MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 72091

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010658	A	6	6	29270	29275	100 %	0 %	0 %	0 %	187733568
502	NC_010658	AAT	2	6	29277	29282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187733568
503	NC_010658	CGA	2	6	29406	29411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730844
504	NC_010658	CAC	2	6	29415	29420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187730844
505	NC_010658	CAA	2	6	29436	29441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187730844
506	NC_010658	ACC	2	6	29530	29535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187730844
507	NC_010658	GCG	2	6	29554	29559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730844
508	NC_010658	CCG	2	6	29598	29603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730844
509	NC_010658	ATGG	2	8	29659	29666	25 %	25 %	50 %	0 %	187730844
510	NC_010658	TTG	2	6	29862	29867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187731568
511	NC_010658	AT	3	6	29897	29902	50 %	50 %	0 %	0 %	187731568
512	NC_010658	GAA	2	6	30140	30145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731568
513	NC_010658	CAGTA	2	10	30197	30206	40 %	20 %	20 %	20 %	187731568
514	NC_010658	TG	3	6	30247	30252	0 %	50 %	50 %	0 %	187731568
515	NC_010658	TGG	2	6	30453	30458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731568
516	NC_010658	CTC	2	6	30472	30477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187731568
517	NC_010658	CG	3	6	30521	30526	0 %	0 %	50 %	50 %	187731568
518	NC_010658	TTGA	2	8	30530	30537	25 %	50 %	25 %	0 %	187731568
519	NC_010658	TGG	2	6	30633	30638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731568
520	NC_010658	GCA	2	6	30646	30651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731568
521	NC_010658	GGT	2	6	30659	30664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731568
522	NC_010658	GAA	2	6	30689	30694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731568
523	NC_010658	GCC	2	6	30874	30879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732027
524	NC_010658	TGA	2	6	30911	30916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732027
525	NC_010658	ACC	2	6	30949	30954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187732027
526	NC_010658	CTG	2	6	30970	30975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732027
527	NC_010658	TGGC	2	8	31073	31080	0 %	25 %	50 %	25 %	187732027
528	NC_010658	TTG	2	6	31088	31093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732027
529	NC_010658	TGG	2	6	31175	31180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732027
530	NC_010658	TCG	2	6	31245	31250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732027
531	NC_010658	CTG	2	6	31271	31276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732027
532	NC_010658	ACG	2	6	31612	31617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732027
533	NC_010658	CAG	2	6	31693	31698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732027
534	NC_010658	CGT	2	6	31724	31729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732027
535	NC_010658	ATG	2	6	31902	31907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732869
536	NC_010658	G	6	6	31937	31942	0 %	0 %	100 %	0 %	187732869
537	NC_010658	GCC	2	6	31950	31955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732869
538	NC_010658	GGC	2	6	31966	31971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732869
539	NC_010658	GCG	2	6	32000	32005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732869
540	NC_010658	TCT	2	6	32021	32026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187732869
541	NC_010658	GCTG	2	8	32050	32057	0 %	25 %	50 %	25 %	187732869
542	NC_010658	AGC	2	6	32087	32092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732869
543	NC_010658	GAT	2	6	32108	32113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732869
544	NC_010658	CGC	3	9	32245	32253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732869
545	NC_010658	GCC	2	6	32273	32278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732869
546	NC_010658	GCT	2	6	32311	32316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732869
547	NC_010658	AGC	2	6	32323	32328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732869
548	NC_010658	ATT	2	6	32360	32365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187732869
549	NC_010658	CAT	2	6	32372	32377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732869
550	NC_010658	CGTG	2	8	32527	32534	0 %	25 %	50 %	25 %	187732869
551	NC_010658	CGG	2	6	33248	33253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733195
552	NC_010658	TCCT	2	8	33309	33316	0 %	50 %	0 %	50 %	187733195
553	NC_010658	CTTA	2	8	33337	33344	25 %	50 %	0 %	25 %	187733195
554	NC_010658	GAA	2	6	33382	33387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733195
555	NC_010658	TCT	2	6	33388	33393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733195
556	NC_010658	CT	3	6	33466	33471	0 %	50 %	0 %	50 %	187733195
557	NC_010658	GCG	2	6	33592	33597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733195
558	NC_010658	CG	3	6	33616	33621	0 %	0 %	50 %	50 %	187733195
559	NC_010658	ACC	2	6	33661	33666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733195
560	NC_010658	CGG	2	6	33708	33713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733195
561	NC_010658	A	6	6	33727	33732	100 %	0 %	0 %	0 %	187733195
562	NC_010658	CGT	2	6	33753	33758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733195
563	NC_010658	TGG	2	6	33800	33805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733195
564	NC_010658	TCA	2	6	33987	33992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733195
565	NC_010658	GCT	2	6	33993	33998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733195
566	NC_010658	CAC	2	6	34042	34047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733195
567	NC_010658	GGC	2	6	34048	34053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733195
568	NC_010658	GTG	2	6	34084	34089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733195
569	NC_010658	AGCC	2	8	34239	34246	25 %	0 %	25 %	50 %	187733195
570	NC_010658	ACG	2	6	34256	34261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733195
571	NC_010658	GTT	2	6	34269	34274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187733195
572	NC_010658	ACT	2	6	34420	34425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733854
573	NC_010658	GC	3	6	34429	34434	0 %	0 %	50 %	50 %	187733854
574	NC_010658	CAT	2	6	34499	34504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733854
575	NC_010658	GACC	2	8	34505	34512	25 %	0 %	25 %	50 %	187733854
576	NC_010658	AGT	2	6	34556	34561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733854
577	NC_010658	ATT	2	6	34569	34574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187733854
578	NC_010658	TGC	2	6	34597	34602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733854
579	NC_010658	GC	3	6	34633	34638	0 %	0 %	50 %	50 %	187733854
580	NC_010658	TGGAGC	2	12	34639	34650	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	187733854
581	NC_010658	CCG	2	6	34696	34701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733854
582	NC_010658	AGA	2	6	34718	34723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733854
583	NC_010658	CCG	2	6	34724	34729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733854
584	NC_010658	GAA	2	6	34748	34753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733854
585	NC_010658	CG	3	6	34769	34774	0 %	0 %	50 %	50 %	187733854
586	NC_010658	CA	3	6	34786	34791	50 %	0 %	0 %	50 %	187733854
587	NC_010658	GAA	2	6	34797	34802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733854
588	NC_010658	ATT	2	6	34839	34844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187733854
589	NC_010658	GCG	3	9	34870	34878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733854
590	NC_010658	GAA	2	6	34905	34910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733854
591	NC_010658	TC	3	6	34931	34936	0 %	50 %	0 %	50 %	187733854
592	NC_010658	GCT	2	6	34949	34954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733854
593	NC_010658	TGA	2	6	34958	34963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733854
594	NC_010658	GTG	2	6	34998	35003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733854
595	NC_010658	CAT	2	6	35024	35029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733854
596	NC_010658	TGC	2	6	35152	35157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733854
597	NC_010658	GGT	2	6	35178	35183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733854
598	NC_010658	TTC	2	6	35258	35263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733854
599	NC_010658	GGC	2	6	35306	35311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733854
600	NC_010658	CGA	2	6	35336	35341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733854
601	NC_010658	TGA	2	6	35344	35349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733854
602	NC_010658	CCT	2	6	35377	35382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187733854
603	NC_010658	CGCA	2	8	35505	35512	25 %	0 %	25 %	50 %	187733854
604	NC_010658	CTGT	2	8	35679	35686	0 %	50 %	25 %	25 %	187733854
605	NC_010658	GAA	2	6	35739	35744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733854
606	NC_010658	GGCG	2	8	35855	35862	0 %	0 %	75 %	25 %	187733854
607	NC_010658	GAA	2	6	35982	35987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733854
608	NC_010658	GCGAA	2	10	35992	36001	40 %	0 %	40 %	20 %	187733854
609	NC_010658	ACCG	2	8	36009	36016	25 %	0 %	25 %	50 %	187733854
610	NC_010658	A	6	6	36019	36024	100 %	0 %	0 %	0 %	187733854
611	NC_010658	CGG	3	9	36035	36043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733854
612	NC_010658	ACT	2	6	36076	36081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733854
613	NC_010658	CGG	2	6	36266	36271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733854
614	NC_010658	GC	5	10	36291	36300	0 %	0 %	50 %	50 %	187733854
615	NC_010658	GCT	2	6	36306	36311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733854
616	NC_010658	AGA	2	6	36356	36361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733854
617	NC_010658	CTGAAA	2	12	36393	36404	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187733854
618	NC_010658	TGG	2	6	36475	36480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733854
619	NC_010658	CGTC	2	8	36483	36490	0 %	25 %	25 %	50 %	187733854
620	NC_010658	CGG	2	6	36500	36505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733854
621	NC_010658	CGG	2	6	36559	36564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733854
622	NC_010658	TGA	2	6	36608	36613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733854
623	NC_010658	GGC	2	6	36666	36671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733854
624	NC_010658	GGCG	2	8	36692	36699	0 %	0 %	75 %	25 %	187733854
625	NC_010658	CAG	2	6	36771	36776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733854
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627	NC_010658	AAC	2	6	36840	36845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187733854
628	NC_010658	GCG	2	6	36876	36881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733854
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632	NC_010658	GCTG	2	8	36959	36966	0 %	25 %	50 %	25 %	187733854
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641	NC_010658	CTG	2	6	37230	37235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733854
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