MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia R551-3 chromosome

Total Repeats: 106790

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011071	AGC	2	6	125321	125326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363880
3002	NC_011071	CGA	2	6	125388	125393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363880
3003	NC_011071	CCA	2	6	125405	125410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194363880
3004	NC_011071	GGT	2	6	125466	125471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194363880
3005	NC_011071	GCA	2	6	125489	125494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363880
3006	NC_011071	CGTG	2	8	125562	125569	0 %	25 %	50 %	25 %	194363880
3007	NC_011071	CCGC	2	8	125597	125604	0 %	0 %	25 %	75 %	194363880
3008	NC_011071	GC	3	6	125603	125608	0 %	0 %	50 %	50 %	194363880
3009	NC_011071	GCA	2	6	125621	125626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363880
3010	NC_011071	GGC	2	6	125663	125668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363880
3011	NC_011071	GTG	2	6	125698	125703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194363880
3012	NC_011071	GCC	2	6	125704	125709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363880
3013	NC_011071	C	6	6	125861	125866	0 %	0 %	0 %	100 %	194363881
3014	NC_011071	GGC	2	6	125869	125874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363881
3015	NC_011071	GT	3	6	125882	125887	0 %	50 %	50 %	0 %	194363881
3016	NC_011071	GCT	2	6	125910	125915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363881
3017	NC_011071	CTGATC	2	12	125944	125955	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	194363881
3018	NC_011071	TGC	2	6	125960	125965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363881
3019	NC_011071	GTG	2	6	126013	126018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194363881
3020	NC_011071	TGG	2	6	126022	126027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194363881
3021	NC_011071	TCG	2	6	126101	126106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363881
3022	NC_011071	CAGC	2	8	126144	126151	25 %	0 %	25 %	50 %	194363881
3023	NC_011071	ATG	2	6	126154	126159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194363881
3024	NC_011071	TGGC	2	8	126205	126212	0 %	25 %	50 %	25 %	194363881
3025	NC_011071	CG	4	8	126213	126220	0 %	0 %	50 %	50 %	194363881
3026	NC_011071	CCA	2	6	126234	126239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194363881
3027	NC_011071	GGC	2	6	126340	126345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363881
3028	NC_011071	TCG	2	6	126455	126460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363881
3029	NC_011071	CGC	2	6	126483	126488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363881
3030	NC_011071	CG	5	10	126596	126605	0 %	0 %	50 %	50 %	194363881
3031	NC_011071	GGC	2	6	126612	126617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363881
3032	NC_011071	GCC	2	6	126706	126711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363882
3033	NC_011071	GCTG	2	8	126714	126721	0 %	25 %	50 %	25 %	194363882
3034	NC_011071	CTG	4	12	126779	126790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363882
3035	NC_011071	GGC	2	6	126830	126835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363882
3036	NC_011071	CTG	3	9	126899	126907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363882
3037	NC_011071	GGC	2	6	126949	126954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363882
3038	NC_011071	CG	3	6	126955	126960	0 %	0 %	50 %	50 %	194363882
3039	NC_011071	CAT	2	6	127019	127024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194363882
3040	NC_011071	CGA	2	6	127057	127062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363882
3041	NC_011071	TGG	2	6	127113	127118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194363882
3042	NC_011071	CCG	2	6	127119	127124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363882
3043	NC_011071	TGC	2	6	127149	127154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363882
3044	NC_011071	TGCG	2	8	127164	127171	0 %	25 %	50 %	25 %	194363882
3045	NC_011071	CGG	2	6	127173	127178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363882
3046	NC_011071	GCT	2	6	127189	127194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363882
3047	NC_011071	GCG	2	6	127306	127311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363882
3048	NC_011071	CGA	2	6	127345	127350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363882
3049	NC_011071	CG	3	6	127373	127378	0 %	0 %	50 %	50 %	194363882
3050	NC_011071	GCCG	2	8	127480	127487	0 %	0 %	50 %	50 %	194363882
3051	NC_011071	CTG	2	6	127576	127581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363882
3052	NC_011071	TGC	2	6	127662	127667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363882
3053	NC_011071	ATC	2	6	127744	127749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194363883
3054	NC_011071	TGA	2	6	127809	127814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194363883
3055	NC_011071	GCTG	2	8	127838	127845	0 %	25 %	50 %	25 %	194363883
3056	NC_011071	GCA	3	9	127857	127865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363883
3057	NC_011071	AGG	2	6	127898	127903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194363883
3058	NC_011071	GCA	2	6	127941	127946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363883
3059	NC_011071	GGCC	2	8	127947	127954	0 %	0 %	50 %	50 %	194363883
3060	NC_011071	TGC	2	6	127955	127960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363883
3061	NC_011071	GC	3	6	127999	128004	0 %	0 %	50 %	50 %	194363883
3062	NC_011071	ACC	2	6	128005	128010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194363883
3063	NC_011071	CGA	2	6	128079	128084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363883
3064	NC_011071	GCG	2	6	128086	128091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363883
3065	NC_011071	CG	3	6	128090	128095	0 %	0 %	50 %	50 %	194363883
3066	NC_011071	CG	3	6	128111	128116	0 %	0 %	50 %	50 %	194363883
3067	NC_011071	GCT	2	6	128136	128141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363883
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3069	NC_011071	GCT	2	6	128196	128201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363883
3070	NC_011071	GCC	2	6	128206	128211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363883
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3073	NC_011071	GCA	2	6	128418	128423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363883
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3075	NC_011071	GCT	2	6	128517	128522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363883
3076	NC_011071	TGC	2	6	128549	128554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363883
3077	NC_011071	GCT	3	9	128556	128564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363883
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3080	NC_011071	CGCCTG	2	12	128758	128769	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	194363883
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3082	NC_011071	CTGCCG	2	12	129052	129063	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	194363883
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3088	NC_011071	TGG	2	6	129305	129310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194363883
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3090	NC_011071	CTG	2	6	129391	129396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363883
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3092	NC_011071	TGC	2	6	129431	129436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363883
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3098	NC_011071	GCGT	2	8	129540	129547	0 %	25 %	50 %	25 %	194363883
3099	NC_011071	CTG	2	6	129595	129600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363883
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3104	NC_011071	TGA	2	6	129737	129742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194363883
3105	NC_011071	GAG	2	6	129800	129805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194363883
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3107	NC_011071	GCC	2	6	129878	129883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363884
3108	NC_011071	CCTGG	2	10	129910	129919	0 %	20 %	40 %	40 %	194363884
3109	NC_011071	GC	3	6	129924	129929	0 %	0 %	50 %	50 %	194363884
3110	NC_011071	CGTT	2	8	129941	129948	0 %	50 %	25 %	25 %	194363884
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3119	NC_011071	CTCG	2	8	130306	130313	0 %	25 %	25 %	50 %	194363884
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3121	NC_011071	CCG	3	9	130332	130340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363884
3122	NC_011071	CTT	2	6	130559	130564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194363885
3123	NC_011071	ACC	2	6	130581	130586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194363885
3124	NC_011071	CGGC	2	8	130618	130625	0 %	0 %	50 %	50 %	194363885
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3131	NC_011071	CGGT	2	8	130876	130883	0 %	25 %	50 %	25 %	194363885
3132	NC_011071	GGTCAG	2	12	130919	130930	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	194363885
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3230	NC_011071	GTTC	2	8	134942	134949	0 %	50 %	25 %	25 %	194363889
3231	NC_011071	TCG	2	6	135029	135034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363889
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3234	NC_011071	TGC	2	6	135113	135118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363889
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3237	NC_011071	TCG	2	6	135272	135277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363889
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3362	NC_011071	CGG	2	6	140435	140440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363891
3363	NC_011071	GCTGCA	2	12	140447	140458	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	194363891
3364	NC_011071	ACA	2	6	140476	140481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194363891
3365	NC_011071	GCG	2	6	140482	140487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363891
3366	NC_011071	TCA	2	6	140533	140538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194363891
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3369	NC_011071	GGCACC	2	12	140565	140576	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	194363891
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3371	NC_011071	CTG	2	6	140619	140624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363891
3372	NC_011071	CTG	2	6	140661	140666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363891
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3374	NC_011071	CCGGCA	2	12	140692	140703	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	194363891
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3381	NC_011071	GCG	2	6	140854	140859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363891
3382	NC_011071	TGT	2	6	140866	140871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194363891
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3385	NC_011071	ACG	2	6	140920	140925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363891
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3390	NC_011071	CGG	2	6	141010	141015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363891
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3479	NC_011071	CGG	2	6	143822	143827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363891
3480	NC_011071	CCTGAC	2	12	143855	143866	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	194363891
3481	NC_011071	CGG	2	6	143888	143893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363891
3482	NC_011071	GCA	2	6	143900	143905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363891
3483	NC_011071	GCT	2	6	143963	143968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363891
3484	NC_011071	ACC	2	6	144000	144005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194363891
3485	NC_011071	GCT	2	6	144059	144064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363891
3486	NC_011071	ATC	2	6	144081	144086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194363891
3487	NC_011071	GC	3	6	144117	144122	0 %	0 %	50 %	50 %	194363891
3488	NC_011071	ACA	2	6	144133	144138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194363891
3489	NC_011071	GC	3	6	144163	144168	0 %	0 %	50 %	50 %	194363891
3490	NC_011071	GC	3	6	144181	144186	0 %	0 %	50 %	50 %	194363891
3491	NC_011071	CAA	2	6	144194	144199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194363891
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3493	NC_011071	GGCAGC	2	12	144222	144233	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	194363891
3494	NC_011071	GGT	2	6	144270	144275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194363891
3495	NC_011071	CGG	2	6	144329	144334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363891
3496	NC_011071	GC	3	6	144358	144363	0 %	0 %	50 %	50 %	194363891
3497	NC_011071	ACA	2	6	144391	144396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194363891
3498	NC_011071	G	6	6	144419	144424	0 %	0 %	100 %	0 %	194363891
3499	NC_011071	CAA	2	6	144452	144457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194363891
3500	NC_011071	CAG	2	6	144458	144463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363891

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