MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 51187

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010658	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731657
2	NC_010658	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731657
3	NC_010658	CGG	2	6	353	358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733611
4	NC_010658	TGG	2	6	475	480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733611
5	NC_010658	GAT	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733611
6	NC_010658	CGC	3	9	569	577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733611
7	NC_010658	TCG	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733611
8	NC_010658	TTG	2	6	663	668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187733611
9	NC_010658	CTG	2	6	795	800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733611
10	NC_010658	CCG	2	6	848	853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733611
11	NC_010658	TGG	2	6	931	936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733611
12	NC_010658	ACT	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733611
13	NC_010658	CGG	2	6	967	972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733611
14	NC_010658	TTG	2	6	998	1003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187733611
15	NC_010658	GTT	2	6	1067	1072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187733611
16	NC_010658	TTC	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733611
17	NC_010658	TGA	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733611
18	NC_010658	AAT	2	6	1272	1277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187733611
19	NC_010658	GGC	2	6	1328	1333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733611
20	NC_010658	TGC	2	6	1343	1348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733611
21	NC_010658	GTG	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733611
22	NC_010658	ATC	2	6	1388	1393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733611
23	NC_010658	AAG	2	6	1483	1488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733611
24	NC_010658	GGT	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733611
25	NC_010658	TCT	2	6	1635	1640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733611
26	NC_010658	GAT	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733611
27	NC_010658	TCA	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733611
28	NC_010658	GCT	2	6	1772	1777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733611
29	NC_010658	CAA	2	6	1794	1799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187733611
30	NC_010658	GAA	2	6	1902	1907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733611
31	NC_010658	ATC	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733611
32	NC_010658	TTG	2	6	1987	1992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187733611
33	NC_010658	CTT	2	6	2033	2038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733611
34	NC_010658	TCG	2	6	2085	2090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733611
35	NC_010658	TAC	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733611
36	NC_010658	GCG	2	6	2118	2123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733611
37	NC_010658	TGA	2	6	2213	2218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733611
38	NC_010658	TGA	2	6	2221	2226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733611
39	NC_010658	ACT	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733611
40	NC_010658	GAT	2	6	2349	2354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733611
41	NC_010658	TGC	2	6	2446	2451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733611
42	NC_010658	CGA	2	6	2510	2515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733611
43	NC_010658	TGA	2	6	2546	2551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733611
44	NC_010658	TGA	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733611
45	NC_010658	TAT	2	6	2685	2690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187733611
46	NC_010658	TGC	2	6	2707	2712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733611
47	NC_010658	GCG	2	6	2863	2868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733021
48	NC_010658	GGC	2	6	2916	2921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733021
49	NC_010658	CAA	2	6	2937	2942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187733021
50	NC_010658	GGT	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733021
51	NC_010658	GCA	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733021
52	NC_010658	TGG	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733021
53	NC_010658	TGA	2	6	3257	3262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733021
54	NC_010658	GAA	2	6	3265	3270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733021
55	NC_010658	TGA	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733021
56	NC_010658	CGC	2	6	3385	3390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733021
57	NC_010658	TGA	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733021
58	NC_010658	CGG	2	6	3704	3709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733021
59	NC_010658	TGA	2	6	3861	3866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732437
60	NC_010658	TGA	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732437
61	NC_010658	CGG	2	6	4059	4064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732437
62	NC_010658	GGC	2	6	4252	4257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732437
63	NC_010658	TGA	3	9	4323	4331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732437
64	NC_010658	CTA	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732437
65	NC_010658	CGG	2	6	4493	4498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732437
66	NC_010658	CTG	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732437
67	NC_010658	TGC	2	6	4542	4547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732437
68	NC_010658	ACG	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732437
69	NC_010658	AAC	2	6	4651	4656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187732437
70	NC_010658	GTT	2	6	4674	4679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732437
71	NC_010658	CCG	2	6	4680	4685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732437
72	NC_010658	GAT	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732437
73	NC_010658	CCG	2	6	4973	4978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732437
74	NC_010658	TGC	2	6	4983	4988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732437
75	NC_010658	TGA	3	9	5000	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732437
76	NC_010658	ATC	2	6	5009	5014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732437
77	NC_010658	GCT	2	6	5687	5692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731324
78	NC_010658	GGA	2	6	5724	5729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187731324
79	NC_010658	TCA	2	6	5734	5739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731324
80	NC_010658	AAG	2	6	5740	5745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731324
81	NC_010658	AAT	2	6	5799	5804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187731324
82	NC_010658	TCA	2	6	5813	5818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731324
83	NC_010658	TGA	2	6	5846	5851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731324
84	NC_010658	TTC	2	6	5866	5871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731324
85	NC_010658	TTC	2	6	5911	5916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731324
86	NC_010658	CAC	2	6	5958	5963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731324
87	NC_010658	TGC	2	6	5976	5981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731324
88	NC_010658	TTG	2	6	5998	6003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187731324
89	NC_010658	TGA	2	6	6005	6010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731324
90	NC_010658	CTG	2	6	6360	6365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731324
91	NC_010658	GTG	2	6	6400	6405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731324
92	NC_010658	CAT	2	6	6542	6547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730478
93	NC_010658	GCC	2	6	6759	6764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730478
94	NC_010658	AGA	2	6	6830	6835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730478
95	NC_010658	ATC	2	6	7057	7062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730478
96	NC_010658	CGC	2	6	7101	7106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730478
97	NC_010658	CGC	2	6	7203	7208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730478
98	NC_010658	GCC	2	6	7209	7214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730478
99	NC_010658	TTA	2	6	7283	7288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187730478
100	NC_010658	CAG	2	6	7386	7391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730478
101	NC_010658	AAT	2	6	7407	7412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187730478
102	NC_010658	CGG	2	6	7700	7705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730478
103	NC_010658	CAA	2	6	7879	7884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187730478
104	NC_010658	TAA	2	6	7934	7939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187730478
105	NC_010658	ACC	2	6	8270	8275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187730143
106	NC_010658	CAG	2	6	8417	8422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730143
107	NC_010658	CAG	2	6	8438	8443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730143
108	NC_010658	TGC	2	6	8659	8664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730143
109	NC_010658	AAG	2	6	8679	8684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730143
110	NC_010658	CTG	2	6	8705	8710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730143
111	NC_010658	TTG	2	6	8769	8774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187730143
112	NC_010658	AGA	2	6	8830	8835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730143
113	NC_010658	TAC	2	6	8870	8875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730143
114	NC_010658	CTG	2	6	8978	8983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730143
115	NC_010658	GCA	2	6	9085	9090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730143
116	NC_010658	CTG	2	6	9182	9187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730143
117	NC_010658	TGA	2	6	9303	9308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733564
118	NC_010658	GCG	2	6	9354	9359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733564
119	NC_010658	GAA	2	6	9389	9394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733564
120	NC_010658	ATC	2	6	9461	9466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733564
121	NC_010658	CAC	2	6	9517	9522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733564
122	NC_010658	CGT	2	6	9542	9547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733564
123	NC_010658	TGC	2	6	9847	9852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733564
124	NC_010658	CAC	2	6	10010	10015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187732969
125	NC_010658	GAT	2	6	10044	10049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732969
126	NC_010658	GCG	2	6	10051	10056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732969
127	NC_010658	CAG	2	6	10080	10085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732969
128	NC_010658	GAA	2	6	10149	10154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187732969
129	NC_010658	CAG	2	6	10242	10247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732969
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133	NC_010658	TGC	2	6	10810	10815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732486
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249	NC_010658	GAA	2	6	20045	20050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187732489
250	NC_010658	TGA	2	6	20149	20154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732489
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252	NC_010658	GAT	2	6	20308	20313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732489
253	NC_010658	CGG	2	6	20322	20327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732489
254	NC_010658	ATT	2	6	20349	20354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187732489
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256	NC_010658	TGC	2	6	20900	20905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733459
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497	NC_010658	TGC	2	6	41205	41210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732301
498	NC_010658	TCA	3	9	41220	41228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732301
499	NC_010658	CGT	2	6	41282	41287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732301
500	NC_010658	GTT	2	6	41299	41304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732301

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