MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 78104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010334	CAAG	2	8	67110	67117	50 %	0 %	25 %	25 %	167622000
1002	NC_010334	GTC	2	6	67157	67162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622000
1003	NC_010334	ATGA	2	8	67245	67252	50 %	25 %	25 %	0 %	167622000
1004	NC_010334	ATG	2	6	67291	67296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622000
1005	NC_010334	CGC	2	6	67304	67309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622000
1006	NC_010334	TGGCT	2	10	67337	67346	0 %	40 %	40 %	20 %	167622000
1007	NC_010334	GTG	2	6	67347	67352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622000
1008	NC_010334	TCA	2	6	67436	67441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622000
1009	NC_010334	GCG	2	6	67518	67523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622000
1010	NC_010334	AGA	2	6	67604	67609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622000
1011	NC_010334	GCG	2	6	67639	67644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622000
1012	NC_010334	TGC	2	6	67652	67657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622000
1013	NC_010334	GAT	2	6	67689	67694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622000
1014	NC_010334	GTT	2	6	67740	67745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622000
1015	NC_010334	CTG	2	6	67786	67791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622000
1016	NC_010334	GAG	2	6	67794	67799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167622000
1017	NC_010334	TAA	2	6	67956	67961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622000
1018	NC_010334	TCT	2	6	68054	68059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622001
1019	NC_010334	GA	3	6	68067	68072	50 %	0 %	50 %	0 %	167622001
1020	NC_010334	TGAG	2	8	68137	68144	25 %	25 %	50 %	0 %	167622001
1021	NC_010334	TAA	2	6	68162	68167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622001
1022	NC_010334	TCAA	2	8	68170	68177	50 %	25 %	0 %	25 %	167622001
1023	NC_010334	GCC	2	6	68239	68244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622001
1024	NC_010334	CAT	2	6	68253	68258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622001
1025	NC_010334	GCC	2	6	68341	68346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622001
1026	NC_010334	CAA	3	9	68366	68374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622001
1027	NC_010334	TCA	3	9	68375	68383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622001
1028	NC_010334	CCA	2	6	68480	68485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622001
1029	NC_010334	AGT	2	6	68551	68556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622001
1030	NC_010334	ACGCTC	2	12	68571	68582	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	167622001
1031	NC_010334	TCATGG	2	12	68636	68647	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167622001
1032	NC_010334	ATC	2	6	68662	68667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622001
1033	NC_010334	CAC	2	6	68771	68776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622001
1034	NC_010334	ACG	2	6	68802	68807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622001
1035	NC_010334	GGC	2	6	68883	68888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622001
1036	NC_010334	TAA	2	6	68900	68905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622001
1037	NC_010334	TCT	2	6	69016	69021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622001
1038	NC_010334	AGAA	2	8	69046	69053	75 %	0 %	25 %	0 %	167622001
1039	NC_010334	GC	3	6	69074	69079	0 %	0 %	50 %	50 %	167622001
1040	NC_010334	GTA	2	6	69087	69092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622001
1041	NC_010334	ATT	2	6	69157	69162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622001
1042	NC_010334	TTA	2	6	69163	69168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622001
1043	NC_010334	GCT	2	6	69203	69208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622002
1044	NC_010334	GA	3	6	69250	69255	50 %	0 %	50 %	0 %	167622002
1045	NC_010334	CAA	2	6	69300	69305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622002
1046	NC_010334	GCG	2	6	69344	69349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622002
1047	NC_010334	CTT	2	6	69351	69356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622002
1048	NC_010334	T	6	6	69395	69400	0 %	100 %	0 %	0 %	167622002
1049	NC_010334	TGG	2	6	69485	69490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622002
1050	NC_010334	GA	3	6	69531	69536	50 %	0 %	50 %	0 %	167622002
1051	NC_010334	AT	3	6	69650	69655	50 %	50 %	0 %	0 %	167622002
1052	NC_010334	TGC	2	6	69710	69715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622002
1053	NC_010334	GGC	2	6	69718	69723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622002
1054	NC_010334	TAA	2	6	69781	69786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622002
1055	NC_010334	GGT	2	6	69808	69813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622002
1056	NC_010334	TGG	2	6	69933	69938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622002
1057	NC_010334	CTTA	2	8	69943	69950	25 %	50 %	0 %	25 %	167622003
1058	NC_010334	TGTT	2	8	69959	69966	0 %	75 %	25 %	0 %	167622003
1059	NC_010334	TGG	2	6	70217	70222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622003
1060	NC_010334	TGA	2	6	70515	70520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622003
1061	NC_010334	TGAG	2	8	70534	70541	25 %	25 %	50 %	0 %	167622003
1062	NC_010334	TGC	2	6	70588	70593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622003
1063	NC_010334	GTCAGT	2	12	70596	70607	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167622003
1064	NC_010334	CTG	2	6	70796	70801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622003
1065	NC_010334	GC	3	6	71050	71055	0 %	0 %	50 %	50 %	167622003
1066	NC_010334	GGATT	2	10	71085	71094	20 %	40 %	40 %	0 %	167622003
1067	NC_010334	GCC	2	6	71198	71203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622003
1068	NC_010334	TGGC	2	8	71245	71252	0 %	25 %	50 %	25 %	167622003
1069	NC_010334	GCC	2	6	71451	71456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622003
1070	NC_010334	T	6	6	71465	71470	0 %	100 %	0 %	0 %	167622003
1071	NC_010334	GTA	2	6	72059	72064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622004
1072	NC_010334	CAA	2	6	72077	72082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622004
1073	NC_010334	CAG	2	6	72126	72131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622004
1074	NC_010334	CTA	2	6	72278	72283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622004
1075	NC_010334	GTT	2	6	72296	72301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622004
1076	NC_010334	CTAT	2	8	72306	72313	25 %	50 %	0 %	25 %	167622004
1077	NC_010334	TCG	2	6	72375	72380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622004
1078	NC_010334	GAC	2	6	72500	72505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622004
1079	NC_010334	GCA	3	9	72533	72541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622004
1080	NC_010334	TTA	2	6	72581	72586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622004
1081	NC_010334	AC	3	6	72675	72680	50 %	0 %	0 %	50 %	167622004
1082	NC_010334	GGC	2	6	72773	72778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622004
1083	NC_010334	CTT	2	6	72862	72867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622004
1084	NC_010334	ACAAG	2	10	72889	72898	60 %	0 %	20 %	20 %	167622004
1085	NC_010334	AGA	2	6	72924	72929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622004
1086	NC_010334	GCG	2	6	73089	73094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622004
1087	NC_010334	TTC	2	6	73124	73129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622004
1088	NC_010334	TG	3	6	73152	73157	0 %	50 %	50 %	0 %	167622004
1089	NC_010334	GTG	2	6	73287	73292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622004
1090	NC_010334	TGGT	2	8	73351	73358	0 %	50 %	50 %	0 %	167622004
1091	NC_010334	GTC	2	6	73377	73382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622004
1092	NC_010334	ACCG	2	8	73409	73416	25 %	0 %	25 %	50 %	167622004
1093	NC_010334	TGA	2	6	73428	73433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622004
1094	NC_010334	TTG	2	6	73515	73520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622004
1095	NC_010334	CTA	2	6	73622	73627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622004
1096	NC_010334	AGC	2	6	73656	73661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622004
1097	NC_010334	AAG	2	6	73706	73711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622004
1098	NC_010334	TTG	2	6	73718	73723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622004
1099	NC_010334	CGT	2	6	73775	73780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622004
1100	NC_010334	ACA	2	6	73791	73796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622004
1101	NC_010334	AAT	2	6	74142	74147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622005
1102	NC_010334	GGTTT	2	10	74159	74168	0 %	60 %	40 %	0 %	167622005
1103	NC_010334	GGC	2	6	74171	74176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622005
1104	NC_010334	GCT	2	6	74347	74352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622005
1105	NC_010334	CCG	2	6	74371	74376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622005
1106	NC_010334	AGCC	2	8	74421	74428	25 %	0 %	25 %	50 %	167622005
1107	NC_010334	CTG	2	6	74460	74465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622005
1108	NC_010334	AAT	2	6	74473	74478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622005
1109	NC_010334	T	6	6	74531	74536	0 %	100 %	0 %	0 %	167622006
1110	NC_010334	ACG	2	6	74609	74614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622006
1111	NC_010334	TGG	2	6	74651	74656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622006
1112	NC_010334	GTT	2	6	74666	74671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622006
1113	NC_010334	CGA	2	6	74682	74687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622006
1114	NC_010334	TCG	2	6	74775	74780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622006
1115	NC_010334	ATA	2	6	74802	74807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622006
1116	NC_010334	CTG	2	6	74888	74893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622007
1117	NC_010334	TTAA	2	8	74910	74917	50 %	50 %	0 %	0 %	167622007
1118	NC_010334	T	6	6	74936	74941	0 %	100 %	0 %	0 %	167622007
1119	NC_010334	CAC	2	6	74963	74968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622007
1120	NC_010334	CTG	2	6	74996	75001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622007
1121	NC_010334	CAT	2	6	75026	75031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622007
1122	NC_010334	CCG	2	6	75139	75144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622007
1123	NC_010334	A	7	7	75179	75185	100 %	0 %	0 %	0 %	167622007
1124	NC_010334	TTG	2	6	75225	75230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622007
1125	NC_010334	ATA	2	6	75309	75314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622007
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1130	NC_010334	TTG	2	6	75701	75706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622008
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1159	NC_010334	CTTCT	2	10	78837	78846	0 %	60 %	0 %	40 %	167622010
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1238	NC_010334	GACC	2	8	83481	83488	25 %	0 %	25 %	50 %	167622014
1239	NC_010334	A	6	6	83563	83568	100 %	0 %	0 %	0 %	167622014
1240	NC_010334	GGC	2	6	83574	83579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622014
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1242	NC_010334	GCT	2	6	83641	83646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622014
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1245	NC_010334	AAC	2	6	83671	83676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622014
1246	NC_010334	GC	3	6	83887	83892	0 %	0 %	50 %	50 %	167622014
1247	NC_010334	TGGG	2	8	83932	83939	0 %	25 %	75 %	0 %	167622014
1248	NC_010334	TGA	2	6	84113	84118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622014
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1250	NC_010334	GTG	2	6	84208	84213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622014
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1366	NC_010334	ATT	2	6	91383	91388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622021
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1372	NC_010334	TTGC	2	8	91982	91989	0 %	50 %	25 %	25 %	167622022
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1376	NC_010334	CAT	3	9	92114	92122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622022
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1498	NC_010334	TCA	2	6	100094	100099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622031
1499	NC_010334	GCA	2	6	100142	100147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622031
1500	NC_010334	GTC	2	6	100159	100164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622031

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