MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 78104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010334	TAT	2	6	234060	234065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622139
3502	NC_010334	CT	3	6	234085	234090	0 %	50 %	0 %	50 %	167622139
3503	NC_010334	CCG	2	6	234130	234135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622139
3504	NC_010334	AGC	2	6	234209	234214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622139
3505	NC_010334	AAG	2	6	234371	234376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622139
3506	NC_010334	TTA	2	6	234620	234625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622139
3507	NC_010334	GGT	2	6	234670	234675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622139
3508	NC_010334	A	6	6	234752	234757	100 %	0 %	0 %	0 %	167622139
3509	NC_010334	TCA	2	6	234758	234763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622139
3510	NC_010334	AGA	2	6	234798	234803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622139
3511	NC_010334	TGGTAT	2	12	234873	234884	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	167622139
3512	NC_010334	TTC	2	6	234958	234963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622139
3513	NC_010334	ACACC	2	10	234995	235004	40 %	0 %	0 %	60 %	167622139
3514	NC_010334	TA	3	6	235034	235039	50 %	50 %	0 %	0 %	167622139
3515	NC_010334	GTT	2	6	235132	235137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622139
3516	NC_010334	TGA	2	6	235230	235235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622139
3517	NC_010334	TGG	3	9	235244	235252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622139
3518	NC_010334	AGG	3	9	235274	235282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167622139
3519	NC_010334	CCA	2	6	235301	235306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622139
3520	NC_010334	GATCA	2	10	235318	235327	40 %	20 %	20 %	20 %	167622139
3521	NC_010334	GC	3	6	235331	235336	0 %	0 %	50 %	50 %	167622139
3522	NC_010334	TGG	2	6	235337	235342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622139
3523	NC_010334	CTG	2	6	235361	235366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622139
3524	NC_010334	ATC	2	6	235468	235473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622139
3525	NC_010334	TG	3	6	235487	235492	0 %	50 %	50 %	0 %	167622139
3526	NC_010334	CTT	2	6	235542	235547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622139
3527	NC_010334	TGGT	2	8	235548	235555	0 %	50 %	50 %	0 %	167622139
3528	NC_010334	ATG	2	6	235633	235638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622139
3529	NC_010334	ACT	2	6	235796	235801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622139
3530	NC_010334	TCG	2	6	235892	235897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622139
3531	NC_010334	CAGT	2	8	235942	235949	25 %	25 %	25 %	25 %	167622139
3532	NC_010334	AAG	2	6	235985	235990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622139
3533	NC_010334	GTTG	2	8	236091	236098	0 %	50 %	50 %	0 %	167622139
3534	NC_010334	AAG	2	6	236168	236173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622139
3535	NC_010334	CAC	2	6	236177	236182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622139
3536	NC_010334	GGT	2	6	236269	236274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622139
3537	NC_010334	AGA	2	6	236355	236360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622139
3538	NC_010334	GGT	2	6	236491	236496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622139
3539	NC_010334	GAT	2	6	236530	236535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622139
3540	NC_010334	AAG	2	6	236551	236556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622139
3541	NC_010334	TCTT	2	8	236589	236596	0 %	75 %	0 %	25 %	167622139
3542	NC_010334	TGG	2	6	236651	236656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622139
3543	NC_010334	GTA	2	6	236707	236712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622139
3544	NC_010334	TAT	2	6	236730	236735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622139
3545	NC_010334	ACG	2	6	236774	236779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622139
3546	NC_010334	TTC	2	6	236782	236787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622139
3547	NC_010334	GGTC	2	8	236790	236797	0 %	25 %	50 %	25 %	167622139
3548	NC_010334	ACC	2	6	236803	236808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622139
3549	NC_010334	TGA	2	6	236930	236935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622139
3550	NC_010334	AGT	2	6	236977	236982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622139
3551	NC_010334	ATG	2	6	237034	237039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622139
3552	NC_010334	TCT	2	6	237074	237079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622139
3553	NC_010334	TTG	2	6	237086	237091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622139
3554	NC_010334	GCGA	2	8	237110	237117	25 %	0 %	50 %	25 %	167622139
3555	NC_010334	GCG	2	6	237151	237156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622139
3556	NC_010334	TGG	2	6	237664	237669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622140
3557	NC_010334	AT	3	6	237691	237696	50 %	50 %	0 %	0 %	167622140
3558	NC_010334	GTG	2	6	237760	237765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622140
3559	NC_010334	TTATC	2	10	237907	237916	20 %	60 %	0 %	20 %	167622140
3560	NC_010334	CAGA	2	8	238063	238070	50 %	0 %	25 %	25 %	167622140
3561	NC_010334	TCA	2	6	238435	238440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622141
3562	NC_010334	GTG	2	6	238471	238476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622141
3563	NC_010334	GAC	2	6	238515	238520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622141
3564	NC_010334	TCC	2	6	238537	238542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167622141
3565	NC_010334	TGC	2	6	238554	238559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622141
3566	NC_010334	TCG	2	6	238622	238627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622141
3567	NC_010334	GCT	2	6	238671	238676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622141
3568	NC_010334	G	6	6	238694	238699	0 %	0 %	100 %	0 %	167622141
3569	NC_010334	GTG	2	6	238706	238711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622141
3570	NC_010334	TCG	2	6	238721	238726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622141
3571	NC_010334	GTGCG	2	10	238827	238836	0 %	20 %	60 %	20 %	167622141
3572	NC_010334	ATG	2	6	238898	238903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622141
3573	NC_010334	AACTCA	2	12	238966	238977	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	167622141
3574	NC_010334	ATG	2	6	238985	238990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622141
3575	NC_010334	AACTCA	2	12	239053	239064	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	167622141
3576	NC_010334	ACA	2	6	239146	239151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622141
3577	NC_010334	ATC	3	9	239227	239235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622141
3578	NC_010334	GTG	2	6	239239	239244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622141
3579	NC_010334	TCG	2	6	239248	239253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622141
3580	NC_010334	CAG	2	6	239273	239278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622141
3581	NC_010334	TGG	2	6	239281	239286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622141
3582	NC_010334	TAG	2	6	239301	239306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622141
3583	NC_010334	TGG	2	6	239351	239356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622141
3584	NC_010334	TG	3	6	239382	239387	0 %	50 %	50 %	0 %	167622141
3585	NC_010334	TAT	2	6	239402	239407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622141
3586	NC_010334	AGC	3	9	239409	239417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622141
3587	NC_010334	GGC	2	6	239428	239433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622141
3588	NC_010334	TAC	2	6	239509	239514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622141
3589	NC_010334	ATC	2	6	239575	239580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622141
3590	NC_010334	TTGAT	2	10	239582	239591	20 %	60 %	20 %	0 %	167622141
3591	NC_010334	TTGG	2	8	239654	239661	0 %	50 %	50 %	0 %	167622141
3592	NC_010334	CAC	2	6	239667	239672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622141
3593	NC_010334	TGA	2	6	239675	239680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622141
3594	NC_010334	TAA	2	6	240044	240049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622142
3595	NC_010334	AATCCA	2	12	240074	240085	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	167622142
3596	NC_010334	AGA	2	6	240099	240104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622142
3597	NC_010334	CCAA	2	8	240112	240119	50 %	0 %	0 %	50 %	167622142
3598	NC_010334	GCA	2	6	240141	240146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622142
3599	NC_010334	TGG	2	6	240147	240152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622142
3600	NC_010334	TACCTA	2	12	240162	240173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622142
3601	NC_010334	TTC	2	6	240176	240181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622142
3602	NC_010334	GCGAC	2	10	240189	240198	20 %	0 %	40 %	40 %	167622142
3603	NC_010334	TCA	2	6	240222	240227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622142
3604	NC_010334	GCC	2	6	240269	240274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622142
3605	NC_010334	CA	3	6	240381	240386	50 %	0 %	0 %	50 %	167622142
3606	NC_010334	AAAG	2	8	240487	240494	75 %	0 %	25 %	0 %	167622142
3607	NC_010334	TGC	2	6	240540	240545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622142
3608	NC_010334	CACATC	2	12	240571	240582	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	167622142
3609	NC_010334	AGATAA	2	12	240636	240647	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	167622142
3610	NC_010334	CGA	2	6	240651	240656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622142
3611	NC_010334	AAG	2	6	240665	240670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622142
3612	NC_010334	G	6	6	240708	240713	0 %	0 %	100 %	0 %	167622142
3613	NC_010334	GCC	2	6	240773	240778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622142
3614	NC_010334	CCAT	2	8	240809	240816	25 %	25 %	0 %	50 %	167622142
3615	NC_010334	CTCG	2	8	240844	240851	0 %	25 %	25 %	50 %	167622142
3616	NC_010334	CAA	2	6	240876	240881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622142
3617	NC_010334	TGA	2	6	240912	240917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622142
3618	NC_010334	ATC	2	6	240980	240985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622142
3619	NC_010334	AGC	2	6	241013	241018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622142
3620	NC_010334	GAC	2	6	241101	241106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622142
3621	NC_010334	ATC	2	6	241121	241126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622142
3622	NC_010334	GCC	2	6	241127	241132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622142
3623	NC_010334	CTG	2	6	241161	241166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622142
3624	NC_010334	AGCG	2	8	241235	241242	25 %	0 %	50 %	25 %	167622142
3625	NC_010334	GCA	2	6	241247	241252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622142
3626	NC_010334	GTG	2	6	241314	241319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622142
3627	NC_010334	TCA	2	6	241377	241382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622142
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3629	NC_010334	ACT	2	6	241408	241413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622142
3630	NC_010334	CAA	2	6	241443	241448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622142
3631	NC_010334	GATAAC	2	12	241480	241491	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	167622142
3632	NC_010334	GGC	2	6	241492	241497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622142
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3634	NC_010334	ACCA	2	8	241575	241582	50 %	0 %	0 %	50 %	167622142
3635	NC_010334	ATT	2	6	241591	241596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622142
3636	NC_010334	TGC	2	6	241644	241649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622142
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3638	NC_010334	AGAA	2	8	242290	242297	75 %	0 %	25 %	0 %	167622143
3639	NC_010334	GCA	2	6	242336	242341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622143
3640	NC_010334	TTC	2	6	242371	242376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622143
3641	NC_010334	TCA	2	6	242417	242422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622143
3642	NC_010334	CAACAT	2	12	242496	242507	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	167622143
3643	NC_010334	CA	3	6	242576	242581	50 %	0 %	0 %	50 %	167622143
3644	NC_010334	ATA	2	6	242584	242589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622143
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3646	NC_010334	GAA	2	6	242706	242711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622143
3647	NC_010334	TGC	2	6	242735	242740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622143
3648	NC_010334	TGC	2	6	242744	242749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622143
3649	NC_010334	GC	3	6	242906	242911	0 %	0 %	50 %	50 %	167622143
3650	NC_010334	CTT	2	6	242982	242987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622143
3651	NC_010334	T	6	6	243011	243016	0 %	100 %	0 %	0 %	167622143
3652	NC_010334	TGC	2	6	243033	243038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622143
3653	NC_010334	TCAC	2	8	243040	243047	25 %	25 %	0 %	50 %	167622143
3654	NC_010334	T	6	6	243077	243082	0 %	100 %	0 %	0 %	167622143
3655	NC_010334	AAGG	2	8	243099	243106	50 %	0 %	50 %	0 %	167622143
3656	NC_010334	CAA	2	6	243155	243160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622143
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3658	NC_010334	AGT	2	6	243229	243234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622143
3659	NC_010334	GAC	2	6	243296	243301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622143
3660	NC_010334	ATC	2	6	243316	243321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622143
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3662	NC_010334	CGATA	2	10	243369	243378	40 %	20 %	20 %	20 %	167622143
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3675	NC_010334	AAG	2	6	244841	244846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622144
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3677	NC_010334	CTG	2	6	245124	245129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622144
3678	NC_010334	CGT	2	6	245132	245137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622144
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3681	NC_010334	GTC	2	6	245544	245549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622145
3682	NC_010334	ATCT	2	8	245573	245580	25 %	50 %	0 %	25 %	167622145
3683	NC_010334	CTTA	2	8	245613	245620	25 %	50 %	0 %	25 %	167622145
3684	NC_010334	ATC	2	6	245639	245644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622145
3685	NC_010334	TAG	2	6	245658	245663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622145
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3689	NC_010334	TGA	2	6	245970	245975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622145
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3692	NC_010334	TAA	2	6	246232	246237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622145
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3732	NC_010334	ACT	2	6	248964	248969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622148
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3735	NC_010334	TAC	2	6	249065	249070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622148
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3741	NC_010334	CAA	2	6	249738	249743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622149
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3744	NC_010334	AG	3	6	249807	249812	50 %	0 %	50 %	0 %	167622149
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3862	NC_010334	GTT	2	6	258252	258257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622155
3863	NC_010334	TCA	2	6	258386	258391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622155
3864	NC_010334	GCCA	2	8	258491	258498	25 %	0 %	25 %	50 %	167622155
3865	NC_010334	CGG	2	6	258536	258541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622155
3866	NC_010334	TTGTAG	2	12	258564	258575	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	167622155
3867	NC_010334	TTGG	2	8	258735	258742	0 %	50 %	50 %	0 %	167622155
3868	NC_010334	TTC	2	6	258744	258749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622155
3869	NC_010334	GTTT	2	8	258803	258810	0 %	75 %	25 %	0 %	167622155
3870	NC_010334	AGT	2	6	258917	258922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622155
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3872	NC_010334	TTA	2	6	258979	258984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622155
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3875	NC_010334	AG	4	8	259114	259121	50 %	0 %	50 %	0 %	167622155
3876	NC_010334	TAAT	2	8	259183	259190	50 %	50 %	0 %	0 %	167622155
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3881	NC_010334	TGTA	2	8	259540	259547	25 %	50 %	25 %	0 %	167622156
3882	NC_010334	TGC	2	6	259553	259558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622156
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3893	NC_010334	T	6	6	260279	260284	0 %	100 %	0 %	0 %	167622156
3894	NC_010334	GTG	2	6	260296	260301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622156
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3900	NC_010334	GA	3	6	260482	260487	50 %	0 %	50 %	0 %	167622156
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3964	NC_010334	A	6	6	265578	265583	100 %	0 %	0 %	0 %	167622161
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3966	NC_010334	T	6	6	265612	265617	0 %	100 %	0 %	0 %	167622161
3967	NC_010334	TTGC	2	8	265624	265631	0 %	50 %	25 %	25 %	167622161
3968	NC_010334	ACTC	2	8	265711	265718	25 %	25 %	0 %	50 %	167622161
3969	NC_010334	TAA	2	6	265794	265799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622161
3970	NC_010334	AGCT	2	8	265833	265840	25 %	25 %	25 %	25 %	167622161
3971	NC_010334	TAC	2	6	265906	265911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622161
3972	NC_010334	TCC	2	6	265923	265928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167622161
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3974	NC_010334	GTT	2	6	266155	266160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622161
3975	NC_010334	CTTGG	2	10	266188	266197	0 %	40 %	40 %	20 %	167622161
3976	NC_010334	CAG	2	6	266252	266257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622161
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3978	NC_010334	ATC	2	6	266365	266370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622161
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3983	NC_010334	TCT	2	6	266564	266569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622161
3984	NC_010334	TC	3	6	266579	266584	0 %	50 %	0 %	50 %	167622161
3985	NC_010334	TGA	2	6	266684	266689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622161
3986	NC_010334	TCA	2	6	266699	266704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622161
3987	NC_010334	GCC	2	6	266734	266739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622161
3988	NC_010334	ATT	2	6	266746	266751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622161
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