MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 chromosome

Total Repeats: 49117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010475	CGA	2	6	244227	244232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076865
4002	NC_010475	ATG	2	6	244268	244273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076865
4003	NC_010475	TATT	2	8	244280	244287	25 %	75 %	0 %	0 %	170076865
4004	NC_010475	CATT	2	8	244470	244477	25 %	50 %	0 %	25 %	170076865
4005	NC_010475	CGC	2	6	244500	244505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076865
4006	NC_010475	CTA	2	6	244560	244565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076865
4007	NC_010475	TGA	2	6	244674	244679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076865
4008	NC_010475	AGC	2	6	244787	244792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076865
4009	NC_010475	A	6	6	244867	244872	100 %	0 %	0 %	0 %	170076865
4010	NC_010475	A	6	6	244886	244891	100 %	0 %	0 %	0 %	170076865
4011	NC_010475	A	6	6	245021	245026	100 %	0 %	0 %	0 %	170076866
4012	NC_010475	AGATC	2	10	245031	245040	40 %	20 %	20 %	20 %	170076866
4013	NC_010475	T	6	6	245211	245216	0 %	100 %	0 %	0 %	170076866
4014	NC_010475	ATT	2	6	245236	245241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076866
4015	NC_010475	TAA	2	6	245244	245249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076866
4016	NC_010475	ATT	2	6	245292	245297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076866
4017	NC_010475	A	7	7	245329	245335	100 %	0 %	0 %	0 %	170076866
4018	NC_010475	ATC	2	6	245347	245352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076866
4019	NC_010475	AAAAT	2	10	245360	245369	80 %	20 %	0 %	0 %	170076866
4020	NC_010475	AGAA	2	8	245444	245451	75 %	0 %	25 %	0 %	170076866
4021	NC_010475	ATT	2	6	245467	245472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076866
4022	NC_010475	TTC	2	6	245477	245482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076866
4023	NC_010475	GAA	2	6	245497	245502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076866
4024	NC_010475	CAC	2	6	245533	245538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076866
4025	NC_010475	GTC	2	6	245563	245568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076866
4026	NC_010475	AGAA	2	8	245576	245583	75 %	0 %	25 %	0 %	170076866
4027	NC_010475	TAC	2	6	245617	245622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076866
4028	NC_010475	GCAA	2	8	245675	245682	50 %	0 %	25 %	25 %	170076866
4029	NC_010475	AAG	2	6	245699	245704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076866
4030	NC_010475	ATTTA	2	10	245711	245720	40 %	60 %	0 %	0 %	170076866
4031	NC_010475	AGA	2	6	245730	245735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076866
4032	NC_010475	ATTC	2	8	245763	245770	25 %	50 %	0 %	25 %	170076866
4033	NC_010475	GAA	2	6	245785	245790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076866
4034	NC_010475	A	6	6	245827	245832	100 %	0 %	0 %	0 %	170076866
4035	NC_010475	GAA	2	6	245872	245877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076866
4036	NC_010475	TAA	2	6	245886	245891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076866
4037	NC_010475	ATC	2	6	245938	245943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076866
4038	NC_010475	A	7	7	246019	246025	100 %	0 %	0 %	0 %	170076866
4039	NC_010475	GATC	2	8	246049	246056	25 %	25 %	25 %	25 %	170076866
4040	NC_010475	T	6	6	246086	246091	0 %	100 %	0 %	0 %	170076866
4041	NC_010475	GAG	2	6	246109	246114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076866
4042	NC_010475	ATA	2	6	246119	246124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076866
4043	NC_010475	AAAGT	2	10	246161	246170	60 %	20 %	20 %	0 %	170076866
4044	NC_010475	GT	3	6	246172	246177	0 %	50 %	50 %	0 %	170076866
4045	NC_010475	AGC	2	6	246180	246185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076866
4046	NC_010475	GTT	2	6	246356	246361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076867
4047	NC_010475	T	6	6	246360	246365	0 %	100 %	0 %	0 %	170076867
4048	NC_010475	GGT	2	6	246368	246373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076867
4049	NC_010475	CTG	2	6	246409	246414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076867
4050	NC_010475	CGG	2	6	246475	246480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076867
4051	NC_010475	GGATT	2	10	246520	246529	20 %	40 %	40 %	0 %	170076867
4052	NC_010475	TAGA	2	8	246537	246544	50 %	25 %	25 %	0 %	170076867
4053	NC_010475	T	6	6	246555	246560	0 %	100 %	0 %	0 %	170076867
4054	NC_010475	ATTTA	2	10	246576	246585	40 %	60 %	0 %	0 %	170076867
4055	NC_010475	ATCA	2	8	246645	246652	50 %	25 %	0 %	25 %	170076867
4056	NC_010475	T	6	6	246684	246689	0 %	100 %	0 %	0 %	170076867
4057	NC_010475	ACC	2	6	246811	246816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076867
4058	NC_010475	TGG	2	6	246932	246937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076867
4059	NC_010475	GCGTT	2	10	246970	246979	0 %	40 %	40 %	20 %	170076867
4060	NC_010475	CCG	2	6	247109	247114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076867
4061	NC_010475	GGA	2	6	247163	247168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076867
4062	NC_010475	A	6	6	247221	247226	100 %	0 %	0 %	0 %	170076867
4063	NC_010475	CGCCC	2	10	247246	247255	0 %	0 %	20 %	80 %	170076867
4064	NC_010475	ATC	2	6	247326	247331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076867
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4066	NC_010475	GCC	2	6	247423	247428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076867
4067	NC_010475	TCAA	2	8	247453	247460	50 %	25 %	0 %	25 %	170076867
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4074	NC_010475	CA	3	6	247759	247764	50 %	0 %	0 %	50 %	170076867
4075	NC_010475	AGC	2	6	247789	247794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076867
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4081	NC_010475	ATAAA	2	10	248011	248020	80 %	20 %	0 %	0 %	170076867
4082	NC_010475	GTT	2	6	248051	248056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076867
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4093	NC_010475	GAC	2	6	248868	248873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076868
4094	NC_010475	CATG	2	8	248975	248982	25 %	25 %	25 %	25 %	170076868
4095	NC_010475	CCA	2	6	249010	249015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076868
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4098	NC_010475	GGGA	2	8	249116	249123	25 %	0 %	75 %	0 %	170076868
4099	NC_010475	CCA	2	6	249136	249141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076868
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4102	NC_010475	GCCTT	2	10	249223	249232	0 %	40 %	20 %	40 %	170076868
4103	NC_010475	A	6	6	249323	249328	100 %	0 %	0 %	0 %	170076869
4104	NC_010475	CAG	2	6	249424	249429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076869
4105	NC_010475	CTA	2	6	249529	249534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076869
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4107	NC_010475	CGG	2	6	249608	249613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076869
4108	NC_010475	G	6	6	249612	249617	0 %	0 %	100 %	0 %	170076869
4109	NC_010475	CGG	2	6	249626	249631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076869
4110	NC_010475	ATCTC	2	10	249638	249647	20 %	40 %	0 %	40 %	170076869
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4112	NC_010475	AAG	2	6	249746	249751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076869
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4114	NC_010475	T	6	6	249809	249814	0 %	100 %	0 %	0 %	170076869
4115	NC_010475	GGC	2	6	249897	249902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076869
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4119	NC_010475	C	7	7	250153	250159	0 %	0 %	0 %	100 %	170076869
4120	NC_010475	AGA	2	6	250176	250181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076869
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4122	NC_010475	AGA	2	6	250284	250289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076869
4123	NC_010475	GAA	2	6	250345	250350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076869
4124	NC_010475	ATC	2	6	250376	250381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076869
4125	NC_010475	CTA	2	6	250405	250410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076869
4126	NC_010475	GCG	2	6	250594	250599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076869
4127	NC_010475	GCA	2	6	250630	250635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076869
4128	NC_010475	CTT	2	6	250752	250757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076869
4129	NC_010475	TGA	2	6	250758	250763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076869
4130	NC_010475	GAT	2	6	250792	250797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076869
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4132	NC_010475	CCT	2	6	250975	250980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076870
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4135	NC_010475	CGG	2	6	251288	251293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076870
4136	NC_010475	CATTGC	2	12	251299	251310	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	170076870
4137	NC_010475	CTG	2	6	251561	251566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076870
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4140	NC_010475	TGG	2	6	251632	251637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076870
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4143	NC_010475	GTTT	2	8	252430	252437	0 %	75 %	25 %	0 %	170076871
4144	NC_010475	CGGTGG	2	12	252491	252502	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	170076871
4145	NC_010475	TGG	2	6	252584	252589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076871
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4147	NC_010475	CTA	2	6	252725	252730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076871
4148	NC_010475	GGC	2	6	252803	252808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076871
4149	NC_010475	ATTA	2	8	252931	252938	50 %	50 %	0 %	0 %	170076872
4150	NC_010475	GAA	2	6	252939	252944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076872
4151	NC_010475	GGC	2	6	253100	253105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076872
4152	NC_010475	GGA	2	6	253267	253272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076872
4153	NC_010475	ATT	2	6	253289	253294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076872
4154	NC_010475	AC	3	6	253326	253331	50 %	0 %	0 %	50 %	170076872
4155	NC_010475	ACT	2	6	253334	253339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076872
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4158	NC_010475	AAAT	2	8	253467	253474	75 %	25 %	0 %	0 %	170076872
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4166	NC_010475	ATT	2	6	253802	253807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076872
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4236	NC_010475	TTTG	2	8	258284	258291	0 %	75 %	25 %	0 %	170076874
4237	NC_010475	A	7	7	258358	258364	100 %	0 %	0 %	0 %	170076874
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4242	NC_010475	TCT	2	6	258725	258730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076875
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4244	NC_010475	CAT	2	6	258927	258932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076875
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4366	NC_010475	TGC	2	6	265377	265382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076879
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4370	NC_010475	TGCC	2	8	265703	265710	0 %	25 %	25 %	50 %	170076879
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4483	NC_010475	ACG	2	6	273176	273181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076887
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4486	NC_010475	CGA	2	6	273269	273274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076887
4487	NC_010475	GGAC	2	8	273294	273301	25 %	0 %	50 %	25 %	170076887
4488	NC_010475	GTC	2	6	273403	273408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076887
4489	NC_010475	G	6	6	273439	273444	0 %	0 %	100 %	0 %	170076887
4490	NC_010475	CTG	2	6	273445	273450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076887
4491	NC_010475	TCG	2	6	273533	273538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076887
4492	NC_010475	TTTCGA	2	12	273546	273557	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	170076887
4493	NC_010475	TCG	2	6	273605	273610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076887
4494	NC_010475	GGGC	2	8	273732	273739	0 %	0 %	75 %	25 %	170076887
4495	NC_010475	TGG	2	6	273744	273749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076887
4496	NC_010475	GCA	2	6	273768	273773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076888
4497	NC_010475	GAT	2	6	273787	273792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076888
4498	NC_010475	GAA	2	6	273890	273895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076888
4499	NC_010475	GGC	2	6	273920	273925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076888
4500	NC_010475	GTT	2	6	273929	273934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076888

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