MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ7

Total Repeats: 2945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010474	TTA	2	6	62588	62593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076532
1002	NC_010474	AAG	2	6	62643	62648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076532
1003	NC_010474	TAA	2	6	62700	62705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076532
1004	NC_010474	CAAG	2	8	62707	62714	50 %	0 %	25 %	25 %	170076532
1005	NC_010474	GTC	2	6	62772	62777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076532
1006	NC_010474	AGC	4	12	62784	62795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076532
1007	NC_010474	AAGCCC	2	12	62859	62870	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	170076532
1008	NC_010474	GCA	2	6	62930	62935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076532
1009	NC_010474	CTT	2	6	62940	62945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076532
1010	NC_010474	CAA	2	6	62966	62971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076532
1011	NC_010474	CAG	2	6	62987	62992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076532
1012	NC_010474	TTAA	2	8	63215	63222	50 %	50 %	0 %	0 %	170076532
1013	NC_010474	CGAT	2	8	63249	63256	25 %	25 %	25 %	25 %	170076532
1014	NC_010474	CAA	2	6	63473	63478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076533
1015	NC_010474	GAG	2	6	63504	63509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076533
1016	NC_010474	GGC	2	6	63520	63525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076533
1017	NC_010474	ATG	2	6	63526	63531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076533
1018	NC_010474	CAT	3	9	63570	63578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076533
1019	NC_010474	CAA	2	6	63619	63624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076533
1020	NC_010474	A	6	6	63647	63652	100 %	0 %	0 %	0 %	170076533
1021	NC_010474	CGG	2	6	64073	64078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076533
1022	NC_010474	GAA	2	6	64094	64099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076533
1023	NC_010474	CGT	2	6	64154	64159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076533
1024	NC_010474	TCT	2	6	64187	64192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076534
1025	NC_010474	GTG	2	6	64196	64201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076534
1026	NC_010474	CGT	2	6	64230	64235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076534
1027	NC_010474	TCTG	2	8	64247	64254	0 %	50 %	25 %	25 %	170076534
1028	NC_010474	TGT	2	6	64298	64303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076534
1029	NC_010474	GTC	2	6	64361	64366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076534
1030	NC_010474	TGG	2	6	64374	64379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076534
1031	NC_010474	GAC	2	6	64509	64514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076534
1032	NC_010474	CGA	3	9	64610	64618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076534
1033	NC_010474	CGT	2	6	64706	64711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076534
1034	NC_010474	GTA	2	6	64776	64781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076534
1035	NC_010474	CAG	2	6	64881	64886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076534
1036	NC_010474	GTG	2	6	64919	64924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076534
1037	NC_010474	CAT	2	6	65102	65107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076535
1038	NC_010474	CTG	2	6	65122	65127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076535
1039	NC_010474	GGTC	2	8	65200	65207	0 %	25 %	50 %	25 %	170076535
1040	NC_010474	GCC	2	6	65224	65229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076535
1041	NC_010474	TTG	2	6	65243	65248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076535
1042	NC_010474	TCG	2	6	65296	65301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076535
1043	NC_010474	ACC	2	6	65442	65447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076535
1044	NC_010474	GAA	2	6	65484	65489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076535
1045	NC_010474	GTT	2	6	65836	65841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076536
1046	NC_010474	T	6	6	65840	65845	0 %	100 %	0 %	0 %	170076536
1047	NC_010474	TAA	2	6	65879	65884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076536
1048	NC_010474	CTG	2	6	65893	65898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076536
1049	NC_010474	ACA	2	6	65983	65988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076536
1050	NC_010474	ATA	2	6	66036	66041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076536
1051	NC_010474	CGC	2	6	66053	66058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076536
1052	NC_010474	TAA	2	6	66109	66114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076536
1053	NC_010474	ACC	2	6	66249	66254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076536
1054	NC_010474	TGC	2	6	66331	66336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076536
1055	NC_010474	AAT	2	6	66352	66357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076536
1056	NC_010474	CCAG	2	8	66446	66453	25 %	0 %	25 %	50 %	170076536
1057	NC_010474	CCA	2	6	66502	66507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076536
1058	NC_010474	ATG	2	6	66624	66629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076536
1059	NC_010474	AGG	2	6	66744	66749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076536
1060	NC_010474	GAT	2	6	66779	66784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076536
1061	NC_010474	GTA	2	6	66824	66829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076536
1062	NC_010474	GAT	2	6	66839	66844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076536
1063	NC_010474	A	6	6	66855	66860	100 %	0 %	0 %	0 %	170076536
1064	NC_010474	GCA	2	6	66886	66891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076536
1065	NC_010474	TGCC	2	8	66922	66929	0 %	25 %	25 %	50 %	170076536
1066	NC_010474	AGG	2	6	66939	66944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076536
1067	NC_010474	GCT	2	6	66945	66950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076536
1068	NC_010474	AGT	2	6	66970	66975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076536
1069	NC_010474	AAT	2	6	67001	67006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076536
1070	NC_010474	AAT	2	6	67025	67030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076536
1071	NC_010474	CTG	2	6	67051	67056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076536
1072	NC_010474	TAA	2	6	67215	67220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076536
1073	NC_010474	CGA	2	6	67228	67233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076536
1074	NC_010474	GCA	2	6	67291	67296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076536
1075	NC_010474	ATT	2	6	67337	67342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076536
1076	NC_010474	A	7	7	67355	67361	100 %	0 %	0 %	0 %	170076536
1077	NC_010474	ACG	2	6	67373	67378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076536
1078	NC_010474	ATC	2	6	68539	68544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076537
1079	NC_010474	ATT	2	6	68713	68718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076537
1080	NC_010474	TGT	2	6	68724	68729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076537
1081	NC_010474	ATT	2	6	68764	68769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076537
1082	NC_010474	AGC	2	6	68788	68793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076537
1083	NC_010474	TTTA	2	8	68800	68807	25 %	75 %	0 %	0 %	170076537
1084	NC_010474	CTA	2	6	68852	68857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076537
1085	NC_010474	CTAC	2	8	68875	68882	25 %	25 %	0 %	50 %	170076537
1086	NC_010474	CTGC	2	8	69031	69038	0 %	25 %	25 %	50 %	170076537
1087	NC_010474	AGT	2	6	69055	69060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076537
1088	NC_010474	GAT	3	9	69067	69075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076537
1089	NC_010474	TCC	2	6	69078	69083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076537
1090	NC_010474	CTT	2	6	69216	69221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076537
1091	NC_010474	AAG	3	9	69227	69235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076537
1092	NC_010474	GCTGAC	2	12	69238	69249	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	170076537
1093	NC_010474	TTC	2	6	69355	69360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076537
1094	NC_010474	TCA	2	6	69395	69400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076537
1095	NC_010474	GAT	2	6	69691	69696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076537
1096	NC_010474	CCGA	2	8	69919	69926	25 %	0 %	25 %	50 %	170076537
1097	NC_010474	CTT	2	6	69978	69983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076537
1098	NC_010474	TTCT	2	8	70334	70341	0 %	75 %	0 %	25 %	170076537
1099	NC_010474	CAA	2	6	70467	70472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076537
1100	NC_010474	AAT	2	6	70510	70515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076537
1101	NC_010474	CAA	2	6	70539	70544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076537
1102	NC_010474	AGC	2	6	70563	70568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076537
1103	NC_010474	ATGGA	2	10	70652	70661	40 %	20 %	40 %	0 %	170076537
1104	NC_010474	TTCC	2	8	70714	70721	0 %	50 %	0 %	50 %	170076537
1105	NC_010474	GAAT	2	8	70815	70822	50 %	25 %	25 %	0 %	170076537
1106	NC_010474	GCC	2	6	70846	70851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076537
1107	NC_010474	ACA	2	6	70892	70897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076537
1108	NC_010474	ATC	2	6	70975	70980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076537
1109	NC_010474	TCA	2	6	70993	70998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076537
1110	NC_010474	AGG	2	6	71042	71047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076537
1111	NC_010474	CCG	2	6	71084	71089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076537
1112	NC_010474	TCC	2	6	71155	71160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076537
1113	NC_010474	CATT	2	8	71168	71175	25 %	50 %	0 %	25 %	170076537
1114	NC_010474	GCT	2	6	71203	71208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076537
1115	NC_010474	ATCCAA	2	12	71233	71244	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	170076537
1116	NC_010474	CTAG	2	8	71308	71315	25 %	25 %	25 %	25 %	170076537
1117	NC_010474	CTAT	2	8	71379	71386	25 %	50 %	0 %	25 %	170076537
1118	NC_010474	TGT	2	6	71433	71438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076537
1119	NC_010474	GGT	2	6	71440	71445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076537
1120	NC_010474	CTC	2	6	71450	71455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076537
1121	NC_010474	GTT	2	6	71464	71469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076537
1122	NC_010474	CTT	2	6	71471	71476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076537
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1124	NC_010474	TTG	2	6	71653	71658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076537
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