MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ7

Total Repeats: 2945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010474	GTT	2	6	97673	97678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076557
1502	NC_010474	AATA	2	8	97684	97691	75 %	25 %	0 %	0 %	170076557
1503	NC_010474	TAA	2	6	97721	97726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076557
1504	NC_010474	CCA	4	12	97778	97789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076557
1505	NC_010474	AGC	2	6	97790	97795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076557
1506	NC_010474	AAT	2	6	97819	97824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076557
1507	NC_010474	GC	3	6	97851	97856	0 %	0 %	50 %	50 %	170076557
1508	NC_010474	CCG	2	6	97895	97900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076557
1509	NC_010474	TAA	2	6	97941	97946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076557
1510	NC_010474	TCA	2	6	97990	97995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076557
1511	NC_010474	AGCCA	2	10	98029	98038	40 %	0 %	20 %	40 %	170076557
1512	NC_010474	ACT	2	6	98040	98045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076557
1513	NC_010474	GCCA	2	8	98110	98117	25 %	0 %	25 %	50 %	170076557
1514	NC_010474	TTGA	2	8	98136	98143	25 %	50 %	25 %	0 %	170076557
1515	NC_010474	GCC	2	6	98176	98181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076557
1516	NC_010474	CCA	2	6	98204	98209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076557
1517	NC_010474	CAC	2	6	98279	98284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076557
1518	NC_010474	CCAG	2	8	98453	98460	25 %	0 %	25 %	50 %	170076557
1519	NC_010474	CAA	2	6	98490	98495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076557
1520	NC_010474	A	6	6	98562	98567	100 %	0 %	0 %	0 %	170076557
1521	NC_010474	TGA	2	6	98585	98590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076557
1522	NC_010474	ATAA	2	8	98729	98736	75 %	25 %	0 %	0 %	170076558
1523	NC_010474	ACCAA	2	10	98763	98772	60 %	0 %	0 %	40 %	170076558
1524	NC_010474	CAG	2	6	98822	98827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076558
1525	NC_010474	CCA	2	6	98881	98886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076558
1526	NC_010474	C	6	6	98951	98956	0 %	0 %	0 %	100 %	170076558
1527	NC_010474	CAG	2	6	98963	98968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076558
1528	NC_010474	CA	3	6	98969	98974	50 %	0 %	0 %	50 %	170076558
1529	NC_010474	CCG	2	6	98977	98982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076558
1530	NC_010474	TAA	2	6	98992	98997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076558
1531	NC_010474	AAAG	2	8	99072	99079	75 %	0 %	25 %	0 %	170076558
1532	NC_010474	AAT	2	6	99089	99094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076558
1533	NC_010474	GGA	2	6	99112	99117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076558
1534	NC_010474	CCAA	2	8	99151	99158	50 %	0 %	0 %	50 %	170076558
1535	NC_010474	TGAC	2	8	99183	99190	25 %	25 %	25 %	25 %	170076558
1536	NC_010474	CCA	2	6	99241	99246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076558
1537	NC_010474	GCG	2	6	99259	99264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076558
1538	NC_010474	CCG	2	6	99307	99312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076558
1539	NC_010474	TAA	2	6	99326	99331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076558
1540	NC_010474	GCC	2	6	99362	99367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076558
1541	NC_010474	ACC	2	6	99387	99392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076558
1542	NC_010474	GCC	2	6	99399	99404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076558
1543	NC_010474	ACC	2	6	99495	99500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076558
1544	NC_010474	GCC	2	6	99606	99611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076558
1545	NC_010474	A	6	6	99630	99635	100 %	0 %	0 %	0 %	170076558
1546	NC_010474	ATT	2	6	99794	99799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076559
1547	NC_010474	GTAA	2	8	99987	99994	50 %	25 %	25 %	0 %	170076559
1548	NC_010474	ACC	2	6	100017	100022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076559
1549	NC_010474	TTCC	2	8	100136	100143	0 %	50 %	0 %	50 %	170076559
1550	NC_010474	T	6	6	100159	100164	0 %	100 %	0 %	0 %	170076559
1551	NC_010474	CAA	2	6	100298	100303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076559
1552	NC_010474	GCC	2	6	100320	100325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076559
1553	NC_010474	CCA	2	6	100436	100441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076559
1554	NC_010474	CACTG	2	10	100482	100491	20 %	20 %	20 %	40 %	170076559
1555	NC_010474	AG	3	6	100508	100513	50 %	0 %	50 %	0 %	170076559
1556	NC_010474	GCT	2	6	100522	100527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076559
1557	NC_010474	A	7	7	100538	100544	100 %	0 %	0 %	0 %	170076559
1558	NC_010474	ACC	2	6	100631	100636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076560
1559	NC_010474	CTGTTG	2	12	100658	100669	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	170076560
1560	NC_010474	TGT	2	6	100674	100679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076560
1561	NC_010474	TTG	2	6	100853	100858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076560
1562	NC_010474	TCGGCC	2	12	100866	100877	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	170076560
1563	NC_010474	TTG	2	6	100883	100888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076560
1564	NC_010474	GTT	3	9	100906	100914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076560
1565	NC_010474	GCT	2	6	100920	100925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076560
1566	NC_010474	GTT	3	9	100942	100950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076560
1567	NC_010474	TGT	2	6	100962	100967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076560
1568	NC_010474	TGT	2	6	101004	101009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076560
1569	NC_010474	TTG	3	9	101012	101020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076560
1570	NC_010474	GC	3	6	101021	101026	0 %	0 %	50 %	50 %	170076560
1571	NC_010474	CTC	2	6	101093	101098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076560
1572	NC_010474	CGC	2	6	101175	101180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076560
1573	NC_010474	CAC	2	6	101185	101190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076560
1574	NC_010474	GCC	2	6	101223	101228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076560
1575	NC_010474	CTTG	2	8	101265	101272	0 %	50 %	25 %	25 %	170076560
1576	NC_010474	AAC	2	6	101374	101379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076560
1577	NC_010474	AGG	2	6	101405	101410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076560
1578	NC_010474	ATT	2	6	101411	101416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076560
1579	NC_010474	GCT	2	6	101445	101450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076560
1580	NC_010474	ATT	2	6	101534	101539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076560
1581	NC_010474	G	6	6	101551	101556	0 %	0 %	100 %	0 %	170076560
1582	NC_010474	GGA	2	6	101558	101563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076560
1583	NC_010474	TTG	2	6	101575	101580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076560
1584	NC_010474	TGG	2	6	101623	101628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076560
1585	NC_010474	GCG	2	6	101649	101654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076560
1586	NC_010474	TTC	2	6	101942	101947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076560
1587	NC_010474	GGC	2	6	101970	101975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076560
1588	NC_010474	GTT	2	6	102004	102009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076560
1589	NC_010474	GGA	2	6	102067	102072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076560
1590	NC_010474	T	6	6	102104	102109	0 %	100 %	0 %	0 %	170076560
1591	NC_010474	CTT	2	6	102115	102120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076560
1592	NC_010474	AGTT	2	8	102561	102568	25 %	50 %	25 %	0 %	170076561
1593	NC_010474	ATA	2	6	102586	102591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076561
1594	NC_010474	TCA	2	6	102594	102599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076561
1595	NC_010474	GCA	2	6	102612	102617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076561
1596	NC_010474	T	6	6	102710	102715	0 %	100 %	0 %	0 %	170076561
1597	NC_010474	ATA	2	6	102774	102779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076561
1598	NC_010474	GTT	3	9	103000	103008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076561
1599	NC_010474	TGA	2	6	103039	103044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076561
1600	NC_010474	TTG	2	6	103123	103128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076562
1601	NC_010474	ATCAG	2	10	103201	103210	40 %	20 %	20 %	20 %	170076562
1602	NC_010474	GTA	2	6	103286	103291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076562
1603	NC_010474	GTT	2	6	103348	103353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076562
1604	NC_010474	CCT	2	6	103354	103359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076562
1605	NC_010474	AAT	2	6	103503	103508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076562
1606	NC_010474	AGA	2	6	103656	103661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076563
1607	NC_010474	TGA	2	6	103666	103671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076563
1608	NC_010474	GCC	3	9	103704	103712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076563
1609	NC_010474	CTG	2	6	103723	103728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076563
1610	NC_010474	ACA	2	6	103741	103746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076563
1611	NC_010474	ATC	2	6	103785	103790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076563
1612	NC_010474	GCGATC	2	12	103806	103817	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	170076563
1613	NC_010474	ATT	2	6	103842	103847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076563
1614	NC_010474	CCAA	2	8	103962	103969	50 %	0 %	0 %	50 %	170076563
1615	NC_010474	TC	3	6	104034	104039	0 %	50 %	0 %	50 %	170076563
1616	NC_010474	GA	3	6	104121	104126	50 %	0 %	50 %	0 %	170076563
1617	NC_010474	ATC	2	6	104193	104198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076563
1618	NC_010474	A	6	6	104245	104250	100 %	0 %	0 %	0 %	170076563
1619	NC_010474	ACTCA	2	10	104298	104307	40 %	20 %	0 %	40 %	170076563
1620	NC_010474	CTC	2	6	104363	104368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076563
1621	NC_010474	TCA	2	6	104389	104394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076563
1622	NC_010474	A	6	6	104406	104411	100 %	0 %	0 %	0 %	170076563
1623	NC_010474	ATC	3	9	104421	104429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076563
1624	NC_010474	TCA	2	6	104446	104451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076563
1625	NC_010474	CAC	2	6	104483	104488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076563
1626	NC_010474	CAA	2	6	104490	104495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076563
1627	NC_010474	ATTA	2	8	104580	104587	50 %	50 %	0 %	0 %	170076563
1628	NC_010474	CTT	2	6	104631	104636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076564
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1632	NC_010474	A	7	7	104858	104864	100 %	0 %	0 %	0 %	170076564
1633	NC_010474	GCG	2	6	104941	104946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076564
1634	NC_010474	ATC	2	6	105007	105012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076564
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1637	NC_010474	GTT	2	6	105158	105163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076564
1638	NC_010474	CCTT	2	8	105197	105204	0 %	50 %	0 %	50 %	170076564
1639	NC_010474	TCT	2	6	105242	105247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076564
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1641	NC_010474	AGAA	2	8	105286	105293	75 %	0 %	25 %	0 %	170076564
1642	NC_010474	TTC	2	6	105298	105303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076564
1643	NC_010474	C	6	6	105333	105338	0 %	0 %	0 %	100 %	170076564
1644	NC_010474	ACC	2	6	105376	105381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076565
1645	NC_010474	CAGGC	2	10	105531	105540	20 %	0 %	40 %	40 %	170076565
1646	NC_010474	GA	3	6	105548	105553	50 %	0 %	50 %	0 %	170076565
1647	NC_010474	CAG	2	6	105560	105565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076565
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1649	NC_010474	TAA	2	6	105608	105613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076565
1650	NC_010474	CAC	2	6	105714	105719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076565
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1652	NC_010474	CTT	2	6	105914	105919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076565
1653	NC_010474	TGTC	2	8	106097	106104	0 %	50 %	25 %	25 %	170076565
1654	NC_010474	CA	3	6	106107	106112	50 %	0 %	0 %	50 %	170076565
1655	NC_010474	T	6	6	106299	106304	0 %	100 %	0 %	0 %	170076566
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1658	NC_010474	AATT	2	8	106641	106648	50 %	50 %	0 %	0 %	170076566
1659	NC_010474	GTT	2	6	106673	106678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076566
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1663	NC_010474	AAT	2	6	106841	106846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076566
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1667	NC_010474	T	6	6	107144	107149	0 %	100 %	0 %	0 %	170076566
1668	NC_010474	TGC	2	6	107170	107175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076566
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1743	NC_010474	CTT	2	6	111734	111739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076569
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1745	NC_010474	GTTG	2	8	111916	111923	0 %	50 %	50 %	0 %	170076569
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1872	NC_010474	GAT	2	6	119092	119097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076574
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1874	NC_010474	TTC	2	6	119267	119272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076574
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1991	NC_010474	ATC	2	6	128055	128060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076581
1992	NC_010474	GGGTT	2	10	128112	128121	0 %	40 %	60 %	0 %	170076581
1993	NC_010474	GAA	2	6	128181	128186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076581
1994	NC_010474	GTT	2	6	128299	128304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076581
1995	NC_010474	CA	3	6	128312	128317	50 %	0 %	0 %	50 %	170076581
1996	NC_010474	GCA	2	6	128347	128352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076581
1997	NC_010474	AGT	2	6	128376	128381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076581
1998	NC_010474	TTA	2	6	128969	128974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076582
1999	NC_010474	AAT	2	6	129002	129007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076582
2000	NC_010474	C	6	6	129036	129041	0 %	0 %	0 %	100 %	170076582

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