MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 plasmid pBS512_211

Total Repeats: 417

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010660	GCGA	2	8	256	263	25 %	0 %	50 %	25 %	187734302
2	NC_010660	CTTT	2	8	723	730	0 %	75 %	0 %	25 %	187734302
3	NC_010660	CCAT	2	8	975	982	25 %	25 %	0 %	50 %	187734302
4	NC_010660	TCTA	2	8	2067	2074	25 %	50 %	0 %	25 %	187734305
5	NC_010660	ACAA	2	8	2376	2383	75 %	0 %	0 %	25 %	187734305
6	NC_010660	TCTT	2	8	2499	2506	0 %	75 %	0 %	25 %	187734305
7	NC_010660	CGCT	2	8	3278	3285	0 %	25 %	25 %	50 %	187734378
8	NC_010660	TTAT	2	8	3489	3496	25 %	75 %	0 %	0 %	187734378
9	NC_010660	TTGG	2	8	3573	3580	0 %	50 %	50 %	0 %	187734378
10	NC_010660	GCCA	2	8	4562	4569	25 %	0 %	25 %	50 %	187734436
11	NC_010660	CAGC	2	8	4695	4702	25 %	0 %	25 %	50 %	187734436
12	NC_010660	AGGA	2	8	5035	5042	50 %	0 %	50 %	0 %	187734412
13	NC_010660	GCGA	2	8	5222	5229	25 %	0 %	50 %	25 %	187734319
14	NC_010660	CTTT	2	8	5689	5696	0 %	75 %	0 %	25 %	187734319
15	NC_010660	CCAT	2	8	5941	5948	25 %	25 %	0 %	50 %	187734319
16	NC_010660	CCGG	2	8	7663	7670	0 %	0 %	50 %	50 %	187734373
17	NC_010660	CAGC	2	8	8794	8801	25 %	0 %	25 %	50 %	187734407
18	NC_010660	GGAT	2	8	9086	9093	25 %	25 %	50 %	0 %	187734407
19	NC_010660	GTCA	2	8	9253	9260	25 %	25 %	25 %	25 %	187734407
20	NC_010660	CTTT	2	8	9746	9753	0 %	75 %	0 %	25 %	187734407
21	NC_010660	GCGA	2	8	10489	10496	25 %	0 %	50 %	25 %	187734277
22	NC_010660	TATT	2	8	11779	11786	25 %	75 %	0 %	0 %	187734514
23	NC_010660	TGTT	2	8	12739	12746	0 %	75 %	25 %	0 %	187734514
24	NC_010660	AAAT	2	8	13083	13090	75 %	25 %	0 %	0 %	187734514
25	NC_010660	ACAT	2	8	13130	13137	50 %	25 %	0 %	25 %	187734514
26	NC_010660	TTTA	2	8	13454	13461	25 %	75 %	0 %	0 %	187734514
27	NC_010660	CATG	2	8	14357	14364	25 %	25 %	25 %	25 %	187734453
28	NC_010660	CCTG	2	8	15103	15110	0 %	25 %	25 %	50 %	187734487
29	NC_010660	TCAT	2	8	15713	15720	25 %	50 %	0 %	25 %	187734306
30	NC_010660	TCTT	2	8	16052	16059	0 %	75 %	0 %	25 %	187734306
31	NC_010660	ATTG	2	8	17003	17010	25 %	50 %	25 %	0 %	187734323
32	NC_010660	CTGT	2	8	18006	18013	0 %	50 %	25 %	25 %	187734290
33	NC_010660	TACT	2	8	18126	18133	25 %	50 %	0 %	25 %	187734290
34	NC_010660	CAGT	2	8	18194	18201	25 %	25 %	25 %	25 %	187734441
35	NC_010660	ACTG	2	8	18208	18215	25 %	25 %	25 %	25 %	187734441
36	NC_010660	CGTC	2	8	18647	18654	0 %	25 %	25 %	50 %	187734441
37	NC_010660	GCCG	2	8	19904	19911	0 %	0 %	50 %	50 %	187734403
38	NC_010660	CTGG	2	8	20020	20027	0 %	25 %	50 %	25 %	187734347
39	NC_010660	TCCG	2	8	20728	20735	0 %	25 %	25 %	50 %	187734287
40	NC_010660	ATCC	2	8	21273	21280	25 %	25 %	0 %	50 %	187734287
41	NC_010660	ATTC	2	8	21513	21520	25 %	50 %	0 %	25 %	187734287
42	NC_010660	AATA	2	8	23157	23164	75 %	25 %	0 %	0 %	187734502
43	NC_010660	TTTC	2	8	23327	23334	0 %	75 %	0 %	25 %	187734502
44	NC_010660	CAGA	2	8	23759	23766	50 %	0 %	25 %	25 %	187734502
45	NC_010660	AAAT	2	8	25061	25068	75 %	25 %	0 %	0 %	187734450
46	NC_010660	GCCT	2	8	26049	26056	0 %	25 %	25 %	50 %	187734491
47	NC_010660	GGCT	2	8	26147	26154	0 %	25 %	50 %	25 %	187734491
48	NC_010660	TCGC	2	8	28388	28395	0 %	25 %	25 %	50 %	187734510
49	NC_010660	CATT	2	8	28442	28449	25 %	50 %	0 %	25 %	187734510
50	NC_010660	GCTG	2	8	28955	28962	0 %	25 %	50 %	25 %	187734510
51	NC_010660	CTCA	2	8	29450	29457	25 %	25 %	0 %	50 %	187734374
52	NC_010660	TCAG	2	8	29701	29708	25 %	25 %	25 %	25 %	187734374
53	NC_010660	CAGA	2	8	29900	29907	50 %	0 %	25 %	25 %	187734374
54	NC_010660	ATTC	2	8	30538	30545	25 %	50 %	0 %	25 %	187734420
55	NC_010660	TAAG	2	8	30693	30700	50 %	25 %	25 %	0 %	187734365
56	NC_010660	GGAT	2	8	31573	31580	25 %	25 %	50 %	0 %	187734365
57	NC_010660	ACCG	2	8	31889	31896	25 %	0 %	25 %	50 %	187734461
58	NC_010660	ACAG	2	8	32070	32077	50 %	0 %	25 %	25 %	187734461
59	NC_010660	ACGT	2	8	32751	32758	25 %	25 %	25 %	25 %	187734461
60	NC_010660	CTGG	2	8	33228	33235	0 %	25 %	50 %	25 %	187734419
61	NC_010660	GGTT	2	8	33488	33495	0 %	50 %	50 %	0 %	187734419
62	NC_010660	TCCT	2	8	33935	33942	0 %	50 %	0 %	50 %	187734335
63	NC_010660	GCAT	2	8	34206	34213	25 %	25 %	25 %	25 %	187734335
64	NC_010660	TCCA	2	8	34475	34482	25 %	25 %	0 %	50 %	187734335
65	NC_010660	TCCA	2	8	34601	34608	25 %	25 %	0 %	50 %	187734335
66	NC_010660	ACGA	2	8	37307	37314	50 %	0 %	25 %	25 %	187734506
67	NC_010660	AAAT	2	8	38826	38833	75 %	25 %	0 %	0 %	187734397
68	NC_010660	GCAG	2	8	39424	39431	25 %	0 %	50 %	25 %	187734397
69	NC_010660	GTCT	2	8	39842	39849	0 %	50 %	25 %	25 %	187734397
70	NC_010660	GAAA	2	8	39852	39859	75 %	0 %	25 %	0 %	187734397
71	NC_010660	AATA	2	8	40043	40050	75 %	25 %	0 %	0 %	187734397
72	NC_010660	GCAC	2	8	40201	40208	25 %	0 %	25 %	50 %	187734349
73	NC_010660	GCGA	2	8	44757	44764	25 %	0 %	50 %	25 %	187734350
74	NC_010660	GCGA	2	8	45587	45594	25 %	0 %	50 %	25 %	187734481
75	NC_010660	CTTT	2	8	46054	46061	0 %	75 %	0 %	25 %	187734481
76	NC_010660	CCAT	2	8	46306	46313	25 %	25 %	0 %	50 %	187734481
77	NC_010660	CTTC	2	8	46931	46938	0 %	50 %	0 %	50 %	187734338
78	NC_010660	CTTC	2	8	49066	49073	0 %	50 %	0 %	50 %	187734384
79	NC_010660	TTTC	2	8	49660	49667	0 %	75 %	0 %	25 %	187734384
80	NC_010660	TGAC	2	8	49831	49838	25 %	25 %	25 %	25 %	187734384
81	NC_010660	TTTA	2	8	54009	54016	25 %	75 %	0 %	0 %	187734415
82	NC_010660	ACAA	2	8	54777	54784	75 %	0 %	0 %	25 %	187734415
83	NC_010660	GAAT	2	8	55324	55331	50 %	25 %	25 %	0 %	187734415
84	NC_010660	GCAG	2	8	55402	55409	25 %	0 %	50 %	25 %	187734415
85	NC_010660	TGAC	2	8	55560	55567	25 %	25 %	25 %	25 %	187734415
86	NC_010660	AGTT	2	8	55672	55679	25 %	50 %	25 %	0 %	187734353
87	NC_010660	TCTT	2	8	58328	58335	0 %	75 %	0 %	25 %	187734334
88	NC_010660	ATCT	2	8	61153	61160	25 %	50 %	0 %	25 %	187734432
89	NC_010660	TGCA	2	8	61163	61170	25 %	25 %	25 %	25 %	187734432
90	NC_010660	CGAA	2	8	61403	61410	50 %	0 %	25 %	25 %	187734401
91	NC_010660	GCAC	2	8	62174	62181	25 %	0 %	25 %	50 %	187734321
92	NC_010660	CTTC	2	8	62614	62621	0 %	50 %	0 %	50 %	187734321
93	NC_010660	CCAG	2	8	63200	63207	25 %	0 %	25 %	50 %	187734321
94	NC_010660	TCCG	2	8	63275	63282	0 %	25 %	25 %	50 %	187734321
95	NC_010660	ATCC	2	8	64603	64610	25 %	25 %	0 %	50 %	187734346
96	NC_010660	GCCG	2	8	64885	64892	0 %	0 %	50 %	50 %	187734346
97	NC_010660	GGCA	2	8	65391	65398	25 %	0 %	50 %	25 %	187734346
98	NC_010660	CCGC	2	8	65534	65541	0 %	0 %	25 %	75 %	187734346
99	NC_010660	AGGA	2	8	65546	65553	50 %	0 %	50 %	0 %	187734346
100	NC_010660	GCGG	2	8	65589	65596	0 %	0 %	75 %	25 %	187734346
101	NC_010660	TAAT	2	8	66430	66437	50 %	50 %	0 %	0 %	187734505
102	NC_010660	ACAA	2	8	66561	66568	75 %	0 %	0 %	25 %	187734505
103	NC_010660	TCTG	2	8	66844	66851	0 %	50 %	25 %	25 %	187734505
104	NC_010660	TTCC	2	8	67006	67013	0 %	50 %	0 %	50 %	187734505
105	NC_010660	ATAA	2	8	67247	67254	75 %	25 %	0 %	0 %	187734505
106	NC_010660	TGTC	2	8	67314	67321	0 %	50 %	25 %	25 %	187734505
107	NC_010660	CAGT	2	8	67393	67400	25 %	25 %	25 %	25 %	187734505
108	NC_010660	AATA	2	8	67639	67646	75 %	25 %	0 %	0 %	187734505
109	NC_010660	TCAC	2	8	67677	67684	25 %	25 %	0 %	50 %	187734505
110	NC_010660	GACA	2	8	67786	67793	50 %	0 %	25 %	25 %	187734505
111	NC_010660	TTTA	2	8	67919	67926	25 %	75 %	0 %	0 %	187734505
112	NC_010660	GAAA	2	8	68607	68614	75 %	0 %	25 %	0 %	187734494
113	NC_010660	ATGT	2	8	69643	69650	25 %	50 %	25 %	0 %	187734494
114	NC_010660	GGCG	2	8	70440	70447	0 %	0 %	75 %	25 %	187734381
115	NC_010660	CCAG	2	8	70745	70752	25 %	0 %	25 %	50 %	187734354
116	NC_010660	CATC	2	8	71955	71962	25 %	25 %	0 %	50 %	187734427
117	NC_010660	TATT	2	8	72323	72330	25 %	75 %	0 %	0 %	187734427
118	NC_010660	TCGA	2	8	73768	73775	25 %	25 %	25 %	25 %	187734496
119	NC_010660	CGCC	2	8	73796	73803	0 %	0 %	25 %	75 %	187734496
120	NC_010660	AATT	2	8	74013	74020	50 %	50 %	0 %	0 %	187734496
121	NC_010660	ATTT	2	8	74084	74091	25 %	75 %	0 %	0 %	187734496
122	NC_010660	GCCA	2	8	74520	74527	25 %	0 %	25 %	50 %	187734496
123	NC_010660	TCTG	2	8	76692	76699	0 %	50 %	25 %	25 %	187734417
124	NC_010660	ATTA	2	8	76804	76811	50 %	50 %	0 %	0 %	187734311
125	NC_010660	GACG	2	8	78210	78217	25 %	0 %	50 %	25 %	187734416
126	NC_010660	CAGT	2	8	78649	78656	25 %	25 %	25 %	25 %	187734416
127	NC_010660	ACTG	2	8	78663	78670	25 %	25 %	25 %	25 %	187734416
128	NC_010660	GGAT	2	8	78774	78781	25 %	25 %	50 %	0 %	187734376
129	NC_010660	ACGA	2	8	80131	80138	50 %	0 %	25 %	25 %	187734511
130	NC_010660	CCAT	2	8	80155	80162	25 %	25 %	0 %	50 %	187734511
131	NC_010660	GACT	2	8	80191	80198	25 %	25 %	25 %	25 %	187734511
132	NC_010660	GCTG	2	8	80920	80927	0 %	25 %	50 %	25 %	187734511
133	NC_010660	GGCA	2	8	81001	81008	25 %	0 %	50 %	25 %	187734511
134	NC_010660	CTGA	2	8	82633	82640	25 %	25 %	25 %	25 %	187734428
135	NC_010660	CTGC	2	8	82825	82832	0 %	25 %	25 %	50 %	187734428
136	NC_010660	GTTC	2	8	82912	82919	0 %	50 %	25 %	25 %	187734428
137	NC_010660	ACAA	2	8	83396	83403	75 %	0 %	0 %	25 %	187734428
138	NC_010660	GAAT	2	8	83943	83950	50 %	25 %	25 %	0 %	187734428
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140	NC_010660	TGAC	2	8	84179	84186	25 %	25 %	25 %	25 %	187734428
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407	NC_010660	TATT	2	8	206699	206706	25 %	75 %	0 %	0 %	187734364
408	NC_010660	TATC	2	8	206826	206833	25 %	50 %	0 %	25 %	187734360
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.