MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae Hungary19A-6

Total Repeats: 37129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010380	CAGG	2	8	232046	232053	25 %	0 %	50 %	25 %	169832580
4002	NC_010380	CTT	2	6	232114	232119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169832580
4003	NC_010380	GGT	2	6	232160	232165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169832580
4004	NC_010380	ATC	2	6	232235	232240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169832580
4005	NC_010380	CAC	2	6	232257	232262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169832580
4006	NC_010380	CTTT	2	8	232316	232323	0 %	75 %	0 %	25 %	169832580
4007	NC_010380	CTT	2	6	232336	232341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169832580
4008	NC_010380	GGC	2	6	232393	232398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169832580
4009	NC_010380	AGCG	2	8	232402	232409	25 %	0 %	50 %	25 %	169832580
4010	NC_010380	GAC	2	6	232474	232479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169832580
4011	NC_010380	TTG	2	6	232497	232502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169832580
4012	NC_010380	TGG	2	6	232534	232539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169832580
4013	NC_010380	CAT	2	6	232606	232611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169832580
4014	NC_010380	ATAA	2	8	232674	232681	75 %	25 %	0 %	0 %	169832580
4015	NC_010380	A	6	6	232680	232685	100 %	0 %	0 %	0 %	169832580
4016	NC_010380	T	6	6	232729	232734	0 %	100 %	0 %	0 %	169832720
4017	NC_010380	AT	3	6	232838	232843	50 %	50 %	0 %	0 %	169832720
4018	NC_010380	AGA	2	6	232865	232870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169832720
4019	NC_010380	TGT	2	6	232918	232923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169832720
4020	NC_010380	GAAA	2	8	232942	232949	75 %	0 %	25 %	0 %	169832720
4021	NC_010380	TTTGT	2	10	232958	232967	0 %	80 %	20 %	0 %	169832720
4022	NC_010380	AGG	2	6	233003	233008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169832720
4023	NC_010380	AGGA	3	12	233023	233034	50 %	0 %	50 %	0 %	169832720
4024	NC_010380	AAG	2	6	233063	233068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169832720
4025	NC_010380	CCG	2	6	233141	233146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169832720
4026	NC_010380	AGGC	2	8	233160	233167	25 %	0 %	50 %	25 %	169832720
4027	NC_010380	AGAT	2	8	233265	233272	50 %	25 %	25 %	0 %	169832720
4028	NC_010380	T	6	6	233272	233277	0 %	100 %	0 %	0 %	169832720
4029	NC_010380	GAT	2	6	233459	233464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833193
4030	NC_010380	CTT	2	6	233474	233479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169833193
4031	NC_010380	AGG	2	6	233498	233503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169833193
4032	NC_010380	TGA	2	6	233539	233544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833193
4033	NC_010380	AGG	2	6	233590	233595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169833193
4034	NC_010380	TCA	2	6	233705	233710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169833193
4035	NC_010380	TAG	2	6	233749	233754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833193
4036	NC_010380	AGC	2	6	233864	233869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169833193
4037	NC_010380	TGCC	2	8	233923	233930	0 %	25 %	25 %	50 %	169833193
4038	NC_010380	T	6	6	233937	233942	0 %	100 %	0 %	0 %	169833193
4039	NC_010380	ATC	2	6	234000	234005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169833193
4040	NC_010380	TGA	2	6	234077	234082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833941
4041	NC_010380	CT	3	6	234112	234117	0 %	50 %	0 %	50 %	169833941
4042	NC_010380	AG	3	6	234152	234157	50 %	0 %	50 %	0 %	169833941
4043	NC_010380	AGTG	2	8	234183	234190	25 %	25 %	50 %	0 %	169833941
4044	NC_010380	AG	3	6	234208	234213	50 %	0 %	50 %	0 %	169833941
4045	NC_010380	TA	3	6	234334	234339	50 %	50 %	0 %	0 %	169833941
4046	NC_010380	TC	3	6	234344	234349	0 %	50 %	0 %	50 %	169833941
4047	NC_010380	TGA	2	6	234363	234368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833941
4048	NC_010380	CTA	2	6	234440	234445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169833941
4049	NC_010380	A	6	6	234464	234469	100 %	0 %	0 %	0 %	169833941
4050	NC_010380	CAG	2	6	234491	234496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169833941
4051	NC_010380	CTG	2	6	234572	234577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169833941
4052	NC_010380	ATA	2	6	234596	234601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169833941
4053	NC_010380	TCAGGT	2	12	234726	234737	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	169833941
4054	NC_010380	TGG	2	6	234878	234883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169833941
4055	NC_010380	TCCA	2	8	234886	234893	25 %	25 %	0 %	50 %	169833941
4056	NC_010380	AAG	2	6	234911	234916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169833941
4057	NC_010380	GAC	2	6	234969	234974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169833941
4058	NC_010380	AGT	2	6	235168	235173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833941
4059	NC_010380	CGA	2	6	235194	235199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169833941
4060	NC_010380	AG	3	6	235201	235206	50 %	0 %	50 %	0 %	169833941
4061	NC_010380	CTC	2	6	235210	235215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169833941
4062	NC_010380	AGAT	2	8	235295	235302	50 %	25 %	25 %	0 %	169833941
4063	NC_010380	TGG	2	6	235445	235450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169833941
4064	NC_010380	TAT	2	6	235699	235704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834437
4065	NC_010380	TAG	2	6	235705	235710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834437
4066	NC_010380	ATG	2	6	235711	235716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834437
4067	NC_010380	GTC	2	6	235776	235781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169834437
4068	NC_010380	TCA	2	6	235840	235845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834437
4069	NC_010380	TGC	2	6	235916	235921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169834437
4070	NC_010380	GTG	2	6	235983	235988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169834437
4071	NC_010380	CTG	2	6	236031	236036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169834437
4072	NC_010380	GA	3	6	236061	236066	50 %	0 %	50 %	0 %	169834437
4073	NC_010380	GAA	2	6	236069	236074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834437
4074	NC_010380	GTTA	2	8	236115	236122	25 %	50 %	25 %	0 %	169834437
4075	NC_010380	TGG	2	6	236142	236147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169834437
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4079	NC_010380	TCAA	2	8	236407	236414	50 %	25 %	0 %	25 %	169834437
4080	NC_010380	AGA	2	6	236420	236425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834437
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4082	NC_010380	ATTT	2	8	236518	236525	25 %	75 %	0 %	0 %	169834437
4083	NC_010380	TGA	2	6	236540	236545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834437
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4085	NC_010380	ATGA	2	8	236646	236653	50 %	25 %	25 %	0 %	169834437
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4087	NC_010380	TCTA	2	8	236746	236753	25 %	50 %	0 %	25 %	169834437
4088	NC_010380	AAAC	2	8	236801	236808	75 %	0 %	0 %	25 %	169834437
4089	NC_010380	CAA	2	6	236826	236831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169834437
4090	NC_010380	ACTAT	2	10	236964	236973	40 %	40 %	0 %	20 %	169834437
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4093	NC_010380	AGA	2	6	237179	237184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169833505
4094	NC_010380	CTA	2	6	237256	237261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169833505
4095	NC_010380	TAT	2	6	237347	237352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169833505
4096	NC_010380	TCA	2	6	237466	237471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169833505
4097	NC_010380	TCT	2	6	237493	237498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169833505
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4101	NC_010380	AAGG	2	8	237770	237777	50 %	0 %	50 %	0 %	169832732
4102	NC_010380	T	6	6	237814	237819	0 %	100 %	0 %	0 %	169832732
4103	NC_010380	GAC	2	6	237874	237879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169832732
4104	NC_010380	TAA	2	6	237958	237963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169832732
4105	NC_010380	TAT	2	6	238069	238074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169832732
4106	NC_010380	TCAT	2	8	238229	238236	25 %	50 %	0 %	25 %	169834158
4107	NC_010380	CAT	2	6	238420	238425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169833236
4108	NC_010380	ACG	2	6	238428	238433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169833236
4109	NC_010380	GGT	2	6	238445	238450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169833236
4110	NC_010380	GAG	2	6	238543	238548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169833236
4111	NC_010380	TCA	3	9	238683	238691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169833236
4112	NC_010380	A	6	6	238738	238743	100 %	0 %	0 %	0 %	169833236
4113	NC_010380	CCT	2	6	238746	238751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169833236
4114	NC_010380	TGA	2	6	238761	238766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833236
4115	NC_010380	GA	3	6	238840	238845	50 %	0 %	50 %	0 %	169833236
4116	NC_010380	CTT	2	6	238869	238874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169833236
4117	NC_010380	ACG	2	6	238897	238902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169833236
4118	NC_010380	AG	3	6	238929	238934	50 %	0 %	50 %	0 %	169833236
4119	NC_010380	AGGG	2	8	238987	238994	25 %	0 %	75 %	0 %	169833236
4120	NC_010380	GTA	2	6	239044	239049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833236
4121	NC_010380	T	6	6	239058	239063	0 %	100 %	0 %	0 %	169833236
4122	NC_010380	GAT	2	6	239241	239246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833236
4123	NC_010380	CTT	2	6	239283	239288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169833236
4124	NC_010380	GAAA	2	8	239423	239430	75 %	0 %	25 %	0 %	169833236
4125	NC_010380	AAGC	2	8	239451	239458	50 %	0 %	25 %	25 %	169833236
4126	NC_010380	CAA	2	6	239470	239475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169833236
4127	NC_010380	GCG	2	6	239590	239595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169833236
4128	NC_010380	A	6	6	239649	239654	100 %	0 %	0 %	0 %	169833236
4129	NC_010380	A	6	6	239662	239667	100 %	0 %	0 %	0 %	169833236
4130	NC_010380	CAT	2	6	239676	239681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169833236
4131	NC_010380	TGA	2	6	239738	239743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833236
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4133	NC_010380	AATC	2	8	240170	240177	50 %	25 %	0 %	25 %	169834191
4134	NC_010380	AAG	2	6	240202	240207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834191
4135	NC_010380	AAAG	2	8	240254	240261	75 %	0 %	25 %	0 %	169834191
4136	NC_010380	GAA	2	6	240320	240325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834191
4137	NC_010380	GAT	2	6	240344	240349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834191
4138	NC_010380	GA	3	6	240416	240421	50 %	0 %	50 %	0 %	169834191
4139	NC_010380	GA	3	6	240550	240555	50 %	0 %	50 %	0 %	169834191
4140	NC_010380	AGC	2	6	240569	240574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169834191
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4143	NC_010380	CATC	2	8	240761	240768	25 %	25 %	0 %	50 %	169834191
4144	NC_010380	AGG	2	6	240771	240776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169834191
4145	NC_010380	TCT	2	6	240814	240819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834191
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4148	NC_010380	TTGAG	2	10	241253	241262	20 %	40 %	40 %	0 %	169834191
4149	NC_010380	GCTT	2	8	241327	241334	0 %	50 %	25 %	25 %	169834191
4150	NC_010380	TTGA	2	8	241342	241349	25 %	50 %	25 %	0 %	169834191
4151	NC_010380	TTGA	2	8	241703	241710	25 %	50 %	25 %	0 %	169833139
4152	NC_010380	T	6	6	241721	241726	0 %	100 %	0 %	0 %	169833139
4153	NC_010380	CT	3	6	241730	241735	0 %	50 %	0 %	50 %	169833139
4154	NC_010380	AACC	2	8	241818	241825	50 %	0 %	0 %	50 %	169833139
4155	NC_010380	AGCC	2	8	241849	241856	25 %	0 %	25 %	50 %	169833139
4156	NC_010380	GAA	2	6	241865	241870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169833139
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4160	NC_010380	T	6	6	242201	242206	0 %	100 %	0 %	0 %	169832539
4161	NC_010380	GA	3	6	242247	242252	50 %	0 %	50 %	0 %	169832539
4162	NC_010380	TGA	2	6	242265	242270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169832539
4163	NC_010380	TA	3	6	242386	242391	50 %	50 %	0 %	0 %	169832539
4164	NC_010380	TAGA	2	8	242419	242426	50 %	25 %	25 %	0 %	169832539
4165	NC_010380	ATC	2	6	242431	242436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169832539
4166	NC_010380	T	6	6	242451	242456	0 %	100 %	0 %	0 %	169832539
4167	NC_010380	TCC	2	6	242537	242542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169832539
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4174	NC_010380	TTCGGA	2	12	243195	243206	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	169833770
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4184	NC_010380	TGA	2	6	243873	243878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833770
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4192	NC_010380	CAG	2	6	244418	244423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169833770
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4198	NC_010380	TGA	2	6	244711	244716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833770
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4201	NC_010380	CAT	2	6	245455	245460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169833444
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4228	NC_010380	ACC	2	6	246476	246481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169832831
4229	NC_010380	T	7	7	246482	246488	0 %	100 %	0 %	0 %	169832831
4230	NC_010380	AC	3	6	246549	246554	50 %	0 %	0 %	50 %	169832831
4231	NC_010380	CT	3	6	246571	246576	0 %	50 %	0 %	50 %	169832831
4232	NC_010380	TGT	2	6	246755	246760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169832831
4233	NC_010380	GCT	2	6	246762	246767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169832831
4234	NC_010380	GTC	2	6	246809	246814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169832831
4235	NC_010380	AACAAG	2	12	246818	246829	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	169832831
4236	NC_010380	CTT	2	6	246856	246861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169832831
4237	NC_010380	ATA	2	6	246917	246922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169833622
4238	NC_010380	TTG	2	6	247017	247022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169833622
4239	NC_010380	TG	3	6	247162	247167	0 %	50 %	50 %	0 %	169833622
4240	NC_010380	TTGAT	2	10	247168	247177	20 %	60 %	20 %	0 %	169833622
4241	NC_010380	ATC	2	6	247191	247196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169833622
4242	NC_010380	T	7	7	247197	247203	0 %	100 %	0 %	0 %	169833622
4243	NC_010380	ACG	2	6	247243	247248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169833622
4244	NC_010380	C	6	6	247251	247256	0 %	0 %	0 %	100 %	169833622
4245	NC_010380	TCAT	2	8	247342	247349	25 %	50 %	0 %	25 %	169833622
4246	NC_010380	TGA	2	6	247369	247374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833622
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4248	NC_010380	TCACT	2	10	247543	247552	20 %	40 %	0 %	40 %	169833009
4249	NC_010380	AT	4	8	247680	247687	50 %	50 %	0 %	0 %	169833009
4250	NC_010380	TCA	2	6	247695	247700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169833009
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4363	NC_010380	T	6	6	254712	254717	0 %	100 %	0 %	0 %	169834457
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4498	NC_010380	TAG	2	6	263901	263906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169832764
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