MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 78104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_010334	GTT	2	6	131757	131762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622056
2002	NC_010334	GGT	2	6	131763	131768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622056
2003	NC_010334	TTC	2	6	131947	131952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622056
2004	NC_010334	ATC	2	6	131967	131972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622056
2005	NC_010334	GGT	2	6	132024	132029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622056
2006	NC_010334	TGA	2	6	132056	132061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622056
2007	NC_010334	GCCA	2	8	132069	132076	25 %	0 %	25 %	50 %	167622056
2008	NC_010334	CAC	2	6	132078	132083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622056
2009	NC_010334	ATT	2	6	132405	132410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622057
2010	NC_010334	CAC	2	6	132446	132451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622057
2011	NC_010334	GAT	2	6	132461	132466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622057
2012	NC_010334	GAT	2	6	132536	132541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622057
2013	NC_010334	AAG	2	6	132561	132566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622057
2014	NC_010334	AGA	2	6	132641	132646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622057
2015	NC_010334	GC	4	8	132651	132658	0 %	0 %	50 %	50 %	167622057
2016	NC_010334	GGT	2	6	132732	132737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622057
2017	NC_010334	CAC	2	6	132740	132745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622057
2018	NC_010334	AGA	2	6	132755	132760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622057
2019	NC_010334	A	6	6	132788	132793	100 %	0 %	0 %	0 %	167622057
2020	NC_010334	GAT	2	6	132915	132920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622057
2021	NC_010334	GGC	2	6	132986	132991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622057
2022	NC_010334	CAC	2	6	133106	133111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622057
2023	NC_010334	TGA	2	6	133120	133125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622057
2024	NC_010334	GGC	2	6	133163	133168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622057
2025	NC_010334	AAT	2	6	133263	133268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622057
2026	NC_010334	CGA	2	6	133277	133282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622057
2027	NC_010334	CAG	2	6	133419	133424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622057
2028	NC_010334	GTC	2	6	133483	133488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622057
2029	NC_010334	GAT	2	6	133631	133636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622057
2030	NC_010334	CTG	2	6	133641	133646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622057
2031	NC_010334	ATG	2	6	133647	133652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622057
2032	NC_010334	ACGT	2	8	133678	133685	25 %	25 %	25 %	25 %	167622057
2033	NC_010334	AT	3	6	133917	133922	50 %	50 %	0 %	0 %	167622058
2034	NC_010334	T	7	7	133953	133959	0 %	100 %	0 %	0 %	167622058
2035	NC_010334	GGT	2	6	133982	133987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622058
2036	NC_010334	TGG	2	6	134005	134010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622058
2037	NC_010334	GGC	2	6	134024	134029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622058
2038	NC_010334	GAT	2	6	134099	134104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622058
2039	NC_010334	AATT	2	8	134143	134150	50 %	50 %	0 %	0 %	167622058
2040	NC_010334	GTA	2	6	134175	134180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622058
2041	NC_010334	TGA	3	9	134196	134204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622058
2042	NC_010334	CAT	2	6	134224	134229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622058
2043	NC_010334	GCC	2	6	134263	134268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622058
2044	NC_010334	GGT	2	6	134356	134361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622058
2045	NC_010334	TA	3	6	134529	134534	50 %	50 %	0 %	0 %	167622058
2046	NC_010334	GCA	2	6	134537	134542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622058
2047	NC_010334	CGG	2	6	134559	134564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622058
2048	NC_010334	TTAG	2	8	134630	134637	25 %	50 %	25 %	0 %	167622058
2049	NC_010334	TCG	2	6	134649	134654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622058
2050	NC_010334	AGC	2	6	134668	134673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622058
2051	NC_010334	CGG	2	6	134742	134747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622058
2052	NC_010334	TAT	2	6	134988	134993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622059
2053	NC_010334	GTG	2	6	135064	135069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622059
2054	NC_010334	AAT	2	6	135127	135132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622059
2055	NC_010334	ATA	2	6	135149	135154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622059
2056	NC_010334	CAA	2	6	135169	135174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622059
2057	NC_010334	TTCG	2	8	135223	135230	0 %	50 %	25 %	25 %	167622059
2058	NC_010334	AGAAC	2	10	135249	135258	60 %	0 %	20 %	20 %	167622059
2059	NC_010334	T	6	6	135319	135324	0 %	100 %	0 %	0 %	167622059
2060	NC_010334	TTGGC	2	10	135548	135557	0 %	40 %	40 %	20 %	167622059
2061	NC_010334	AGGCA	2	10	135628	135637	40 %	0 %	40 %	20 %	167622059
2062	NC_010334	ATG	2	6	135662	135667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622059
2063	NC_010334	TGC	2	6	135669	135674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622059
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2065	NC_010334	ATC	2	6	135910	135915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622059
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2068	NC_010334	GAG	2	6	136204	136209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167622059
2069	NC_010334	TGC	2	6	136220	136225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622059
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2071	NC_010334	TGG	2	6	136277	136282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622059
2072	NC_010334	TGC	2	6	136338	136343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622059
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2080	NC_010334	CAT	2	6	136749	136754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622060
2081	NC_010334	TCG	2	6	136781	136786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622060
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2083	NC_010334	ATT	2	6	136881	136886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622060
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2088	NC_010334	TGA	2	6	137393	137398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622061
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2090	NC_010334	TCG	2	6	137498	137503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622061
2091	NC_010334	T	6	6	137512	137517	0 %	100 %	0 %	0 %	167622061
2092	NC_010334	CGC	2	6	137562	137567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622061
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2094	NC_010334	CTT	2	6	137856	137861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622062
2095	NC_010334	CTT	2	6	137870	137875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622062
2096	NC_010334	AC	3	6	137888	137893	50 %	0 %	0 %	50 %	167622062
2097	NC_010334	CAG	2	6	137894	137899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622062
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2101	NC_010334	AG	3	6	138024	138029	50 %	0 %	50 %	0 %	167622062
2102	NC_010334	CCG	2	6	138145	138150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622062
2103	NC_010334	CGC	2	6	138179	138184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622062
2104	NC_010334	TA	3	6	138233	138238	50 %	50 %	0 %	0 %	167622062
2105	NC_010334	CTC	2	6	138240	138245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167622062
2106	NC_010334	CAT	2	6	138312	138317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622062
2107	NC_010334	TG	3	6	138367	138372	0 %	50 %	50 %	0 %	167622062
2108	NC_010334	CGC	2	6	138500	138505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622062
2109	NC_010334	GT	3	6	138531	138536	0 %	50 %	50 %	0 %	167622062
2110	NC_010334	GCC	2	6	138642	138647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622062
2111	NC_010334	GCCA	2	8	138671	138678	25 %	0 %	25 %	50 %	167622062
2112	NC_010334	GCTC	2	8	138710	138717	0 %	25 %	25 %	50 %	167622062
2113	NC_010334	TGC	2	6	138754	138759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622062
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2115	NC_010334	GC	3	6	139003	139008	0 %	0 %	50 %	50 %	167622062
2116	NC_010334	GC	4	8	139096	139103	0 %	0 %	50 %	50 %	167622062
2117	NC_010334	TCA	2	6	139132	139137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622062
2118	NC_010334	CGG	2	6	139145	139150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622062
2119	NC_010334	GTC	2	6	139179	139184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622062
2120	NC_010334	CTG	2	6	139331	139336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622062
2121	NC_010334	GTCA	2	8	139816	139823	25 %	25 %	25 %	25 %	167622063
2122	NC_010334	A	6	6	139950	139955	100 %	0 %	0 %	0 %	167622063
2123	NC_010334	GGT	2	6	139967	139972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622063
2124	NC_010334	CCCT	2	8	139976	139983	0 %	25 %	0 %	75 %	167622063
2125	NC_010334	ATT	2	6	140003	140008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622063
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2129	NC_010334	GCG	2	6	140204	140209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622063
2130	NC_010334	TGC	2	6	140247	140252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622063
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2132	NC_010334	TGA	2	6	140443	140448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622063
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2136	NC_010334	AGTT	2	8	140640	140647	25 %	50 %	25 %	0 %	167622063
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2142	NC_010334	GAT	2	6	141033	141038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622064
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2154	NC_010334	CTG	2	6	141791	141796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622065
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2230	NC_010334	TGG	2	6	146523	146528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622073
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2236	NC_010334	GCTAA	2	10	146830	146839	40 %	20 %	20 %	20 %	167622073
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2241	NC_010334	CT	3	6	147184	147189	0 %	50 %	0 %	50 %	167622074
2242	NC_010334	TGG	2	6	147250	147255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622074
2243	NC_010334	TGG	2	6	147280	147285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622074
2244	NC_010334	TGA	2	6	147291	147296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622074
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2247	NC_010334	GTACA	2	10	147452	147461	40 %	20 %	20 %	20 %	167622074
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2269	NC_010334	TCG	2	6	149481	149486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622076
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2354	NC_010334	TAT	2	6	154181	154186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622080
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2357	NC_010334	TC	3	6	154399	154404	0 %	50 %	0 %	50 %	167622080
2358	NC_010334	AGC	2	6	154444	154449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622080
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2482	NC_010334	TGC	2	6	166318	166323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622088
2483	NC_010334	CCA	2	6	166325	166330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622088
2484	NC_010334	TCA	2	6	166399	166404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622088
2485	NC_010334	GGT	2	6	166406	166411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622088
2486	NC_010334	GAT	2	6	166523	166528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622088
2487	NC_010334	CTC	2	6	166574	166579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167622089
2488	NC_010334	CAT	2	6	166744	166749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622089
2489	NC_010334	CAA	2	6	166788	166793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622089
2490	NC_010334	TAA	2	6	166798	166803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622089
2491	NC_010334	CT	3	6	166819	166824	0 %	50 %	0 %	50 %	167622089
2492	NC_010334	GGC	2	6	166906	166911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622089
2493	NC_010334	CAA	2	6	166923	166928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622089
2494	NC_010334	CAG	2	6	167032	167037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622089
2495	NC_010334	ATG	2	6	167195	167200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622089
2496	NC_010334	CAG	2	6	167227	167232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622089
2497	NC_010334	CTG	2	6	167242	167247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622089
2498	NC_010334	TTCA	2	8	167266	167273	25 %	50 %	0 %	25 %	167622089
2499	NC_010334	TTG	2	6	167320	167325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622090
2500	NC_010334	TGC	2	6	167442	167447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622090

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