MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 plasmid pBS512_211

Total Repeats: 3099

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010660	A	6	6	202426	202431	100 %	0 %	0 %	0 %	187734410
3002	NC_010660	CTG	2	6	202440	202445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734474
3003	NC_010660	CAT	2	6	202536	202541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734474
3004	NC_010660	GAA	2	6	202583	202588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734474
3005	NC_010660	GTT	2	6	202652	202657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734474
3006	NC_010660	TTAC	2	8	202840	202847	25 %	50 %	0 %	25 %	187734474
3007	NC_010660	TCA	2	6	202882	202887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734474
3008	NC_010660	GTAT	2	8	203027	203034	25 %	50 %	25 %	0 %	187734474
3009	NC_010660	AC	3	6	203044	203049	50 %	0 %	0 %	50 %	187734474
3010	NC_010660	GTGG	2	8	203207	203214	0 %	25 %	75 %	0 %	187734474
3011	NC_010660	CGA	2	6	203229	203234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734474
3012	NC_010660	CTC	2	6	203257	203262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187734474
3013	NC_010660	GCAGAA	2	12	203265	203276	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	187734474
3014	NC_010660	TTA	2	6	203282	203287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734474
3015	NC_010660	GAT	2	6	203304	203309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734474
3016	NC_010660	CCGC	2	8	203392	203399	0 %	0 %	25 %	75 %	187734324
3017	NC_010660	AGGA	2	8	203404	203411	50 %	0 %	50 %	0 %	187734324
3018	NC_010660	GCGG	2	8	203447	203454	0 %	0 %	75 %	25 %	187734324
3019	NC_010660	CAC	3	9	203465	203473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734324
3020	NC_010660	ACG	2	6	203521	203526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734489
3021	NC_010660	AGG	2	6	203607	203612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187734489
3022	NC_010660	ATT	2	6	203656	203661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734489
3023	NC_010660	TG	3	6	203727	203732	0 %	50 %	50 %	0 %	187734489
3024	NC_010660	GCC	2	6	203796	203801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734418
3025	NC_010660	TGA	2	6	204082	204087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734476
3026	NC_010660	TGC	2	6	204109	204114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734476
3027	NC_010660	TCA	2	6	204144	204149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734476
3028	NC_010660	AACG	2	8	204212	204219	50 %	0 %	25 %	25 %	187734476
3029	NC_010660	TTA	2	6	204231	204236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734476
3030	NC_010660	AAAT	2	8	204305	204312	75 %	25 %	0 %	0 %	187734476
3031	NC_010660	TTG	2	6	204328	204333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734301
3032	NC_010660	CGTT	2	8	204437	204444	0 %	50 %	25 %	25 %	187734301
3033	NC_010660	GGA	2	6	204453	204458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187734301
3034	NC_010660	TAC	2	6	204478	204483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734301
3035	NC_010660	TGT	2	6	204558	204563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734301
3036	NC_010660	CTA	2	6	204622	204627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734301
3037	NC_010660	TGA	3	9	204699	204707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734301
3038	NC_010660	GTTTTG	2	12	204728	204739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734301
3039	NC_010660	TCAG	2	8	204741	204748	25 %	25 %	25 %	25 %	187734301
3040	NC_010660	AGTCTG	2	12	204777	204788	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	187734301
3041	NC_010660	A	7	7	204955	204961	100 %	0 %	0 %	0 %	187734488
3042	NC_010660	GTT	2	6	205003	205008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734488
3043	NC_010660	GCC	2	6	205033	205038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734488
3044	NC_010660	AAC	2	6	205082	205087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734488
3045	NC_010660	TGA	2	6	205092	205097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734488
3046	NC_010660	A	6	6	205203	205208	100 %	0 %	0 %	0 %	187734488
3047	NC_010660	TCAT	2	8	206092	206099	25 %	50 %	0 %	25 %	187734364
3048	NC_010660	CTAT	2	8	206113	206120	25 %	50 %	0 %	25 %	187734364
3049	NC_010660	AAT	3	9	206163	206171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734364
3050	NC_010660	TC	3	6	206225	206230	0 %	50 %	0 %	50 %	187734364
3051	NC_010660	ACA	2	6	206299	206304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734364
3052	NC_010660	TA	3	6	206307	206312	50 %	50 %	0 %	0 %	187734364
3053	NC_010660	A	6	6	206314	206319	100 %	0 %	0 %	0 %	187734364
3054	NC_010660	CTTC	2	8	206452	206459	0 %	50 %	0 %	50 %	187734364
3055	NC_010660	GTC	2	6	206537	206542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734364
3056	NC_010660	TAA	2	6	206555	206560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734364
3057	NC_010660	CTC	2	6	206562	206567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187734364
3058	NC_010660	CTT	2	6	206610	206615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734364
3059	NC_010660	AT	3	6	206619	206624	50 %	50 %	0 %	0 %	187734364
3060	NC_010660	TA	3	6	206679	206684	50 %	50 %	0 %	0 %	187734364
3061	NC_010660	TATT	2	8	206699	206706	25 %	75 %	0 %	0 %	187734364
3062	NC_010660	TATC	2	8	206826	206833	25 %	50 %	0 %	25 %	187734360
3063	NC_010660	GGC	2	6	206908	206913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734360
3064	NC_010660	TAT	2	6	207257	207262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734455
3065	NC_010660	CAT	2	6	207302	207307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734455
3066	NC_010660	CAC	2	6	207308	207313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734455
3067	NC_010660	CAAC	2	8	207320	207327	50 %	0 %	0 %	50 %	187734455
3068	NC_010660	AGT	2	6	207360	207365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734455
3069	NC_010660	AGG	2	6	207942	207947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187734337
3070	NC_010660	TGA	2	6	207990	207995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734337
3071	NC_010660	GTT	2	6	208013	208018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734337
3072	NC_010660	TGAT	2	8	208036	208043	25 %	50 %	25 %	0 %	187734337
3073	NC_010660	A	6	6	208315	208320	100 %	0 %	0 %	0 %	187734391
3074	NC_010660	TAC	2	6	208380	208385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734391
3075	NC_010660	ACTA	2	8	208396	208403	50 %	25 %	0 %	25 %	187734391
3076	NC_010660	CAAAA	2	10	208461	208470	80 %	0 %	0 %	20 %	187734391
3077	NC_010660	ATC	2	6	208481	208486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734391
3078	NC_010660	AAGG	2	8	208489	208496	50 %	0 %	50 %	0 %	187734391
3079	NC_010660	G	6	6	208495	208500	0 %	0 %	100 %	0 %	187734391
3080	NC_010660	ACTGG	2	10	208515	208524	20 %	20 %	40 %	20 %	187734391
3081	NC_010660	ACT	2	6	208606	208611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734391
3082	NC_010660	AGCA	2	8	208626	208633	50 %	0 %	25 %	25 %	187734391
3083	NC_010660	GACC	2	8	208677	208684	25 %	0 %	25 %	50 %	187734391
3084	NC_010660	GGTT	2	8	208744	208751	0 %	50 %	50 %	0 %	187734391
3085	NC_010660	AAT	2	6	208756	208761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734391
3086	NC_010660	AG	3	6	208797	208802	50 %	0 %	50 %	0 %	187734391
3087	NC_010660	GGGA	2	8	208824	208831	25 %	0 %	75 %	0 %	187734391
3088	NC_010660	G	6	6	208852	208857	0 %	0 %	100 %	0 %	187734391
3089	NC_010660	A	6	6	208867	208872	100 %	0 %	0 %	0 %	187734391
3090	NC_010660	GTG	2	6	208886	208891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734391
3091	NC_010660	GTTC	2	8	209002	209009	0 %	50 %	25 %	25 %	187734391
3092	NC_010660	A	6	6	209061	209066	100 %	0 %	0 %	0 %	187734391
3093	NC_010660	TGC	2	6	209085	209090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734391
3094	NC_010660	TA	3	6	209128	209133	50 %	50 %	0 %	0 %	187734391
3095	NC_010660	TAA	2	6	209157	209162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734391
3096	NC_010660	A	6	6	209161	209166	100 %	0 %	0 %	0 %	187734391
3097	NC_010660	AT	3	6	209198	209203	50 %	50 %	0 %	0 %	187734391
3098	NC_010660	AT	3	6	209235	209240	50 %	50 %	0 %	0 %	187734391
3099	NC_010660	T	6	6	209273	209278	0 %	100 %	0 %	0 %	187734391

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