 %	194397614
1083	NC_011072	AAAG	2	8	64728	64735	75 %	0 %	25 %	0 %	194397614
1084	NC_011072	CT	3	6	65066	65071	0 %	50 %	0 %	50 %	194397614
1085	NC_011072	AAGG	2	8	65098	65105	50 %	0 %	50 %	0 %	194397614
1086	NC_011072	CAT	2	6	65115	65120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194397614
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1088	NC_011072	GAC	2	6	65304	65309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194398074
1089	NC_011072	CAA	2	6	65318	65323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194398074
1090	NC_011072	ACC	2	6	65357	65362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194398074
1091	NC_011072	TTGGT	2	10	65473	65482	0 %	60 %	40 %	0 %	194398074
1092	NC_011072	GTA	2	6	65568	65573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398074
1093	NC_011072	TTA	2	6	65670	65675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194398074
1094	NC_011072	TGG	2	6	65718	65723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194398754
1095	NC_011072	TGA	2	6	65765	65770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398754
1096	NC_011072	ACT	2	6	65844	65849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194398754
1097	NC_011072	GGT	2	6	65862	65867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194398754
1098	NC_011072	GTTC	2	8	65879	65886	0 %	50 %	25 %	25 %	194398754
1099	NC_011072	GGT	2	6	65904	65909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194398754
1100	NC_011072	TAC	2	6	65993	65998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194398754
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1102	NC_011072	ACTT	2	8	66027	66034	25 %	50 %	0 %	25 %	194398754
1103	NC_011072	ACT	2	6	66054	66059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194398754
1104	NC_011072	CTT	2	6	66062	66067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194398754
1105	NC_011072	TGC	2	6	66083	66088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194398754
1106	NC_011072	ACT	2	6	66124	66129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194398754
1107	NC_011072	TCT	2	6	66172	66177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194398754
1108	NC_011072	TGG	2	6	66191	66196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194398754
1109	NC_011072	AGT	2	6	66212	66217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398754
1110	NC_011072	TGG	2	6	66401	66406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194398754
1111	NC_011072	CTG	2	6	66436	66441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194398754
1112	NC_011072	A	6	6	66451	66456	100 %	0 %	0 %	0 %	194398754
1113	NC_011072	AAC	2	6	66468	66473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194398754
1114	NC_011072	CTTCA	2	10	66528	66537	20 %	40 %	0 %	40 %	194398754
1115	NC_011072	AGC	2	6	66560	66565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194398754
1116	NC_011072	AGA	2	6	66630	66635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397103
1117	NC_011072	AATCA	2	10	66640	66649	60 %	20 %	0 %	20 %	194397103
1118	NC_011072	GAAA	2	8	66771	66778	75 %	0 %	25 %	0 %	194397103
1119	NC_011072	TGA	2	6	66779	66784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397103
1120	NC_011072	TTC	2	6	66799	66804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194397103
1121	NC_011072	TTC	2	6	66817	66822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194397103
1122	NC_011072	GAA	2	6	66856	66861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397103
1123	NC_011072	CTC	2	6	66926	66931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194397103
1124	NC_011072	GCA	2	6	66982	66987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194397103
1125	NC_011072	TTGCAG	2	12	67031	67042	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	194397103
1126	NC_011072	AAG	2	6	67088	67093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397103
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