MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1 chromosome

Total Repeats: 38140

< Previous12...65666768697071727374757677Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38001	NC_010730	AAG	2	6	1831151	1831156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188997669
38002	NC_010730	AGA	2	6	1831179	1831184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188997669
38003	NC_010730	A	6	6	1831272	1831277	100 %	0 %	0 %	0 %	188997669
38004	NC_010730	TCT	2	6	1831321	1831326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188997669
38005	NC_010730	TGA	2	6	1831362	1831367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188997669
38006	NC_010730	AGA	2	6	1831386	1831391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188997669
38007	NC_010730	GATA	2	8	1831392	1831399	50 %	25 %	25 %	0 %	188997669
38008	NC_010730	A	6	6	1831410	1831415	100 %	0 %	0 %	0 %	188997669
38009	NC_010730	TCT	2	6	1831427	1831432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188997669
38010	NC_010730	AAC	2	6	1831444	1831449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188997669
38011	NC_010730	TAA	2	6	1831478	1831483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188997669
38012	NC_010730	GATA	2	8	1831491	1831498	50 %	25 %	25 %	0 %	188997669
38013	NC_010730	AAAG	2	8	1831546	1831553	75 %	0 %	25 %	0 %	188997669
38014	NC_010730	AAG	2	6	1831562	1831567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188997669
38015	NC_010730	A	7	7	1831650	1831656	100 %	0 %	0 %	0 %	188997669
38016	NC_010730	TACC	2	8	1831701	1831708	25 %	25 %	0 %	50 %	188997669
38017	NC_010730	AGA	2	6	1831782	1831787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188997669
38018	NC_010730	TGA	2	6	1831862	1831867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188997669
38019	NC_010730	GAA	2	6	1831984	1831989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188997669
38020	NC_010730	TAG	2	6	1832073	1832078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188997670
38021	NC_010730	A	6	6	1832094	1832099	100 %	0 %	0 %	0 %	188997670
38022	NC_010730	AAAG	2	8	1832196	1832203	75 %	0 %	25 %	0 %	188997670
38023	NC_010730	AGA	2	6	1832218	1832223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188997670
38024	NC_010730	AT	3	6	1832234	1832239	50 %	50 %	0 %	0 %	188997670
38025	NC_010730	AATG	2	8	1832261	1832268	50 %	25 %	25 %	0 %	188997670
38026	NC_010730	TTC	2	6	1832332	1832337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188997671
38027	NC_010730	TAT	2	6	1832484	1832489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188997671
38028	NC_010730	TAA	2	6	1832501	1832506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188997671
38029	NC_010730	AAG	2	6	1832524	1832529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188997671
38030	NC_010730	GAT	3	9	1832550	1832558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188997671
38031	NC_010730	AT	4	8	1832602	1832609	50 %	50 %	0 %	0 %	188997671
38032	NC_010730	ACAG	2	8	1832615	1832622	50 %	0 %	25 %	25 %	188997671
38033	NC_010730	A	6	6	1832646	1832651	100 %	0 %	0 %	0 %	188997671
38034	NC_010730	TAAT	2	8	1832703	1832710	50 %	50 %	0 %	0 %	188997671
38035	NC_010730	CAG	2	6	1832869	1832874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188997672
38036	NC_010730	TATC	2	8	1832893	1832900	25 %	50 %	0 %	25 %	188997672
38037	NC_010730	TTA	2	6	1832905	1832910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188997672
38038	NC_010730	AAT	2	6	1832929	1832934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188997672
38039	NC_010730	T	6	6	1833011	1833016	0 %	100 %	0 %	0 %	188997672
38040	NC_010730	CT	3	6	1833060	1833065	0 %	50 %	0 %	50 %	188997672
38041	NC_010730	AATATC	2	12	1833131	1833142	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	188997672
38042	NC_010730	TACT	2	8	1833169	1833176	25 %	50 %	0 %	25 %	188997672
38043	NC_010730	ATT	2	6	1833216	1833221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188997672
38044	NC_010730	T	8	8	1833220	1833227	0 %	100 %	0 %	0 %	188997672
38045	NC_010730	TC	3	6	1833293	1833298	0 %	50 %	0 %	50 %	188997672
38046	NC_010730	GA	3	6	1833301	1833306	50 %	0 %	50 %	0 %	188997672
38047	NC_010730	ATA	2	6	1833368	1833373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188997672
38048	NC_010730	T	6	6	1833385	1833390	0 %	100 %	0 %	0 %	188997672
38049	NC_010730	T	6	6	1833472	1833477	0 %	100 %	0 %	0 %	188997672
38050	NC_010730	AAT	2	6	1833489	1833494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188997672
38051	NC_010730	T	7	7	1833506	1833512	0 %	100 %	0 %	0 %	188997672
38052	NC_010730	CAG	2	6	1833559	1833564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188997672
38053	NC_010730	GTT	2	6	1833584	1833589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188997672
38054	NC_010730	AATTA	2	10	1833590	1833599	60 %	40 %	0 %	0 %	188997672
38055	NC_010730	ATTT	2	8	1833601	1833608	25 %	75 %	0 %	0 %	188997672
38056	NC_010730	TTTA	2	8	1833617	1833624	25 %	75 %	0 %	0 %	188997672
38057	NC_010730	TC	3	6	1833629	1833634	0 %	50 %	0 %	50 %	188997672
38058	NC_010730	TAT	2	6	1833655	1833660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188997672
38059	NC_010730	T	6	6	1833668	1833673	0 %	100 %	0 %	0 %	188997672
38060	NC_010730	TCA	2	6	1833690	1833695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188997672
38061	NC_010730	AAT	2	6	1833707	1833712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188997672
38062	NC_010730	TCT	3	9	1833717	1833725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188997672
38063	NC_010730	ATT	2	6	1833731	1833736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188997672
38064	NC_010730	ATT	2	6	1833741	1833746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188997672
38065	NC_010730	T	7	7	1833858	1833864	0 %	100 %	0 %	0 %	188997672
38066	NC_010730	TAT	2	6	1833886	1833891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188997672
38067	NC_010730	TA	3	6	1833911	1833916	50 %	50 %	0 %	0 %	188997672
38068	NC_010730	CTT	2	6	1833931	1833936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188997672
38069	NC_010730	AT	3	6	1833949	1833954	50 %	50 %	0 %	0 %	188997672
38070	NC_010730	AGCA	2	8	1834424	1834431	50 %	0 %	25 %	25 %	188997673
38071	NC_010730	GAA	2	6	1834453	1834458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188997673
38072	NC_010730	TGC	3	9	1834518	1834526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188997673
38073	NC_010730	A	6	6	1834572	1834577	100 %	0 %	0 %	0 %	188997673
38074	NC_010730	CAG	2	6	1834646	1834651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188997673
38075	NC_010730	AGA	2	6	1834657	1834662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188997673
38076	NC_010730	GAT	2	6	1834777	1834782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188997673
38077	NC_010730	AGA	2	6	1834797	1834802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188997673
38078	NC_010730	AG	3	6	1834819	1834824	50 %	0 %	50 %	0 %	188997673
38079	NC_010730	CT	3	6	1835020	1835025	0 %	50 %	0 %	50 %	188997673
38080	NC_010730	A	6	6	1835031	1835036	100 %	0 %	0 %	0 %	188997673
38081	NC_010730	TGC	2	6	1835091	1835096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188997673
38082	NC_010730	GAA	2	6	1835101	1835106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188997673
38083	NC_010730	ATT	2	6	1835193	1835198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188997673
38084	NC_010730	CAAA	2	8	1835228	1835235	75 %	0 %	0 %	25 %	188997673
38085	NC_010730	AAT	2	6	1835316	1835321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188997673
38086	NC_010730	A	6	6	1835464	1835469	100 %	0 %	0 %	0 %	188997673
38087	NC_010730	A	6	6	1835482	1835487	100 %	0 %	0 %	0 %	188997673
38088	NC_010730	CAACTG	2	12	1835597	1835608	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	188997673
38089	NC_010730	GAA	2	6	1835629	1835634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188997673
38090	NC_010730	CAAT	2	8	1835675	1835682	50 %	25 %	0 %	25 %	188997673
38091	NC_010730	ACTAT	2	10	1835723	1835732	40 %	40 %	0 %	20 %	188997673
38092	NC_010730	ATA	2	6	1835836	1835841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188997673
38093	NC_010730	AAGC	2	8	1835843	1835850	50 %	0 %	25 %	25 %	188997673
38094	NC_010730	ACA	2	6	1835873	1835878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188997673
38095	NC_010730	TCTT	2	8	1835896	1835903	0 %	75 %	0 %	25 %	188997673
38096	NC_010730	A	7	7	1835935	1835941	100 %	0 %	0 %	0 %	188997674
38097	NC_010730	TTATT	2	10	1835978	1835987	20 %	80 %	0 %	0 %	188997674
38098	NC_010730	GA	3	6	1836053	1836058	50 %	0 %	50 %	0 %	188997674
38099	NC_010730	AAG	2	6	1836176	1836181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188997674
38100	NC_010730	CTTGG	2	10	1836214	1836223	0 %	40 %	40 %	20 %	188997674
38101	NC_010730	ACC	2	6	1836318	1836323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188997674
38102	NC_010730	ATA	2	6	1836355	1836360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188997674
38103	NC_010730	TATG	2	8	1836466	1836473	25 %	50 %	25 %	0 %	188997674
38104	NC_010730	CCTT	2	8	1836483	1836490	0 %	50 %	0 %	50 %	188997674
38105	NC_010730	A	6	6	1836505	1836510	100 %	0 %	0 %	0 %	188997674
38106	NC_010730	TATT	2	8	1836513	1836520	25 %	75 %	0 %	0 %	188997674
38107	NC_010730	ATA	2	6	1836542	1836547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188997674
38108	NC_010730	A	6	6	1836577	1836582	100 %	0 %	0 %	0 %	188997674
38109	NC_010730	TGA	2	6	1836612	1836617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188997674
38110	NC_010730	TA	3	6	1836783	1836788	50 %	50 %	0 %	0 %	188997674
38111	NC_010730	TGC	2	6	1836798	1836803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188997674
38112	NC_010730	A	6	6	1836903	1836908	100 %	0 %	0 %	0 %	188997674
38113	NC_010730	AAC	2	6	1836928	1836933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188997674
38114	NC_010730	GTT	2	6	1836940	1836945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188997674
38115	NC_010730	AT	3	6	1836964	1836969	50 %	50 %	0 %	0 %	188997674
38116	NC_010730	ATT	2	6	1836982	1836987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188997674
38117	NC_010730	AAG	2	6	1837043	1837048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188997674
38118	NC_010730	A	6	6	1837060	1837065	100 %	0 %	0 %	0 %	188997674
38119	NC_010730	TA	3	6	1837072	1837077	50 %	50 %	0 %	0 %	188997674
38120	NC_010730	AAC	2	6	1837089	1837094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188997674
38121	NC_010730	TAG	2	6	1837217	1837222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188997674
38122	NC_010730	TAA	2	6	1837227	1837232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188997674
38123	NC_010730	CAG	2	6	1837252	1837257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188997675
38124	NC_010730	CAAA	2	8	1837279	1837286	75 %	0 %	0 %	25 %	188997675
38125	NC_010730	AAC	2	6	1837307	1837312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188997675
38126	NC_010730	A	6	6	1837338	1837343	100 %	0 %	0 %	0 %	188997675
38127	NC_010730	TGT	2	6	1837472	1837477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188997675
38128	NC_010730	TC	3	6	1837564	1837569	0 %	50 %	0 %	50 %	188997675
38129	NC_010730	TTA	2	6	1837581	1837586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188997675
38130	NC_010730	TA	3	6	1837608	1837613	50 %	50 %	0 %	0 %	188997675
38131	NC_010730	GAT	2	6	1837635	1837640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188997675
38132	NC_010730	TAA	2	6	1837663	1837668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188997675
38133	NC_010730	ATAATT	2	12	1837690	1837701	50 %	50 %	0 %	0 %	188997675
38134	NC_010730	ATT	2	6	1837713	1837718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188997675
38135	NC_010730	CAA	2	6	1837780	1837785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188997675
38136	NC_010730	A	7	7	1837902	1837908	100 %	0 %	0 %	0 %	188997676
38137	NC_010730	CAT	2	6	1837989	1837994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188997676
38138	NC_010730	GAA	2	6	1838000	1838005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188997676
38139	NC_010730	A	7	7	1838088	1838094	100 %	0 %	0 %	0 %	188997676
38140	NC_010730	AAG	2	6	1838109	1838114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188997676

< Previous12...65666768697071727374757677Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.