MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 plasmid pBS512_211

Total Repeats: 273

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010660	CT	3	6	393	398	0 %	50 %	0 %	50 %	187734302
2	NC_010660	TC	4	8	668	675	0 %	50 %	0 %	50 %	187734302
3	NC_010660	GA	3	6	2036	2041	50 %	0 %	50 %	0 %	187734305
4	NC_010660	CT	3	6	2517	2522	0 %	50 %	0 %	50 %	187734305
5	NC_010660	CT	3	6	5359	5364	0 %	50 %	0 %	50 %	187734319
6	NC_010660	TC	4	8	5634	5641	0 %	50 %	0 %	50 %	187734319
7	NC_010660	TG	3	6	7388	7393	0 %	50 %	50 %	0 %	187734373
8	NC_010660	CT	3	6	10546	10551	0 %	50 %	0 %	50 %	187734277
9	NC_010660	TA	3	6	12095	12100	50 %	50 %	0 %	0 %	187734514
10	NC_010660	TG	3	6	12155	12160	0 %	50 %	50 %	0 %	187734514
11	NC_010660	TA	3	6	12557	12562	50 %	50 %	0 %	0 %	187734514
12	NC_010660	AT	3	6	12692	12697	50 %	50 %	0 %	0 %	187734514
13	NC_010660	AT	4	8	13250	13257	50 %	50 %	0 %	0 %	187734514
14	NC_010660	AT	3	6	14430	14435	50 %	50 %	0 %	0 %	187734453
15	NC_010660	AT	3	6	14505	14510	50 %	50 %	0 %	0 %	187734453
16	NC_010660	GC	3	6	15293	15298	0 %	0 %	50 %	50 %	187734487
17	NC_010660	TA	3	6	15669	15674	50 %	50 %	0 %	0 %	187734306
18	NC_010660	AT	3	6	15821	15826	50 %	50 %	0 %	0 %	187734306
19	NC_010660	AT	3	6	15953	15958	50 %	50 %	0 %	0 %	187734306
20	NC_010660	GT	3	6	16175	16180	0 %	50 %	50 %	0 %	187734306
21	NC_010660	TA	4	8	16188	16195	50 %	50 %	0 %	0 %	187734306
22	NC_010660	AC	3	6	19124	19129	50 %	0 %	0 %	50 %	187734441
23	NC_010660	GA	3	6	19430	19435	50 %	0 %	50 %	0 %	187734441
24	NC_010660	TG	3	6	19683	19688	0 %	50 %	50 %	0 %	187734403
25	NC_010660	AT	3	6	23712	23717	50 %	50 %	0 %	0 %	187734502
26	NC_010660	AT	3	6	23720	23725	50 %	50 %	0 %	0 %	187734502
27	NC_010660	AT	3	6	25434	25439	50 %	50 %	0 %	0 %	187734450
28	NC_010660	TC	4	8	28453	28460	0 %	50 %	0 %	50 %	187734510
29	NC_010660	CG	3	6	28682	28687	0 %	0 %	50 %	50 %	187734510
30	NC_010660	TC	3	6	28796	28801	0 %	50 %	0 %	50 %	187734510
31	NC_010660	CG	3	6	30831	30836	0 %	0 %	50 %	50 %	187734365
32	NC_010660	GT	3	6	31029	31034	0 %	50 %	50 %	0 %	187734365
33	NC_010660	GA	3	6	31721	31726	50 %	0 %	50 %	0 %	187734365
34	NC_010660	AG	3	6	32380	32385	50 %	0 %	50 %	0 %	187734461
35	NC_010660	AT	3	6	32531	32536	50 %	50 %	0 %	0 %	187734461
36	NC_010660	AG	3	6	37214	37219	50 %	0 %	50 %	0 %	187734506
37	NC_010660	AT	3	6	39292	39297	50 %	50 %	0 %	0 %	187734397
38	NC_010660	TA	3	6	39534	39539	50 %	50 %	0 %	0 %	187734397
39	NC_010660	AC	3	6	39706	39711	50 %	0 %	0 %	50 %	187734397
40	NC_010660	GA	3	6	39733	39738	50 %	0 %	50 %	0 %	187734397
41	NC_010660	CT	3	6	44814	44819	0 %	50 %	0 %	50 %	187734350
42	NC_010660	CT	3	6	45724	45729	0 %	50 %	0 %	50 %	187734481
43	NC_010660	TC	4	8	45999	46006	0 %	50 %	0 %	50 %	187734481
44	NC_010660	CT	3	6	47617	47622	0 %	50 %	0 %	50 %	187734345
45	NC_010660	TA	3	6	49352	49357	50 %	50 %	0 %	0 %	187734384
46	NC_010660	CG	3	6	49431	49436	0 %	0 %	50 %	50 %	187734384
47	NC_010660	AT	3	6	49473	49478	50 %	50 %	0 %	0 %	187734384
48	NC_010660	AT	3	6	52144	52149	50 %	50 %	0 %	0 %	187734274
49	NC_010660	AT	3	6	53949	53954	50 %	50 %	0 %	0 %	187734415
50	NC_010660	TA	3	6	58274	58279	50 %	50 %	0 %	0 %	187734334
51	NC_010660	AG	3	6	58392	58397	50 %	0 %	50 %	0 %	187734334
52	NC_010660	TA	3	6	60218	60223	50 %	50 %	0 %	0 %	187734276
53	NC_010660	GA	3	6	61367	61372	50 %	0 %	50 %	0 %	187734401
54	NC_010660	TG	3	6	62811	62816	0 %	50 %	50 %	0 %	187734321
55	NC_010660	AT	3	6	63936	63941	50 %	50 %	0 %	0 %	187734398
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57	NC_010660	CG	3	6	64451	64456	0 %	0 %	50 %	50 %	187734346
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59	NC_010660	CA	3	6	64644	64649	50 %	0 %	0 %	50 %	187734346
60	NC_010660	GC	3	6	64867	64872	0 %	0 %	50 %	50 %	187734346
61	NC_010660	TG	3	6	65869	65874	0 %	50 %	50 %	0 %	187734281
62	NC_010660	CT	3	6	66916	66921	0 %	50 %	0 %	50 %	187734505
63	NC_010660	AT	3	6	68310	68315	50 %	50 %	0 %	0 %	187734494
64	NC_010660	TA	4	8	68570	68577	50 %	50 %	0 %	0 %	187734494
65	NC_010660	AT	3	6	69054	69059	50 %	50 %	0 %	0 %	187734494
66	NC_010660	AT	3	6	69394	69399	50 %	50 %	0 %	0 %	187734494
67	NC_010660	GA	3	6	69502	69507	50 %	0 %	50 %	0 %	187734494
68	NC_010660	AT	3	6	69709	69714	50 %	50 %	0 %	0 %	187734494
69	NC_010660	TG	3	6	70223	70228	0 %	50 %	50 %	0 %	187734381
70	NC_010660	GA	3	6	70631	70636	50 %	0 %	50 %	0 %	187734354
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72	NC_010660	TG	3	6	70946	70951	0 %	50 %	50 %	0 %	187734396
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77	NC_010660	CG	3	6	72709	72714	0 %	0 %	50 %	50 %	187734496
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80	NC_010660	CG	3	6	73697	73702	0 %	0 %	50 %	50 %	187734496
81	NC_010660	AT	3	6	74179	74184	50 %	50 %	0 %	0 %	187734496
82	NC_010660	AG	3	6	76120	76125	50 %	0 %	50 %	0 %	187734417
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85	NC_010660	AT	3	6	76785	76790	50 %	50 %	0 %	0 %	187734311
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90	NC_010660	TG	3	6	78861	78866	0 %	50 %	50 %	0 %	187734376
91	NC_010660	CG	3	6	78928	78933	0 %	0 %	50 %	50 %	187734376
92	NC_010660	GC	3	6	79730	79735	0 %	0 %	50 %	50 %	187734317
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104	NC_010660	AT	3	6	99431	99436	50 %	50 %	0 %	0 %	187734483
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109	NC_010660	AT	4	8	101651	101658	50 %	50 %	0 %	0 %	187734298
110	NC_010660	AT	3	6	101694	101699	50 %	50 %	0 %	0 %	187734298
111	NC_010660	TA	4	8	102512	102519	50 %	50 %	0 %	0 %	187734423
112	NC_010660	AT	3	6	102563	102568	50 %	50 %	0 %	0 %	187734423
113	NC_010660	GA	3	6	102825	102830	50 %	0 %	50 %	0 %	187734423
114	NC_010660	AG	3	6	103111	103116	50 %	0 %	50 %	0 %	187734423
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123	NC_010660	TG	3	6	106231	106236	0 %	50 %	50 %	0 %	187734325
124	NC_010660	AT	3	6	106452	106457	50 %	50 %	0 %	0 %	187734325
125	NC_010660	TA	3	6	106461	106466	50 %	50 %	0 %	0 %	187734325
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.