MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 plasmid pBS512_211

Total Repeats: 3099

< Previous1234567Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_010660	TTGA	2	8	128586	128593	25 %	50 %	25 %	0 %	187734451
2002	NC_010660	AT	3	6	128597	128602	50 %	50 %	0 %	0 %	187734451
2003	NC_010660	GAT	2	6	128618	128623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734451
2004	NC_010660	TAA	2	6	128656	128661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734394
2005	NC_010660	TTTA	2	8	128667	128674	25 %	75 %	0 %	0 %	187734394
2006	NC_010660	ACAG	2	8	128740	128747	50 %	0 %	25 %	25 %	187734394
2007	NC_010660	CTT	2	6	128816	128821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734394
2008	NC_010660	ATGGT	2	10	128827	128836	20 %	40 %	40 %	0 %	187734394
2009	NC_010660	AAT	2	6	128863	128868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734394
2010	NC_010660	TTAA	2	8	128873	128880	50 %	50 %	0 %	0 %	187734394
2011	NC_010660	T	8	8	128951	128958	0 %	100 %	0 %	0 %	187734285
2012	NC_010660	ATT	2	6	128970	128975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734285
2013	NC_010660	TTTC	2	8	128976	128983	0 %	75 %	0 %	25 %	187734285
2014	NC_010660	TTG	2	6	129041	129046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734285
2015	NC_010660	ATTA	2	8	129054	129061	50 %	50 %	0 %	0 %	187734285
2016	NC_010660	TTC	2	6	129084	129089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734285
2017	NC_010660	TTG	2	6	129131	129136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734285
2018	NC_010660	CCT	2	6	129138	129143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187734285
2019	NC_010660	TC	3	6	129144	129149	0 %	50 %	0 %	50 %	187734285
2020	NC_010660	ATT	2	6	129196	129201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734285
2021	NC_010660	TAG	2	6	129225	129230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734285
2022	NC_010660	T	6	6	129287	129292	0 %	100 %	0 %	0 %	187734285
2023	NC_010660	GTG	2	6	129314	129319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734285
2024	NC_010660	AT	3	6	129359	129364	50 %	50 %	0 %	0 %	187734285
2025	NC_010660	TAT	2	6	129497	129502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734285
2026	NC_010660	TAT	2	6	129570	129575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734285
2027	NC_010660	TTC	2	6	129585	129590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734285
2028	NC_010660	A	6	6	129700	129705	100 %	0 %	0 %	0 %	187734501
2029	NC_010660	A	7	7	129720	129726	100 %	0 %	0 %	0 %	187734501
2030	NC_010660	ATTTAA	2	12	129735	129746	50 %	50 %	0 %	0 %	187734501
2031	NC_010660	GTT	2	6	129760	129765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734501
2032	NC_010660	ATT	2	6	129766	129771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734501
2033	NC_010660	TAA	2	6	129839	129844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734501
2034	NC_010660	T	6	6	129877	129882	0 %	100 %	0 %	0 %	187734501
2035	NC_010660	T	6	6	129898	129903	0 %	100 %	0 %	0 %	187734501
2036	NC_010660	T	7	7	129923	129929	0 %	100 %	0 %	0 %	187734501
2037	NC_010660	CAAA	2	8	129964	129971	75 %	0 %	0 %	25 %	187734501
2038	NC_010660	GATT	2	8	129999	130006	25 %	50 %	25 %	0 %	187734501
2039	NC_010660	A	8	8	130035	130042	100 %	0 %	0 %	0 %	187734501
2040	NC_010660	CTT	2	6	130087	130092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734501
2041	NC_010660	ATT	2	6	130093	130098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734501
2042	NC_010660	AAC	2	6	130107	130112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734501
2043	NC_010660	T	6	6	130145	130150	0 %	100 %	0 %	0 %	187734501
2044	NC_010660	G	8	8	130190	130197	0 %	0 %	100 %	0 %	187734501
2045	NC_010660	ATA	2	6	130210	130215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734501
2046	NC_010660	TTA	2	6	130244	130249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734501
2047	NC_010660	ATG	3	9	130291	130299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734501
2048	NC_010660	AT	3	6	130323	130328	50 %	50 %	0 %	0 %	187734501
2049	NC_010660	TATT	2	8	130461	130468	25 %	75 %	0 %	0 %	187734501
2050	NC_010660	TC	3	6	130501	130506	0 %	50 %	0 %	50 %	187734501
2051	NC_010660	TA	3	6	130598	130603	50 %	50 %	0 %	0 %	187734501
2052	NC_010660	TTG	2	6	130625	130630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734501
2053	NC_010660	TAA	2	6	130696	130701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734501
2054	NC_010660	TAA	2	6	130737	130742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734449
2055	NC_010660	CAT	2	6	130782	130787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734449
2056	NC_010660	CAA	2	6	130833	130838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734449
2057	NC_010660	ATA	2	6	130843	130848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734449
2058	NC_010660	A	6	6	130931	130936	100 %	0 %	0 %	0 %	187734449
2059	NC_010660	TGA	2	6	130941	130946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734449
2060	NC_010660	TCAT	2	8	130954	130961	25 %	50 %	0 %	25 %	187734449
2061	NC_010660	CAG	2	6	132467	132472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734315
2062	NC_010660	CTC	2	6	132484	132489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187734315
2063	NC_010660	CCGAA	2	10	132496	132505	40 %	0 %	20 %	40 %	187734315
2064	NC_010660	CAGCC	2	10	132574	132583	20 %	0 %	20 %	60 %	187734315
2065	NC_010660	ATC	2	6	132584	132589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734315
2066	NC_010660	CAGC	2	8	132683	132690	25 %	0 %	25 %	50 %	187734315
2067	NC_010660	CAG	2	6	132704	132709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734315
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2069	NC_010660	CCG	2	6	132748	132753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734315
2070	NC_010660	TCC	2	6	132810	132815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187734315
2071	NC_010660	CGG	2	6	132858	132863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734315
2072	NC_010660	GGC	2	6	132878	132883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734315
2073	NC_010660	GGAT	2	8	132975	132982	25 %	25 %	50 %	0 %	187734315
2074	NC_010660	CCG	2	6	133015	133020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734315
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2082	NC_010660	CAG	2	6	133316	133321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734315
2083	NC_010660	CGG	2	6	133459	133464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734315
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2085	NC_010660	GCA	2	6	133522	133527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734315
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2087	NC_010660	GTC	2	6	133607	133612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734315
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2089	NC_010660	ACG	2	6	133679	133684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734315
2090	NC_010660	CAG	2	6	133784	133789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734315
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2092	NC_010660	GCT	2	6	133856	133861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734315
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2095	NC_010660	CAG	2	6	134060	134065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734283
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2100	NC_010660	GCGA	2	8	134378	134385	25 %	0 %	50 %	25 %	187734292
2101	NC_010660	CT	3	6	134435	134440	0 %	50 %	0 %	50 %	187734292
2102	NC_010660	GAA	2	6	134441	134446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734292
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2104	NC_010660	TTG	2	6	134473	134478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734292
2105	NC_010660	AAC	2	6	134489	134494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734292
2106	NC_010660	AGG	2	6	134553	134558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187734292
2107	NC_010660	GCT	2	6	134568	134573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734292
2108	NC_010660	GGA	2	6	134585	134590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187734292
2109	NC_010660	CGGCTT	2	12	134786	134797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734357
2110	NC_010660	ATT	2	6	134833	134838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734357
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2112	NC_010660	AT	3	6	135670	135675	50 %	50 %	0 %	0 %	187734300
2113	NC_010660	AC	3	6	135683	135688	50 %	0 %	0 %	50 %	187734300
2114	NC_010660	GGT	2	6	135719	135724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734300
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2116	NC_010660	TAG	2	6	135798	135803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734300
2117	NC_010660	G	6	6	135836	135841	0 %	0 %	100 %	0 %	187734300
2118	NC_010660	GCA	2	6	135945	135950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734300
2119	NC_010660	AAC	2	6	136083	136088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734367
2120	NC_010660	CGG	2	6	136141	136146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734367
2121	NC_010660	CTT	2	6	136152	136157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734367
2122	NC_010660	GCA	2	6	136159	136164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734445
2123	NC_010660	GTT	2	6	136167	136172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734445
2124	NC_010660	GACA	2	8	136189	136196	50 %	0 %	25 %	25 %	187734445
2125	NC_010660	CAC	2	6	136201	136206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734445
2126	NC_010660	GCA	2	6	136210	136215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734445
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2369	NC_010660	GTT	2	6	153191	153196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734313
2370	NC_010660	CTT	2	6	153242	153247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734313
2371	NC_010660	TGC	2	6	153370	153375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734467
2372	NC_010660	ATG	2	6	153395	153400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734467
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2472	NC_010660	ATA	2	6	161420	161425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734303
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2490	NC_010660	TAA	2	6	162013	162018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734379
2491	NC_010660	A	6	6	162066	162071	100 %	0 %	0 %	0 %	187734452
2492	NC_010660	A	6	6	162102	162107	100 %	0 %	0 %	0 %	187734452
2493	NC_010660	ACAG	2	8	162112	162119	50 %	0 %	25 %	25 %	187734452
2494	NC_010660	AAT	2	6	162126	162131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734452
2495	NC_010660	ATT	2	6	162167	162172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734452
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2499	NC_010660	CCG	2	6	162419	162424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734278
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