MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 plasmid pBS512_211

Total Repeats: 3099

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010660	ATG	2	6	76172	76177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734417
1002	NC_010660	CTT	2	6	76191	76196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734417
1003	NC_010660	T	7	7	76216	76222	0 %	100 %	0 %	0 %	187734417
1004	NC_010660	T	8	8	76238	76245	0 %	100 %	0 %	0 %	187734417
1005	NC_010660	AGC	2	6	76286	76291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734417
1006	NC_010660	ACC	2	6	76344	76349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734417
1007	NC_010660	AGT	2	6	76364	76369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734417
1008	NC_010660	AC	3	6	76467	76472	50 %	0 %	0 %	50 %	187734417
1009	NC_010660	TGA	2	6	76523	76528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734417
1010	NC_010660	AAT	2	6	76555	76560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734417
1011	NC_010660	GCT	2	6	76597	76602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734417
1012	NC_010660	AAT	2	6	76606	76611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734417
1013	NC_010660	TCTG	2	8	76692	76699	0 %	50 %	25 %	25 %	187734417
1014	NC_010660	AT	3	6	76775	76780	50 %	50 %	0 %	0 %	187734311
1015	NC_010660	AT	3	6	76785	76790	50 %	50 %	0 %	0 %	187734311
1016	NC_010660	ATTA	2	8	76804	76811	50 %	50 %	0 %	0 %	187734311
1017	NC_010660	AAT	2	6	76838	76843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734311
1018	NC_010660	CAA	2	6	76853	76858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734311
1019	NC_010660	T	7	7	77328	77334	0 %	100 %	0 %	0 %	187734416
1020	NC_010660	TC	3	6	77429	77434	0 %	50 %	0 %	50 %	187734416
1021	NC_010660	TTGCC	2	10	77436	77445	0 %	40 %	20 %	40 %	187734416
1022	NC_010660	ATG	2	6	77491	77496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734416
1023	NC_010660	TTG	2	6	77507	77512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734416
1024	NC_010660	CAT	2	6	77565	77570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734416
1025	NC_010660	CCG	2	6	77646	77651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734416
1026	NC_010660	ACGCC	2	10	77684	77693	20 %	0 %	20 %	60 %	187734416
1027	NC_010660	CTG	2	6	77719	77724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734416
1028	NC_010660	GT	3	6	77735	77740	0 %	50 %	50 %	0 %	187734416
1029	NC_010660	CTG	2	6	77860	77865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734416
1030	NC_010660	GAA	2	6	77889	77894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734416
1031	NC_010660	TTA	2	6	77967	77972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734416
1032	NC_010660	GAT	2	6	78024	78029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734416
1033	NC_010660	ATC	2	6	78083	78088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734416
1034	NC_010660	A	6	6	78120	78125	100 %	0 %	0 %	0 %	187734416
1035	NC_010660	CTG	2	6	78160	78165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734416
1036	NC_010660	CTG	2	6	78196	78201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734416
1037	NC_010660	GACG	2	8	78210	78217	25 %	0 %	50 %	25 %	187734416
1038	NC_010660	GGA	2	6	78232	78237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187734416
1039	NC_010660	GAT	2	6	78402	78407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734416
1040	NC_010660	TGA	2	6	78476	78481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734416
1041	NC_010660	TGA	2	6	78488	78493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734416
1042	NC_010660	CGA	2	6	78572	78577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734416
1043	NC_010660	GAAGGG	2	12	78578	78589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187734416
1044	NC_010660	CAGT	2	8	78649	78656	25 %	25 %	25 %	25 %	187734416
1045	NC_010660	ACTG	2	8	78663	78670	25 %	25 %	25 %	25 %	187734416
1046	NC_010660	GT	3	6	78734	78739	0 %	50 %	50 %	0 %	187734376
1047	NC_010660	GA	3	6	78741	78746	50 %	0 %	50 %	0 %	187734376
1048	NC_010660	GGAT	2	8	78774	78781	25 %	25 %	50 %	0 %	187734376
1049	NC_010660	TG	3	6	78861	78866	0 %	50 %	50 %	0 %	187734376
1050	NC_010660	CCG	2	6	78883	78888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734376
1051	NC_010660	GAA	2	6	78919	78924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734376
1052	NC_010660	CG	3	6	78928	78933	0 %	0 %	50 %	50 %	187734376
1053	NC_010660	CTG	2	6	78944	78949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734376
1054	NC_010660	GCC	2	6	79477	79482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734317
1055	NC_010660	A	7	7	79490	79496	100 %	0 %	0 %	0 %	187734317
1056	NC_010660	CGG	2	6	79538	79543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734317
1057	NC_010660	GCA	2	6	79678	79683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734317
1058	NC_010660	GC	3	6	79730	79735	0 %	0 %	50 %	50 %	187734317
1059	NC_010660	GGC	2	6	79873	79878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734317
1060	NC_010660	CGC	2	6	79890	79895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734317
1061	NC_010660	ACGA	2	8	80131	80138	50 %	0 %	25 %	25 %	187734511
1062	NC_010660	CCAT	2	8	80155	80162	25 %	25 %	0 %	50 %	187734511
1063	NC_010660	AC	3	6	80166	80171	50 %	0 %	0 %	50 %	187734511
1064	NC_010660	GACT	2	8	80191	80198	25 %	25 %	25 %	25 %	187734511
1065	NC_010660	ATGCTG	2	12	80202	80213	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	187734511
1066	NC_010660	CTG	2	6	80252	80257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734511
1067	NC_010660	CTG	2	6	80442	80447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734511
1068	NC_010660	CGC	2	6	80499	80504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734511
1069	NC_010660	TG	3	6	80525	80530	0 %	50 %	50 %	0 %	187734511
1070	NC_010660	GCA	2	6	80586	80591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734511
1071	NC_010660	ATGAAG	2	12	80638	80649	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	187734511
1072	NC_010660	GGT	2	6	80711	80716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734511
1073	NC_010660	GGC	2	6	80790	80795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734511
1074	NC_010660	TCA	2	6	80818	80823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734511
1075	NC_010660	CTG	2	6	80826	80831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734511
1076	NC_010660	GCTG	2	8	80920	80927	0 %	25 %	50 %	25 %	187734511
1077	NC_010660	GGCA	2	8	81001	81008	25 %	0 %	50 %	25 %	187734511
1078	NC_010660	ATC	2	6	81031	81036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734511
1079	NC_010660	A	6	6	81063	81068	100 %	0 %	0 %	0 %	187734511
1080	NC_010660	ATT	2	6	81158	81163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734433
1081	NC_010660	CCA	2	6	81176	81181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734433
1082	NC_010660	A	6	6	81194	81199	100 %	0 %	0 %	0 %	187734433
1083	NC_010660	T	7	7	81205	81211	0 %	100 %	0 %	0 %	187734433
1084	NC_010660	TAC	2	6	82029	82034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734352
1085	NC_010660	CA	3	6	82161	82166	50 %	0 %	0 %	50 %	187734352
1086	NC_010660	ATA	2	6	82556	82561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734428
1087	NC_010660	TCA	2	6	82567	82572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734428
1088	NC_010660	AACTCA	2	12	82594	82605	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	187734428
1089	NC_010660	CTGA	2	8	82633	82640	25 %	25 %	25 %	25 %	187734428
1090	NC_010660	AAG	2	6	82715	82720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734428
1091	NC_010660	ATA	2	6	82799	82804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734428
1092	NC_010660	CAT	2	6	82811	82816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734428
1093	NC_010660	CTGC	2	8	82825	82832	0 %	25 %	25 %	50 %	187734428
1094	NC_010660	ATA	2	6	82856	82861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734428
1095	NC_010660	AAC	2	6	82899	82904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734428
1096	NC_010660	GTTC	2	8	82912	82919	0 %	50 %	25 %	25 %	187734428
1097	NC_010660	CAT	2	6	82961	82966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734428
1098	NC_010660	TTG	2	6	82970	82975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734428
1099	NC_010660	TA	3	6	82988	82993	50 %	50 %	0 %	0 %	187734428
1100	NC_010660	TAT	2	6	83035	83040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734428
1101	NC_010660	ACA	2	6	83050	83055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734428
1102	NC_010660	AAT	2	6	83101	83106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734428
1103	NC_010660	ATT	2	6	83159	83164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734428
1104	NC_010660	ACA	2	6	83337	83342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734428
1105	NC_010660	ACAA	2	8	83396	83403	75 %	0 %	0 %	25 %	187734428
1106	NC_010660	CAG	2	6	83572	83577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734428
1107	NC_010660	TGC	2	6	83589	83594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734428
1108	NC_010660	CCT	2	6	83655	83660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187734428
1109	NC_010660	GCTCT	2	10	83704	83713	0 %	40 %	20 %	40 %	187734428
1110	NC_010660	GGA	2	6	83748	83753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187734428
1111	NC_010660	GAAT	2	8	83943	83950	50 %	25 %	25 %	0 %	187734428
1112	NC_010660	GCAG	2	8	84021	84028	25 %	0 %	50 %	25 %	187734428
1113	NC_010660	CAG	2	6	84160	84165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734428
1114	NC_010660	TGAC	2	8	84179	84186	25 %	25 %	25 %	25 %	187734428
1115	NC_010660	GCATAA	2	12	84248	84259	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187734459
1116	NC_010660	AAC	3	9	84310	84318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734459
1117	NC_010660	T	6	6	84368	84373	0 %	100 %	0 %	0 %	187734459
1118	NC_010660	AACC	2	8	84382	84389	50 %	0 %	0 %	50 %	187734459
1119	NC_010660	CAA	2	6	84679	84684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734297
1120	NC_010660	T	7	7	84691	84697	0 %	100 %	0 %	0 %	187734297
1121	NC_010660	AGA	2	6	84739	84744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734297
1122	NC_010660	ACC	2	6	84762	84767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734297
1123	NC_010660	AAC	3	9	84796	84804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734297
1124	NC_010660	ATT	2	6	84829	84834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734297
1125	NC_010660	ACC	2	6	84898	84903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734297
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1127	NC_010660	AAC	2	6	85001	85006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734297
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1129	NC_010660	CAT	2	6	85083	85088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734297
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