MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 78104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010334	AAC	2	6	100240	100245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622031
1502	NC_010334	GCCA	2	8	100430	100437	25 %	0 %	25 %	50 %	167622031
1503	NC_010334	CTG	2	6	100548	100553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622031
1504	NC_010334	TGG	2	6	100666	100671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622031
1505	NC_010334	CAT	2	6	100695	100700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622031
1506	NC_010334	TAG	3	9	100701	100709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622031
1507	NC_010334	TAAA	2	8	100842	100849	75 %	25 %	0 %	0 %	167622031
1508	NC_010334	CAT	2	6	100917	100922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622031
1509	NC_010334	ATC	2	6	100936	100941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622031
1510	NC_010334	TAG	2	6	100968	100973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622031
1511	NC_010334	CCA	2	6	100974	100979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622031
1512	NC_010334	AAT	2	6	101010	101015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622031
1513	NC_010334	ATC	2	6	101059	101064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622031
1514	NC_010334	CCA	2	6	101068	101073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622031
1515	NC_010334	GCA	2	6	101087	101092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622031
1516	NC_010334	GCC	2	6	101097	101102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622031
1517	NC_010334	AGC	2	6	101227	101232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622031
1518	NC_010334	GCC	2	6	101259	101264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622031
1519	NC_010334	TAA	2	6	101343	101348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622031
1520	NC_010334	AGCT	2	8	101360	101367	25 %	25 %	25 %	25 %	167622031
1521	NC_010334	TGT	2	6	101624	101629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622032
1522	NC_010334	GAA	2	6	101694	101699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622032
1523	NC_010334	GCC	2	6	101702	101707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622032
1524	NC_010334	ATG	2	6	101746	101751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622032
1525	NC_010334	CGG	2	6	101820	101825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622032
1526	NC_010334	TAT	2	6	101826	101831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622032
1527	NC_010334	GAT	2	6	101853	101858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622032
1528	NC_010334	TGG	2	6	101871	101876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622032
1529	NC_010334	GAG	2	6	101899	101904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167622032
1530	NC_010334	GCG	2	6	101956	101961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622032
1531	NC_010334	G	6	6	102029	102034	0 %	0 %	100 %	0 %	167622032
1532	NC_010334	TGA	2	6	102131	102136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622032
1533	NC_010334	CA	3	6	102181	102186	50 %	0 %	0 %	50 %	167622032
1534	NC_010334	CCT	2	6	102383	102388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167622033
1535	NC_010334	TG	3	6	102391	102396	0 %	50 %	50 %	0 %	167622033
1536	NC_010334	CT	3	6	102405	102410	0 %	50 %	0 %	50 %	167622033
1537	NC_010334	AGC	2	6	102472	102477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622033
1538	NC_010334	TA	3	6	102511	102516	50 %	50 %	0 %	0 %	167622033
1539	NC_010334	ATT	2	6	102562	102567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622033
1540	NC_010334	TGG	2	6	102569	102574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622033
1541	NC_010334	TAG	2	6	102707	102712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622033
1542	NC_010334	CGG	2	6	102790	102795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622033
1543	NC_010334	ACC	2	6	102895	102900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622033
1544	NC_010334	TCA	2	6	102901	102906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622033
1545	NC_010334	CAATC	2	10	102947	102956	40 %	20 %	0 %	40 %	167622033
1546	NC_010334	AAT	2	6	103022	103027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622033
1547	NC_010334	GGC	2	6	103076	103081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622033
1548	NC_010334	GCA	2	6	103085	103090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622033
1549	NC_010334	AGG	2	6	103232	103237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167622033
1550	NC_010334	ATG	2	6	103272	103277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622033
1551	NC_010334	ATG	2	6	103321	103326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622033
1552	NC_010334	GT	3	6	103363	103368	0 %	50 %	50 %	0 %	167622033
1553	NC_010334	CTAGC	2	10	103417	103426	20 %	20 %	20 %	40 %	167622033
1554	NC_010334	GGT	2	6	103542	103547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622033
1555	NC_010334	GTG	2	6	103679	103684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622033
1556	NC_010334	TCGA	2	8	103767	103774	25 %	25 %	25 %	25 %	167622033
1557	NC_010334	CAC	2	6	103825	103830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622033
1558	NC_010334	TCGATG	2	12	103834	103845	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167622033
1559	NC_010334	AGTC	2	8	103909	103916	25 %	25 %	25 %	25 %	167622033
1560	NC_010334	ACA	2	6	103955	103960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622033
1561	NC_010334	GGC	2	6	103964	103969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622033
1562	NC_010334	GAT	2	6	103980	103985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622033
1563	NC_010334	GTG	2	6	103992	103997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622033
1564	NC_010334	CAGATG	2	12	104037	104048	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	167622033
1565	NC_010334	GGCT	2	8	104136	104143	0 %	25 %	50 %	25 %	167622033
1566	NC_010334	GCG	2	6	104160	104165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622033
1567	NC_010334	GCT	2	6	104271	104276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622033
1568	NC_010334	ATC	2	6	104347	104352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622033
1569	NC_010334	TAC	2	6	104488	104493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622033
1570	NC_010334	CTT	2	6	104496	104501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622033
1571	NC_010334	TAAT	2	8	104531	104538	50 %	50 %	0 %	0 %	167622033
1572	NC_010334	TC	3	6	104690	104695	0 %	50 %	0 %	50 %	167622034
1573	NC_010334	CAG	2	6	104762	104767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622034
1574	NC_010334	TAT	2	6	104770	104775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622034
1575	NC_010334	CA	3	6	104784	104789	50 %	0 %	0 %	50 %	167622034
1576	NC_010334	TTG	3	9	104919	104927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622034
1577	NC_010334	AT	3	6	104929	104934	50 %	50 %	0 %	0 %	167622034
1578	NC_010334	A	6	6	104966	104971	100 %	0 %	0 %	0 %	167622034
1579	NC_010334	AGT	2	6	104979	104984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622034
1580	NC_010334	CTT	2	6	104994	104999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622035
1581	NC_010334	AAATT	2	10	105001	105010	60 %	40 %	0 %	0 %	167622035
1582	NC_010334	T	6	6	105021	105026	0 %	100 %	0 %	0 %	167622035
1583	NC_010334	GCA	2	6	105027	105032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622035
1584	NC_010334	TC	3	6	105043	105048	0 %	50 %	0 %	50 %	167622035
1585	NC_010334	AGC	2	6	105175	105180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622035
1586	NC_010334	A	7	7	105219	105225	100 %	0 %	0 %	0 %	167622035
1587	NC_010334	CAA	3	9	105243	105251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622035
1588	NC_010334	AGC	2	6	105274	105279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622035
1589	NC_010334	TCA	2	6	105300	105305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622035
1590	NC_010334	TAA	3	9	105323	105331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622035
1591	NC_010334	GAT	2	6	105381	105386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622035
1592	NC_010334	CTG	2	6	105453	105458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622035
1593	NC_010334	TGA	2	6	105499	105504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622035
1594	NC_010334	TCT	2	6	105544	105549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622035
1595	NC_010334	CG	3	6	105576	105581	0 %	0 %	50 %	50 %	167622035
1596	NC_010334	GCT	2	6	105594	105599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622035
1597	NC_010334	CGATGA	2	12	105617	105628	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	167622035
1598	NC_010334	GC	3	6	105691	105696	0 %	0 %	50 %	50 %	167622035
1599	NC_010334	ATA	2	6	105739	105744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622035
1600	NC_010334	TGA	2	6	105784	105789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622035
1601	NC_010334	GAA	2	6	105810	105815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622035
1602	NC_010334	G	6	6	105818	105823	0 %	0 %	100 %	0 %	167622035
1603	NC_010334	TGG	2	6	105872	105877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622035
1604	NC_010334	TGC	2	6	105938	105943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622035
1605	NC_010334	GGT	2	6	106053	106058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622035
1606	NC_010334	GGCT	2	8	106064	106071	0 %	25 %	50 %	25 %	167622035
1607	NC_010334	CTAT	2	8	106129	106136	25 %	50 %	0 %	25 %	167622035
1608	NC_010334	TTG	2	6	106207	106212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622035
1609	NC_010334	TAC	2	6	106305	106310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622035
1610	NC_010334	CGG	2	6	106363	106368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622035
1611	NC_010334	GCTTA	2	10	106376	106385	20 %	40 %	20 %	20 %	167622035
1612	NC_010334	GATTAT	2	12	106416	106427	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167622035
1613	NC_010334	TAA	2	6	106490	106495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622035
1614	NC_010334	ATC	2	6	106506	106511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622035
1615	NC_010334	GCA	2	6	106756	106761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622035
1616	NC_010334	AAG	2	6	106799	106804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622035
1617	NC_010334	CAA	2	6	106806	106811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622035
1618	NC_010334	CAA	2	6	106886	106891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622035
1619	NC_010334	GTA	2	6	106957	106962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622035
1620	NC_010334	GA	3	6	106982	106987	50 %	0 %	50 %	0 %	167622035
1621	NC_010334	GAT	2	6	107058	107063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622035
1622	NC_010334	TGA	2	6	107137	107142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622035
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1624	NC_010334	AGCT	2	8	107255	107262	25 %	25 %	25 %	25 %	167622035
1625	NC_010334	GCG	2	6	107278	107283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622035
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1744	NC_010334	TCA	2	6	115073	115078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622043
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1864	NC_010334	GCTAA	2	10	122860	122869	40 %	20 %	20 %	20 %	167622050
1865	NC_010334	GTT	2	6	122893	122898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622050
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1868	NC_010334	GT	3	6	122984	122989	0 %	50 %	50 %	0 %	167622050
1869	NC_010334	TGG	2	6	122991	122996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622050
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1903	NC_010334	TG	3	6	125206	125211	0 %	50 %	50 %	0 %	167622051
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1977	NC_010334	TGA	2	6	130209	130214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622054
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1984	NC_010334	CGG	2	6	130883	130888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622055
1985	NC_010334	AGA	2	6	130892	130897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622055
1986	NC_010334	TG	3	6	130963	130968	0 %	50 %	50 %	0 %	167622055
1987	NC_010334	TG	3	6	130975	130980	0 %	50 %	50 %	0 %	167622055
1988	NC_010334	ACT	2	6	130991	130996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622055
1989	NC_010334	GTT	2	6	131013	131018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622055
1990	NC_010334	TTC	2	6	131196	131201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622056
1991	NC_010334	GT	3	6	131203	131208	0 %	50 %	50 %	0 %	167622056
1992	NC_010334	AAC	2	6	131256	131261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622056
1993	NC_010334	CAA	2	6	131311	131316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622056
1994	NC_010334	ACTTG	2	10	131360	131369	20 %	40 %	20 %	20 %	167622056
1995	NC_010334	ATG	2	6	131394	131399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622056
1996	NC_010334	ATC	3	9	131418	131426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622056
1997	NC_010334	CTT	3	9	131588	131596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622056
1998	NC_010334	GCT	2	6	131640	131645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622056
1999	NC_010334	CAT	2	6	131660	131665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622056
2000	NC_010334	GAT	2	6	131750	131755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622056

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