MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 chromosome

Total Repeats: 5182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010475	CCAA	2	8	370	377	50 %	0 %	0 %	50 %	170076637
2	NC_010475	CCAC	2	8	914	921	25 %	0 %	0 %	75 %	170076637
3	NC_010475	ACCC	2	8	1681	1688	25 %	0 %	0 %	75 %	170076638
4	NC_010475	TTAT	2	8	2207	2214	25 %	75 %	0 %	0 %	170076638
5	NC_010475	TCAA	2	8	2678	2685	50 %	25 %	0 %	25 %	170076639
6	NC_010475	GGCT	2	8	3196	3203	0 %	25 %	50 %	25 %	170076641
7	NC_010475	CGGG	2	8	3810	3817	0 %	0 %	75 %	25 %	170076642
8	NC_010475	TTGA	2	8	4014	4021	25 %	50 %	25 %	0 %	170076642
9	NC_010475	ATTT	2	8	6027	6034	25 %	75 %	0 %	0 %	170076646
10	NC_010475	CAAA	2	8	6464	6471	75 %	0 %	0 %	25 %	170076646
11	NC_010475	ACCC	2	8	6537	6544	25 %	0 %	0 %	75 %	170076646
12	NC_010475	GGCG	2	8	6615	6622	0 %	0 %	75 %	25 %	170076646
13	NC_010475	TAAT	2	8	6631	6638	50 %	50 %	0 %	0 %	170076646
14	NC_010475	ACTA	2	8	7521	7528	50 %	25 %	0 %	25 %	170076647
15	NC_010475	AGAA	2	8	7783	7790	75 %	0 %	25 %	0 %	170076648
16	NC_010475	TACC	2	8	8370	8377	25 %	25 %	0 %	50 %	170076649
17	NC_010475	TGCA	2	8	8474	8481	25 %	25 %	25 %	25 %	170076649
18	NC_010475	CTGC	2	8	9485	9492	0 %	25 %	25 %	50 %	170076649
19	NC_010475	TTGA	2	8	9604	9611	25 %	50 %	25 %	0 %	170076649
20	NC_010475	TTGA	2	8	9819	9826	25 %	50 %	25 %	0 %	170076650
21	NC_010475	TTGT	2	8	9885	9892	0 %	75 %	25 %	0 %	170076650
22	NC_010475	CGCC	2	8	11118	11125	0 %	0 %	25 %	75 %	170076651
23	NC_010475	CCGA	2	8	11322	11329	25 %	0 %	25 %	50 %	170076651
24	NC_010475	TCAA	2	8	12459	12466	50 %	25 %	0 %	25 %	170076654
25	NC_010475	GTTT	2	8	13760	13767	0 %	75 %	25 %	0 %	170076655
26	NC_010475	GCGG	2	8	13914	13921	0 %	0 %	75 %	25 %	170076655
27	NC_010475	GCTG	2	8	14321	14328	0 %	25 %	50 %	25 %	170076656
28	NC_010475	GCTC	2	8	14607	14614	0 %	25 %	25 %	50 %	170076656
29	NC_010475	AAAT	2	8	15303	15310	75 %	25 %	0 %	0 %	170076657
30	NC_010475	TTAA	2	8	15413	15420	50 %	50 %	0 %	0 %	170076657
31	NC_010475	ACTT	2	8	15840	15847	25 %	50 %	0 %	25 %	170076657
32	NC_010475	AGGT	2	8	16099	16106	25 %	25 %	50 %	0 %	170076658
33	NC_010475	TGAT	2	8	16715	16722	25 %	50 %	25 %	0 %	170076658
34	NC_010475	GGTT	2	8	16771	16778	0 %	50 %	50 %	0 %	170076658
35	NC_010475	AAAT	2	8	18199	18206	75 %	25 %	0 %	0 %	170076658
36	NC_010475	TCGG	2	8	19959	19966	0 %	25 %	50 %	25 %	170076658
37	NC_010475	GACC	2	8	20250	20257	25 %	0 %	25 %	50 %	170076659
38	NC_010475	CCAA	2	8	20354	20361	50 %	0 %	0 %	50 %	170076659
39	NC_010475	GTGG	2	8	21250	21257	0 %	25 %	75 %	0 %	170076660
40	NC_010475	GCGG	2	8	21837	21844	0 %	0 %	75 %	25 %	170076660
41	NC_010475	GGCA	2	8	22423	22430	25 %	0 %	50 %	25 %	170076661
42	NC_010475	CAAA	2	8	23454	23461	75 %	0 %	0 %	25 %	170076662
43	NC_010475	TAAA	2	8	25185	25192	75 %	25 %	0 %	0 %	170076663
44	NC_010475	TACT	2	8	25406	25413	25 %	50 %	0 %	25 %	170076664
45	NC_010475	TCTT	2	8	28215	28222	0 %	75 %	0 %	25 %	170076666
46	NC_010475	TACC	2	8	28623	28630	25 %	25 %	0 %	50 %	170076667
47	NC_010475	CAGC	2	8	30303	30310	25 %	0 %	25 %	50 %	170076668
48	NC_010475	GATA	2	8	30394	30401	50 %	25 %	25 %	0 %	170076668
49	NC_010475	ATTC	2	8	30566	30573	25 %	50 %	0 %	25 %	170076668
50	NC_010475	TTCA	2	8	32302	32309	25 %	50 %	0 %	25 %	170076670
51	NC_010475	GCTT	2	8	32366	32373	0 %	50 %	25 %	25 %	170076670
52	NC_010475	ATTA	2	8	33127	33134	50 %	50 %	0 %	0 %	170076670
53	NC_010475	GAGG	2	8	33394	33401	25 %	0 %	75 %	0 %	170076670
54	NC_010475	CGCC	2	8	36903	36910	0 %	0 %	25 %	75 %	170076674
55	NC_010475	TCTA	2	8	37034	37041	25 %	50 %	0 %	25 %	170076674
56	NC_010475	CTAC	2	8	37426	37433	25 %	25 %	0 %	50 %	170076674
57	NC_010475	CCAG	2	8	37434	37441	25 %	0 %	25 %	50 %	170076674
58	NC_010475	CCAT	2	8	39101	39108	25 %	25 %	0 %	50 %	170076675
59	NC_010475	TTTG	2	8	39225	39232	0 %	75 %	25 %	0 %	170076675
60	NC_010475	AAGA	2	8	39893	39900	75 %	0 %	25 %	0 %	170076675
61	NC_010475	GCTC	2	8	40365	40372	0 %	25 %	25 %	50 %	170076676
62	NC_010475	AAGA	2	8	40481	40488	75 %	0 %	25 %	0 %	170076676
63	NC_010475	CTGG	2	8	40618	40625	0 %	25 %	50 %	25 %	170076676
64	NC_010475	ATTG	2	8	41752	41759	25 %	50 %	25 %	0 %	170076676
65	NC_010475	GGGT	2	8	42459	42466	0 %	25 %	75 %	0 %	170076676
66	NC_010475	CCGC	2	8	42891	42898	0 %	0 %	25 %	75 %	170076676
67	NC_010475	CTGG	2	8	43605	43612	0 %	25 %	50 %	25 %	170076676
68	NC_010475	AGGT	2	8	44658	44665	25 %	25 %	50 %	0 %	170076676
69	NC_010475	TGGC	2	8	44756	44763	0 %	25 %	50 %	25 %	170076676
70	NC_010475	TCTT	2	8	46574	46581	0 %	75 %	0 %	25 %	170076677
71	NC_010475	GAGT	2	8	47116	47123	25 %	25 %	50 %	0 %	170076678
72	NC_010475	GTCT	2	8	47477	47484	0 %	50 %	25 %	25 %	170076678
73	NC_010475	CTAT	2	8	47614	47621	25 %	50 %	0 %	25 %	170076678
74	NC_010475	CCCA	2	8	48022	48029	25 %	0 %	0 %	75 %	170076678
75	NC_010475	TCAG	2	8	48261	48268	25 %	25 %	25 %	25 %	170076678
76	NC_010475	TGGG	2	8	48472	48479	0 %	25 %	75 %	0 %	170076679
77	NC_010475	GGCG	2	8	48885	48892	0 %	0 %	75 %	25 %	170076679
78	NC_010475	CCCG	2	8	48915	48922	0 %	0 %	25 %	75 %	170076679
79	NC_010475	TTGC	2	8	50347	50354	0 %	50 %	25 %	25 %	170076680
80	NC_010475	TTGA	2	8	50595	50602	25 %	50 %	25 %	0 %	170076680
81	NC_010475	TGGC	2	8	51455	51462	0 %	25 %	50 %	25 %	170076682
82	NC_010475	GCGG	2	8	52132	52139	0 %	0 %	75 %	25 %	170076683
83	NC_010475	GCGG	2	8	52639	52646	0 %	0 %	75 %	25 %	170076683
84	NC_010475	CTGG	2	8	52870	52877	0 %	25 %	50 %	25 %	170076683
85	NC_010475	CGCC	2	8	53014	53021	0 %	0 %	25 %	75 %	170076683
86	NC_010475	CCGA	2	8	53277	53284	25 %	0 %	25 %	50 %	170076683
87	NC_010475	TGAA	2	8	54207	54214	50 %	25 %	25 %	0 %	170076683
88	NC_010475	ATCC	2	8	55567	55574	25 %	25 %	0 %	50 %	170076683
89	NC_010475	CCAA	2	8	55782	55789	50 %	0 %	0 %	50 %	170076683
90	NC_010475	ATCA	2	8	56690	56697	50 %	25 %	0 %	25 %	170076684
91	NC_010475	ATTT	2	8	56842	56849	25 %	75 %	0 %	0 %	170076684
92	NC_010475	CTCC	2	8	57165	57172	0 %	25 %	0 %	75 %	170076684
93	NC_010475	AGTC	2	8	58444	58451	25 %	25 %	25 %	25 %	170076684
94	NC_010475	GCCA	2	8	59094	59101	25 %	0 %	25 %	50 %	170076684
95	NC_010475	CAAC	2	8	59224	59231	50 %	0 %	0 %	50 %	170076684
96	NC_010475	CTCA	2	8	60134	60141	25 %	25 %	0 %	50 %	170076685
97	NC_010475	CCTG	2	8	60447	60454	0 %	25 %	25 %	50 %	170076686
98	NC_010475	TCAT	2	8	60807	60814	25 %	50 %	0 %	25 %	170076687
99	NC_010475	GATG	2	8	61809	61816	25 %	25 %	50 %	0 %	170076688
100	NC_010475	CAAA	2	8	62689	62696	75 %	0 %	0 %	25 %	170076690
101	NC_010475	CCTT	2	8	62731	62738	0 %	50 %	0 %	50 %	170076690
102	NC_010475	TGAG	2	8	62843	62850	25 %	25 %	50 %	0 %	170076690
103	NC_010475	AGAA	2	8	62995	63002	75 %	0 %	25 %	0 %	170076690
104	NC_010475	CGCT	2	8	63224	63231	0 %	25 %	25 %	50 %	170076691
105	NC_010475	TTTC	2	8	63582	63589	0 %	75 %	0 %	25 %	170076692
106	NC_010475	GTGG	2	8	63682	63689	0 %	25 %	75 %	0 %	170076692
107	NC_010475	CATT	2	8	63921	63928	25 %	50 %	0 %	25 %	170076692
108	NC_010475	GTTG	2	8	64499	64506	0 %	50 %	50 %	0 %	170076693
109	NC_010475	TGTT	2	8	64715	64722	0 %	75 %	25 %	0 %	170076693
110	NC_010475	GTCG	2	8	65180	65187	0 %	25 %	50 %	25 %	170076693
111	NC_010475	TCAA	2	8	65226	65233	50 %	25 %	0 %	25 %	170076693
112	NC_010475	AAAT	2	8	65561	65568	75 %	25 %	0 %	0 %	170076694
113	NC_010475	GCGG	2	8	66388	66395	0 %	0 %	75 %	25 %	170076696
114	NC_010475	GGGT	2	8	66947	66954	0 %	25 %	75 %	0 %	170076696
115	NC_010475	CGAT	2	8	67010	67017	25 %	25 %	25 %	25 %	170076696
116	NC_010475	CTCA	2	8	67182	67189	25 %	25 %	0 %	50 %	170076697
117	NC_010475	CCTC	2	8	67556	67563	0 %	25 %	0 %	75 %	170076697
118	NC_010475	GCGG	2	8	67624	67631	0 %	0 %	75 %	25 %	170076697
119	NC_010475	TATC	2	8	67719	67726	25 %	50 %	0 %	25 %	170076698
120	NC_010475	GGTT	2	8	68386	68393	0 %	50 %	50 %	0 %	170076698
121	NC_010475	GAAT	2	8	68931	68938	50 %	25 %	25 %	0 %	170076698
122	NC_010475	GTTT	2	8	69611	69618	0 %	75 %	25 %	0 %	170076698
123	NC_010475	ATTT	2	8	70230	70237	25 %	75 %	0 %	0 %	170076698
124	NC_010475	ATTT	2	8	71051	71058	25 %	75 %	0 %	0 %	170076699
125	NC_010475	TCAC	2	8	71453	71460	25 %	25 %	0 %	50 %	170076699
126	NC_010475	TCAA	2	8	72041	72048	50 %	25 %	0 %	25 %	170076699
127	NC_010475	CTCA	2	8	72704	72711	25 %	25 %	0 %	50 %	170076701
128	NC_010475	GACG	2	8	72974	72981	25 %	0 %	50 %	25 %	170076701
129	NC_010475	CAAC	2	8	73582	73589	50 %	0 %	0 %	50 %	170076701
130	NC_010475	CGGT	2	8	75085	75092	0 %	25 %	50 %	25 %	170076703
131	NC_010475	TCAG	2	8	77449	77456	25 %	25 %	25 %	25 %	170076707
132	NC_010475	GTTG	2	8	77510	77517	0 %	50 %	50 %	0 %	170076707
133	NC_010475	TCAT	2	8	77794	77801	25 %	50 %	0 %	25 %	170076707
134	NC_010475	AACA	2	8	78642	78649	75 %	0 %	0 %	25 %	170076708
135	NC_010475	GGGC	2	8	80073	80080	0 %	0 %	75 %	25 %	170076709
136	NC_010475	GCCA	2	8	80192	80199	25 %	0 %	25 %	50 %	170076709
137	NC_010475	CTAT	2	8	80463	80470	25 %	50 %	0 %	25 %	170076710
138	NC_010475	TGGG	2	8	80561	80568	0 %	25 %	75 %	0 %	170076710
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