MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 72091

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010658	TCT	2	6	57689	57694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730282
1002	NC_010658	CGA	2	6	57903	57908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734070
1003	NC_010658	ATCA	2	8	57971	57978	50 %	25 %	0 %	25 %	187734070
1004	NC_010658	GC	3	6	58057	58062	0 %	0 %	50 %	50 %	187734070
1005	NC_010658	CAG	2	6	58142	58147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734070
1006	NC_010658	CAG	2	6	58184	58189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734070
1007	NC_010658	ATCA	2	8	58208	58215	50 %	25 %	0 %	25 %	187734070
1008	NC_010658	ACC	2	6	58277	58282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734070
1009	NC_010658	TCT	2	6	58317	58322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734070
1010	NC_010658	TCC	2	6	58401	58406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187734070
1011	NC_010658	AGG	2	6	58411	58416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187734070
1012	NC_010658	GCC	2	6	58418	58423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734070
1013	NC_010658	ATG	2	6	58449	58454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734070
1014	NC_010658	GCG	2	6	58464	58469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734070
1015	NC_010658	CTG	2	6	58505	58510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734070
1016	NC_010658	GGT	3	9	58568	58576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734070
1017	NC_010658	CGC	2	6	58631	58636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734070
1018	NC_010658	TG	3	6	58671	58676	0 %	50 %	50 %	0 %	187734070
1019	NC_010658	AGC	2	6	58693	58698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734070
1020	NC_010658	CAC	2	6	58748	58753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734070
1021	NC_010658	CG	3	6	58986	58991	0 %	0 %	50 %	50 %	187734070
1022	NC_010658	GGTTCA	2	12	59029	59040	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	187734070
1023	NC_010658	GCA	2	6	59098	59103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734070
1024	NC_010658	TTG	2	6	59109	59114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734070
1025	NC_010658	CAC	2	6	59168	59173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734070
1026	NC_010658	TCG	2	6	59190	59195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734070
1027	NC_010658	TCGCG	2	10	59200	59209	0 %	20 %	40 %	40 %	187734070
1028	NC_010658	GTG	2	6	59235	59240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734070
1029	NC_010658	AAC	2	6	59297	59302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734070
1030	NC_010658	GCTG	2	8	59353	59360	0 %	25 %	50 %	25 %	187734070
1031	NC_010658	GTT	2	6	59468	59473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187733621
1032	NC_010658	GCG	2	6	59499	59504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733621
1033	NC_010658	T	6	6	59573	59578	0 %	100 %	0 %	0 %	187733621
1034	NC_010658	GCA	2	6	59620	59625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733621
1035	NC_010658	CGC	2	6	59631	59636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733621
1036	NC_010658	CAA	2	6	59663	59668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187733621
1037	NC_010658	GCA	2	6	59694	59699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733621
1038	NC_010658	CG	3	6	59725	59730	0 %	0 %	50 %	50 %	187733621
1039	NC_010658	GCC	2	6	59733	59738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733621
1040	NC_010658	GCA	2	6	59815	59820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733621
1041	NC_010658	CAG	2	6	59835	59840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733621
1042	NC_010658	GCG	2	6	59907	59912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733621
1043	NC_010658	CAC	2	6	59931	59936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733621
1044	NC_010658	GTT	2	6	59993	59998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187733621
1045	NC_010658	CTGG	2	8	60000	60007	0 %	25 %	50 %	25 %	187733621
1046	NC_010658	GGC	2	6	60039	60044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733621
1047	NC_010658	TGCGCC	2	12	60261	60272	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	187733621
1048	NC_010658	CGC	2	6	60299	60304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733621
1049	NC_010658	CAC	2	6	60312	60317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733621
1050	NC_010658	CAGG	2	8	60323	60330	25 %	0 %	50 %	25 %	187733621
1051	NC_010658	TCA	2	6	60439	60444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733621
1052	NC_010658	CTGG	2	8	60451	60458	0 %	25 %	50 %	25 %	187733621
1053	NC_010658	GCC	2	6	60465	60470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733621
1054	NC_010658	CGA	2	6	60517	60522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733621
1055	NC_010658	GCGG	2	8	60530	60537	0 %	0 %	75 %	25 %	187733621
1056	NC_010658	AATA	2	8	60659	60666	75 %	25 %	0 %	0 %	187733621
1057	NC_010658	CCA	2	6	60667	60672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733621
1058	NC_010658	AGT	2	6	60683	60688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733621
1059	NC_010658	CTT	2	6	60731	60736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733621
1060	NC_010658	GC	3	6	60880	60885	0 %	0 %	50 %	50 %	187733621
1061	NC_010658	GAT	2	6	60953	60958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733621
1062	NC_010658	TGG	2	6	61025	61030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733621
1063	NC_010658	CTG	2	6	61475	61480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733147
1064	NC_010658	TGG	2	6	61506	61511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733147
1065	NC_010658	T	7	7	61549	61555	0 %	100 %	0 %	0 %	187733147
1066	NC_010658	CGAC	2	8	61558	61565	25 %	0 %	25 %	50 %	187733147
1067	NC_010658	GTG	2	6	61616	61621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733147
1068	NC_010658	TTTG	2	8	61640	61647	0 %	75 %	25 %	0 %	187733147
1069	NC_010658	GA	3	6	61680	61685	50 %	0 %	50 %	0 %	187733147
1070	NC_010658	TCA	2	6	61687	61692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733147
1071	NC_010658	GTC	2	6	61698	61703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733147
1072	NC_010658	CG	3	6	61749	61754	0 %	0 %	50 %	50 %	187733147
1073	NC_010658	TTTC	2	8	61804	61811	0 %	75 %	0 %	25 %	187733147
1074	NC_010658	GCT	2	6	61897	61902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733147
1075	NC_010658	GCG	2	6	61933	61938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733147
1076	NC_010658	TCCA	2	8	61962	61969	25 %	25 %	0 %	50 %	187733147
1077	NC_010658	CAG	2	6	62099	62104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733147
1078	NC_010658	GCT	2	6	62158	62163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733147
1079	NC_010658	CAC	2	6	62170	62175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733147
1080	NC_010658	GTCG	2	8	62195	62202	0 %	25 %	50 %	25 %	187733147
1081	NC_010658	A	6	6	62246	62251	100 %	0 %	0 %	0 %	187733147
1082	NC_010658	CGAG	2	8	62268	62275	25 %	0 %	50 %	25 %	187733147
1083	NC_010658	GAA	2	6	62291	62296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733147
1084	NC_010658	ATG	2	6	62304	62309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733147
1085	NC_010658	TTA	2	6	62437	62442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187732393
1086	NC_010658	GGT	2	6	62471	62476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732393
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1088	NC_010658	CGCTGG	2	12	62497	62508	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	187732393
1089	NC_010658	GCG	2	6	62566	62571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732393
1090	NC_010658	CTGG	2	8	62591	62598	0 %	25 %	50 %	25 %	187732393
1091	NC_010658	CTG	2	6	62616	62621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732393
1092	NC_010658	CTGG	2	8	62639	62646	0 %	25 %	50 %	25 %	187732393
1093	NC_010658	GAA	2	6	62687	62692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187732393
1094	NC_010658	GGTC	2	8	62756	62763	0 %	25 %	50 %	25 %	187732393
1095	NC_010658	TTG	2	6	62767	62772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732393
1096	NC_010658	TGG	2	6	62797	62802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732393
1097	NC_010658	CTGC	2	8	62855	62862	0 %	25 %	25 %	50 %	187732393
1098	NC_010658	CCTG	2	8	62882	62889	0 %	25 %	25 %	50 %	187732393
1099	NC_010658	GGCG	2	8	62897	62904	0 %	0 %	75 %	25 %	187732393
1100	NC_010658	CGAT	2	8	62908	62915	25 %	25 %	25 %	25 %	187732393
1101	NC_010658	GCG	2	6	62935	62940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732393
1102	NC_010658	TGC	2	6	62953	62958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732393
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1104	NC_010658	TGG	2	6	62984	62989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732393
1105	NC_010658	ATT	2	6	63043	63048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187732393
1106	NC_010658	CG	3	6	63052	63057	0 %	0 %	50 %	50 %	187732393
1107	NC_010658	TGT	2	6	63064	63069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732393
1108	NC_010658	GTG	2	6	63099	63104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732393
1109	NC_010658	TGG	2	6	63109	63114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732393
1110	NC_010658	CAA	2	6	63338	63343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187731683
1111	NC_010658	TTC	2	6	63344	63349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731683
1112	NC_010658	ACC	3	9	63384	63392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731683
1113	NC_010658	CGC	2	6	63410	63415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731683
1114	NC_010658	T	6	6	63451	63456	0 %	100 %	0 %	0 %	187731683
1115	NC_010658	GCT	2	6	63457	63462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731683
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1120	NC_010658	CGT	2	6	63794	63799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731683
1121	NC_010658	GCTG	2	8	63833	63840	0 %	25 %	50 %	25 %	187731683
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1124	NC_010658	TCAG	2	8	63975	63982	25 %	25 %	25 %	25 %	187731683
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