MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ6

Total Repeats: 2008

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010480	CTCC	2	8	30983	30990	0 %	25 %	0 %	75 %	170079584
502	NC_010480	GAA	2	6	31072	31077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079584
503	NC_010480	A	7	7	31154	31160	100 %	0 %	0 %	0 %	170079584
504	NC_010480	CTA	2	6	31348	31353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079585
505	NC_010480	CGC	2	6	31374	31379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079585
506	NC_010480	TC	3	6	31452	31457	0 %	50 %	0 %	50 %	170079585
507	NC_010480	TCTG	2	8	31544	31551	0 %	50 %	25 %	25 %	170079585
508	NC_010480	GCC	2	6	31642	31647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079585
509	NC_010480	AGA	2	6	31769	31774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079585
510	NC_010480	CTT	2	6	31937	31942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079586
511	NC_010480	CCA	3	9	31945	31953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079586
512	NC_010480	CCA	3	9	31963	31971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079586
513	NC_010480	TAA	2	6	32106	32111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079586
514	NC_010480	ATT	2	6	32123	32128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079586
515	NC_010480	CGC	2	6	32152	32157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079586
516	NC_010480	AAT	2	6	32210	32215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079586
517	NC_010480	TGG	2	6	32513	32518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079586
518	NC_010480	CTG	2	6	32581	32586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079586
519	NC_010480	T	6	6	32652	32657	0 %	100 %	0 %	0 %	170079586
520	NC_010480	CTG	2	6	32700	32705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079586
521	NC_010480	GAT	2	6	32706	32711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079586
522	NC_010480	TG	3	6	32712	32717	0 %	50 %	50 %	0 %	170079586
523	NC_010480	CAA	2	6	32893	32898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079587
524	NC_010480	CTC	2	6	33086	33091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079587
525	NC_010480	ATC	2	6	33117	33122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079587
526	NC_010480	AGG	2	6	33132	33137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170079587
527	NC_010480	TTC	2	6	33143	33148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079587
528	NC_010480	CATA	2	8	33178	33185	50 %	25 %	0 %	25 %	170079587
529	NC_010480	T	8	8	33246	33253	0 %	100 %	0 %	0 %	170079587
530	NC_010480	TCA	2	6	33273	33278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079587
531	NC_010480	AATC	2	8	33331	33338	50 %	25 %	0 %	25 %	170079587
532	NC_010480	CTG	2	6	33349	33354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079587
533	NC_010480	TGA	2	6	33400	33405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079587
534	NC_010480	CCA	2	6	33454	33459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079588
535	NC_010480	A	7	7	33692	33698	100 %	0 %	0 %	0 %	170079588
536	NC_010480	TC	3	6	33741	33746	0 %	50 %	0 %	50 %	170079588
537	NC_010480	AATCAA	2	12	33921	33932	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	170079588
538	NC_010480	TTGA	2	8	33946	33953	25 %	50 %	25 %	0 %	170079588
539	NC_010480	CAG	2	6	34036	34041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079588
540	NC_010480	TCA	2	6	34055	34060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079588
541	NC_010480	GCC	2	6	34075	34080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079588
542	NC_010480	TTA	2	6	34160	34165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079588
543	NC_010480	CCA	2	6	34186	34191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079588
544	NC_010480	TCGAT	2	10	34217	34226	20 %	40 %	20 %	20 %	170079588
545	NC_010480	AGCC	2	8	34360	34367	25 %	0 %	25 %	50 %	170079588
546	NC_010480	CTC	2	6	34384	34389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079588
547	NC_010480	ATA	2	6	34398	34403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079588
548	NC_010480	CT	3	6	34415	34420	0 %	50 %	0 %	50 %	170079588
549	NC_010480	CTG	2	6	34677	34682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079588
550	NC_010480	TG	3	6	34681	34686	0 %	50 %	50 %	0 %	170079588
551	NC_010480	TCA	2	6	34725	34730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079588
552	NC_010480	A	7	7	34759	34765	100 %	0 %	0 %	0 %	170079588
553	NC_010480	TC	3	6	34782	34787	0 %	50 %	0 %	50 %	170079588
554	NC_010480	ATC	2	6	34843	34848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079588
555	NC_010480	GCA	2	6	34859	34864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079588
556	NC_010480	TTGA	2	8	34891	34898	25 %	50 %	25 %	0 %	170079588
557	NC_010480	CAC	2	6	34926	34931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079588
558	NC_010480	ATC	2	6	35005	35010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079588
559	NC_010480	CTG	2	6	35263	35268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079589
560	NC_010480	AGC	2	6	35357	35362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079589
561	NC_010480	TGA	2	6	35377	35382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079589
562	NC_010480	A	6	6	35382	35387	100 %	0 %	0 %	0 %	170079589
563	NC_010480	ACG	2	6	35396	35401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079589
564	NC_010480	T	7	7	35458	35464	0 %	100 %	0 %	0 %	170079589
565	NC_010480	GA	3	6	35511	35516	50 %	0 %	50 %	0 %	170079589
566	NC_010480	TGTCT	2	10	35518	35527	0 %	60 %	20 %	20 %	170079589
567	NC_010480	GTA	2	6	35569	35574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079589
568	NC_010480	GTT	2	6	35590	35595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079589
569	NC_010480	TAA	2	6	35961	35966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079590
570	NC_010480	CTG	2	6	36258	36263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079590
571	NC_010480	TGC	3	9	36327	36335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079590
572	NC_010480	CAAC	2	8	36346	36353	50 %	0 %	0 %	50 %	170079590
573	NC_010480	GAG	2	6	36365	36370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170079590
574	NC_010480	CAC	2	6	36482	36487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079590
575	NC_010480	CCCCT	2	10	36513	36522	0 %	20 %	0 %	80 %	170079590
576	NC_010480	CAGT	2	8	36575	36582	25 %	25 %	25 %	25 %	170079590
577	NC_010480	TTG	2	6	36897	36902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079590
578	NC_010480	CAT	2	6	36911	36916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079590
579	NC_010480	ATG	2	6	36957	36962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079590
580	NC_010480	A	6	6	36965	36970	100 %	0 %	0 %	0 %	170079590
581	NC_010480	AAT	2	6	36990	36995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079590
582	NC_010480	GCA	2	6	37128	37133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079591
583	NC_010480	AAT	2	6	37149	37154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079591
584	NC_010480	GCCG	2	8	37205	37212	0 %	0 %	50 %	50 %	170079591
585	NC_010480	CGT	2	6	37231	37236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079591
586	NC_010480	AGT	2	6	37278	37283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079591
587	NC_010480	CGA	2	6	37322	37327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079591
588	NC_010480	CCA	2	6	37335	37340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079591
589	NC_010480	CAG	2	6	37369	37374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079591
590	NC_010480	ATA	2	6	37379	37384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079591
591	NC_010480	TGA	2	6	37388	37393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079591
592	NC_010480	CAC	2	6	37441	37446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079591
593	NC_010480	CTC	2	6	37525	37530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079591
594	NC_010480	CGT	2	6	37575	37580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079591
595	NC_010480	TTG	2	6	37600	37605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079591
596	NC_010480	TTC	2	6	37651	37656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079591
597	NC_010480	CTG	2	6	37720	37725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079591
598	NC_010480	TTG	2	6	37768	37773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079591
599	NC_010480	AATT	2	8	37786	37793	50 %	50 %	0 %	0 %	170079591
600	NC_010480	TGG	2	6	37896	37901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079591
601	NC_010480	TCC	2	6	37905	37910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079592
602	NC_010480	GGA	2	6	37942	37947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170079592
603	NC_010480	AGGC	2	8	38034	38041	25 %	0 %	50 %	25 %	170079592
604	NC_010480	AAC	2	6	38054	38059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079592
605	NC_010480	GTT	2	6	38092	38097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079592
606	NC_010480	ATAA	2	8	38124	38131	75 %	25 %	0 %	0 %	170079592
607	NC_010480	CAT	2	6	38233	38238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079592
608	NC_010480	GGC	2	6	38285	38290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079592
609	NC_010480	GCTGA	2	10	38405	38414	20 %	20 %	40 %	20 %	170079592
610	NC_010480	TGC	2	6	38472	38477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079592
611	NC_010480	CAG	2	6	38524	38529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079592
612	NC_010480	GTT	2	6	38557	38562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079592
613	NC_010480	CAG	2	6	38596	38601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079592
614	NC_010480	ATC	2	6	38658	38663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079592
615	NC_010480	TCC	2	6	38669	38674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079592
616	NC_010480	TGC	2	6	38744	38749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079592
617	NC_010480	TCC	2	6	38756	38761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079592
618	NC_010480	GCT	2	6	38775	38780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079592
619	NC_010480	A	7	7	38790	38796	100 %	0 %	0 %	0 %	170079592
620	NC_010480	AGA	2	6	38964	38969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079592
621	NC_010480	A	7	7	38969	38975	100 %	0 %	0 %	0 %	170079592
622	NC_010480	TTA	2	6	38979	38984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079592
623	NC_010480	CTG	3	9	38990	38998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079592
624	NC_010480	ATA	2	6	39050	39055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079592
625	NC_010480	GTG	2	6	39064	39069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079592
626	NC_010480	A	6	6	39090	39095	100 %	0 %	0 %	0 %	170079592
627	NC_010480	AAT	2	6	39165	39170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079593
628	NC_010480	GCG	2	6	39195	39200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079593
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