MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 72091

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_010658	TGC	2	6	357358	357363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732708
6002	NC_010658	CAA	2	6	357440	357445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187732708
6003	NC_010658	AAC	2	6	357451	357456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187732708
6004	NC_010658	CTG	2	6	357480	357485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732708
6005	NC_010658	GGC	2	6	357590	357595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732708
6006	NC_010658	CACTGC	2	12	357601	357612	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	187732708
6007	NC_010658	CTG	2	6	357669	357674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732708
6008	NC_010658	A	6	6	357717	357722	100 %	0 %	0 %	0 %	187732708
6009	NC_010658	AAC	2	6	357747	357752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187732708
6010	NC_010658	TGA	2	6	357775	357780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732708
6011	NC_010658	AAT	2	6	357832	357837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187732708
6012	NC_010658	GC	3	6	358051	358056	0 %	0 %	50 %	50 %	187730909
6013	NC_010658	GGC	2	6	358058	358063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730909
6014	NC_010658	CGG	2	6	358084	358089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730909
6015	NC_010658	GCA	2	6	358113	358118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730909
6016	NC_010658	AGC	2	6	358127	358132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730909
6017	NC_010658	GAA	2	6	358155	358160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730909
6018	NC_010658	TAA	2	6	358178	358183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187730909
6019	NC_010658	CG	3	6	358206	358211	0 %	0 %	50 %	50 %	187730909
6020	NC_010658	GAA	2	6	358229	358234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730909
6021	NC_010658	GGA	2	6	358286	358291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187730909
6022	NC_010658	TGG	2	6	358324	358329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730909
6023	NC_010658	TAAT	2	8	358356	358363	50 %	50 %	0 %	0 %	187730909
6024	NC_010658	ATC	2	6	358480	358485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731527
6025	NC_010658	CAA	2	6	358505	358510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187731527
6026	NC_010658	GAA	2	6	358533	358538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731527
6027	NC_010658	TCG	2	6	358603	358608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731527
6028	NC_010658	TCAATA	2	12	358612	358623	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	187731527
6029	NC_010658	TCG	2	6	358631	358636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731527
6030	NC_010658	CAGT	2	8	358670	358677	25 %	25 %	25 %	25 %	187731527
6031	NC_010658	GCA	2	6	358679	358684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731527
6032	NC_010658	GGT	2	6	358742	358747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731527
6033	NC_010658	TTA	2	6	358759	358764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187731527
6034	NC_010658	GTTT	2	8	358766	358773	0 %	75 %	25 %	0 %	187731527
6035	NC_010658	AAT	2	6	358897	358902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187730250
6036	NC_010658	TAA	2	6	359074	359079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187730250
6037	NC_010658	GCG	2	6	359120	359125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730250
6038	NC_010658	AT	3	6	359268	359273	50 %	50 %	0 %	0 %	187730250
6039	NC_010658	GCC	2	6	359275	359280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730250
6040	NC_010658	GCT	2	6	359379	359384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730250
6041	NC_010658	AGC	2	6	359401	359406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730250
6042	NC_010658	GC	3	6	359426	359431	0 %	0 %	50 %	50 %	187730250
6043	NC_010658	TCA	2	6	359518	359523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730250
6044	NC_010658	TTG	2	6	359526	359531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187730250
6045	NC_010658	GGT	2	6	359550	359555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730250
6046	NC_010658	CG	3	6	359709	359714	0 %	0 %	50 %	50 %	187730849
6047	NC_010658	GATAGT	2	12	359757	359768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730849
6048	NC_010658	GCG	2	6	359775	359780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730849
6049	NC_010658	GCGTC	2	10	359784	359793	0 %	20 %	40 %	40 %	187730849
6050	NC_010658	TCA	2	6	359843	359848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730849
6051	NC_010658	CAT	2	6	359986	359991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730849
6052	NC_010658	GTCGT	2	10	360014	360023	0 %	40 %	40 %	20 %	187730849
6053	NC_010658	T	6	6	360029	360034	0 %	100 %	0 %	0 %	187730849
6054	NC_010658	AAT	2	6	360046	360051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187730849
6055	NC_010658	TAA	2	6	360250	360255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187730849
6056	NC_010658	TGA	2	6	360263	360268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730849
6057	NC_010658	ACT	2	6	360355	360360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730849
6058	NC_010658	CTC	2	6	360382	360387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187730849
6059	NC_010658	GCG	2	6	360450	360455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730849
6060	NC_010658	AGC	2	6	360482	360487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730849
6061	NC_010658	TAA	2	6	360503	360508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187730849
6062	NC_010658	AAG	2	6	360653	360658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730849
6063	NC_010658	TAA	2	6	360699	360704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187730849
6064	NC_010658	AAT	2	6	360740	360745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187730849
6065	NC_010658	TAT	3	9	360879	360887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187730849
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6068	NC_010658	TGC	2	6	361091	361096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730849
6069	NC_010658	CAT	2	6	361120	361125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730849
6070	NC_010658	CCT	2	6	361215	361220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187730849
6071	NC_010658	TGACGG	2	12	361284	361295	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	187730849
6072	NC_010658	GAAA	2	8	361455	361462	75 %	0 %	25 %	0 %	187733315
6073	NC_010658	GCA	2	6	361474	361479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733315
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6075	NC_010658	CAT	2	6	361513	361518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733315
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6077	NC_010658	GCA	2	6	361608	361613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733315
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6079	NC_010658	TGA	2	6	361701	361706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733315
6080	NC_010658	GCAT	2	8	361763	361770	25 %	25 %	25 %	25 %	187733315
6081	NC_010658	GAC	2	6	361780	361785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733315
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6083	NC_010658	GTT	2	6	361815	361820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187733315
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6085	NC_010658	ACG	2	6	361916	361921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733315
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6087	NC_010658	GC	3	6	362169	362174	0 %	0 %	50 %	50 %	187733315
6088	NC_010658	TC	3	6	362222	362227	0 %	50 %	0 %	50 %	187733315
6089	NC_010658	CTGG	2	8	362241	362248	0 %	25 %	50 %	25 %	187733315
6090	NC_010658	AAT	2	6	362276	362281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187733315
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6093	NC_010658	CT	3	6	362487	362492	0 %	50 %	0 %	50 %	187733871
6094	NC_010658	ACC	2	6	362526	362531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733871
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6100	NC_010658	ACG	2	6	362782	362787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733871
6101	NC_010658	CTT	2	6	362872	362877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733871
6102	NC_010658	AATA	2	8	362887	362894	75 %	25 %	0 %	0 %	187733871
6103	NC_010658	ATT	2	6	362926	362931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187732630
6104	NC_010658	CTTG	2	8	362989	362996	0 %	50 %	25 %	25 %	187732630
6105	NC_010658	TGC	2	6	363009	363014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732630
6106	NC_010658	TGGT	2	8	363033	363040	0 %	50 %	50 %	0 %	187732630
6107	NC_010658	TTG	2	6	363042	363047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732630
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6109	NC_010658	TAC	2	6	363073	363078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732630
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6111	NC_010658	ATT	2	6	363204	363209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187732630
6112	NC_010658	GCA	2	6	363226	363231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732630
6113	NC_010658	CGT	2	6	363298	363303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732630
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6118	NC_010658	CGACC	2	10	363652	363661	20 %	0 %	20 %	60 %	187732630
6119	NC_010658	GGC	2	6	363701	363706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732630
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6121	NC_010658	ATG	2	6	363761	363766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732630
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