MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ6

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010480	GCCGT	2	10	419	428	0 %	20 %	40 %	40 %	170079554
2	NC_010480	CAAAG	2	10	1258	1267	60 %	0 %	20 %	20 %	170079555
3	NC_010480	AATCG	2	10	2149	2158	40 %	20 %	20 %	20 %	170079556
4	NC_010480	TCTCC	2	10	8360	8369	0 %	40 %	0 %	60 %	170079561
5	NC_010480	GAGAT	2	10	12210	12219	40 %	20 %	40 %	0 %	170079564
6	NC_010480	CTGAG	2	10	13702	13711	20 %	20 %	40 %	20 %	170079567
7	NC_010480	TTTGG	2	10	13870	13879	0 %	60 %	40 %	0 %	170079567
8	NC_010480	TCAGA	2	10	19087	19096	40 %	20 %	20 %	20 %	170079570
9	NC_010480	ATGTC	2	10	20082	20091	20 %	40 %	20 %	20 %	170079572
10	NC_010480	TTAAT	2	10	23318	23327	40 %	60 %	0 %	0 %	170079575
11	NC_010480	CCCGT	2	10	23688	23697	0 %	20 %	20 %	60 %	170079575
12	NC_010480	ATAGA	2	10	25439	25448	60 %	20 %	20 %	0 %	170079577
13	NC_010480	TAAAT	2	10	26121	26130	60 %	40 %	0 %	0 %	170079578
14	NC_010480	TCAAT	2	10	27937	27946	40 %	40 %	0 %	20 %	170079584
15	NC_010480	TCGAT	2	10	34217	34226	20 %	40 %	20 %	20 %	170079588
16	NC_010480	TGTCT	2	10	35518	35527	0 %	60 %	20 %	20 %	170079589
17	NC_010480	CCCCT	2	10	36513	36522	0 %	20 %	0 %	80 %	170079590
18	NC_010480	GCTGA	2	10	38405	38414	20 %	20 %	40 %	20 %	170079592
19	NC_010480	GACGC	2	10	39603	39612	20 %	0 %	40 %	40 %	170079593
20	NC_010480	CCAGA	2	10	40335	40344	40 %	0 %	20 %	40 %	170079594
21	NC_010480	GCGAC	2	10	41009	41018	20 %	0 %	40 %	40 %	170079595
22	NC_010480	GTTCT	2	10	41225	41234	0 %	60 %	20 %	20 %	170079595
23	NC_010480	TGATT	2	10	42652	42661	20 %	60 %	20 %	0 %	170079595
24	NC_010480	AGCCA	2	10	45152	45161	40 %	0 %	20 %	40 %	170079597
25	NC_010480	TTCCC	2	10	45365	45374	0 %	40 %	0 %	60 %	170079597
26	NC_010480	ATTGC	2	10	50914	50923	20 %	40 %	20 %	20 %	170079601
27	NC_010480	GTATC	2	10	51288	51297	20 %	40 %	20 %	20 %	170079601
28	NC_010480	AATTC	2	10	53149	53158	40 %	40 %	0 %	20 %	170079604
29	NC_010480	GGGGT	2	10	63873	63882	0 %	20 %	80 %	0 %	170079609
30	NC_010480	GGGCA	2	10	63910	63919	20 %	0 %	60 %	20 %	170079609
31	NC_010480	CTTGG	2	10	65982	65991	0 %	40 %	40 %	20 %	170079610
32	NC_010480	TGGCA	2	10	66104	66113	20 %	20 %	40 %	20 %	170079610
33	NC_010480	GCGGT	2	10	66382	66391	0 %	20 %	60 %	20 %	170079610
34	NC_010480	TAAAA	2	10	72523	72532	80 %	20 %	0 %	0 %	170079618
35	NC_010480	TCTTT	2	10	74051	74060	0 %	80 %	0 %	20 %	170079618
36	NC_010480	ATCTT	2	10	74318	74327	20 %	60 %	0 %	20 %	170079618
37	NC_010480	GGCCA	2	10	76805	76814	20 %	0 %	40 %	40 %	170079619
38	NC_010480	CTTTG	2	10	76911	76920	0 %	60 %	20 %	20 %	170079619
39	NC_010480	TGCCA	2	10	79151	79160	20 %	20 %	20 %	40 %	170079622
40	NC_010480	AGAAA	2	10	82098	82107	80 %	0 %	20 %	0 %	170079625
41	NC_010480	AGAAA	2	10	82512	82521	80 %	0 %	20 %	0 %	170079625
42	NC_010480	AGAAA	2	10	82650	82659	80 %	0 %	20 %	0 %	170079625
43	NC_010480	CTCAG	2	10	83403	83412	20 %	20 %	20 %	40 %	170079625
44	NC_010480	GCAGA	2	10	84247	84256	40 %	0 %	40 %	20 %	170079625
45	NC_010480	ACTGG	2	10	85251	85260	20 %	20 %	40 %	20 %	170079626
46	NC_010480	CCAAG	2	10	85945	85954	40 %	0 %	20 %	40 %	170079626
47	NC_010480	TCACC	2	10	89008	89017	20 %	20 %	0 %	60 %	170079630
48	NC_010480	TTTTG	2	10	93095	93104	0 %	80 %	20 %	0 %	170079634
49	NC_010480	ATTCA	2	10	96656	96665	40 %	40 %	0 %	20 %	170079639
50	NC_010480	TGACC	2	10	97984	97993	20 %	20 %	20 %	40 %	170079639
51	NC_010480	TGTTC	2	10	100809	100818	0 %	60 %	20 %	20 %	170079639
52	NC_010480	CCCCT	2	10	100930	100939	0 %	20 %	0 %	80 %	170079639
53	NC_010480	AATAA	2	10	101837	101846	80 %	20 %	0 %	0 %	170079640
54	NC_010480	CATGC	2	10	102160	102169	20 %	20 %	20 %	40 %	170079641
55	NC_010480	ATTTT	2	10	102527	102536	20 %	80 %	0 %	0 %	170079642
56	NC_010480	TTCAG	2	10	106116	106125	20 %	40 %	20 %	20 %	170079643
57	NC_010480	TGCGA	2	10	111654	111663	20 %	20 %	40 %	20 %	170079645
58	NC_010480	CAACT	2	10	112923	112932	40 %	20 %	0 %	40 %	170079650
59	NC_010480	GGATA	2	10	115197	115206	40 %	20 %	40 %	0 %	170079653
60	NC_010480	TAAAG	2	10	115494	115503	60 %	20 %	20 %	0 %	170079653
61	NC_010480	CCAAT	2	10	115743	115752	40 %	20 %	0 %	40 %	170079653
62	NC_010480	AATCA	2	10	117888	117897	60 %	20 %	0 %	20 %	170079656
63	NC_010480	GGGGT	2	10	120436	120445	0 %	20 %	80 %	0 %	170079656
64	NC_010480	TTCTG	2	10	123573	123582	0 %	60 %	20 %	20 %	170079660

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.