MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 72091

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_010658	GGC	2	6	86749	86754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733976
1503	NC_010658	GCT	2	6	86759	86764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733976
1504	NC_010658	GCG	2	6	86820	86825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733976
1505	NC_010658	GCC	2	6	86927	86932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733976
1506	NC_010658	GTA	2	6	86942	86947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733976
1507	NC_010658	TGGC	2	8	86980	86987	0 %	25 %	50 %	25 %	187733257
1508	NC_010658	ATT	2	6	87005	87010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187733257
1509	NC_010658	CTG	2	6	87058	87063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733257
1510	NC_010658	GGT	2	6	87135	87140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733257
1511	NC_010658	ACG	2	6	87146	87151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733257
1512	NC_010658	CTG	2	6	87232	87237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733257
1513	NC_010658	TGG	2	6	87275	87280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733257
1514	NC_010658	TGA	2	6	87312	87317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733257
1515	NC_010658	GTG	2	6	87328	87333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733257
1516	NC_010658	TGG	2	6	87449	87454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733257
1517	NC_010658	CTG	2	6	87502	87507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733257
1518	NC_010658	GGT	2	6	87598	87603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733257
1519	NC_010658	TGG	2	6	87611	87616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733257
1520	NC_010658	GGT	2	6	87790	87795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733257
1521	NC_010658	CTG	2	6	87835	87840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733257
1522	NC_010658	G	6	6	87849	87854	0 %	0 %	100 %	0 %	187733257
1523	NC_010658	TCA	2	6	87942	87947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733257
1524	NC_010658	CG	3	6	87977	87982	0 %	0 %	50 %	50 %	187733257
1525	NC_010658	ATT	2	6	88000	88005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187733257
1526	NC_010658	GTC	2	6	88080	88085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732828
1527	NC_010658	CTCG	2	8	88131	88138	0 %	25 %	25 %	50 %	187732828
1528	NC_010658	CGC	2	6	88147	88152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732828
1529	NC_010658	GCCTG	2	10	88178	88187	0 %	20 %	40 %	40 %	187732828
1530	NC_010658	ATG	2	6	88231	88236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732828
1531	NC_010658	GGC	2	6	88247	88252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732828
1532	NC_010658	CATC	2	8	88290	88297	25 %	25 %	0 %	50 %	187732828
1533	NC_010658	AAGCAC	2	12	88360	88371	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	187732828
1534	NC_010658	CAC	2	6	88412	88417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187732828
1535	NC_010658	GCG	2	6	88440	88445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732828
1536	NC_010658	GTGG	2	8	88461	88468	0 %	25 %	75 %	0 %	187732828
1537	NC_010658	TGC	2	6	88492	88497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732828
1538	NC_010658	GGC	2	6	88574	88579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732828
1539	NC_010658	GTTTG	2	10	88622	88631	0 %	60 %	40 %	0 %	187732828
1540	NC_010658	GTC	2	6	88683	88688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732828
1541	NC_010658	TGA	2	6	88694	88699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732828
1542	NC_010658	TGA	2	6	88727	88732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732828
1543	NC_010658	ATC	2	6	88777	88782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732828
1544	NC_010658	GCA	2	6	88853	88858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732828
1545	NC_010658	GCA	2	6	88878	88883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732828
1546	NC_010658	CTGGCA	2	12	88884	88895	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	187732828
1547	NC_010658	CG	3	6	88912	88917	0 %	0 %	50 %	50 %	187732828
1548	NC_010658	CAG	2	6	88919	88924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732828
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1551	NC_010658	GCG	2	6	89040	89045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732828
1552	NC_010658	TTG	2	6	89079	89084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732828
1553	NC_010658	GCG	2	6	89089	89094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732828
1554	NC_010658	CGG	2	6	89104	89109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732828
1555	NC_010658	GC	3	6	89124	89129	0 %	0 %	50 %	50 %	187732828
1556	NC_010658	GGC	2	6	89186	89191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732828
1557	NC_010658	AAC	2	6	89326	89331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187732828
1558	NC_010658	TC	3	6	89381	89386	0 %	50 %	0 %	50 %	187732373
1559	NC_010658	GCG	2	6	89537	89542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732373
1560	NC_010658	TTC	3	9	89606	89614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187732373
1561	NC_010658	CATT	2	8	89646	89653	25 %	50 %	0 %	25 %	187732373
1562	NC_010658	TGC	2	6	89712	89717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732373
1563	NC_010658	ATC	2	6	89726	89731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732373
1564	NC_010658	CTG	2	6	89732	89737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732373
1565	NC_010658	GATC	2	8	89785	89792	25 %	25 %	25 %	25 %	187732373
1566	NC_010658	TGC	2	6	89799	89804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732373
1567	NC_010658	CGA	2	6	89875	89880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732373
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1569	NC_010658	CTG	2	6	89945	89950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732373
1570	NC_010658	GGT	4	12	89971	89982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732373
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1572	NC_010658	ACCGT	2	10	90091	90100	20 %	20 %	20 %	40 %	187732373
1573	NC_010658	CCG	2	6	90103	90108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732373
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1577	NC_010658	CG	3	6	90344	90349	0 %	0 %	50 %	50 %	187732373
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1588	NC_010658	GCA	2	6	91128	91133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733785
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1593	NC_010658	TGA	2	6	91344	91349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733785
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1595	NC_010658	GTC	2	6	91378	91383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733785
1596	NC_010658	GTGA	2	8	91408	91415	25 %	25 %	50 %	0 %	187733785
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1601	NC_010658	TTA	2	6	91588	91593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187733785
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1603	NC_010658	GAAT	2	8	91732	91739	50 %	25 %	25 %	0 %	187730669
1604	NC_010658	ACA	2	6	91742	91747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187730669
1605	NC_010658	GGT	2	6	91815	91820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730669
1606	NC_010658	ATCAG	2	10	91864	91873	40 %	20 %	20 %	20 %	187730669
1607	NC_010658	GCA	2	6	91904	91909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730669
1608	NC_010658	CGA	2	6	91927	91932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730669
1609	NC_010658	ACGT	2	8	91957	91964	25 %	25 %	25 %	25 %	187730669
1610	NC_010658	GTT	2	6	91980	91985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187730669
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1612	NC_010658	GCTG	2	8	92066	92073	0 %	25 %	50 %	25 %	187730669
1613	NC_010658	ACC	2	6	92130	92135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187730669
1614	NC_010658	CGG	2	6	92189	92194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730669
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1616	NC_010658	TGG	2	6	92296	92301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730669
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1618	NC_010658	TTA	2	6	92374	92379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187730669
1619	NC_010658	TG	3	6	92419	92424	0 %	50 %	50 %	0 %	187730669
1620	NC_010658	TGA	2	6	92426	92431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730669
1621	NC_010658	CGTG	2	8	92504	92511	0 %	25 %	50 %	25 %	187730669
1622	NC_010658	AGA	2	6	92513	92518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730669
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1624	NC_010658	GCT	2	6	92552	92557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730669
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1990	NC_010658	GCA	2	6	114128	114133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733404
1991	NC_010658	TCGCG	2	10	114285	114294	0 %	20 %	40 %	40 %	187733404
1992	NC_010658	TGC	2	6	114298	114303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733404
1993	NC_010658	AGT	2	6	114312	114317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733404
1994	NC_010658	GAA	2	6	114360	114365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733404
1995	NC_010658	GC	3	6	114366	114371	0 %	0 %	50 %	50 %	187733404
1996	NC_010658	GCATC	2	10	114375	114384	20 %	20 %	20 %	40 %	187733404
1997	NC_010658	GAA	2	6	114402	114407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733404
1998	NC_010658	AG	3	6	114431	114436	50 %	0 %	50 %	0 %	187733404
1999	NC_010658	CCG	2	6	114437	114442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733404
2000	NC_010658	CGT	2	6	114456	114461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733404

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