MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ5

Total Repeats: 655

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010479	T	6	6	32762	32767	0 %	100 %	0 %	0 %	170079549
502	NC_010479	GAT	2	6	32795	32800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079549
503	NC_010479	AGA	3	9	32810	32818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079549
504	NC_010479	GCG	2	6	32893	32898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079550
505	NC_010479	GGT	2	6	32977	32982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079550
506	NC_010479	AGCA	2	8	33011	33018	50 %	0 %	25 %	25 %	170079550
507	NC_010479	TTG	2	6	33064	33069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079550
508	NC_010479	GATG	2	8	33111	33118	25 %	25 %	50 %	0 %	170079550
509	NC_010479	TGA	2	6	33141	33146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079550
510	NC_010479	GTC	2	6	33155	33160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079550
511	NC_010479	GAT	2	6	33252	33257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079550
512	NC_010479	GAA	2	6	33345	33350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079551
513	NC_010479	A	6	6	33358	33363	100 %	0 %	0 %	0 %	170079551
514	NC_010479	CGA	2	6	33365	33370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079551
515	NC_010479	TGA	2	6	33420	33425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079551
516	NC_010479	GGA	2	6	33444	33449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170079551
517	NC_010479	GGAAGG	2	12	33512	33523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170079551
518	NC_010479	CAT	2	6	33597	33602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079551
519	NC_010479	GCA	2	6	33615	33620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079551
520	NC_010479	GAAG	2	8	33630	33637	50 %	0 %	50 %	0 %	170079551
521	NC_010479	GAAG	2	8	33639	33646	50 %	0 %	50 %	0 %	170079551
522	NC_010479	TTTG	2	8	33666	33673	0 %	75 %	25 %	0 %	170079551
523	NC_010479	GAG	2	6	33685	33690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170079551
524	NC_010479	GATT	2	8	33708	33715	25 %	50 %	25 %	0 %	170079551
525	NC_010479	TTGG	2	8	33731	33738	0 %	50 %	50 %	0 %	170079551
526	NC_010479	GAT	2	6	33747	33752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079551
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528	NC_010479	TGA	2	6	33773	33778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079551
529	NC_010479	AAGG	2	8	33793	33800	50 %	0 %	50 %	0 %	170079551
530	NC_010479	CCCT	2	8	33834	33841	0 %	25 %	0 %	75 %	170079551
531	NC_010479	ATTC	2	8	33970	33977	25 %	50 %	0 %	25 %	170079551
532	NC_010479	TGG	2	6	34007	34012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079551
533	NC_010479	GTT	2	6	34040	34045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079551
534	NC_010479	TGA	2	6	34059	34064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079551
535	NC_010479	GATG	2	8	34089	34096	25 %	25 %	50 %	0 %	170079551
536	NC_010479	TAA	2	6	34127	34132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079551
537	NC_010479	TGT	2	6	34134	34139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079551
538	NC_010479	AAC	2	6	34143	34148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079551
539	NC_010479	CAA	2	6	34154	34159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079551
540	NC_010479	CAT	2	6	34160	34165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079551
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542	NC_010479	T	8	8	34235	34242	0 %	100 %	0 %	0 %	170079551
543	NC_010479	A	9	9	34244	34252	100 %	0 %	0 %	0 %	170079551
544	NC_010479	GGT	2	6	34255	34260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079551
545	NC_010479	ACA	2	6	34277	34282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079551
546	NC_010479	A	7	7	34306	34312	100 %	0 %	0 %	0 %	170079551
547	NC_010479	AAC	2	6	34331	34336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079551
548	NC_010479	ATA	2	6	34343	34348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079551
549	NC_010479	GA	3	6	34352	34357	50 %	0 %	50 %	0 %	170079551
550	NC_010479	TTTGAA	2	12	34426	34437	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	170079551
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552	NC_010479	ATC	2	6	34521	34526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079551
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557	NC_010479	GAA	2	6	34744	34749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079551
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559	NC_010479	GAA	2	6	34855	34860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079551
560	NC_010479	AAG	2	6	34871	34876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079551
561	NC_010479	GAA	2	6	34990	34995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079551
562	NC_010479	CTG	2	6	35059	35064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079551
563	NC_010479	GAA	2	6	35077	35082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079551
564	NC_010479	AAG	2	6	35120	35125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079551
565	NC_010479	ATT	2	6	35133	35138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079551
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574	NC_010479	A	6	6	35416	35421	100 %	0 %	0 %	0 %	170079551
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603	NC_010479	A	7	7	36605	36611	100 %	0 %	0 %	0 %	170079552
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