MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 chromosome

Total Repeats: 49117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010475	GATA	2	8	30394	30401	50 %	25 %	25 %	0 %	170076668
502	NC_010475	CAC	2	6	30414	30419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076668
503	NC_010475	CAC	2	6	30423	30428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076668
504	NC_010475	CAC	2	6	30503	30508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076668
505	NC_010475	GA	3	6	30559	30564	50 %	0 %	50 %	0 %	170076668
506	NC_010475	ATTC	2	8	30566	30573	25 %	50 %	0 %	25 %	170076668
507	NC_010475	ATT	2	6	30576	30581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076668
508	NC_010475	ACG	2	6	30658	30663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076668
509	NC_010475	AGA	2	6	30706	30711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076668
510	NC_010475	TGG	2	6	30743	30748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076668
511	NC_010475	CTG	2	6	30921	30926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076669
512	NC_010475	GCC	2	6	30966	30971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076669
513	NC_010475	CAC	2	6	30978	30983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076669
514	NC_010475	TGC	2	6	31083	31088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076669
515	NC_010475	TCT	2	6	31252	31257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076669
516	NC_010475	GAC	2	6	31362	31367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076669
517	NC_010475	AAT	2	6	31467	31472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076669
518	NC_010475	CGT	2	6	31502	31507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076669
519	NC_010475	TTC	2	6	31512	31517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076669
520	NC_010475	TGC	2	6	31581	31586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076669
521	NC_010475	T	6	6	31614	31619	0 %	100 %	0 %	0 %	170076669
522	NC_010475	TAA	2	6	31648	31653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076669
523	NC_010475	AG	3	6	31858	31863	50 %	0 %	50 %	0 %	170076670
524	NC_010475	CAA	2	6	31966	31971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076670
525	NC_010475	GCT	2	6	32078	32083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076670
526	NC_010475	TTC	2	6	32098	32103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076670
527	NC_010475	CCGTTG	2	12	32107	32118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076670
528	NC_010475	TTCA	2	8	32302	32309	25 %	50 %	0 %	25 %	170076670
529	NC_010475	GCTT	2	8	32366	32373	0 %	50 %	25 %	25 %	170076670
530	NC_010475	GCG	2	6	32375	32380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076670
531	NC_010475	TCA	2	6	32387	32392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076670
532	NC_010475	TCACC	2	10	32475	32484	20 %	20 %	0 %	60 %	170076670
533	NC_010475	CGA	2	6	32505	32510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076670
534	NC_010475	TCT	2	6	32537	32542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076670
535	NC_010475	CAT	2	6	32551	32556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076670
536	NC_010475	CGA	2	6	32676	32681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076670
537	NC_010475	TGG	2	6	32744	32749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076670
538	NC_010475	GCC	2	6	32773	32778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076670
539	NC_010475	GGA	2	6	32790	32795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076670
540	NC_010475	TTTCAA	2	12	32802	32813	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	170076670
541	NC_010475	CGG	2	6	32837	32842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076670
542	NC_010475	GGC	2	6	32845	32850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076670
543	NC_010475	CGG	2	6	32867	32872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076670
544	NC_010475	TAA	2	6	32895	32900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076670
545	NC_010475	GCCAT	2	10	32947	32956	20 %	20 %	20 %	40 %	170076670
546	NC_010475	GCA	2	6	32970	32975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076670
547	NC_010475	ATA	2	6	33041	33046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076670
548	NC_010475	AAT	2	6	33058	33063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076670
549	NC_010475	T	6	6	33082	33087	0 %	100 %	0 %	0 %	170076670
550	NC_010475	GGT	2	6	33090	33095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076670
551	NC_010475	ATTA	2	8	33127	33134	50 %	50 %	0 %	0 %	170076670
552	NC_010475	A	6	6	33184	33189	100 %	0 %	0 %	0 %	170076670
553	NC_010475	ACG	2	6	33208	33213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076670
554	NC_010475	CTT	2	6	33252	33257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076670
555	NC_010475	CGG	2	6	33294	33299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076670
556	NC_010475	TGG	2	6	33302	33307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076670
557	NC_010475	GAGG	2	8	33394	33401	25 %	0 %	75 %	0 %	170076670
558	NC_010475	GGA	2	6	33557	33562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076671
559	NC_010475	GCC	2	6	33580	33585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076671
560	NC_010475	G	7	7	33614	33620	0 %	0 %	100 %	0 %	170076671
561	NC_010475	GGC	3	9	33693	33701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076671
562	NC_010475	TCC	2	6	33748	33753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076671
563	NC_010475	GTG	2	6	33960	33965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076671
564	NC_010475	GCG	2	6	33966	33971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076671
565	NC_010475	TGGGG	2	10	33985	33994	0 %	20 %	80 %	0 %	170076671
566	NC_010475	G	6	6	33991	33996	0 %	0 %	100 %	0 %	170076671
567	NC_010475	AG	3	6	34025	34030	50 %	0 %	50 %	0 %	170076671
568	NC_010475	GTC	2	6	34118	34123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076671
569	NC_010475	ATA	2	6	34204	34209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076671
570	NC_010475	AAC	2	6	34218	34223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076671
571	NC_010475	TGG	2	6	34364	34369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076671
572	NC_010475	CATGG	2	10	34476	34485	20 %	20 %	40 %	20 %	170076671
573	NC_010475	TC	3	6	34735	34740	0 %	50 %	0 %	50 %	170076672
574	NC_010475	T	6	6	34828	34833	0 %	100 %	0 %	0 %	170076672
575	NC_010475	TG	3	6	34835	34840	0 %	50 %	50 %	0 %	170076672
576	NC_010475	ATA	2	6	34890	34895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076672
577	NC_010475	CGC	2	6	34906	34911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076672
578	NC_010475	TTGAC	2	10	34932	34941	20 %	40 %	20 %	20 %	170076672
579	NC_010475	GTT	2	6	34996	35001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076672
580	NC_010475	TG	3	6	35006	35011	0 %	50 %	50 %	0 %	170076672
581	NC_010475	GAT	2	6	35035	35040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076672
582	NC_010475	ATG	2	6	35133	35138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076672
583	NC_010475	ACA	2	6	35170	35175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076672
584	NC_010475	GAA	2	6	35227	35232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076672
585	NC_010475	TGA	2	6	35286	35291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076672
586	NC_010475	GAA	2	6	35308	35313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076672
587	NC_010475	C	6	6	35363	35368	0 %	0 %	0 %	100 %	170076672
588	NC_010475	GAA	2	6	35380	35385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076672
589	NC_010475	TGCTC	2	10	35473	35482	0 %	40 %	20 %	40 %	170076672
590	NC_010475	CTC	2	6	35549	35554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076672
591	NC_010475	GCC	2	6	35570	35575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076672
592	NC_010475	ACC	2	6	35775	35780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076673
593	NC_010475	CGT	2	6	35787	35792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076673
594	NC_010475	G	6	6	35843	35848	0 %	0 %	100 %	0 %	170076673
595	NC_010475	TGC	2	6	35863	35868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076673
596	NC_010475	GTC	2	6	35942	35947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076673
597	NC_010475	GCC	2	6	35952	35957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076673
598	NC_010475	A	7	7	36204	36210	100 %	0 %	0 %	0 %	170076673
599	NC_010475	GAA	2	6	36360	36365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076673
600	NC_010475	ATG	2	6	36391	36396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076673
601	NC_010475	A	6	6	36434	36439	100 %	0 %	0 %	0 %	170076673
602	NC_010475	ATT	2	6	36489	36494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076673
603	NC_010475	GCG	2	6	36543	36548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076673
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605	NC_010475	A	6	6	36603	36608	100 %	0 %	0 %	0 %	170076673
606	NC_010475	AGTTTA	2	12	36677	36688	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	170076673
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608	NC_010475	AAG	3	9	37008	37016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076674
609	NC_010475	TCTA	2	8	37034	37041	25 %	50 %	0 %	25 %	170076674
610	NC_010475	CGG	2	6	37176	37181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076674
611	NC_010475	CTAC	2	8	37426	37433	25 %	25 %	0 %	50 %	170076674
612	NC_010475	CCAG	2	8	37434	37441	25 %	0 %	25 %	50 %	170076674
613	NC_010475	GGC	2	6	37485	37490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076674
614	NC_010475	GGC	2	6	37550	37555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076674
615	NC_010475	TCT	2	6	37556	37561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076674
616	NC_010475	CTC	2	6	38179	38184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076675
617	NC_010475	GCT	2	6	38216	38221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076675
618	NC_010475	CG	3	6	38263	38268	0 %	0 %	50 %	50 %	170076675
619	NC_010475	CTT	2	6	38277	38282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076675
620	NC_010475	CTT	2	6	38298	38303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076675
621	NC_010475	CGG	2	6	38313	38318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076675
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623	NC_010475	CTT	3	9	38490	38498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076675
624	NC_010475	TTC	2	6	38512	38517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076675
625	NC_010475	T	6	6	38652	38657	0 %	100 %	0 %	0 %	170076675
626	NC_010475	CAA	2	6	38718	38723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076675
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