MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia K279a chromosome

Total Repeats: 3741

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010943	TGCGC	2	10	2099	2108	0 %	20 %	40 %	40 %	190572093
2	NC_010943	TGCTC	2	10	4201	4210	0 %	40 %	20 %	40 %	190572095
3	NC_010943	GGCCA	2	10	4535	4544	20 %	0 %	40 %	40 %	190572095
4	NC_010943	CGCTG	2	10	6647	6656	0 %	20 %	40 %	40 %	190572096
5	NC_010943	GCCGC	2	10	7489	7498	0 %	0 %	40 %	60 %	190572097
6	NC_010943	CGTGG	2	10	7600	7609	0 %	20 %	60 %	20 %	190572097
7	NC_010943	TGGAC	2	10	14239	14248	20 %	20 %	40 %	20 %	190572104
8	NC_010943	ATGCG	2	10	16347	16356	20 %	20 %	40 %	20 %	190572107
9	NC_010943	GAAGT	2	10	19142	19151	40 %	20 %	40 %	0 %	190572110
10	NC_010943	TCCTG	2	10	23351	23360	0 %	40 %	20 %	40 %	190572113
11	NC_010943	GAGGT	2	10	25006	25015	20 %	20 %	60 %	0 %	190572114
12	NC_010943	CTTGC	2	10	26337	26346	0 %	40 %	20 %	40 %	190572115
13	NC_010943	ACCGC	2	10	27006	27015	20 %	0 %	20 %	60 %	190572116
14	NC_010943	CGAGT	2	10	29829	29838	20 %	20 %	40 %	20 %	190572118
15	NC_010943	CGAAT	2	10	30240	30249	40 %	20 %	20 %	20 %	190572118
16	NC_010943	GTCCG	2	10	31713	31722	0 %	20 %	40 %	40 %	190572119
17	NC_010943	CGCCC	2	10	31811	31820	0 %	0 %	20 %	80 %	190572119
18	NC_010943	CAGAA	2	10	34403	34412	60 %	0 %	20 %	20 %	190572123
19	NC_010943	CTTCC	2	10	36110	36119	0 %	40 %	0 %	60 %	190572123
20	NC_010943	GGCTT	2	10	36178	36187	0 %	40 %	40 %	20 %	190572123
21	NC_010943	AGCGT	2	10	36576	36585	20 %	20 %	40 %	20 %	190572123
22	NC_010943	GGCTT	2	10	37138	37147	0 %	40 %	40 %	20 %	190572123
23	NC_010943	CTGGC	2	10	37937	37946	0 %	20 %	40 %	40 %	190572124
24	NC_010943	CGCTT	2	10	39652	39661	0 %	40 %	20 %	40 %	190572125
25	NC_010943	GCCCA	2	10	43205	43214	20 %	0 %	20 %	60 %	190572128
26	NC_010943	CGAAA	2	10	43256	43265	60 %	0 %	20 %	20 %	190572128
27	NC_010943	CTGCC	2	10	44002	44011	0 %	20 %	20 %	60 %	190572128
28	NC_010943	GTGGC	2	10	45681	45690	0 %	20 %	60 %	20 %	190572129
29	NC_010943	AACGA	2	10	47959	47968	60 %	0 %	20 %	20 %	190572130
30	NC_010943	GCAGC	2	10	50064	50073	20 %	0 %	40 %	40 %	190572133
31	NC_010943	AGCGC	2	10	52945	52954	20 %	0 %	40 %	40 %	190572135
32	NC_010943	CACCG	2	10	53168	53177	20 %	0 %	20 %	60 %	190572135
33	NC_010943	TCGAA	2	10	53337	53346	40 %	20 %	20 %	20 %	190572135
34	NC_010943	GGTCG	2	10	54282	54291	0 %	20 %	60 %	20 %	190572136
35	NC_010943	CAGCG	2	10	54794	54803	20 %	0 %	40 %	40 %	190572137
36	NC_010943	GCCAG	2	10	57764	57773	20 %	0 %	40 %	40 %	190572139
37	NC_010943	CGCTG	2	10	58562	58571	0 %	20 %	40 %	40 %	190572139
38	NC_010943	CGCGC	2	10	62955	62964	0 %	0 %	40 %	60 %	190572144
39	NC_010943	CAGCG	2	10	64495	64504	20 %	0 %	40 %	40 %	190572148
40	NC_010943	CCACC	2	10	64998	65007	20 %	0 %	0 %	80 %	190572148
41	NC_010943	GGCGA	2	10	66713	66722	20 %	0 %	60 %	20 %	190572149
42	NC_010943	GCGTG	2	10	67944	67953	0 %	20 %	60 %	20 %	190572150
43	NC_010943	ACCGC	2	10	68237	68246	20 %	0 %	20 %	60 %	190572151
44	NC_010943	CCGTG	2	10	71362	71371	0 %	20 %	40 %	40 %	190572155
45	NC_010943	TGCCC	2	10	72186	72195	0 %	20 %	20 %	60 %	190572156
46	NC_010943	AAGGC	2	10	72735	72744	40 %	0 %	40 %	20 %	190572157
47	NC_010943	GTGGC	2	10	76044	76053	0 %	20 %	60 %	20 %	190572160
48	NC_010943	CACGC	2	10	76925	76934	20 %	0 %	20 %	60 %	190572161
49	NC_010943	GCTCG	2	10	79905	79914	0 %	20 %	40 %	40 %	190572164
50	NC_010943	CTCGG	2	10	80626	80635	0 %	20 %	40 %	40 %	190572164
51	NC_010943	CCGTT	2	10	81074	81083	0 %	40 %	20 %	40 %	190572164
52	NC_010943	CGACC	2	10	81567	81576	20 %	0 %	20 %	60 %	190572164
53	NC_010943	GCTGG	2	10	83651	83660	0 %	20 %	60 %	20 %	190572166
54	NC_010943	CGCAG	2	10	84115	84124	20 %	0 %	40 %	40 %	190572167
55	NC_010943	CACGC	2	10	86835	86844	20 %	0 %	20 %	60 %	190572169
56	NC_010943	AGGGC	2	10	87831	87840	20 %	0 %	60 %	20 %	190572170
57	NC_010943	GCGCC	2	10	88052	88061	0 %	0 %	40 %	60 %	190572171
58	NC_010943	CTGCC	2	10	88695	88704	0 %	20 %	20 %	60 %	190572171
59	NC_010943	AGCAC	2	10	91325	91334	40 %	0 %	20 %	40 %	190572173
60	NC_010943	CTGGC	2	10	93872	93881	0 %	20 %	40 %	40 %	190572176
61	NC_010943	CTGGC	2	10	94427	94436	0 %	20 %	40 %	40 %	190572176
62	NC_010943	GCGCC	2	10	94768	94777	0 %	0 %	40 %	60 %	190572176
63	NC_010943	AGCCG	2	10	95118	95127	20 %	0 %	40 %	40 %	190572176
64	NC_010943	TGGGC	2	10	95874	95883	0 %	20 %	60 %	20 %	190572177
65	NC_010943	TGGCG	2	10	96353	96362	0 %	20 %	60 %	20 %	190572178
66	NC_010943	AGCTG	2	10	97281	97290	20 %	20 %	40 %	20 %	190572179
67	NC_010943	CGCGG	2	10	98463	98472	0 %	0 %	60 %	40 %	190572180
68	NC_010943	GCAGC	2	10	99268	99277	20 %	0 %	40 %	40 %	190572181
69	NC_010943	GACCA	2	10	102040	102049	40 %	0 %	20 %	40 %	190572182
70	NC_010943	GGCGA	2	10	103019	103028	20 %	0 %	60 %	20 %	190572183
71	NC_010943	CTGCG	2	10	104501	104510	0 %	20 %	40 %	40 %	190572184
72	NC_010943	GCGCG	2	10	104982	104991	0 %	0 %	60 %	40 %	190572185
73	NC_010943	CGCTG	2	10	105158	105167	0 %	20 %	40 %	40 %	190572185
74	NC_010943	GAGTG	2	10	108163	108172	20 %	20 %	60 %	0 %	190572187
75	NC_010943	GGCCG	2	10	110338	110347	0 %	0 %	60 %	40 %	190572188
76	NC_010943	AGGCC	2	10	111156	111165	20 %	0 %	40 %	40 %	190572189
77	NC_010943	CACCG	2	10	111583	111592	20 %	0 %	20 %	60 %	190572189
78	NC_010943	CGCGG	2	10	111800	111809	0 %	0 %	60 %	40 %	190572189
79	NC_010943	CGCAG	2	10	113406	113415	20 %	0 %	40 %	40 %	190572189
80	NC_010943	GCGCC	2	10	116112	116121	0 %	0 %	40 %	60 %	190572190
81	NC_010943	GGCCA	2	10	117224	117233	20 %	0 %	40 %	40 %	190572191
82	NC_010943	CAGCG	2	10	118843	118852	20 %	0 %	40 %	40 %	190572193
83	NC_010943	CGCGG	2	10	118969	118978	0 %	0 %	60 %	40 %	190572193
84	NC_010943	GCGAC	2	10	119067	119076	20 %	0 %	40 %	40 %	190572193
85	NC_010943	CGATG	2	10	119185	119194	20 %	20 %	40 %	20 %	190572193
86	NC_010943	CCACG	2	10	119379	119388	20 %	0 %	20 %	60 %	190572193
87	NC_010943	GCGAA	2	10	119973	119982	40 %	0 %	40 %	20 %	190572193
88	NC_010943	CGCTG	2	10	120457	120466	0 %	20 %	40 %	40 %	190572194
89	NC_010943	GATCG	2	10	125446	125455	20 %	20 %	40 %	20 %	190572199
90	NC_010943	CCACC	2	10	126476	126485	20 %	0 %	0 %	80 %	190572200
91	NC_010943	CAGCG	2	10	128445	128454	20 %	0 %	40 %	40 %	190572200
92	NC_010943	GCCGT	2	10	129770	129779	0 %	20 %	40 %	40 %	190572202
93	NC_010943	CGCGC	3	15	129941	129955	0 %	0 %	40 %	60 %	190572202
94	NC_010943	TGCAG	2	10	130316	130325	20 %	20 %	40 %	20 %	190572203
95	NC_010943	GCGCA	2	10	130415	130424	20 %	0 %	40 %	40 %	190572203
96	NC_010943	CATCG	2	10	132003	132012	20 %	20 %	20 %	40 %	190572204
97	NC_010943	ATCGC	2	10	132817	132826	20 %	20 %	20 %	40 %	190572204
98	NC_010943	TGGCC	2	10	133577	133586	0 %	20 %	40 %	40 %	190572204
99	NC_010943	CGCAG	2	10	134343	134352	20 %	0 %	40 %	40 %	190572205
100	NC_010943	TGCGT	2	10	135352	135361	0 %	40 %	40 %	20 %	190572206
101	NC_010943	ACGGC	2	10	136159	136168	20 %	0 %	40 %	40 %	190572207
102	NC_010943	GCCGG	2	10	136403	136412	0 %	0 %	60 %	40 %	190572207
103	NC_010943	GCGCG	2	10	137074	137083	0 %	0 %	60 %	40 %	190572207
104	NC_010943	CACGG	2	10	138778	138787	20 %	0 %	40 %	40 %	190572209
105	NC_010943	CAGCG	2	10	141986	141995	20 %	0 %	40 %	40 %	190572211
106	NC_010943	GCCCA	2	10	148643	148652	20 %	0 %	20 %	60 %	190572215
107	NC_010943	GCAGG	2	10	151866	151875	20 %	0 %	60 %	20 %	190572218
108	NC_010943	GTGCT	2	10	152612	152621	0 %	40 %	40 %	20 %	190572219
109	NC_010943	CGGCG	2	10	152625	152634	0 %	0 %	60 %	40 %	190572219
110	NC_010943	GGCGC	2	10	152951	152960	0 %	0 %	60 %	40 %	190572220
111	NC_010943	CGGCC	2	10	152993	153002	0 %	0 %	40 %	60 %	190572220
112	NC_010943	CGCGG	2	10	153927	153936	0 %	0 %	60 %	40 %	190572221
113	NC_010943	GTGCT	2	10	154091	154100	0 %	40 %	40 %	20 %	190572221
114	NC_010943	CCCGA	2	10	154847	154856	20 %	0 %	20 %	60 %	190572221
115	NC_010943	GCCCG	2	10	155446	155455	0 %	0 %	40 %	60 %	190572221
116	NC_010943	GGCGA	2	10	156317	156326	20 %	0 %	60 %	20 %	190572223
117	NC_010943	GGCCA	2	10	158147	158156	20 %	0 %	40 %	40 %	190572225
118	NC_010943	AGCGC	2	10	158413	158422	20 %	0 %	40 %	40 %	190572225
119	NC_010943	CCTGG	2	10	160238	160247	0 %	20 %	40 %	40 %	190572226
120	NC_010943	CCGGC	2	10	160471	160480	0 %	0 %	40 %	60 %	190572226
121	NC_010943	ACTTC	2	10	161664	161673	20 %	40 %	0 %	40 %	190572228
122	NC_010943	CTGCC	2	10	162542	162551	0 %	20 %	20 %	60 %	190572229
123	NC_010943	ACCTC	2	10	167572	167581	20 %	20 %	0 %	60 %	190572233
124	NC_010943	CTGGC	2	10	168559	168568	0 %	20 %	40 %	40 %	190572234
125	NC_010943	CAGCG	2	10	174584	174593	20 %	0 %	40 %	40 %	190572239
126	NC_010943	GCCGC	2	10	175150	175159	0 %	0 %	40 %	60 %	190572240
127	NC_010943	GTCGC	2	10	175826	175835	0 %	20 %	40 %	40 %	190572241
128	NC_010943	GCGCA	2	10	180033	180042	20 %	0 %	40 %	40 %	190572244
129	NC_010943	TGCGC	2	10	180279	180288	0 %	20 %	40 %	40 %	190572244
130	NC_010943	TTCAG	2	10	180757	180766	20 %	40 %	20 %	20 %	190572245
131	NC_010943	CTGCG	2	10	181357	181366	0 %	20 %	40 %	40 %	190572245
132	NC_010943	CGGGG	2	10	181615	181624	0 %	0 %	80 %	20 %	190572245
133	NC_010943	GCGTG	2	10	181774	181783	0 %	20 %	60 %	20 %	190572246
134	NC_010943	CGGCG	2	10	182449	182458	0 %	0 %	60 %	40 %	190572246
135	NC_010943	GCACG	2	10	184727	184736	20 %	0 %	40 %	40 %	190572251
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143	NC_010943	TGCAA	2	10	191987	191996	40 %	20 %	20 %	20 %	190572260
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174	NC_010943	TGGGC	2	10	219560	219569	0 %	20 %	60 %	20 %	190572283
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253	NC_010943	CGTCG	2	10	320475	320484	0 %	20 %	40 %	40 %	190572383
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255	NC_010943	CGGCG	2	10	321787	321796	0 %	0 %	60 %	40 %	190572385
256	NC_010943	ATCAG	2	10	324455	324464	40 %	20 %	20 %	20 %	190572391
257	NC_010943	GGCGC	2	10	325121	325130	0 %	0 %	60 %	40 %	190572393
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261	NC_010943	GCCAA	2	10	328155	328164	40 %	0 %	20 %	40 %	190572396
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