MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 plasmid pBS512_211

Total Repeats: 1907

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010660	TGC	2	6	326	331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734302
2	NC_010660	CCG	2	6	427	432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734302
3	NC_010660	TTC	2	6	435	440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734302
4	NC_010660	GAC	2	6	525	530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734302
5	NC_010660	GCG	2	6	548	553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734302
6	NC_010660	GCC	2	6	599	604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734302
7	NC_010660	CAG	2	6	639	644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734302
8	NC_010660	CAG	2	6	684	689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734302
9	NC_010660	CAG	2	6	772	777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734302
10	NC_010660	AGC	2	6	873	878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734302
11	NC_010660	CGA	2	6	888	893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734302
12	NC_010660	ATC	2	6	950	955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734302
13	NC_010660	GAC	2	6	961	966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734302
14	NC_010660	GCG	2	6	968	973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734302
15	NC_010660	GAT	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734512
16	NC_010660	ATA	2	6	1975	1980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734305
17	NC_010660	TCA	2	6	1996	2001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734305
18	NC_010660	AGC	2	6	2016	2021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734305
19	NC_010660	ATG	2	6	2060	2065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734305
20	NC_010660	ACA	2	6	2082	2087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734305
21	NC_010660	TAA	2	6	2204	2209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734305
22	NC_010660	ATG	3	9	2213	2221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734305
23	NC_010660	TGC	3	9	2232	2240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734305
24	NC_010660	TAA	2	6	2301	2306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734305
25	NC_010660	TCA	2	6	2340	2345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734305
26	NC_010660	CTG	2	6	2489	2494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734305
27	NC_010660	CTG	2	6	2687	2692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734305
28	NC_010660	AAG	2	6	2712	2717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734305
29	NC_010660	TAT	2	6	2736	2741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734305
30	NC_010660	TAA	2	6	2742	2747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734305
31	NC_010660	TCT	2	6	3106	3111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734378
32	NC_010660	CAA	2	6	3182	3187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734378
33	NC_010660	CCG	2	6	3215	3220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734378
34	NC_010660	AGT	2	6	3238	3243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734378
35	NC_010660	TAC	2	6	3326	3331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734378
36	NC_010660	GTT	2	6	3406	3411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734378
37	NC_010660	TAC	2	6	3420	3425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734378
38	NC_010660	GTT	2	6	3725	3730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734378
39	NC_010660	ATA	2	6	3741	3746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734378
40	NC_010660	GAA	2	6	3791	3796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734378
41	NC_010660	CAC	2	6	3909	3914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734482
42	NC_010660	TTA	2	6	3985	3990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734482
43	NC_010660	TGC	2	6	3991	3996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734482
44	NC_010660	GAT	2	6	4007	4012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734482
45	NC_010660	TGT	2	6	4468	4473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734436
46	NC_010660	CAG	2	6	4602	4607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734436
47	NC_010660	AGA	2	6	4612	4617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734436
48	NC_010660	TCC	2	6	4667	4672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187734436
49	NC_010660	CAC	2	6	5012	5017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734412
50	NC_010660	CAT	2	6	5085	5090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734412
51	NC_010660	TGC	2	6	5292	5297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734319
52	NC_010660	CCG	2	6	5393	5398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734319
53	NC_010660	TTC	2	6	5401	5406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734319
54	NC_010660	GAC	2	6	5491	5496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734319
55	NC_010660	GCG	2	6	5514	5519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734319
56	NC_010660	GCC	2	6	5565	5570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734319
57	NC_010660	CAG	2	6	5605	5610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734319
58	NC_010660	CAG	2	6	5650	5655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734319
59	NC_010660	CAG	2	6	5738	5743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734319
60	NC_010660	AGC	2	6	5839	5844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734319
61	NC_010660	CGA	2	6	5854	5859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734319
62	NC_010660	ATC	2	6	5916	5921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734319
63	NC_010660	GAC	2	6	5927	5932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734319
64	NC_010660	GCG	2	6	5934	5939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734319
65	NC_010660	TAG	2	6	7397	7402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734373
66	NC_010660	AAC	2	6	7448	7453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734373
67	NC_010660	GTT	2	6	7555	7560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734373
68	NC_010660	GCT	2	6	7580	7585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734373
69	NC_010660	GCT	2	6	7597	7602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734373
70	NC_010660	CAC	3	9	7633	7641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734373
71	NC_010660	TCC	2	6	7782	7787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187734373
72	NC_010660	CCG	2	6	7823	7828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734373
73	NC_010660	CAG	2	6	8578	8583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734407
74	NC_010660	CTC	2	6	8595	8600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187734407
75	NC_010660	ATC	2	6	8695	8700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734407
76	NC_010660	CAG	2	6	8815	8820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734407
77	NC_010660	GCT	2	6	8853	8858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734407
78	NC_010660	CCG	2	6	8859	8864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734407
79	NC_010660	TCC	2	6	8921	8926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187734407
80	NC_010660	CGG	2	6	8969	8974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734407
81	NC_010660	GGC	2	6	8989	8994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734407
82	NC_010660	CCG	2	6	9126	9131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734407
83	NC_010660	GTC	2	6	9157	9162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734407
84	NC_010660	TCA	2	6	9233	9238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734407
85	NC_010660	CTT	2	6	9279	9284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734407
86	NC_010660	GCA	2	6	9304	9309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734407
87	NC_010660	CAG	2	6	9328	9333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734407
88	NC_010660	GGC	2	6	9357	9362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734407
89	NC_010660	CAG	2	6	9427	9432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734407
90	NC_010660	CGG	2	6	9570	9575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734407
91	NC_010660	GCA	2	6	9616	9621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734407
92	NC_010660	GCA	2	6	9633	9638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734407
93	NC_010660	GTC	2	6	9718	9723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734407
94	NC_010660	ACG	2	6	9790	9795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734407
95	NC_010660	CAG	2	6	9895	9900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734407
96	NC_010660	CCT	2	6	9915	9920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187734407
97	NC_010660	GCT	2	6	9967	9972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734407
98	NC_010660	ACA	2	6	10026	10031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734393
99	NC_010660	GCC	2	6	10062	10067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734393
100	NC_010660	CAG	2	6	10171	10176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734393
101	NC_010660	CGT	2	6	10273	10278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734393
102	NC_010660	GCC	2	6	10289	10294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734393
103	NC_010660	ATC	2	6	10367	10372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734393
104	NC_010660	CAG	2	6	10389	10394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734277
105	NC_010660	GAA	2	6	10552	10557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734277
106	NC_010660	AGC	2	6	10564	10569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734277
107	NC_010660	TTG	2	6	10584	10589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734277
108	NC_010660	AAC	2	6	10600	10605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734277
109	NC_010660	AGG	2	6	10664	10669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187734277
110	NC_010660	GCT	2	6	10679	10684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734277
111	NC_010660	GGA	2	6	10696	10701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187734277
112	NC_010660	ACT	2	6	10768	10773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734277
113	NC_010660	GCG	2	6	10927	10932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734400
114	NC_010660	ATT	2	6	11068	11073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734400
115	NC_010660	CAA	2	6	11363	11368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734322
116	NC_010660	GCC	2	6	11375	11380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734322
117	NC_010660	ACC	2	6	11426	11431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734322
118	NC_010660	GAT	2	6	11470	11475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734322
119	NC_010660	CGA	2	6	11502	11507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734322
120	NC_010660	GAA	2	6	11558	11563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734322
121	NC_010660	ATC	2	6	11593	11598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734322
122	NC_010660	GGT	2	6	11665	11670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734322
123	NC_010660	TCT	2	6	11809	11814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734514
124	NC_010660	TAT	2	6	11861	11866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734514
125	NC_010660	TAC	2	6	11903	11908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734514
126	NC_010660	TTA	2	6	11937	11942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734514
127	NC_010660	ATA	2	6	12082	12087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734514
128	NC_010660	AAC	2	6	12180	12185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734514
129	NC_010660	AAT	2	6	12201	12206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734514
130	NC_010660	ACT	2	6	12221	12226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734514
131	NC_010660	TTA	2	6	12237	12242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734514
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133	NC_010660	AAT	2	6	12527	12532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734514
134	NC_010660	ATA	2	6	12658	12663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734514
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146	NC_010660	ATA	2	6	14250	14255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734453
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250	NC_010660	CAA	2	6	28052	28057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734442
251	NC_010660	GCC	2	6	28275	28280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734510
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253	NC_010660	CTG	2	6	28298	28303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734510
254	NC_010660	GAC	2	6	28508	28513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734510
255	NC_010660	TGT	2	6	28595	28600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734510
256	NC_010660	CTT	2	6	28665	28670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734510
257	NC_010660	TGG	2	6	28671	28676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734510
258	NC_010660	AGC	2	6	29030	29035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734510
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