MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 72091

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010658	T	7	7	234365	234371	0 %	100 %	0 %	0 %	187731243
4002	NC_010658	TGA	2	6	234465	234470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731740
4003	NC_010658	AGT	2	6	234513	234518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731740
4004	NC_010658	AAAG	2	8	234579	234586	75 %	0 %	25 %	0 %	187731740
4005	NC_010658	TTG	2	6	234587	234592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187731740
4006	NC_010658	AGGTC	2	10	234639	234648	20 %	20 %	40 %	20 %	187731740
4007	NC_010658	TAC	2	6	234654	234659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731740
4008	NC_010658	AGAA	2	8	234676	234683	75 %	0 %	25 %	0 %	187731740
4009	NC_010658	CTAT	2	8	234734	234741	25 %	50 %	0 %	25 %	187731740
4010	NC_010658	AGCT	2	8	234803	234810	25 %	25 %	25 %	25 %	187731740
4011	NC_010658	GGTT	2	8	234856	234863	0 %	50 %	50 %	0 %	187731740
4012	NC_010658	TAG	2	6	234864	234869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731740
4013	NC_010658	TAA	2	6	234876	234881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187731740
4014	NC_010658	AC	3	6	234923	234928	50 %	0 %	0 %	50 %	187731740
4015	NC_010658	CCA	2	6	234937	234942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731740
4016	NC_010658	AAG	2	6	235036	235041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731740
4017	NC_010658	CTTT	2	8	235094	235101	0 %	75 %	0 %	25 %	187731740
4018	NC_010658	TCAA	2	8	235106	235113	50 %	25 %	0 %	25 %	187731740
4019	NC_010658	GAA	2	6	235168	235173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731740
4020	NC_010658	ATG	2	6	235460	235465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732764
4021	NC_010658	GTG	2	6	235542	235547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732764
4022	NC_010658	TGGTTG	2	12	235548	235559	0 %	50 %	50 %	0 %	187732764
4023	NC_010658	GTA	2	6	235569	235574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732764
4024	NC_010658	ATA	2	6	235590	235595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187732764
4025	NC_010658	TGG	2	6	235599	235604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732764
4026	NC_010658	ATT	2	6	235649	235654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187732764
4027	NC_010658	TGA	2	6	235684	235689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732764
4028	NC_010658	ATT	2	6	235694	235699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187732764
4029	NC_010658	TTG	2	6	235785	235790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732764
4030	NC_010658	CAG	2	6	235806	235811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732764
4031	NC_010658	CTA	2	6	235827	235832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732764
4032	NC_010658	ATG	2	6	235836	235841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732764
4033	NC_010658	GTG	2	6	235842	235847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732764
4034	NC_010658	TA	3	6	235917	235922	50 %	50 %	0 %	0 %	187732764
4035	NC_010658	AAG	2	6	236093	236098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187732764
4036	NC_010658	ATT	2	6	236175	236180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187733383
4037	NC_010658	CGG	2	6	236206	236211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733383
4038	NC_010658	CTATTG	2	12	236248	236259	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	187733383
4039	NC_010658	G	6	6	236278	236283	0 %	0 %	100 %	0 %	187733383
4040	NC_010658	CG	3	6	236306	236311	0 %	0 %	50 %	50 %	187733383
4041	NC_010658	CGTA	2	8	236321	236328	25 %	25 %	25 %	25 %	187733383
4042	NC_010658	AAG	2	6	236404	236409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733383
4043	NC_010658	TCT	2	6	236431	236436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733383
4044	NC_010658	CGG	2	6	236728	236733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733383
4045	NC_010658	TGC	2	6	236794	236799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733383
4046	NC_010658	CCA	2	6	236924	236929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733383
4047	NC_010658	TGA	2	6	237041	237046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733383
4048	NC_010658	CG	3	6	237110	237115	0 %	0 %	50 %	50 %	187733383
4049	NC_010658	CGC	2	6	237132	237137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733383
4050	NC_010658	GGCG	2	8	237138	237145	0 %	0 %	75 %	25 %	187733383
4051	NC_010658	TGG	2	6	237157	237162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733383
4052	NC_010658	ATT	2	6	237312	237317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187733982
4053	NC_010658	CAC	2	6	237318	237323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733982
4054	NC_010658	GCC	2	6	237332	237337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733982
4055	NC_010658	TTA	2	6	237426	237431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187733982
4056	NC_010658	TTG	2	6	237462	237467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187733982
4057	NC_010658	CCG	2	6	237481	237486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733982
4058	NC_010658	T	6	6	237569	237574	0 %	100 %	0 %	0 %	187733982
4059	NC_010658	AGC	2	6	237600	237605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733982
4060	NC_010658	TTA	2	6	237633	237638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187733982
4061	NC_010658	TGA	2	6	237966	237971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730289
4062	NC_010658	CAA	2	6	237997	238002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187730289
4063	NC_010658	AC	3	6	238005	238010	50 %	0 %	0 %	50 %	187730289
4064	NC_010658	TTC	2	6	238093	238098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730289
4065	NC_010658	TCGC	2	8	238175	238182	0 %	25 %	25 %	50 %	187730289
4066	NC_010658	GAA	2	6	238237	238242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730289
4067	NC_010658	GCTG	2	8	238244	238251	0 %	25 %	50 %	25 %	187730289
4068	NC_010658	GGC	2	6	238315	238320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730289
4069	NC_010658	CAA	2	6	238339	238344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187730289
4070	NC_010658	ATC	2	6	238354	238359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730289
4071	NC_010658	G	6	6	238430	238435	0 %	0 %	100 %	0 %	187730289
4072	NC_010658	CAT	2	6	238497	238502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730843
4073	NC_010658	CGT	2	6	238522	238527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730843
4074	NC_010658	GTA	2	6	238584	238589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730843
4075	NC_010658	GCG	2	6	238615	238620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730843
4076	NC_010658	AAC	2	6	238633	238638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187730843
4077	NC_010658	TTA	2	6	238654	238659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187730843
4078	NC_010658	AGC	2	6	238731	238736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730843
4079	NC_010658	GAG	2	6	238779	238784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187730843
4080	NC_010658	TGA	2	6	238901	238906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730843
4081	NC_010658	TAC	2	6	238929	238934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730843
4082	NC_010658	ACG	3	9	238957	238965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730843
4083	NC_010658	CTG	2	6	238994	238999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730843
4084	NC_010658	CTT	2	6	239049	239054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730843
4085	NC_010658	AGCGA	2	10	239062	239071	40 %	0 %	40 %	20 %	187730843
4086	NC_010658	CCG	2	6	239111	239116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730843
4087	NC_010658	ATC	3	9	239217	239225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730843
4088	NC_010658	GCGT	2	8	239276	239283	0 %	25 %	50 %	25 %	187730843
4089	NC_010658	ATG	2	6	239317	239322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730843
4090	NC_010658	GCG	2	6	239373	239378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730843
4091	NC_010658	GCTG	2	8	239455	239462	0 %	25 %	50 %	25 %	187730843
4092	NC_010658	CAA	2	6	239465	239470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187730843
4093	NC_010658	CAG	2	6	239472	239477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730843
4094	NC_010658	TGT	2	6	239488	239493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187730843
4095	NC_010658	GTTT	2	8	239519	239526	0 %	75 %	25 %	0 %	187730843
4096	NC_010658	TCG	2	6	239527	239532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730843
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4100	NC_010658	TGT	2	6	240520	240525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732116
4101	NC_010658	AAG	2	6	240560	240565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187732116
4102	NC_010658	TCA	2	6	240729	240734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732116
4103	NC_010658	TGA	2	6	240777	240782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732116
4104	NC_010658	TCG	2	6	240823	240828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732116
4105	NC_010658	CGG	2	6	240863	240868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732116
4106	NC_010658	TCAG	2	8	240909	240916	25 %	25 %	25 %	25 %	187732116
4107	NC_010658	AGC	3	9	240974	240982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732116
4108	NC_010658	GCG	2	6	241014	241019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732116
4109	NC_010658	AAT	2	6	241144	241149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187732660
4110	NC_010658	TTTC	2	8	241163	241170	0 %	75 %	0 %	25 %	187732660
4111	NC_010658	TCAG	2	8	241177	241184	25 %	25 %	25 %	25 %	187732660
4112	NC_010658	T	6	6	241290	241295	0 %	100 %	0 %	0 %	187732660
4113	NC_010658	TTG	2	6	241345	241350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732660
4114	NC_010658	GCCA	2	8	241409	241416	25 %	0 %	25 %	50 %	187732660
4115	NC_010658	GCCA	2	8	241446	241453	25 %	0 %	25 %	50 %	187732660
4116	NC_010658	CAC	2	6	241479	241484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187732660
4117	NC_010658	GTCA	2	8	241542	241549	25 %	25 %	25 %	25 %	187732660
4118	NC_010658	CAC	2	6	241554	241559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187732660
4119	NC_010658	CAG	2	6	241635	241640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732660
4120	NC_010658	CAA	2	6	241704	241709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187732660
4121	NC_010658	TTTCTC	2	12	241719	241730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187732660
4122	NC_010658	GCC	2	6	241851	241856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732660
4123	NC_010658	TTC	2	6	241884	241889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187732660
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4133	NC_010658	GAC	2	6	242391	242396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732660
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4241	NC_010658	TAAA	2	8	248868	248875	75 %	25 %	0 %	0 %	187730917
4242	NC_010658	T	7	7	249585	249591	0 %	100 %	0 %	0 %	187730339
4243	NC_010658	AGC	2	6	249593	249598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730339
4244	NC_010658	TGA	2	6	249603	249608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730339
4245	NC_010658	GAC	2	6	249655	249660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730339
4246	NC_010658	TTA	2	6	249720	249725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187730339
4247	NC_010658	CAGAC	2	10	249824	249833	40 %	0 %	20 %	40 %	187730339
4248	NC_010658	GTG	2	6	249887	249892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730339
4249	NC_010658	TG	3	6	250041	250046	0 %	50 %	50 %	0 %	187730339
4250	NC_010658	CAG	2	6	250109	250114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730339
4251	NC_010658	GGTTCG	2	12	250138	250149	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	187730339
4252	NC_010658	GAT	2	6	250229	250234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730339
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4254	NC_010658	TCA	2	6	250326	250331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730339
4255	NC_010658	TCTG	2	8	250340	250347	0 %	50 %	25 %	25 %	187730339
4256	NC_010658	TAA	2	6	250371	250376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187730339
4257	NC_010658	T	7	7	250489	250495	0 %	100 %	0 %	0 %	187732133
4258	NC_010658	AT	3	6	250497	250502	50 %	50 %	0 %	0 %	187732133
4259	NC_010658	GGC	2	6	250603	250608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732133
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4261	NC_010658	ATT	2	6	250745	250750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187732133
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4263	NC_010658	CATA	2	8	251022	251029	50 %	25 %	0 %	25 %	187731419
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4266	NC_010658	TGC	2	6	251503	251508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733160
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4268	NC_010658	TCG	2	6	251543	251548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733160
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4270	NC_010658	CAG	2	6	251641	251646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733160
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4273	NC_010658	ACC	2	6	251866	251871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733160
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4276	NC_010658	T	6	6	252089	252094	0 %	100 %	0 %	0 %	187732410
4277	NC_010658	CTG	2	6	252158	252163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732410
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4282	NC_010658	TCG	2	6	254850	254855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733925
4283	NC_010658	GCT	2	6	254865	254870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733925
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4286	NC_010658	CTG	2	6	255054	255059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733925
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4323	NC_010658	CTG	2	6	257963	257968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733250
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4346	NC_010658	A	6	6	258977	258982	100 %	0 %	0 %	0 %	187733250
4347	NC_010658	GA	3	6	258991	258996	50 %	0 %	50 %	0 %	187733250
4348	NC_010658	TGA	2	6	259045	259050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733250
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4351	NC_010658	GAAA	2	8	259110	259117	75 %	0 %	25 %	0 %	187733250
4352	NC_010658	TTC	2	6	259127	259132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733250
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4358	NC_010658	AG	3	6	259436	259441	50 %	0 %	50 %	0 %	187733757
4359	NC_010658	GGGAA	2	10	259472	259481	40 %	0 %	60 %	0 %	187733757
4360	NC_010658	AGA	2	6	259554	259559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733757
4361	NC_010658	GCA	2	6	259560	259565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733757
4362	NC_010658	TC	4	8	259656	259663	0 %	50 %	0 %	50 %	187734088
4363	NC_010658	AAT	2	6	259674	259679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734088
4364	NC_010658	CGA	2	6	259712	259717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734088
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4487	NC_010658	ATG	2	6	267734	267739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733030
4488	NC_010658	TTCCAT	2	12	267764	267775	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	187733030
4489	NC_010658	TCCT	2	8	267782	267789	0 %	50 %	0 %	50 %	187733030
4490	NC_010658	GTG	2	6	267807	267812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733030
4491	NC_010658	A	6	6	268010	268015	100 %	0 %	0 %	0 %	187732785
4492	NC_010658	GTGAT	2	10	268056	268065	20 %	40 %	40 %	0 %	187732785
4493	NC_010658	GCTG	2	8	268122	268129	0 %	25 %	50 %	25 %	187732785
4494	NC_010658	GGA	2	6	268152	268157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187732785
4495	NC_010658	CTG	2	6	268217	268222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732785
4496	NC_010658	TGGC	2	8	268255	268262	0 %	25 %	50 %	25 %	187732785
4497	NC_010658	AATCTG	2	12	268337	268348	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	187732785
4498	NC_010658	ACA	2	6	268351	268356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187732785
4499	NC_010658	ATC	2	6	268540	268545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731361
4500	NC_010658	GC	3	6	268752	268757	0 %	0 %	50 %	50 %	187731361

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