MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 78104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_010334	TGG	2	6	328181	328186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622213
5002	NC_010334	TTA	2	6	328222	328227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622213
5003	NC_010334	GCA	2	6	328230	328235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622213
5004	NC_010334	GGC	2	6	328370	328375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622214
5005	NC_010334	ATCC	2	8	328446	328453	25 %	25 %	0 %	50 %	167622214
5006	NC_010334	AT	3	6	328462	328467	50 %	50 %	0 %	0 %	167622214
5007	NC_010334	AGAT	2	8	328497	328504	50 %	25 %	25 %	0 %	167622214
5008	NC_010334	GTT	2	6	328544	328549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622214
5009	NC_010334	GA	3	6	328553	328558	50 %	0 %	50 %	0 %	167622214
5010	NC_010334	TAA	2	6	328600	328605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622214
5011	NC_010334	AGT	2	6	328724	328729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622214
5012	NC_010334	AGT	2	6	328744	328749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622214
5013	NC_010334	CTGTT	2	10	328812	328821	0 %	60 %	20 %	20 %	167622214
5014	NC_010334	TTG	3	9	328824	328832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622214
5015	NC_010334	CTG	2	6	328995	329000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622214
5016	NC_010334	ACA	2	6	329028	329033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622214
5017	NC_010334	TGC	2	6	329125	329130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622214
5018	NC_010334	AGT	2	6	329230	329235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622214
5019	NC_010334	TTG	2	6	329502	329507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622215
5020	NC_010334	TGC	2	6	329539	329544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622215
5021	NC_010334	GCT	2	6	329570	329575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622215
5022	NC_010334	TAA	2	6	329611	329616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622215
5023	NC_010334	CA	3	6	329619	329624	50 %	0 %	0 %	50 %	167622215
5024	NC_010334	TG	3	6	329755	329760	0 %	50 %	50 %	0 %	167622215
5025	NC_010334	TTTA	2	8	329850	329857	25 %	75 %	0 %	0 %	167622216
5026	NC_010334	CTTA	2	8	329908	329915	25 %	50 %	0 %	25 %	167622216
5027	NC_010334	GGTT	2	8	329925	329932	0 %	50 %	50 %	0 %	167622216
5028	NC_010334	TGGG	2	8	329943	329950	0 %	25 %	75 %	0 %	167622216
5029	NC_010334	TC	3	6	329975	329980	0 %	50 %	0 %	50 %	167622216
5030	NC_010334	GGC	2	6	329982	329987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622216
5031	NC_010334	ACA	2	6	330052	330057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622216
5032	NC_010334	TAAA	2	8	330136	330143	75 %	25 %	0 %	0 %	167622216
5033	NC_010334	AAAG	2	8	330156	330163	75 %	0 %	25 %	0 %	167622216
5034	NC_010334	GGC	2	6	330185	330190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622216
5035	NC_010334	A	7	7	330295	330301	100 %	0 %	0 %	0 %	167622216
5036	NC_010334	CAA	2	6	330369	330374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622216
5037	NC_010334	GCT	2	6	330455	330460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622216
5038	NC_010334	TGCAG	2	10	330482	330491	20 %	20 %	40 %	20 %	167622216
5039	NC_010334	TAT	2	6	330599	330604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622216
5040	NC_010334	TA	3	6	330618	330623	50 %	50 %	0 %	0 %	167622216
5041	NC_010334	TGG	2	6	330811	330816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622216
5042	NC_010334	GAT	2	6	330822	330827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622216
5043	NC_010334	AAT	2	6	330858	330863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622216
5044	NC_010334	ACTG	2	8	330887	330894	25 %	25 %	25 %	25 %	167622216
5045	NC_010334	CTA	2	6	331022	331027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622216
5046	NC_010334	ATCTA	2	10	331038	331047	40 %	40 %	0 %	20 %	167622216
5047	NC_010334	TCA	2	6	331177	331182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622217
5048	NC_010334	T	6	6	331196	331201	0 %	100 %	0 %	0 %	167622217
5049	NC_010334	TGCT	2	8	331273	331280	0 %	50 %	25 %	25 %	167622217
5050	NC_010334	GTA	2	6	331322	331327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622217
5051	NC_010334	CCG	2	6	331423	331428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622217
5052	NC_010334	T	7	7	331467	331473	0 %	100 %	0 %	0 %	167622217
5053	NC_010334	T	6	6	331527	331532	0 %	100 %	0 %	0 %	167622217
5054	NC_010334	ATCA	2	8	331545	331552	50 %	25 %	0 %	25 %	167622217
5055	NC_010334	GGA	2	6	331608	331613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167622217
5056	NC_010334	TGA	2	6	331732	331737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622217
5057	NC_010334	AGTT	2	8	331772	331779	25 %	50 %	25 %	0 %	167622217
5058	NC_010334	ATG	2	6	331889	331894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622217
5059	NC_010334	GCAAA	2	10	331933	331942	60 %	0 %	20 %	20 %	167622217
5060	NC_010334	A	7	7	331965	331971	100 %	0 %	0 %	0 %	167622217
5061	NC_010334	A	6	6	332007	332012	100 %	0 %	0 %	0 %	167622217
5062	NC_010334	TGA	2	6	332015	332020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622217
5063	NC_010334	AAGA	2	8	332034	332041	75 %	0 %	25 %	0 %	167622217
5064	NC_010334	GCA	2	6	332059	332064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622217
5065	NC_010334	TAA	2	6	332089	332094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622217
5066	NC_010334	AGC	2	6	332095	332100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622217
5067	NC_010334	CAG	2	6	332148	332153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622217
5068	NC_010334	AGT	2	6	332171	332176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622217
5069	NC_010334	GCT	2	6	332225	332230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622217
5070	NC_010334	GCG	2	6	332236	332241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622217
5071	NC_010334	TGCT	2	8	332614	332621	0 %	50 %	25 %	25 %	167622218
5072	NC_010334	TGA	2	6	332630	332635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622218
5073	NC_010334	TGG	2	6	332668	332673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622218
5074	NC_010334	G	6	6	332753	332758	0 %	0 %	100 %	0 %	167622218
5075	NC_010334	ATT	2	6	332766	332771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622218
5076	NC_010334	ATG	2	6	332779	332784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622218
5077	NC_010334	GCTT	2	8	332909	332916	0 %	50 %	25 %	25 %	167622218
5078	NC_010334	GGT	2	6	333033	333038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622218
5079	NC_010334	TGA	2	6	333046	333051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622218
5080	NC_010334	AGA	2	6	333053	333058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622218
5081	NC_010334	TGG	2	6	333140	333145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622218
5082	NC_010334	GT	4	8	333150	333157	0 %	50 %	50 %	0 %	167622218
5083	NC_010334	TGG	2	6	333212	333217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622218
5084	NC_010334	CAG	2	6	333358	333363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622219
5085	NC_010334	CAG	2	6	333391	333396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622219
5086	NC_010334	CGGTG	2	10	333397	333406	0 %	20 %	60 %	20 %	167622219
5087	NC_010334	TAA	2	6	333481	333486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622219
5088	NC_010334	AGA	2	6	333492	333497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622219
5089	NC_010334	TGG	2	6	333498	333503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622219
5090	NC_010334	TA	3	6	333579	333584	50 %	50 %	0 %	0 %	167622219
5091	NC_010334	TGT	2	6	333612	333617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622219
5092	NC_010334	CGG	2	6	333648	333653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622219
5093	NC_010334	ATC	2	6	333671	333676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622219
5094	NC_010334	TCA	3	9	333795	333803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622219
5095	NC_010334	TGC	2	6	333934	333939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622219
5096	NC_010334	CAGG	2	8	334101	334108	25 %	0 %	50 %	25 %	167622219
5097	NC_010334	GATAG	2	10	334159	334168	40 %	20 %	40 %	0 %	167622219
5098	NC_010334	GCC	2	6	334204	334209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622219
5099	NC_010334	CAC	2	6	334222	334227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622219
5100	NC_010334	T	6	6	334268	334273	0 %	100 %	0 %	0 %	167622219
5101	NC_010334	TA	3	6	334291	334296	50 %	50 %	0 %	0 %	167622219
5102	NC_010334	CCA	2	6	334301	334306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622219
5103	NC_010334	CTC	2	6	334387	334392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167622219
5104	NC_010334	T	6	6	334509	334514	0 %	100 %	0 %	0 %	167622219
5105	NC_010334	TC	3	6	334562	334567	0 %	50 %	0 %	50 %	167622219
5106	NC_010334	CGAC	2	8	334631	334638	25 %	0 %	25 %	50 %	167622219
5107	NC_010334	TGC	2	6	334691	334696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622219
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5109	NC_010334	GTT	2	6	334847	334852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622219
5110	NC_010334	CGAA	2	8	334946	334953	50 %	0 %	25 %	25 %	167622219
5111	NC_010334	CGC	2	6	334999	335004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622219
5112	NC_010334	TGGA	2	8	335032	335039	25 %	25 %	50 %	0 %	167622219
5113	NC_010334	CAT	2	6	335184	335189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622219
5114	NC_010334	GCA	2	6	335243	335248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622219
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5117	NC_010334	GCA	2	6	335388	335393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622219
5118	NC_010334	AGA	2	6	335394	335399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622219
5119	NC_010334	TGAG	2	8	335444	335451	25 %	25 %	50 %	0 %	167622219
5120	NC_010334	ATT	2	6	335554	335559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622219
5121	NC_010334	ACA	2	6	335594	335599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622219
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5123	NC_010334	TCA	2	6	335685	335690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622219
5124	NC_010334	GCC	2	6	335809	335814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622219
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5126	NC_010334	TCA	2	6	335853	335858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622219
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5143	NC_010334	TAA	2	6	337177	337182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622220
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5235	NC_010334	AGC	2	6	344194	344199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622228
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5240	NC_010334	GTT	2	6	344510	344515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622228
5241	NC_010334	GCTCGT	2	12	344532	344543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622228
5242	NC_010334	GAA	2	6	344612	344617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622228
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5244	NC_010334	CGA	2	6	344852	344857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622228
5245	NC_010334	GAC	2	6	344913	344918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622228
5246	NC_010334	TAAT	2	8	344999	345006	50 %	50 %	0 %	0 %	167622229
5247	NC_010334	GTAA	2	8	345023	345030	50 %	25 %	25 %	0 %	167622229
5248	NC_010334	CGG	2	6	345040	345045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622229
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5250	NC_010334	GCT	2	6	345133	345138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622229
5251	NC_010334	CGG	2	6	345169	345174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622229
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5253	NC_010334	CGT	2	6	345236	345241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622229
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5259	NC_010334	TGG	2	6	345421	345426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622229
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5262	NC_010334	GCC	2	6	345469	345474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622229
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5269	NC_010334	AGA	2	6	346059	346064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622230
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5272	NC_010334	GGT	2	6	346260	346265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622230
5273	NC_010334	TGGT	2	8	346391	346398	0 %	50 %	50 %	0 %	167622230
5274	NC_010334	G	6	6	346459	346464	0 %	0 %	100 %	0 %	167622230
5275	NC_010334	TTA	2	6	346489	346494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622230
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5277	NC_010334	GTA	2	6	346541	346546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622230
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5280	NC_010334	CA	3	6	346973	346978	50 %	0 %	0 %	50 %	167622231
5281	NC_010334	AAG	2	6	347144	347149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622231
5282	NC_010334	TGA	2	6	347162	347167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622231
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5350	NC_010334	ATG	2	6	352922	352927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622235
5351	NC_010334	TCT	2	6	352982	352987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622235
5352	NC_010334	CGC	3	9	353001	353009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622235
5353	NC_010334	TGA	2	6	353010	353015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622235
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5362	NC_010334	GCG	2	6	353630	353635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622235
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5365	NC_010334	TG	3	6	353718	353723	0 %	50 %	50 %	0 %	167622235
5366	NC_010334	TGC	2	6	353795	353800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622235
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5403	NC_010334	TGC	3	9	355546	355554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622237
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5483	NC_010334	TC	3	6	360234	360239	0 %	50 %	0 %	50 %	167622240
5484	NC_010334	TTA	2	6	361150	361155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622241
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5486	NC_010334	AAC	2	6	361182	361187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622241
5487	NC_010334	CGA	2	6	361196	361201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622241
5488	NC_010334	TGC	2	6	361459	361464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622242
5489	NC_010334	AAT	2	6	361519	361524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622242
5490	NC_010334	TAA	2	6	361627	361632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622242
5491	NC_010334	GTT	2	6	361665	361670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622242
5492	NC_010334	TAA	2	6	361729	361734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622242
5493	NC_010334	AAG	2	6	361868	361873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622243
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5495	NC_010334	AAG	2	6	361937	361942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622243
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5499	NC_010334	TGA	2	6	362153	362158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622243
5500	NC_010334	GT	3	6	362240	362245	0 %	50 %	50 %	0 %	167622243

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