MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 72091

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_010658	GCCC	2	8	268761	268768	0 %	0 %	25 %	75 %	187731361
4502	NC_010658	ATG	2	6	268810	268815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731361
4503	NC_010658	CAA	2	6	268974	268979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187731361
4504	NC_010658	TAA	2	6	268980	268985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187731361
4505	NC_010658	TGT	2	6	268986	268991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187731361
4506	NC_010658	CATT	2	8	269118	269125	25 %	50 %	0 %	25 %	187731361
4507	NC_010658	AAT	2	6	269145	269150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187731361
4508	NC_010658	GCC	2	6	269170	269175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731361
4509	NC_010658	TCA	2	6	269362	269367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731688
4510	NC_010658	CGC	2	6	269459	269464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731688
4511	NC_010658	GAT	2	6	269547	269552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731688
4512	NC_010658	CGCA	2	8	269592	269599	25 %	0 %	25 %	50 %	187731688
4513	NC_010658	TTG	2	6	269647	269652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187731688
4514	NC_010658	CAG	2	6	269658	269663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731688
4515	NC_010658	TTC	2	6	269740	269745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731688
4516	NC_010658	CG	3	6	269788	269793	0 %	0 %	50 %	50 %	187731688
4517	NC_010658	CTGG	2	8	269849	269856	0 %	25 %	50 %	25 %	187731688
4518	NC_010658	TGT	2	6	269867	269872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187731688
4519	NC_010658	GGT	2	6	269889	269894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731688
4520	NC_010658	CAG	2	6	269907	269912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731688
4521	NC_010658	GTG	2	6	270040	270045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731688
4522	NC_010658	CGC	2	6	270128	270133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731688
4523	NC_010658	ACC	2	6	270232	270237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731688
4524	NC_010658	T	6	6	270327	270332	0 %	100 %	0 %	0 %	187731688
4525	NC_010658	GGT	2	6	270334	270339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731688
4526	NC_010658	GCA	2	6	270391	270396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731688
4527	NC_010658	TC	3	6	270407	270412	0 %	50 %	0 %	50 %	187731688
4528	NC_010658	GTC	2	6	270475	270480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731196
4529	NC_010658	ACG	2	6	270667	270672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731196
4530	NC_010658	TCT	2	6	270693	270698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731196
4531	NC_010658	CAT	2	6	270914	270919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730718
4532	NC_010658	CGT	2	6	270939	270944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730718
4533	NC_010658	GTA	2	6	271001	271006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730718
4534	NC_010658	AAC	2	6	271050	271055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187730718
4535	NC_010658	TTA	2	6	271071	271076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187730718
4536	NC_010658	AGC	2	6	271148	271153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730718
4537	NC_010658	GAG	2	6	271196	271201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187730718
4538	NC_010658	TGA	2	6	271318	271323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730718
4539	NC_010658	TAC	2	6	271346	271351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730718
4540	NC_010658	ACG	3	9	271374	271382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730718
4541	NC_010658	CTG	2	6	271411	271416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730718
4542	NC_010658	CTT	2	6	271466	271471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730718
4543	NC_010658	AGCGA	2	10	271479	271488	40 %	0 %	40 %	20 %	187730718
4544	NC_010658	CCG	2	6	271528	271533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730718
4545	NC_010658	ATC	3	9	271634	271642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730718
4546	NC_010658	GCGT	2	8	271693	271700	0 %	25 %	50 %	25 %	187730718
4547	NC_010658	ATG	2	6	271734	271739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730718
4548	NC_010658	GCG	2	6	271790	271795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730718
4549	NC_010658	GCTG	2	8	271872	271879	0 %	25 %	50 %	25 %	187730718
4550	NC_010658	CAA	2	6	271882	271887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187730718
4551	NC_010658	CAG	2	6	271889	271894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730718
4552	NC_010658	TGT	2	6	271905	271910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187730718
4553	NC_010658	GTTT	2	8	271936	271943	0 %	75 %	25 %	0 %	187730718
4554	NC_010658	TCG	2	6	271944	271949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730718
4555	NC_010658	ATC	2	6	272398	272403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730757
4556	NC_010658	TCAG	2	8	272456	272463	25 %	25 %	25 %	25 %	187730757
4557	NC_010658	TGC	2	6	272496	272501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730757
4558	NC_010658	CG	3	6	272580	272585	0 %	0 %	50 %	50 %	187730757
4559	NC_010658	ACC	2	6	272623	272628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187730757
4560	NC_010658	CGC	2	6	272694	272699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730757
4561	NC_010658	CAT	2	6	272721	272726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730757
4562	NC_010658	TAT	2	6	272826	272831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187730757
4563	NC_010658	ACG	2	6	272932	272937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730757
4564	NC_010658	AGC	2	6	272957	272962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730757
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4567	NC_010658	GCC	2	6	273098	273103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730757
4568	NC_010658	TAA	2	6	273106	273111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187730757
4569	NC_010658	GGTA	2	8	273173	273180	25 %	25 %	50 %	0 %	187733995
4570	NC_010658	CG	3	6	273199	273204	0 %	0 %	50 %	50 %	187733995
4571	NC_010658	AAT	2	6	273227	273232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187733995
4572	NC_010658	ATA	2	6	273246	273251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187733995
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4581	NC_010658	A	6	6	273801	273806	100 %	0 %	0 %	0 %	187733995
4582	NC_010658	ATAA	2	8	273819	273826	75 %	25 %	0 %	0 %	187733995
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4587	NC_010658	GGCA	2	8	275091	275098	25 %	0 %	50 %	25 %	187733115
4588	NC_010658	GAT	2	6	275124	275129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733115
4589	NC_010658	CAT	2	6	275145	275150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733115
4590	NC_010658	TA	3	6	275157	275162	50 %	50 %	0 %	0 %	187733115
4591	NC_010658	ATG	2	6	275201	275206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733115
4592	NC_010658	ATCAT	2	10	275222	275231	40 %	40 %	0 %	20 %	187733115
4593	NC_010658	TGG	2	6	275279	275284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733115
4594	NC_010658	TTC	2	6	275314	275319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733115
4595	NC_010658	CGAT	2	8	275324	275331	25 %	25 %	25 %	25 %	187733115
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4599	NC_010658	GAA	2	6	275483	275488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733115
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4601	NC_010658	AC	3	6	276152	276157	50 %	0 %	0 %	50 %	187733683
4602	NC_010658	ACA	2	6	276257	276262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187733683
4603	NC_010658	AG	3	6	276273	276278	50 %	0 %	50 %	0 %	187733683
4604	NC_010658	CCAA	2	8	276392	276399	50 %	0 %	0 %	50 %	187733683
4605	NC_010658	TCT	2	6	276416	276421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733683
4606	NC_010658	TGG	2	6	276455	276460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733683
4607	NC_010658	CCA	2	6	276524	276529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733683
4608	NC_010658	CTG	2	6	276541	276546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733683
4609	NC_010658	GCG	2	6	276547	276552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733683
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4611	NC_010658	CGC	2	6	276618	276623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733683
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4616	NC_010658	CAA	2	6	276961	276966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187733683
4617	NC_010658	GACCG	2	10	276978	276987	20 %	0 %	40 %	40 %	187733683
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4619	NC_010658	TGC	2	6	277109	277114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732597
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4621	NC_010658	GGC	2	6	277141	277146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732597
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4986	NC_010658	CAT	2	6	301783	301788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730361
4987	NC_010658	AG	3	6	301823	301828	50 %	0 %	50 %	0 %	187730361
4988	NC_010658	GCA	2	6	301830	301835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730361
4989	NC_010658	TTC	2	6	301865	301870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730361
4990	NC_010658	T	6	6	301947	301952	0 %	100 %	0 %	0 %	187730361
4991	NC_010658	CTT	2	6	301953	301958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730361
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4998	NC_010658	GTTG	2	8	302425	302432	0 %	50 %	50 %	0 %	187731576
4999	NC_010658	GGTA	2	8	302467	302474	25 %	25 %	50 %	0 %	187731576
5000	NC_010658	GTG	2	6	302510	302515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731576

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