MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ6

Total Repeats: 2008

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010480	GCA	2	6	69530	69535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079614
1002	NC_010480	GCG	2	6	69645	69650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079614
1003	NC_010480	CGA	2	6	69668	69673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079614
1004	NC_010480	TTC	2	6	69735	69740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079614
1005	NC_010480	GTCC	2	8	69752	69759	0 %	25 %	25 %	50 %	170079614
1006	NC_010480	GTT	2	6	69763	69768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079614
1007	NC_010480	GTC	2	6	69808	69813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079614
1008	NC_010480	CTTGAT	2	12	69861	69872	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	170079615
1009	NC_010480	TGA	2	6	69890	69895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079615
1010	NC_010480	TCA	2	6	69897	69902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079615
1011	NC_010480	GGA	2	6	69916	69921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170079615
1012	NC_010480	AAT	2	6	70040	70045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079615
1013	NC_010480	TGT	2	6	70047	70052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079615
1014	NC_010480	TGGA	2	8	70059	70066	25 %	25 %	50 %	0 %	170079615
1015	NC_010480	GTT	2	6	70150	70155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079615
1016	NC_010480	CGC	2	6	70158	70163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079615
1017	NC_010480	GTT	2	6	70250	70255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079615
1018	NC_010480	GCG	2	6	70284	70289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079615
1019	NC_010480	GTT	2	6	70291	70296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079615
1020	NC_010480	GAG	2	6	70298	70303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170079615
1021	NC_010480	CAT	2	6	70487	70492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079616
1022	NC_010480	A	6	6	70494	70499	100 %	0 %	0 %	0 %	170079616
1023	NC_010480	CT	3	6	70587	70592	0 %	50 %	0 %	50 %	170079616
1024	NC_010480	CGA	2	6	70605	70610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079616
1025	NC_010480	ATCA	2	8	70663	70670	50 %	25 %	0 %	25 %	170079616
1026	NC_010480	AGG	2	6	70742	70747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170079616
1027	NC_010480	CAC	2	6	70831	70836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079616
1028	NC_010480	CCA	2	6	70851	70856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079616
1029	NC_010480	CTT	2	6	70879	70884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079616
1030	NC_010480	TGG	2	6	70955	70960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079616
1031	NC_010480	CTA	2	6	70999	71004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079617
1032	NC_010480	T	6	6	71005	71010	0 %	100 %	0 %	0 %	170079617
1033	NC_010480	TTG	2	6	71030	71035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079617
1034	NC_010480	TAA	2	6	71063	71068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079617
1035	NC_010480	TCT	2	6	71091	71096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079617
1036	NC_010480	GCC	3	9	71139	71147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079617
1037	NC_010480	TCAG	2	8	71169	71176	25 %	25 %	25 %	25 %	170079617
1038	NC_010480	GCT	2	6	71196	71201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079617
1039	NC_010480	AGCG	2	8	71245	71252	25 %	0 %	50 %	25 %	170079617
1040	NC_010480	TAC	2	6	71369	71374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079618
1041	NC_010480	CTT	2	6	71472	71477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079618
1042	NC_010480	T	8	8	71476	71483	0 %	100 %	0 %	0 %	170079618
1043	NC_010480	CCG	2	6	71542	71547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079618
1044	NC_010480	GTTT	3	12	71583	71594	0 %	75 %	25 %	0 %	170079618
1045	NC_010480	ATA	3	9	71608	71616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079618
1046	NC_010480	ATC	2	6	71641	71646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079618
1047	NC_010480	AG	3	6	71655	71660	50 %	0 %	50 %	0 %	170079618
1048	NC_010480	AGA	2	6	71711	71716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079618
1049	NC_010480	AG	3	6	71758	71763	50 %	0 %	50 %	0 %	170079618
1050	NC_010480	AGC	2	6	71869	71874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079618
1051	NC_010480	ATG	2	6	71875	71880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079618
1052	NC_010480	CT	3	6	71901	71906	0 %	50 %	0 %	50 %	170079618
1053	NC_010480	AG	3	6	71910	71915	50 %	0 %	50 %	0 %	170079618
1054	NC_010480	GAT	2	6	71955	71960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079618
1055	NC_010480	T	7	7	71983	71989	0 %	100 %	0 %	0 %	170079618
1056	NC_010480	CTA	2	6	72039	72044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079618
1057	NC_010480	ATA	2	6	72150	72155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079618
1058	NC_010480	GCA	2	6	72263	72268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079618
1059	NC_010480	ATG	2	6	72277	72282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079618
1060	NC_010480	TTG	2	6	72393	72398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079618
1061	NC_010480	T	6	6	72436	72441	0 %	100 %	0 %	0 %	170079618
1062	NC_010480	TCT	2	6	72452	72457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079618
1063	NC_010480	TAAAA	2	10	72523	72532	80 %	20 %	0 %	0 %	170079618
1064	NC_010480	AT	3	6	72533	72538	50 %	50 %	0 %	0 %	170079618
1065	NC_010480	TAA	2	6	72597	72602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079618
1066	NC_010480	TTC	2	6	72604	72609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079618
1067	NC_010480	TGC	2	6	72635	72640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079618
1068	NC_010480	TCT	2	6	72653	72658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079618
1069	NC_010480	T	6	6	72678	72683	0 %	100 %	0 %	0 %	170079618
1070	NC_010480	TCT	2	6	72710	72715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079618
1071	NC_010480	AAT	2	6	72738	72743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079618
1072	NC_010480	GAA	2	6	72747	72752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079618
1073	NC_010480	TCT	2	6	72782	72787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079618
1074	NC_010480	ATA	2	6	72820	72825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079618
1075	NC_010480	ATT	2	6	72838	72843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079618
1076	NC_010480	CTT	2	6	72861	72866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079618
1077	NC_010480	CT	3	6	72939	72944	0 %	50 %	0 %	50 %	170079618
1078	NC_010480	ATTG	2	8	72991	72998	25 %	50 %	25 %	0 %	170079618
1079	NC_010480	AAT	2	6	73006	73011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079618
1080	NC_010480	GCC	2	6	73017	73022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079618
1081	NC_010480	TCA	2	6	73028	73033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079618
1082	NC_010480	AAG	2	6	73048	73053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079618
1083	NC_010480	TGC	2	6	73106	73111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079618
1084	NC_010480	A	6	6	73114	73119	100 %	0 %	0 %	0 %	170079618
1085	NC_010480	TCT	2	6	73226	73231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079618
1086	NC_010480	TC	4	8	73246	73253	0 %	50 %	0 %	50 %	170079618
1087	NC_010480	T	6	6	73330	73335	0 %	100 %	0 %	0 %	170079618
1088	NC_010480	AGT	2	6	73338	73343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079618
1089	NC_010480	CT	3	6	73467	73472	0 %	50 %	0 %	50 %	170079618
1090	NC_010480	ATT	2	6	73546	73551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079618
1091	NC_010480	GAC	2	6	73618	73623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079618
1092	NC_010480	TTCT	2	8	73659	73666	0 %	75 %	0 %	25 %	170079618
1093	NC_010480	ATT	2	6	73684	73689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079618
1094	NC_010480	AGA	2	6	73711	73716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079618
1095	NC_010480	TGAT	2	8	73823	73830	25 %	50 %	25 %	0 %	170079618
1096	NC_010480	CAG	2	6	73845	73850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079618
1097	NC_010480	CT	3	6	73856	73861	0 %	50 %	0 %	50 %	170079618
1098	NC_010480	A	6	6	73893	73898	100 %	0 %	0 %	0 %	170079618
1099	NC_010480	TAT	2	6	74001	74006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079618
1100	NC_010480	AGAT	2	8	74020	74027	50 %	25 %	25 %	0 %	170079618
1101	NC_010480	GAA	2	6	74028	74033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079618
1102	NC_010480	TCTTT	2	10	74051	74060	0 %	80 %	0 %	20 %	170079618
1103	NC_010480	CAA	2	6	74064	74069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079618
1104	NC_010480	T	6	6	74130	74135	0 %	100 %	0 %	0 %	170079618
1105	NC_010480	TCT	2	6	74138	74143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079618
1106	NC_010480	A	7	7	74167	74173	100 %	0 %	0 %	0 %	170079618
1107	NC_010480	CTT	2	6	74181	74186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079618
1108	NC_010480	TA	3	6	74262	74267	50 %	50 %	0 %	0 %	170079618
1109	NC_010480	AGT	2	6	74273	74278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079618
1110	NC_010480	T	6	6	74278	74283	0 %	100 %	0 %	0 %	170079618
1111	NC_010480	ATCTT	2	10	74318	74327	20 %	60 %	0 %	20 %	170079618
1112	NC_010480	TA	3	6	74349	74354	50 %	50 %	0 %	0 %	170079618
1113	NC_010480	T	6	6	74357	74362	0 %	100 %	0 %	0 %	170079618
1114	NC_010480	A	6	6	74390	74395	100 %	0 %	0 %	0 %	170079618
1115	NC_010480	CAG	2	6	74409	74414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079618
1116	NC_010480	T	6	6	74447	74452	0 %	100 %	0 %	0 %	170079618
1117	NC_010480	TAG	2	6	74518	74523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079618
1118	NC_010480	T	6	6	74532	74537	0 %	100 %	0 %	0 %	170079618
1119	NC_010480	ATTT	2	8	74544	74551	25 %	75 %	0 %	0 %	170079618
1120	NC_010480	AAT	2	6	74683	74688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079618
1121	NC_010480	A	6	6	74718	74723	100 %	0 %	0 %	0 %	170079618
1122	NC_010480	T	6	6	74725	74730	0 %	100 %	0 %	0 %	170079618
1123	NC_010480	AAT	2	6	74740	74745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079618
1124	NC_010480	GTA	2	6	74791	74796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079618
1125	NC_010480	GCTT	2	8	74813	74820	0 %	50 %	25 %	25 %	170079618
1126	NC_010480	ATA	2	6	74897	74902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079618
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