MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 plasmid pBS512_211

Total Repeats: 3099

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010660	TGG	2	6	34933	34938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734335
502	NC_010660	G	6	6	35035	35040	0 %	0 %	100 %	0 %	187734335
503	NC_010660	TTG	2	6	35046	35051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734335
504	NC_010660	ATG	2	6	35068	35073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734335
505	NC_010660	TGC	2	6	35581	35586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734413
506	NC_010660	TCA	2	6	35609	35614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734413
507	NC_010660	ATC	2	6	35683	35688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734413
508	NC_010660	CAT	2	6	36684	36689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734333
509	NC_010660	T	6	6	36689	36694	0 %	100 %	0 %	0 %	187734333
510	NC_010660	GCG	2	6	36758	36763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734333
511	NC_010660	GGT	2	6	36812	36817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734333
512	NC_010660	AG	3	6	37214	37219	50 %	0 %	50 %	0 %	187734506
513	NC_010660	CAA	2	6	37277	37282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734506
514	NC_010660	ACGA	2	8	37307	37314	50 %	0 %	25 %	25 %	187734506
515	NC_010660	CTG	2	6	37797	37802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734490
516	NC_010660	AAC	2	6	37859	37864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734490
517	NC_010660	ATT	2	6	37886	37891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734490
518	NC_010660	GCT	2	6	37932	37937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734490
519	NC_010660	GCT	2	6	38036	38041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734490
520	NC_010660	GAT	2	6	38077	38082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734490
521	NC_010660	GCTGAT	2	12	38252	38263	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	187734314
522	NC_010660	GGA	2	6	38290	38295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187734314
523	NC_010660	CTG	2	6	38313	38318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734314
524	NC_010660	CTC	2	6	38363	38368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187734314
525	NC_010660	TGT	2	6	38421	38426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734314
526	NC_010660	GAA	2	6	38579	38584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734397
527	NC_010660	GAA	2	6	38591	38596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734397
528	NC_010660	CGT	2	6	38678	38683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734397
529	NC_010660	CTG	2	6	38705	38710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734397
530	NC_010660	AAC	2	6	38712	38717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734397
531	NC_010660	TCG	2	6	38794	38799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734397
532	NC_010660	AAAT	2	8	38826	38833	75 %	25 %	0 %	0 %	187734397
533	NC_010660	AGA	2	6	38845	38850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734397
534	NC_010660	AAC	2	6	38907	38912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734397
535	NC_010660	AGC	2	6	38924	38929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734397
536	NC_010660	A	7	7	38959	38965	100 %	0 %	0 %	0 %	187734397
537	NC_010660	TGC	2	6	39167	39172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734397
538	NC_010660	CGC	2	6	39183	39188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734397
539	NC_010660	ATG	2	6	39192	39197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734397
540	NC_010660	TGA	2	6	39213	39218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734397
541	NC_010660	TGA	2	6	39238	39243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734397
542	NC_010660	GAA	2	6	39274	39279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734397
543	NC_010660	AT	3	6	39292	39297	50 %	50 %	0 %	0 %	187734397
544	NC_010660	CGG	2	6	39345	39350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734397
545	NC_010660	AGC	2	6	39393	39398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734397
546	NC_010660	GCAG	2	8	39424	39431	25 %	0 %	50 %	25 %	187734397
547	NC_010660	GGC	2	6	39476	39481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734397
548	NC_010660	GCG	2	6	39514	39519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734397
549	NC_010660	TA	3	6	39534	39539	50 %	50 %	0 %	0 %	187734397
550	NC_010660	GAA	2	6	39563	39568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734397
551	NC_010660	AC	3	6	39706	39711	50 %	0 %	0 %	50 %	187734397
552	NC_010660	A	6	6	39719	39724	100 %	0 %	0 %	0 %	187734397
553	NC_010660	GA	3	6	39733	39738	50 %	0 %	50 %	0 %	187734397
554	NC_010660	TGA	2	6	39787	39792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734397
555	NC_010660	ATA	2	6	39810	39815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734397
556	NC_010660	GTCT	2	8	39842	39849	0 %	50 %	25 %	25 %	187734397
557	NC_010660	GAAA	2	8	39852	39859	75 %	0 %	25 %	0 %	187734397
558	NC_010660	TTC	2	6	39869	39874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734397
559	NC_010660	GTG	2	6	39897	39902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734397
560	NC_010660	AATA	2	8	40043	40050	75 %	25 %	0 %	0 %	187734397
561	NC_010660	ATG	2	6	40149	40154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734349
562	NC_010660	GCAC	2	8	40201	40208	25 %	0 %	25 %	50 %	187734349
563	NC_010660	AAC	2	6	40232	40237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734349
564	NC_010660	CAT	2	6	40247	40252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734349
565	NC_010660	TTG	2	6	40413	40418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734349
566	NC_010660	ACA	2	6	40435	40440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734349
567	NC_010660	T	6	6	40468	40473	0 %	100 %	0 %	0 %	187734349
568	NC_010660	TCA	2	6	40495	40500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734349
569	NC_010660	TGA	2	6	40534	40539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734349
570	NC_010660	ATC	2	6	40613	40618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734406
571	NC_010660	ATTAAA	2	12	40667	40678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734406
572	NC_010660	CCG	2	6	40682	40687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734406
573	NC_010660	CAG	2	6	40705	40710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734406
574	NC_010660	GAA	2	6	40753	40758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734406
575	NC_010660	GCA	3	9	40764	40772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734406
576	NC_010660	A	7	7	41525	41531	100 %	0 %	0 %	0 %	187734390
577	NC_010660	GTT	2	6	41573	41578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734390
578	NC_010660	GCC	2	6	41603	41608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734390
579	NC_010660	AAC	2	6	41652	41657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734390
580	NC_010660	TGA	2	6	41662	41667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734390
581	NC_010660	A	6	6	41773	41778	100 %	0 %	0 %	0 %	187734390
582	NC_010660	ATC	2	6	44635	44640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734350
583	NC_010660	CAG	2	6	44657	44662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734350
584	NC_010660	GCGA	2	8	44757	44764	25 %	0 %	50 %	25 %	187734350
585	NC_010660	CT	3	6	44814	44819	0 %	50 %	0 %	50 %	187734350
586	NC_010660	GAA	2	6	44820	44825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734350
587	NC_010660	AGC	2	6	44832	44837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734350
588	NC_010660	TTG	2	6	44852	44857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734350
589	NC_010660	AAC	2	6	44868	44873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734350
590	NC_010660	AGG	2	6	44932	44937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187734350
591	NC_010660	GCT	2	6	44947	44952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734350
592	NC_010660	GGA	2	6	44964	44969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187734350
593	NC_010660	GCGA	2	8	45587	45594	25 %	0 %	50 %	25 %	187734481
594	NC_010660	TGC	2	6	45657	45662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734481
595	NC_010660	CT	3	6	45724	45729	0 %	50 %	0 %	50 %	187734481
596	NC_010660	CCG	2	6	45758	45763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734481
597	NC_010660	TTC	2	6	45766	45771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734481
598	NC_010660	CCACT	2	10	45843	45852	20 %	20 %	0 %	60 %	187734481
599	NC_010660	GAC	2	6	45856	45861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734481
600	NC_010660	GCG	2	6	45879	45884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734481
601	NC_010660	GCC	2	6	45930	45935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734481
602	NC_010660	CAGTG	2	10	45949	45958	20 %	20 %	40 %	20 %	187734481
603	NC_010660	CAG	2	6	45970	45975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734481
604	NC_010660	TC	4	8	45999	46006	0 %	50 %	0 %	50 %	187734481
605	NC_010660	CAG	2	6	46015	46020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734481
606	NC_010660	CTTT	2	8	46054	46061	0 %	75 %	0 %	25 %	187734481
607	NC_010660	TGG	2	6	46095	46100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734481
608	NC_010660	CAG	2	6	46103	46108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734481
609	NC_010660	AGC	2	6	46204	46209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734481
610	NC_010660	CGA	2	6	46219	46224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734481
611	NC_010660	ATC	2	6	46281	46286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734481
612	NC_010660	GAC	2	6	46292	46297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734481
613	NC_010660	GCG	2	6	46299	46304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734481
614	NC_010660	CCAT	2	8	46306	46313	25 %	25 %	0 %	50 %	187734481
615	NC_010660	T	6	6	46428	46433	0 %	100 %	0 %	0 %	187734481
616	NC_010660	GCA	2	6	46913	46918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734338
617	NC_010660	CAG	2	6	46920	46925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734338
618	NC_010660	CTTC	2	8	46931	46938	0 %	50 %	0 %	50 %	187734338
619	NC_010660	ATT	2	6	46944	46949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734338
620	NC_010660	T	6	6	46948	46953	0 %	100 %	0 %	0 %	187734338
621	NC_010660	GGCTG	2	10	46968	46977	0 %	20 %	60 %	20 %	187734338
622	NC_010660	TCAGCA	2	12	47212	47223	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	187734345
623	NC_010660	ACT	3	9	47242	47250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734345
624	NC_010660	T	6	6	47391	47396	0 %	100 %	0 %	0 %	187734345
625	NC_010660	TAC	2	6	47449	47454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734345
626	NC_010660	A	6	6	47572	47577	100 %	0 %	0 %	0 %	187734345
627	NC_010660	CT	3	6	47617	47622	0 %	50 %	0 %	50 %	187734345
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760	NC_010660	CGG	2	6	62569	62574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734321
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764	NC_010660	TCA	2	6	62699	62704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734321
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882	NC_010660	GAAA	2	8	68607	68614	75 %	0 %	25 %	0 %	187734494
883	NC_010660	T	7	7	68632	68638	0 %	100 %	0 %	0 %	187734494
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