MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 72091

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51001	NC_010658	CGG	2	6	3288788	3288793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731656
51002	NC_010658	GCG	2	6	3288818	3288823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731656
51003	NC_010658	GAA	2	6	3288853	3288858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731656
51004	NC_010658	TCA	2	6	3288906	3288911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731656
51005	NC_010658	GTG	2	6	3288995	3289000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731656
51006	NC_010658	TGA	2	6	3289007	3289012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731656
51007	NC_010658	TGG	2	6	3289058	3289063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731656
51008	NC_010658	GCT	2	6	3289107	3289112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731656
51009	NC_010658	TGC	2	6	3289154	3289159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731656
51010	NC_010658	TCAG	2	8	3289289	3289296	25 %	25 %	25 %	25 %	187731656
51011	NC_010658	TCG	2	6	3289322	3289327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731656
51012	NC_010658	TG	3	6	3289330	3289335	0 %	50 %	50 %	0 %	187731656
51013	NC_010658	CG	3	6	3289373	3289378	0 %	0 %	50 %	50 %	187731656
51014	NC_010658	GTTT	2	8	3289407	3289414	0 %	75 %	25 %	0 %	187731656
51015	NC_010658	CGT	2	6	3289450	3289455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731656
51016	NC_010658	ACC	2	6	3289463	3289468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731656
51017	NC_010658	CAG	2	6	3289483	3289488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731656
51018	NC_010658	TGA	2	6	3289499	3289504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731656
51019	NC_010658	GAT	2	6	3289548	3289553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731656
51020	NC_010658	CAG	2	6	3289634	3289639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731656
51021	NC_010658	GAT	2	6	3289663	3289668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731656
51022	NC_010658	CGT	2	6	3289672	3289677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731656
51023	NC_010658	GAA	2	6	3289699	3289704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731656
51024	NC_010658	TTTGAT	2	12	3289928	3289939	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	187730485
51025	NC_010658	AGG	2	6	3289953	3289958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187730485
51026	NC_010658	GA	3	6	3290088	3290093	50 %	0 %	50 %	0 %	187730485
51027	NC_010658	TGA	2	6	3290131	3290136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730485
51028	NC_010658	T	6	6	3290328	3290333	0 %	100 %	0 %	0 %	187730716
51029	NC_010658	CAC	2	6	3290372	3290377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187730716
51030	NC_010658	GCA	2	6	3290419	3290424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730716
51031	NC_010658	AG	3	6	3290454	3290459	50 %	0 %	50 %	0 %	187730716
51032	NC_010658	GGT	2	6	3290938	3290943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733662
51033	NC_010658	CAG	2	6	3291004	3291009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733662
51034	NC_010658	GCGCC	2	10	3291024	3291033	0 %	0 %	40 %	60 %	187733662
51035	NC_010658	TTC	2	6	3291089	3291094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733662
51036	NC_010658	GGT	2	6	3291106	3291111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733662
51037	NC_010658	GGCA	2	8	3291131	3291138	25 %	0 %	50 %	25 %	187733662
51038	NC_010658	CCATTT	2	12	3291144	3291155	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	187733662
51039	NC_010658	GTAC	2	8	3291167	3291174	25 %	25 %	25 %	25 %	187733662
51040	NC_010658	CGA	2	6	3291249	3291254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733662
51041	NC_010658	TCT	2	6	3291278	3291283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733662
51042	NC_010658	TTC	2	6	3291313	3291318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733662
51043	NC_010658	GCT	2	6	3291795	3291800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733000
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51045	NC_010658	CT	4	8	3291861	3291868	0 %	50 %	0 %	50 %	187733000
51046	NC_010658	CTG	2	6	3291925	3291930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733000
51047	NC_010658	TTAACG	2	12	3292045	3292056	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	187733000
51048	NC_010658	TAT	2	6	3292118	3292123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187733000
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51050	NC_010658	A	6	6	3292170	3292175	100 %	0 %	0 %	0 %	187733000
51051	NC_010658	AAAC	2	8	3292193	3292200	75 %	0 %	0 %	25 %	187733000
51052	NC_010658	TTG	2	6	3292243	3292248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187733000
51053	NC_010658	GCT	2	6	3292325	3292330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733000
51054	NC_010658	GGT	2	6	3292409	3292414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733000
51055	NC_010658	GTCT	2	8	3292477	3292484	0 %	50 %	25 %	25 %	187733000
51056	NC_010658	TCT	2	6	3292561	3292566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733000
51057	NC_010658	GCT	3	9	3292574	3292582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733000
51058	NC_010658	AAGA	2	8	3292671	3292678	75 %	0 %	25 %	0 %	187733000
51059	NC_010658	TAA	2	6	3292703	3292708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187733000
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51063	NC_010658	CGC	2	6	3292961	3292966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731547
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51073	NC_010658	CCA	2	6	3293485	3293490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731547
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51081	NC_010658	GGCGC	2	10	3293676	3293685	0 %	0 %	60 %	40 %	187731547
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51111	NC_010658	T	6	6	3295291	3295296	0 %	100 %	0 %	0 %	187731297
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