MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 72091

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_010658	CAG	2	6	145216	145221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731223
2503	NC_010658	GGC	2	6	145237	145242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731223
2504	NC_010658	TTC	2	6	145295	145300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731223
2505	NC_010658	GAT	2	6	145386	145391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731223
2506	NC_010658	CA	3	6	145395	145400	50 %	0 %	0 %	50 %	187731223
2507	NC_010658	TTC	2	6	145450	145455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731223
2508	NC_010658	CAG	2	6	145483	145488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731223
2509	NC_010658	GCGAG	2	10	145493	145502	20 %	0 %	60 %	20 %	187731223
2510	NC_010658	GGC	2	6	145546	145551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731223
2511	NC_010658	CG	3	6	145561	145566	0 %	0 %	50 %	50 %	187731223
2512	NC_010658	GCC	2	6	145648	145653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731223
2513	NC_010658	ACGG	2	8	145663	145670	25 %	0 %	50 %	25 %	187731223
2514	NC_010658	TCT	2	6	145727	145732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731223
2515	NC_010658	TGT	2	6	145749	145754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187731223
2516	NC_010658	GCA	2	6	145758	145763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731223
2517	NC_010658	GTG	2	6	145816	145821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731223
2518	NC_010658	GGC	2	6	145896	145901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731223
2519	NC_010658	GGCGT	2	10	145931	145940	0 %	20 %	60 %	20 %	187731223
2520	NC_010658	CGC	3	9	145992	146000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731223
2521	NC_010658	CCAG	2	8	146004	146011	25 %	0 %	25 %	50 %	187731223
2522	NC_010658	TGC	2	6	146087	146092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731223
2523	NC_010658	CGG	2	6	146306	146311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733286
2524	NC_010658	CTGA	2	8	146333	146340	25 %	25 %	25 %	25 %	187733286
2525	NC_010658	ATCAG	2	10	146569	146578	40 %	20 %	20 %	20 %	187733286
2526	NC_010658	ATC	2	6	146613	146618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733286
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2528	NC_010658	ATGA	2	8	146661	146668	50 %	25 %	25 %	0 %	187733286
2529	NC_010658	TCG	2	6	146692	146697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733286
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2531	NC_010658	TGC	2	6	146743	146748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733286
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2533	NC_010658	ATG	2	6	146781	146786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733286
2534	NC_010658	CGT	2	6	146804	146809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733286
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2536	NC_010658	CGT	2	6	146903	146908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733286
2537	NC_010658	TCT	2	6	147016	147021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733286
2538	NC_010658	CCAG	2	8	147029	147036	25 %	0 %	25 %	50 %	187733286
2539	NC_010658	GCG	2	6	147076	147081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733286
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2542	NC_010658	A	6	6	147163	147168	100 %	0 %	0 %	0 %	187733286
2543	NC_010658	AGCC	2	8	147221	147228	25 %	0 %	25 %	50 %	187733763
2544	NC_010658	CAGC	2	8	147248	147255	25 %	0 %	25 %	50 %	187733763
2545	NC_010658	GC	3	6	147288	147293	0 %	0 %	50 %	50 %	187733763
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2547	NC_010658	TCT	2	6	147371	147376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733763
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2550	NC_010658	ACG	2	6	147549	147554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733763
2551	NC_010658	TTCA	2	8	147573	147580	25 %	50 %	0 %	25 %	187733763
2552	NC_010658	CTT	2	6	147665	147670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733763
2553	NC_010658	TAC	2	6	147850	147855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732996
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2555	NC_010658	CAG	2	6	147893	147898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732996
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2557	NC_010658	GC	3	6	147981	147986	0 %	0 %	50 %	50 %	187732996
2558	NC_010658	GCA	2	6	148013	148018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732996
2559	NC_010658	CGCA	2	8	148035	148042	25 %	0 %	25 %	50 %	187732996
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2563	NC_010658	AGTT	2	8	148347	148354	25 %	50 %	25 %	0 %	187732996
2564	NC_010658	GT	3	6	148360	148365	0 %	50 %	50 %	0 %	187732996
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2566	NC_010658	CG	3	6	148527	148532	0 %	0 %	50 %	50 %	187732996
2567	NC_010658	GA	3	6	148544	148549	50 %	0 %	50 %	0 %	187732996
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2570	NC_010658	GGC	2	6	148680	148685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731852
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2573	NC_010658	ACCAC	2	10	148834	148843	40 %	0 %	0 %	60 %	187731852
2574	NC_010658	TCA	2	6	148869	148874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731852
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2578	NC_010658	GC	3	6	149025	149030	0 %	0 %	50 %	50 %	187731852
2579	NC_010658	GTC	2	6	149177	149182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730081
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2596	NC_010658	TGA	2	6	149615	149620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730081
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2606	NC_010658	CTGC	2	8	150167	150174	0 %	25 %	25 %	50 %	187730081
2607	NC_010658	GCTG	2	8	150301	150308	0 %	25 %	50 %	25 %	187730081
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2614	NC_010658	GGCGT	2	10	150537	150546	0 %	20 %	60 %	20 %	187730081
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2984	NC_010658	ATCGGT	2	12	168547	168558	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	187732326
2985	NC_010658	TGG	2	6	168602	168607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732326
2986	NC_010658	TAT	2	6	168639	168644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187732326
2987	NC_010658	TCC	2	6	168730	168735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187732326
2988	NC_010658	GTGAT	2	10	168761	168770	20 %	40 %	40 %	0 %	187732326
2989	NC_010658	CAG	2	6	168795	168800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732326
2990	NC_010658	GCA	2	6	168842	168847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732326
2991	NC_010658	GCA	2	6	168903	168908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732326
2992	NC_010658	AGC	2	6	168910	168915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732326
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2997	NC_010658	CAG	2	6	169075	169080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732326
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3000	NC_010658	GACT	2	8	170642	170649	25 %	25 %	25 %	25 %	187730763

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