MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ5

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010479	TGAT	2	8	242	249	25 %	50 %	25 %	0 %	170079514
2	NC_010479	GAAT	2	8	2853	2860	50 %	25 %	25 %	0 %	170079516
3	NC_010479	AGGC	2	8	3672	3679	25 %	0 %	50 %	25 %	170079518
4	NC_010479	CCTA	2	8	3780	3787	25 %	25 %	0 %	50 %	170079518
5	NC_010479	CAGA	2	8	4005	4012	50 %	0 %	25 %	25 %	170079519
6	NC_010479	TGGA	2	8	4089	4096	25 %	25 %	50 %	0 %	170079519
7	NC_010479	GAAC	2	8	4136	4143	50 %	0 %	25 %	25 %	170079519
8	NC_010479	ATCC	2	8	4805	4812	25 %	25 %	0 %	50 %	170079521
9	NC_010479	AAGG	2	8	5108	5115	50 %	0 %	50 %	0 %	170079522
10	NC_010479	CAAT	2	8	6150	6157	50 %	25 %	0 %	25 %	170079524
11	NC_010479	TGGT	2	8	6501	6508	0 %	50 %	50 %	0 %	170079524
12	NC_010479	GGAG	2	8	6954	6961	25 %	0 %	75 %	0 %	170079525
13	NC_010479	CAGG	2	8	7080	7087	25 %	0 %	50 %	25 %	170079525
14	NC_010479	CCAG	2	8	8244	8251	25 %	0 %	25 %	50 %	170079526
15	NC_010479	GACT	2	8	9202	9209	25 %	25 %	25 %	25 %	170079527
16	NC_010479	GCCA	2	8	9389	9396	25 %	0 %	25 %	50 %	170079527
17	NC_010479	TCAA	2	8	10931	10938	50 %	25 %	0 %	25 %	170079529
18	NC_010479	TTCA	2	8	12047	12054	25 %	50 %	0 %	25 %	170079531
19	NC_010479	TAAA	2	8	12705	12712	75 %	25 %	0 %	0 %	170079531
20	NC_010479	ATCC	2	8	12812	12819	25 %	25 %	0 %	50 %	170079531
21	NC_010479	TAGC	2	8	14125	14132	25 %	25 %	25 %	25 %	170079532
22	NC_010479	ACTG	2	8	14322	14329	25 %	25 %	25 %	25 %	170079532
23	NC_010479	TGTC	2	8	14778	14785	0 %	50 %	25 %	25 %	170079533
24	NC_010479	GCCA	2	8	14996	15003	25 %	0 %	25 %	50 %	170079534
25	NC_010479	TTTC	2	8	15037	15044	0 %	75 %	0 %	25 %	170079534
26	NC_010479	ACTG	2	8	15573	15580	25 %	25 %	25 %	25 %	170079535
27	NC_010479	AAGG	2	8	15601	15608	50 %	0 %	50 %	0 %	170079535
28	NC_010479	CTCA	2	8	16177	16184	25 %	25 %	0 %	50 %	170079535
29	NC_010479	GGCT	2	8	17341	17348	0 %	25 %	50 %	25 %	170079537
30	NC_010479	GCGG	2	8	17413	17420	0 %	0 %	75 %	25 %	170079537
31	NC_010479	GTCG	2	8	17498	17505	0 %	25 %	50 %	25 %	170079537
32	NC_010479	ATCA	2	8	18019	18026	50 %	25 %	0 %	25 %	170079538
33	NC_010479	ATTG	2	8	18055	18062	25 %	50 %	25 %	0 %	170079538
34	NC_010479	GCCA	2	8	18247	18254	25 %	0 %	25 %	50 %	170079538
35	NC_010479	AATT	2	8	19758	19765	50 %	50 %	0 %	0 %	170079539
36	NC_010479	AAGA	2	8	20798	20805	75 %	0 %	25 %	0 %	170079540
37	NC_010479	CTGA	2	8	20810	20817	25 %	25 %	25 %	25 %	170079540
38	NC_010479	GTTA	2	8	20845	20852	25 %	50 %	25 %	0 %	170079540
39	NC_010479	GAAA	2	8	21233	21240	75 %	0 %	25 %	0 %	170079540
40	NC_010479	TTTC	2	8	21335	21342	0 %	75 %	0 %	25 %	170079540
41	NC_010479	CCCA	2	8	21766	21773	25 %	0 %	0 %	75 %	170079541
42	NC_010479	ACCG	2	8	22446	22453	25 %	0 %	25 %	50 %	170079541
43	NC_010479	CCAT	2	8	22638	22645	25 %	25 %	0 %	50 %	170079541
44	NC_010479	AGCG	2	8	22713	22720	25 %	0 %	50 %	25 %	170079541
45	NC_010479	GCAA	2	8	23325	23332	50 %	0 %	25 %	25 %	170079541
46	NC_010479	ATCA	2	8	24040	24047	50 %	25 %	0 %	25 %	170079542
47	NC_010479	CCTA	2	8	24092	24099	25 %	25 %	0 %	50 %	170079542
48	NC_010479	GAAA	2	8	24169	24176	75 %	0 %	25 %	0 %	170079542
49	NC_010479	TAAA	2	8	24215	24222	75 %	25 %	0 %	0 %	170079542
50	NC_010479	ACAG	2	8	24517	24524	50 %	0 %	25 %	25 %	170079543
51	NC_010479	TATT	2	8	25147	25154	25 %	75 %	0 %	0 %	170079544
52	NC_010479	CACT	2	8	25210	25217	25 %	25 %	0 %	50 %	170079544
53	NC_010479	GGAA	2	8	25295	25302	50 %	0 %	50 %	0 %	170079544
54	NC_010479	TAAT	2	8	25760	25767	50 %	50 %	0 %	0 %	170079545
55	NC_010479	AGTG	2	8	26139	26146	25 %	25 %	50 %	0 %	170079545
56	NC_010479	AATT	2	8	26692	26699	50 %	50 %	0 %	0 %	170079546
57	NC_010479	CCGA	2	8	27415	27422	25 %	0 %	25 %	50 %	170079546
58	NC_010479	ATTT	2	8	28125	28132	25 %	75 %	0 %	0 %	170079547
59	NC_010479	CTTT	2	8	28259	28266	0 %	75 %	0 %	25 %	170079547
60	NC_010479	TTCA	2	8	28330	28337	25 %	50 %	0 %	25 %	170079547
61	NC_010479	ACTA	2	8	29564	29571	50 %	25 %	0 %	25 %	170079548
62	NC_010479	TTTA	2	8	30056	30063	25 %	75 %	0 %	0 %	170079548
63	NC_010479	GGAA	2	8	30584	30591	50 %	0 %	50 %	0 %	170079548
64	NC_010479	CGAA	2	8	32532	32539	50 %	0 %	25 %	25 %	170079548
65	NC_010479	AGCA	2	8	33011	33018	50 %	0 %	25 %	25 %	170079550
66	NC_010479	GATG	2	8	33111	33118	25 %	25 %	50 %	0 %	170079550
67	NC_010479	GAAG	2	8	33630	33637	50 %	0 %	50 %	0 %	170079551
68	NC_010479	GAAG	2	8	33639	33646	50 %	0 %	50 %	0 %	170079551
69	NC_010479	TTTG	2	8	33666	33673	0 %	75 %	25 %	0 %	170079551
70	NC_010479	GATT	2	8	33708	33715	25 %	50 %	25 %	0 %	170079551
71	NC_010479	TTGG	2	8	33731	33738	0 %	50 %	50 %	0 %	170079551
72	NC_010479	AAGG	2	8	33793	33800	50 %	0 %	50 %	0 %	170079551
73	NC_010479	CCCT	2	8	33834	33841	0 %	25 %	0 %	75 %	170079551
74	NC_010479	ATTC	2	8	33970	33977	25 %	50 %	0 %	25 %	170079551
75	NC_010479	GATG	2	8	34089	34096	25 %	25 %	50 %	0 %	170079551
76	NC_010479	AGAA	2	8	35171	35178	75 %	0 %	25 %	0 %	170079551
77	NC_010479	AAAT	2	8	36345	36352	75 %	25 %	0 %	0 %	170079552
78	NC_010479	CGAT	2	8	37101	37108	25 %	25 %	25 %	25 %	170079552
79	NC_010479	CATT	2	8	37189	37196	25 %	50 %	0 %	25 %	170079552
80	NC_010479	GTTG	2	8	37406	37413	0 %	50 %	50 %	0 %	170079552
81	NC_010479	TCTT	2	8	37588	37595	0 %	75 %	0 %	25 %	170079552
82	NC_010479	AAAT	2	8	38049	38056	75 %	25 %	0 %	0 %	170079552

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.