MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 78104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010334	CCAA	2	8	29726	29733	50 %	0 %	0 %	50 %	167621966
502	NC_010334	ATC	2	6	29735	29740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167621966
503	NC_010334	TTG	2	6	29750	29755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167621966
504	NC_010334	AAG	2	6	29793	29798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167621966
505	NC_010334	GTT	2	6	29930	29935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167621966
506	NC_010334	GAC	2	6	29962	29967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621966
507	NC_010334	CCA	2	6	30029	30034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621966
508	NC_010334	GGC	2	6	30047	30052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621966
509	NC_010334	TGC	2	6	30099	30104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621966
510	NC_010334	AAGT	2	8	30167	30174	50 %	25 %	25 %	0 %	167621966
511	NC_010334	ACC	2	6	30185	30190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621966
512	NC_010334	TCA	2	6	30219	30224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167621966
513	NC_010334	GCT	2	6	30323	30328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621966
514	NC_010334	TC	3	6	30400	30405	0 %	50 %	0 %	50 %	167621966
515	NC_010334	CTG	2	6	30416	30421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621966
516	NC_010334	GTT	2	6	30422	30427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167621966
517	NC_010334	TGC	2	6	30491	30496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621966
518	NC_010334	ACC	2	6	30600	30605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621966
519	NC_010334	GAC	2	6	30631	30636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621966
520	NC_010334	CAAC	2	8	30699	30706	50 %	0 %	0 %	50 %	167621966
521	NC_010334	AGT	2	6	30711	30716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621966
522	NC_010334	GCT	2	6	30730	30735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621966
523	NC_010334	TTGT	2	8	30770	30777	0 %	75 %	25 %	0 %	167621966
524	NC_010334	AAG	2	6	30821	30826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167621966
525	NC_010334	TGA	3	9	31066	31074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621967
526	NC_010334	GCAG	2	8	31338	31345	25 %	0 %	50 %	25 %	167621967
527	NC_010334	GC	3	6	31539	31544	0 %	0 %	50 %	50 %	167621967
528	NC_010334	GCG	2	6	31554	31559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621967
529	NC_010334	ACA	2	6	31653	31658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167621967
530	NC_010334	TCA	2	6	31704	31709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167621967
531	NC_010334	CAG	2	6	31795	31800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621967
532	NC_010334	TA	3	6	31816	31821	50 %	50 %	0 %	0 %	167621967
533	NC_010334	GCA	2	6	31869	31874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621967
534	NC_010334	GTG	2	6	31985	31990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167621968
535	NC_010334	CAA	2	6	32000	32005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167621968
536	NC_010334	CAAA	2	8	32051	32058	75 %	0 %	0 %	25 %	167621968
537	NC_010334	CTT	2	6	32165	32170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167621968
538	NC_010334	CAC	2	6	32183	32188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621968
539	NC_010334	CAA	2	6	32195	32200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167621968
540	NC_010334	TGA	2	6	32210	32215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621968
541	NC_010334	CAT	2	6	32234	32239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167621968
542	NC_010334	TGG	2	6	32266	32271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167621968
543	NC_010334	TCG	2	6	32332	32337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621968
544	NC_010334	AGC	2	6	32352	32357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621968
545	NC_010334	TAA	2	6	32421	32426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167621968
546	NC_010334	AGTT	2	8	32468	32475	25 %	50 %	25 %	0 %	167621968
547	NC_010334	TGA	2	6	32579	32584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621969
548	NC_010334	GTTG	2	8	32614	32621	0 %	50 %	50 %	0 %	167621969
549	NC_010334	TC	3	6	32882	32887	0 %	50 %	0 %	50 %	167621969
550	NC_010334	CT	3	6	32917	32922	0 %	50 %	0 %	50 %	167621969
551	NC_010334	ATT	2	6	33034	33039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167621969
552	NC_010334	TAC	2	6	33233	33238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167621969
553	NC_010334	AT	3	6	33503	33508	50 %	50 %	0 %	0 %	167621969
554	NC_010334	CAT	2	6	33591	33596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167621969
555	NC_010334	TAG	2	6	33657	33662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621969
556	NC_010334	TAC	2	6	33890	33895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167621970
557	NC_010334	GCG	2	6	33931	33936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621970
558	NC_010334	GCA	2	6	33945	33950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621970
559	NC_010334	AGC	2	6	33951	33956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621970
560	NC_010334	CAT	2	6	33964	33969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167621970
561	NC_010334	GT	3	6	33973	33978	0 %	50 %	50 %	0 %	167621970
562	NC_010334	CT	3	6	33989	33994	0 %	50 %	0 %	50 %	167621970
563	NC_010334	TCC	2	6	33996	34001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167621970
564	NC_010334	TCC	2	6	34023	34028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167621970
565	NC_010334	TGT	2	6	34083	34088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167621970
566	NC_010334	TGG	2	6	34110	34115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167621970
567	NC_010334	A	6	6	34117	34122	100 %	0 %	0 %	0 %	167621970
568	NC_010334	TGC	2	6	34200	34205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621970
569	NC_010334	TATTGA	2	12	34218	34229	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167621970
570	NC_010334	CGAAA	2	10	34373	34382	60 %	0 %	20 %	20 %	167621970
571	NC_010334	TAT	2	6	34386	34391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167621970
572	NC_010334	AAGC	2	8	34424	34431	50 %	0 %	25 %	25 %	167621970
573	NC_010334	TCA	2	6	34533	34538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167621970
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577	NC_010334	G	7	7	34648	34654	0 %	0 %	100 %	0 %	167621970
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580	NC_010334	ATT	2	6	34898	34903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167621971
581	NC_010334	ACTC	2	8	34931	34938	25 %	25 %	0 %	50 %	167621971
582	NC_010334	TCA	2	6	34949	34954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167621971
583	NC_010334	T	6	6	35102	35107	0 %	100 %	0 %	0 %	167621971
584	NC_010334	TGA	2	6	35180	35185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621971
585	NC_010334	TGA	2	6	35201	35206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621971
586	NC_010334	ATCTT	2	10	35278	35287	20 %	60 %	0 %	20 %	167621971
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589	NC_010334	ATC	2	6	35702	35707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167621972
590	NC_010334	AGT	2	6	35794	35799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621972
591	NC_010334	AGT	2	6	35809	35814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621972
592	NC_010334	TCT	2	6	35925	35930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167621972
593	NC_010334	TAA	2	6	35959	35964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167621972
594	NC_010334	TCA	2	6	35985	35990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167621972
595	NC_010334	ACC	2	6	36022	36027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621972
596	NC_010334	CCA	2	6	36137	36142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621972
597	NC_010334	AAG	2	6	36156	36161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167621972
598	NC_010334	ATAC	2	8	36200	36207	50 %	25 %	0 %	25 %	167621972
599	NC_010334	GGT	2	6	36250	36255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167621972
600	NC_010334	CGA	2	6	36277	36282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621972
601	NC_010334	AT	3	6	36481	36486	50 %	50 %	0 %	0 %	167621972
602	NC_010334	CA	3	6	36499	36504	50 %	0 %	0 %	50 %	167621972
603	NC_010334	CAC	2	6	36565	36570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621972
604	NC_010334	CGC	2	6	36596	36601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621972
605	NC_010334	GCG	2	6	36606	36611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621972
606	NC_010334	TCT	2	6	36645	36650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167621972
607	NC_010334	GAT	2	6	36651	36656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621972
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609	NC_010334	TGC	2	6	36740	36745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621972
610	NC_010334	TAAG	2	8	36826	36833	50 %	25 %	25 %	0 %	167621972
611	NC_010334	TAG	2	6	36857	36862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621972
612	NC_010334	TGC	2	6	36893	36898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621972
613	NC_010334	CGT	2	6	36955	36960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621972
614	NC_010334	GTA	2	6	37103	37108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621972
615	NC_010334	AGT	2	6	37123	37128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621972
616	NC_010334	ATCA	2	8	37139	37146	50 %	25 %	0 %	25 %	167621972
617	NC_010334	TGC	2	6	37159	37164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621972
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619	NC_010334	TGC	2	6	37284	37289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621972
620	NC_010334	AG	5	10	37307	37316	50 %	0 %	50 %	0 %	167621972
621	NC_010334	TAATAG	2	12	37333	37344	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	167621972
622	NC_010334	TAC	2	6	37529	37534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167621973
623	NC_010334	GGT	2	6	37614	37619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167621973
624	NC_010334	TAA	2	6	37631	37636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167621973
625	NC_010334	GCA	2	6	37670	37675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621973
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627	NC_010334	ACTA	2	8	37776	37783	50 %	25 %	0 %	25 %	167621973
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