MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae Hungary19A-6

Total Repeats: 785

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010380	GAAATG	2	12	338	349	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	169832473
2	NC_010380	ATTGGA	2	12	4778	4789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833645
3	NC_010380	TTGCAA	2	12	5067	5078	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	169833013
4	NC_010380	TGCTTA	2	12	7714	7725	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	169833013
5	NC_010380	GCTAAC	2	12	7955	7966	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	169833013
6	NC_010380	TTGATT	2	12	8889	8900	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	169833356
7	NC_010380	TTCTTG	2	12	24457	24468	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	169832991
8	NC_010380	ACTTTT	2	12	24526	24537	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	169832991
9	NC_010380	CTTTAT	2	12	27410	27421	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	169834260
10	NC_010380	ATGATA	2	12	29420	29431	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	169833210
11	NC_010380	TAAATT	2	12	34354	34365	50 %	50 %	0 %	0 %	169834226
12	NC_010380	CAATGA	2	12	34764	34775	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	169834011
13	NC_010380	TTCATG	2	12	36300	36311	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	169833564
14	NC_010380	GAAATT	2	12	41546	41557	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	169833513
15	NC_010380	GCCAAG	2	12	47039	47050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169833508
16	NC_010380	TTTGGA	2	12	49203	49214	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	169833508
17	NC_010380	TTTGGA	2	12	50853	50864	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	169833508
18	NC_010380	CATTTA	2	12	51612	51623	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	169833508
19	NC_010380	AGGTTG	2	12	53316	53327	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	169833508
20	NC_010380	CGGTAG	2	12	54667	54678	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	169833508
21	NC_010380	ATCCAT	2	12	56852	56863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169832565
22	NC_010380	TCTATA	2	12	60891	60902	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	169832735
23	NC_010380	GAAATT	2	12	63861	63872	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	169833134
24	NC_010380	AGCAAA	3	18	64636	64653	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	169833598
25	NC_010380	AAAAGC	2	12	65382	65393	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	169833596
26	NC_010380	TTAGGA	2	12	67388	67399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833924
27	NC_010380	GATTGA	2	12	70716	70727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833376
28	NC_010380	AGAAAC	2	12	72667	72678	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	169832446
29	NC_010380	TTTTAC	2	12	74282	74293	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	169833859
30	NC_010380	TTGATG	2	12	78706	78717	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	169833815
31	NC_010380	CTGCAA	2	12	81938	81949	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	169833475
32	NC_010380	AGGTTG	2	12	100376	100387	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	169832478
33	NC_010380	TTGTTT	2	12	102601	102612	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	169833724
34	NC_010380	CGATTG	2	12	106621	106632	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	169833568
35	NC_010380	TTCCTT	2	12	109993	110004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169833832
36	NC_010380	TCTTTT	2	12	119244	119255	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	169834356
37	NC_010380	ATAAGA	2	12	119444	119455	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	169834356
38	NC_010380	TCAATC	2	12	121698	121709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169832830
39	NC_010380	TTACTG	2	12	132080	132091	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	169834382
40	NC_010380	GTTTCT	2	12	142381	142392	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	169833911
41	NC_010380	TTCCTT	2	12	143461	143472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169833503
42	NC_010380	TTGCAG	2	12	147614	147625	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	169833461
43	NC_010380	TCTTGC	2	12	149147	149158	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	169832904
44	NC_010380	GACTTG	2	12	149551	149562	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	169832904
45	NC_010380	ACATCA	2	12	159119	159130	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	169832775
46	NC_010380	GCTTGC	2	12	161223	161234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169832775
47	NC_010380	TACAGG	2	12	163448	163459	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	169832653
48	NC_010380	AAAAAC	2	12	163549	163560	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	169832653
49	NC_010380	TGGTTG	2	12	167297	167308	0 %	50 %	50 %	0 %	169834103
50	NC_010380	TTTTGA	2	12	170836	170847	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	169833768
51	NC_010380	AAGGAA	2	12	176292	176303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169832797
52	NC_010380	ATTGAG	2	12	189109	189120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833085
53	NC_010380	TTATCT	2	12	196110	196121	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	169832969
54	NC_010380	TTTTAT	2	12	197474	197485	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	169832957
55	NC_010380	TAACAA	2	12	197969	197980	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	169832957
56	NC_010380	ATAAAA	2	12	200783	200794	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	169832603
57	NC_010380	AGGCAG	2	12	201459	201470	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	169833837
58	NC_010380	CTCCAG	2	12	202380	202391	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	169833837
59	NC_010380	TCAGGG	2	12	211910	211921	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	169832924
60	NC_010380	ATAAAT	2	12	215254	215265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169832903
61	NC_010380	GAAGCA	2	12	221548	221559	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	169833123
62	NC_010380	GTTTTA	2	12	224024	224035	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	169834215
63	NC_010380	TCAGGT	2	12	234726	234737	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	169833941
64	NC_010380	ATTGAG	2	12	243065	243076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833770
65	NC_010380	TTCGGA	2	12	243195	243206	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	169833770
66	NC_010380	AACAAG	2	12	246818	246829	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	169832831
67	NC_010380	GGATTG	2	12	248547	248558	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	169833009
68	NC_010380	TGCACT	2	12	252312	252323	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	169834063
69	NC_010380	CAATAT	2	12	253792	253803	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	169833831
70	NC_010380	ATCTAT	2	12	254448	254459	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	169834457
71	NC_010380	ATTATC	2	12	255874	255885	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	169832849
72	NC_010380	GTATTT	2	12	264569	264580	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	169832736
73	NC_010380	TTGGAA	2	12	266127	266138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833359
74	NC_010380	TGTTCG	2	12	267487	267498	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	169833621
75	NC_010380	ACTTGG	2	12	268284	268295	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	169833621
76	NC_010380	ACCACG	2	12	272821	272832	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	169833153
77	NC_010380	ACAAGA	2	12	281246	281257	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	169832515
78	NC_010380	CAGGAA	2	12	281450	281461	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	169833663
79	NC_010380	TAAAGG	2	12	284139	284150	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	169833378
80	NC_010380	GCAATC	2	12	286727	286738	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	169832894
81	NC_010380	ACATCA	2	12	287274	287285	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	169834372
82	NC_010380	TAAAGG	2	12	291524	291535	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	169832463
83	NC_010380	AAATTA	2	12	292563	292574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834314
84	NC_010380	ACTTGG	2	12	292630	292641	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	169834314
85	NC_010380	TTGAAG	2	12	295571	295582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834296
86	NC_010380	GTAAAG	2	12	296254	296265	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	169833118
87	NC_010380	AAACTC	2	12	297629	297640	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	169834017
88	NC_010380	TATCTG	2	12	310429	310440	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	169834161
89	NC_010380	ACAATT	2	12	312549	312560	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	169833106
90	NC_010380	TTAAGG	2	12	316948	316959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834477
91	NC_010380	CCAATC	2	12	317529	317540	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	169834477
92	NC_010380	TGAAAT	2	12	318560	318571	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	169834477
93	NC_010380	TGTCAA	2	12	328176	328187	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	169833273
94	NC_010380	GATGGT	2	12	328935	328946	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	169833865
95	NC_010380	TGCCTT	2	12	330586	330597	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	169834503
96	NC_010380	GTTGCT	2	12	335204	335215	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	169834168
97	NC_010380	GCAAGA	2	12	339116	339127	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	169832443
98	NC_010380	TATCAC	2	12	339134	339145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169832443
99	NC_010380	ATTCGA	2	12	340514	340525	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	169832443
100	NC_010380	GTCAGT	2	12	343919	343930	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	169833032
101	NC_010380	TTGAGC	2	12	347870	347881	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	169834462
102	NC_010380	CGATAC	2	12	354789	354800	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	169834253
103	NC_010380	TCTTTT	2	12	358712	358723	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	169834172
104	NC_010380	ATAGAA	2	12	358971	358982	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	169833864
105	NC_010380	TTTTGG	2	12	359240	359251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169833864
106	NC_010380	ATTGAT	2	12	368771	368782	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	169833055
107	NC_010380	GGATTT	2	12	370856	370867	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	169833328
108	NC_010380	TAGATA	2	12	371899	371910	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	169834404
109	NC_010380	CATTAT	2	12	373501	373512	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	169833476
110	NC_010380	GATAAA	2	12	377247	377258	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	169833327
111	NC_010380	AAAATG	2	12	381192	381203	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	169833422
112	NC_010380	AGAGGA	2	12	383766	383777	50 %	0 %	50 %	0 %	169833175
113	NC_010380	ATGGAG	2	12	384199	384210	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	169833501
114	NC_010380	GGACAA	2	12	385066	385077	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	169833752
115	NC_010380	CCATAG	2	12	388529	388540	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	169834337
116	NC_010380	TTGATT	2	12	388972	388983	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	169834337
117	NC_010380	AGGAGT	2	12	390718	390729	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	169832739
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119	NC_010380	AGCGTG	2	12	392354	392365	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	169832477
120	NC_010380	AGGTTC	2	12	395456	395467	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	169833971
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344	NC_010380	TGGTTT	2	12	991310	991321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169834018
345	NC_010380	ATCCGT	2	12	993132	993143	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	169834018
346	NC_010380	AGGACA	2	12	995471	995482	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	169834084
347	NC_010380	GCTGGA	2	12	996256	996267	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	169833338
348	NC_010380	GCGTCA	2	12	997666	997677	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	169834390
349	NC_010380	CGCTTT	2	12	998995	999006	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	169834173
350	NC_010380	TCAAGC	2	12	999278	999289	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	169834173
351	NC_010380	TGCACC	2	12	1001877	1001888	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	169833403
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353	NC_010380	AGGATG	2	12	1005316	1005327	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	169833218
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355	NC_010380	TCACTA	2	12	1018895	1018906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834532
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362	NC_010380	CAAGGT	2	12	1036390	1036401	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	169833340
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372	NC_010380	CCAGAT	2	12	1056758	1056769	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	169832387
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452	NC_010380	ACTTTG	2	12	1333117	1333128	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	169833148
453	NC_010380	TTTTCC	2	12	1334138	1334149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169832711
454	NC_010380	TAAGAA	2	12	1334696	1334707	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	169832891
455	NC_010380	CTGAGC	2	12	1336399	1336410	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	169834065
456	NC_010380	TTTCTG	2	12	1337011	1337022	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	169834065
457	NC_010380	ACGTAA	2	12	1341987	1341998	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	169833398
458	NC_010380	AAAGAT	2	12	1342245	1342256	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	169832885
459	NC_010380	AATTTC	2	12	1348974	1348985	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	169833886
460	NC_010380	ATAAAT	2	12	1350911	1350922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834498
461	NC_010380	GTTGCA	2	12	1357823	1357834	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	169833620
462	NC_010380	ACTTGT	2	12	1359853	1359864	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	169834398
463	NC_010380	TTGACC	2	12	1361985	1361996	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	169833310
464	NC_010380	AATCTA	2	12	1362186	1362197	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	169833779
465	NC_010380	ATTATC	2	12	1365134	1365145	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	169833545
466	NC_010380	TCAACT	2	12	1369012	1369023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169833760
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469	NC_010380	CATGGA	2	12	1371845	1371856	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	169833999
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471	NC_010380	GAACGA	2	12	1376568	1376579	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	169832798
472	NC_010380	AGCTAC	2	12	1379085	1379096	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	169833280
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475	NC_010380	TAGACA	2	12	1384655	1384666	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	169834449
476	NC_010380	ATTCTC	2	12	1385254	1385265	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	169834449
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480	NC_010380	CCTTGA	2	12	1389460	1389471	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	169833234
481	NC_010380	AGCAAG	2	12	1397716	1397727	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	169833721
482	NC_010380	TTTCAC	2	12	1398076	1398087	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	169833721
483	NC_010380	CACTGG	2	12	1400658	1400669	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	169834400
484	NC_010380	GCCATG	2	12	1401807	1401818	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	169833050
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487	NC_010380	AGGCTG	2	12	1416154	1416165	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	169833207
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492	NC_010380	GAGAGG	2	12	1423511	1423522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169833534
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