MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 78104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010334	ATTGC	2	10	362257	362266	20 %	40 %	20 %	20 %	167622243
5502	NC_010334	GCA	2	6	362467	362472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622243
5503	NC_010334	CATTT	2	10	362544	362553	20 %	60 %	0 %	20 %	167622244
5504	NC_010334	GTT	2	6	362915	362920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622244
5505	NC_010334	CTT	2	6	362968	362973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622244
5506	NC_010334	TAT	2	6	363015	363020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622244
5507	NC_010334	AAT	2	6	363047	363052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622244
5508	NC_010334	GCG	2	6	363098	363103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622244
5509	NC_010334	GGC	2	6	363116	363121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622244
5510	NC_010334	GAT	2	6	363184	363189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622244
5511	NC_010334	TGG	2	6	363192	363197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622244
5512	NC_010334	CTT	2	6	363217	363222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622244
5513	NC_010334	GCA	2	6	363260	363265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622244
5514	NC_010334	GTT	3	9	363317	363325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622244
5515	NC_010334	TCT	2	6	363368	363373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622244
5516	NC_010334	AGCT	2	8	363403	363410	25 %	25 %	25 %	25 %	167622244
5517	NC_010334	ATT	2	6	363478	363483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622244
5518	NC_010334	TGC	2	6	363544	363549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622245
5519	NC_010334	GTCAT	2	10	363598	363607	20 %	40 %	20 %	20 %	167622245
5520	NC_010334	CGG	2	6	363624	363629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622245
5521	NC_010334	TG	3	6	363653	363658	0 %	50 %	50 %	0 %	167622245
5522	NC_010334	CAG	2	6	363701	363706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622245
5523	NC_010334	ATC	2	6	363716	363721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622245
5524	NC_010334	TGT	2	6	363739	363744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622245
5525	NC_010334	TGC	2	6	364059	364064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622246
5526	NC_010334	CAG	2	6	364112	364117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622246
5527	NC_010334	CTG	2	6	364120	364125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622246
5528	NC_010334	GCG	2	6	364127	364132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622246
5529	NC_010334	GCT	3	9	364201	364209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622246
5530	NC_010334	CAT	2	6	364288	364293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622246
5531	NC_010334	TCG	2	6	364311	364316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622246
5532	NC_010334	GTC	2	6	364335	364340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622246
5533	NC_010334	CTT	2	6	364363	364368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622246
5534	NC_010334	CAC	2	6	364394	364399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622246
5535	NC_010334	TAA	2	6	364406	364411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622246
5536	NC_010334	GCA	2	6	364419	364424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622246
5537	NC_010334	CTC	2	6	364445	364450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167622246
5538	NC_010334	GT	3	6	364464	364469	0 %	50 %	50 %	0 %	167622246
5539	NC_010334	GA	3	6	364790	364795	50 %	0 %	50 %	0 %	167622247
5540	NC_010334	TGC	2	6	364831	364836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622247
5541	NC_010334	CTG	2	6	364889	364894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622247
5542	NC_010334	TGC	2	6	364923	364928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622247
5543	NC_010334	CTG	2	6	365005	365010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622247
5544	NC_010334	TTG	2	6	365067	365072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622247
5545	NC_010334	TTA	2	6	365112	365117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622247
5546	NC_010334	T	7	7	365343	365349	0 %	100 %	0 %	0 %	167622248
5547	NC_010334	TTTG	2	8	365376	365383	0 %	75 %	25 %	0 %	167622248
5548	NC_010334	TGC	2	6	365439	365444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622248
5549	NC_010334	ATG	2	6	365488	365493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622248
5550	NC_010334	GTT	2	6	365496	365501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622248
5551	NC_010334	CTG	2	6	365617	365622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622248
5552	NC_010334	GT	3	6	365630	365635	0 %	50 %	50 %	0 %	167622248
5553	NC_010334	ATT	2	6	365698	365703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622248
5554	NC_010334	TGG	2	6	365708	365713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622248
5555	NC_010334	TATC	2	8	365718	365725	25 %	50 %	0 %	25 %	167622248
5556	NC_010334	TTTAGT	2	12	365803	365814	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	167622248
5557	NC_010334	GTG	2	6	365839	365844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622248
5558	NC_010334	T	6	6	365947	365952	0 %	100 %	0 %	0 %	167622248
5559	NC_010334	TA	3	6	365984	365989	50 %	50 %	0 %	0 %	167622248
5560	NC_010334	AGC	2	6	366043	366048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622248
5561	NC_010334	CA	3	6	366267	366272	50 %	0 %	0 %	50 %	167622249
5562	NC_010334	TGC	2	6	366278	366283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622249
5563	NC_010334	GAA	2	6	366330	366335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622249
5564	NC_010334	GTG	2	6	366449	366454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622249
5565	NC_010334	CAAG	2	8	366561	366568	50 %	0 %	25 %	25 %	167622249
5566	NC_010334	TGGT	2	8	366665	366672	0 %	50 %	50 %	0 %	167622249
5567	NC_010334	TGA	2	6	366735	366740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622249
5568	NC_010334	AGCT	2	8	366777	366784	25 %	25 %	25 %	25 %	167622249
5569	NC_010334	GA	3	6	366863	366868	50 %	0 %	50 %	0 %	167622249
5570	NC_010334	CTATTT	2	12	366945	366956	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	167622249
5571	NC_010334	TAT	2	6	367063	367068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622249
5572	NC_010334	CGC	2	6	367110	367115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622249
5573	NC_010334	GTG	2	6	367166	367171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622249
5574	NC_010334	GCC	2	6	367219	367224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622249
5575	NC_010334	TGT	2	6	367247	367252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622249
5576	NC_010334	ATG	2	6	367274	367279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622249
5577	NC_010334	TC	3	6	367299	367304	0 %	50 %	0 %	50 %	167622249
5578	NC_010334	CTTA	2	8	367316	367323	25 %	50 %	0 %	25 %	167622249
5579	NC_010334	TTGAG	2	10	367364	367373	20 %	40 %	40 %	0 %	167622249
5580	NC_010334	CTG	2	6	367418	367423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622249
5581	NC_010334	GCT	2	6	367428	367433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622249
5582	NC_010334	GA	3	6	367445	367450	50 %	0 %	50 %	0 %	167622249
5583	NC_010334	GCT	2	6	367567	367572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622249
5584	NC_010334	GCT	2	6	367575	367580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622249
5585	NC_010334	ATA	2	6	367599	367604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622249
5586	NC_010334	T	6	6	367744	367749	0 %	100 %	0 %	0 %	167622250
5587	NC_010334	CTA	2	6	367882	367887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622250
5588	NC_010334	TCA	2	6	368032	368037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622250
5589	NC_010334	TTC	2	6	368040	368045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622250
5590	NC_010334	CAA	2	6	368168	368173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622250
5591	NC_010334	TTA	2	6	368195	368200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622250
5592	NC_010334	GGC	2	6	368269	368274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622250
5593	NC_010334	TATGCA	2	12	368320	368331	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167622250
5594	NC_010334	TA	3	6	368574	368579	50 %	50 %	0 %	0 %	167622250
5595	NC_010334	TGA	2	6	368638	368643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622250
5596	NC_010334	GGT	2	6	368647	368652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622250
5597	NC_010334	CTGGA	2	10	368685	368694	20 %	20 %	40 %	20 %	167622250
5598	NC_010334	CTA	2	6	368746	368751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622250
5599	NC_010334	T	6	6	368867	368872	0 %	100 %	0 %	0 %	167622250
5600	NC_010334	TGC	2	6	368923	368928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622250
5601	NC_010334	GAC	2	6	368950	368955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622250
5602	NC_010334	GTG	2	6	369094	369099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622251
5603	NC_010334	CTT	2	6	369112	369117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622251
5604	NC_010334	AGCG	2	8	369184	369191	25 %	0 %	50 %	25 %	167622251
5605	NC_010334	TAA	2	6	369257	369262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622251
5606	NC_010334	CTAGCG	2	12	369277	369288	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	167622251
5607	NC_010334	AACC	2	8	369318	369325	50 %	0 %	0 %	50 %	167622251
5608	NC_010334	TTG	2	6	369547	369552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622252
5609	NC_010334	GAT	2	6	369582	369587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622252
5610	NC_010334	TCG	2	6	369613	369618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622252
5611	NC_010334	CAG	2	6	369636	369641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622252
5612	NC_010334	CTT	2	6	369699	369704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622252
5613	NC_010334	GCTG	2	8	369720	369727	0 %	25 %	50 %	25 %	167622252
5614	NC_010334	AGATC	2	10	369737	369746	40 %	20 %	20 %	20 %	167622252
5615	NC_010334	GGC	2	6	369765	369770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622252
5616	NC_010334	CGG	2	6	369802	369807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622252
5617	NC_010334	GAT	2	6	369827	369832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622252
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5619	NC_010334	TAAA	2	8	369888	369895	75 %	25 %	0 %	0 %	167622252
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5621	NC_010334	TGA	2	6	369964	369969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622252
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