MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ7

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010474	ACCCA	2	10	232	241	40 %	0 %	0 %	60 %	170076471
2	NC_010474	TCGAT	2	10	775	784	20 %	40 %	20 %	20 %	170076472
3	NC_010474	TGAGC	2	10	4122	4131	20 %	20 %	40 %	20 %	170076476
4	NC_010474	CCTGG	2	10	6962	6971	0 %	20 %	40 %	40 %	170076477
5	NC_010474	ATTTG	2	10	7009	7018	20 %	60 %	20 %	0 %	170076477
6	NC_010474	CCAAC	2	10	8822	8831	40 %	0 %	0 %	60 %	170076478
7	NC_010474	GCCAT	2	10	9936	9945	20 %	20 %	20 %	40 %	170076478
8	NC_010474	CTTTG	2	10	10470	10479	0 %	60 %	20 %	20 %	170076478
9	NC_010474	ACGCA	2	10	12529	12538	40 %	0 %	20 %	40 %	170076481
10	NC_010474	TTGAT	2	10	12620	12629	20 %	60 %	20 %	0 %	170076481
11	NC_010474	GCAGC	2	10	14924	14933	20 %	0 %	40 %	40 %	170076482
12	NC_010474	AAATG	2	10	15907	15916	60 %	20 %	20 %	0 %	170076482
13	NC_010474	GATTT	2	10	16577	16586	20 %	60 %	20 %	0 %	170076482
14	NC_010474	AGGGG	2	10	19204	19213	20 %	0 %	80 %	0 %	170076484
15	NC_010474	TTATT	2	10	20641	20650	20 %	80 %	0 %	0 %	170076485
16	NC_010474	CTGCT	2	10	23189	23198	0 %	40 %	20 %	40 %	170076488
17	NC_010474	GTGTT	2	10	27419	27428	0 %	60 %	40 %	0 %	170076491
18	NC_010474	TTAAA	2	10	28359	28368	60 %	40 %	0 %	0 %	170076491
19	NC_010474	AGGCC	2	10	28867	28876	20 %	0 %	40 %	40 %	170076492
20	NC_010474	CAAGG	2	10	32673	32682	40 %	0 %	40 %	20 %	170076495
21	NC_010474	ATTTC	2	10	33797	33806	20 %	60 %	0 %	20 %	170076495
22	NC_010474	TGTCT	2	10	34486	34495	0 %	60 %	20 %	20 %	170076496
23	NC_010474	ACCCG	2	10	35267	35276	20 %	0 %	20 %	60 %	170076497
24	NC_010474	CGGTG	2	10	35597	35606	0 %	20 %	60 %	20 %	170076497
25	NC_010474	CATTT	2	10	38405	38414	20 %	60 %	0 %	20 %	170076501
26	NC_010474	TTTCA	2	10	42083	42092	20 %	60 %	0 %	20 %	170076505
27	NC_010474	ACCAA	2	10	45696	45705	60 %	0 %	0 %	40 %	170076511
28	NC_010474	CTCAG	2	10	45865	45874	20 %	20 %	20 %	40 %	170076511
29	NC_010474	AGAGA	2	10	47812	47821	60 %	0 %	40 %	0 %	170076513
30	NC_010474	CCCAG	2	10	47993	48002	20 %	0 %	20 %	60 %	170076514
31	NC_010474	CGTTT	2	10	50272	50281	0 %	60 %	20 %	20 %	170076518
32	NC_010474	GTTCG	2	10	50927	50936	0 %	40 %	40 %	20 %	170076519
33	NC_010474	ACCGA	2	10	51750	51759	40 %	0 %	20 %	40 %	170076521
34	NC_010474	TGCCA	2	10	52005	52014	20 %	20 %	20 %	40 %	170076521
35	NC_010474	AATTA	2	10	54672	54681	60 %	40 %	0 %	0 %	170076524
36	NC_010474	TTGGA	2	10	55828	55837	20 %	40 %	40 %	0 %	170076525
37	NC_010474	CGCGC	2	10	57562	57571	0 %	0 %	40 %	60 %	170076529
38	NC_010474	AGCGC	2	10	58980	58989	20 %	0 %	40 %	40 %	170076529
39	NC_010474	GCCAA	2	10	62401	62410	40 %	0 %	20 %	40 %	170076531
40	NC_010474	ACCTC	2	10	62570	62579	20 %	20 %	0 %	60 %	170076531
41	NC_010474	ATGGA	2	10	70652	70661	40 %	20 %	40 %	0 %	170076537
42	NC_010474	AATTT	2	10	73003	73012	40 %	60 %	0 %	0 %	170076537
43	NC_010474	CAAAA	2	10	79414	79423	80 %	0 %	0 %	20 %	170076540
44	NC_010474	ACCGA	2	10	82958	82967	40 %	0 %	20 %	40 %	170076543
45	NC_010474	CCAGT	2	10	83501	83510	20 %	20 %	20 %	40 %	170076543
46	NC_010474	TGGAT	2	10	87826	87835	20 %	40 %	40 %	0 %	170076547
47	NC_010474	AAGGG	2	10	88648	88657	40 %	0 %	60 %	0 %	170076546
48	NC_010474	CAGTG	2	10	90217	90226	20 %	20 %	40 %	20 %	170076549
49	NC_010474	GATGC	2	10	91892	91901	20 %	20 %	40 %	20 %	170076551
50	NC_010474	CGGCC	2	10	92233	92242	0 %	0 %	40 %	60 %	170076551
51	NC_010474	AAATG	2	10	93103	93112	60 %	20 %	20 %	0 %	170076551
52	NC_010474	TCGGG	2	10	96923	96932	0 %	20 %	60 %	20 %	170076556
53	NC_010474	AGCCA	2	10	98029	98038	40 %	0 %	20 %	40 %	170076557
54	NC_010474	ACCAA	2	10	98763	98772	60 %	0 %	0 %	40 %	170076558
55	NC_010474	CACTG	2	10	100482	100491	20 %	20 %	20 %	40 %	170076559
56	NC_010474	ATCAG	2	10	103201	103210	40 %	20 %	20 %	20 %	170076562
57	NC_010474	ACTCA	2	10	104298	104307	40 %	20 %	0 %	40 %	170076563
58	NC_010474	CAGGC	2	10	105531	105540	20 %	0 %	40 %	40 %	170076565
59	NC_010474	CAAAA	2	10	107650	107659	80 %	0 %	0 %	20 %	170076567
60	NC_010474	ACCAT	2	10	114364	114373	40 %	20 %	0 %	40 %	170076571
61	NC_010474	CCAAT	2	10	114789	114798	40 %	20 %	0 %	40 %	170076572
62	NC_010474	CTGGG	2	10	115028	115037	0 %	20 %	60 %	20 %	170076572
63	NC_010474	ACACC	2	10	116428	116437	40 %	0 %	0 %	60 %	170076573
64	NC_010474	ATGAC	2	10	121920	121929	40 %	20 %	20 %	20 %	170076576
65	NC_010474	CCTGG	2	10	123829	123838	0 %	20 %	40 %	40 %	170076577
66	NC_010474	TTGGG	2	10	123957	123966	0 %	40 %	60 %	0 %	170076577
67	NC_010474	GTTTG	2	10	125642	125651	0 %	60 %	40 %	0 %	170076578
68	NC_010474	GATGG	2	10	126819	126828	20 %	20 %	60 %	0 %	170076580
69	NC_010474	GGGTT	2	10	128112	128121	0 %	40 %	60 %	0 %	170076581
70	NC_010474	TGCCC	2	10	129196	129205	0 %	20 %	20 %	60 %	170076582
71	NC_010474	CCAAA	2	10	129385	129394	60 %	0 %	0 %	40 %	170076582
72	NC_010474	TGGAG	2	10	131232	131241	20 %	20 %	60 %	0 %	170076583
73	NC_010474	GGTCT	2	10	133361	133370	0 %	40 %	40 %	20 %	170076584
74	NC_010474	CGGAT	2	10	134755	134764	20 %	20 %	40 %	20 %	170076586
75	NC_010474	GCTGG	2	10	135343	135352	0 %	20 %	60 %	20 %	170076587
76	NC_010474	GTTGG	2	10	135802	135811	0 %	40 %	60 %	0 %	170076587
77	NC_010474	TACGG	2	10	136319	136328	20 %	20 %	40 %	20 %	170076587
78	NC_010474	GATCT	2	10	138142	138151	20 %	40 %	20 %	20 %	170076588
79	NC_010474	CTCAA	2	10	139834	139843	40 %	20 %	0 %	40 %	170076590
80	NC_010474	TGGCC	2	10	140431	140440	0 %	20 %	40 %	40 %	170076592
81	NC_010474	GTTGG	2	10	140847	140856	0 %	40 %	60 %	0 %	170076591
82	NC_010474	AACTG	2	10	144114	144123	40 %	20 %	20 %	20 %	170076594
83	NC_010474	ATAGT	2	10	148867	148876	40 %	40 %	20 %	0 %	170076599
84	NC_010474	GATTT	2	10	149838	149847	20 %	60 %	20 %	0 %	170076600
85	NC_010474	AAGCG	2	10	151046	151055	40 %	0 %	40 %	20 %	170076602
86	NC_010474	ACTGG	2	10	152414	152423	20 %	20 %	40 %	20 %	170076603
87	NC_010474	CGTCT	2	10	155391	155400	0 %	40 %	20 %	40 %	170076605
88	NC_010474	ACAGA	2	10	159277	159286	60 %	0 %	20 %	20 %	170076608
89	NC_010474	GAACT	2	10	159424	159433	40 %	20 %	20 %	20 %	170076608
90	NC_010474	ACTCA	2	10	159757	159766	40 %	20 %	0 %	40 %	170076608
91	NC_010474	ACGCA	2	10	162408	162417	40 %	0 %	20 %	40 %	170076610
92	NC_010474	ATGAC	2	10	162959	162968	40 %	20 %	20 %	20 %	170076610
93	NC_010474	CCAAT	2	10	166067	166076	40 %	20 %	0 %	40 %	170076613
94	NC_010474	GGCCC	2	10	169871	169880	0 %	0 %	40 %	60 %	170076619
95	NC_010474	CCGGC	2	10	170982	170991	0 %	0 %	40 %	60 %	170076621
96	NC_010474	TGGAA	2	10	171269	171278	40 %	20 %	40 %	0 %	170076621
97	NC_010474	AATTT	2	10	171895	171904	40 %	60 %	0 %	0 %	170076621
98	NC_010474	CAAAC	2	10	172111	172120	60 %	0 %	0 %	40 %	170076621
99	NC_010474	TGTAG	2	10	174150	174159	20 %	40 %	40 %	0 %	170076623
100	NC_010474	TGTGT	2	10	177061	177070	0 %	60 %	40 %	0 %	170076625
101	NC_010474	AAAAT	2	10	177494	177503	80 %	20 %	0 %	0 %	170076625
102	NC_010474	CAAAT	2	10	180320	180329	60 %	20 %	0 %	20 %	170076628

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.