MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 78104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_010334	TG	3	6	298330	298335	0 %	50 %	50 %	0 %	167622189
4502	NC_010334	A	6	6	298349	298354	100 %	0 %	0 %	0 %	167622189
4503	NC_010334	ATA	2	6	298466	298471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622189
4504	NC_010334	GCT	2	6	298660	298665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622189
4505	NC_010334	AAG	2	6	298734	298739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622189
4506	NC_010334	ATA	2	6	298842	298847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622189
4507	NC_010334	GTT	2	6	298870	298875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622189
4508	NC_010334	AGC	2	6	298884	298889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622189
4509	NC_010334	TTCAAC	2	12	298967	298978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622189
4510	NC_010334	GGC	2	6	299033	299038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622189
4511	NC_010334	TAG	2	6	299048	299053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622189
4512	NC_010334	AAT	2	6	299076	299081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622189
4513	NC_010334	TTG	2	6	299087	299092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622189
4514	NC_010334	CGC	2	6	299200	299205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622189
4515	NC_010334	ATA	2	6	299210	299215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622189
4516	NC_010334	CAA	2	6	299233	299238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622189
4517	NC_010334	CGA	2	6	299248	299253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622189
4518	NC_010334	AGC	2	6	299259	299264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622189
4519	NC_010334	T	7	7	299319	299325	0 %	100 %	0 %	0 %	167622189
4520	NC_010334	CGG	2	6	299424	299429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622190
4521	NC_010334	ATC	2	6	299442	299447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622190
4522	NC_010334	AAC	2	6	299525	299530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622190
4523	NC_010334	GTG	2	6	299555	299560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622190
4524	NC_010334	TCAA	2	8	299564	299571	50 %	25 %	0 %	25 %	167622190
4525	NC_010334	A	6	6	299576	299581	100 %	0 %	0 %	0 %	167622190
4526	NC_010334	GAT	2	6	299615	299620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622190
4527	NC_010334	GCA	2	6	299628	299633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622190
4528	NC_010334	ATG	2	6	299726	299731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622190
4529	NC_010334	GCA	2	6	299737	299742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622190
4530	NC_010334	CGA	2	6	299830	299835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622190
4531	NC_010334	AAG	2	6	300242	300247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622190
4532	NC_010334	GAGTAA	2	12	300334	300345	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	167622190
4533	NC_010334	TAC	2	6	300353	300358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622190
4534	NC_010334	AAT	2	6	300648	300653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622191
4535	NC_010334	CCA	2	6	300806	300811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622191
4536	NC_010334	AGT	2	6	300847	300852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622191
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4538	NC_010334	GCG	2	6	301139	301144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622191
4539	NC_010334	TAA	2	6	301238	301243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622191
4540	NC_010334	TTC	2	6	301442	301447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622192
4541	NC_010334	AGT	2	6	301491	301496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622192
4542	NC_010334	CA	3	6	301522	301527	50 %	0 %	0 %	50 %	167622192
4543	NC_010334	CTA	2	6	301531	301536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622192
4544	NC_010334	AAGC	2	8	301548	301555	50 %	0 %	25 %	25 %	167622192
4545	NC_010334	GCA	2	6	301621	301626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622192
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4547	NC_010334	AGC	2	6	301719	301724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622192
4548	NC_010334	AGT	2	6	301764	301769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622192
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4551	NC_010334	TAAG	2	8	301826	301833	50 %	25 %	25 %	0 %	167622192
4552	NC_010334	CAC	2	6	301910	301915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622192
4553	NC_010334	ACG	2	6	302021	302026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622192
4554	NC_010334	GATGA	2	10	302030	302039	40 %	20 %	40 %	0 %	167622192
4555	NC_010334	GCC	3	9	302046	302054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622192
4556	NC_010334	CAT	2	6	302063	302068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622192
4557	NC_010334	TGCCA	2	10	302078	302087	20 %	20 %	20 %	40 %	167622192
4558	NC_010334	TAA	2	6	302190	302195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622192
4559	NC_010334	GTG	2	6	302212	302217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622192
4560	NC_010334	TAAT	2	8	302290	302297	50 %	50 %	0 %	0 %	167622193
4561	NC_010334	AGT	2	6	302311	302316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622193
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4564	NC_010334	GTG	2	6	302443	302448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622193
4565	NC_010334	TGA	2	6	302501	302506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622193
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4568	NC_010334	GAT	2	6	302703	302708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622193
4569	NC_010334	TGC	2	6	302795	302800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622193
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4571	NC_010334	CAG	2	6	302817	302822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622193
4572	NC_010334	GAT	2	6	302916	302921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622193
4573	NC_010334	CAT	2	6	302957	302962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622193
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4585	NC_010334	GTCT	2	8	303564	303571	0 %	50 %	25 %	25 %	167622194
4586	NC_010334	AGC	2	6	303608	303613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622194
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4590	NC_010334	T	7	7	303791	303797	0 %	100 %	0 %	0 %	167622194
4591	NC_010334	G	6	6	303798	303803	0 %	0 %	100 %	0 %	167622194
4592	NC_010334	TTA	2	6	303942	303947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622195
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4600	NC_010334	CAAG	2	8	304641	304648	50 %	0 %	25 %	25 %	167622195
4601	NC_010334	TACTGC	2	12	304708	304719	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	167622195
4602	NC_010334	GTG	2	6	304827	304832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622195
4603	NC_010334	ATAA	2	8	304951	304958	75 %	25 %	0 %	0 %	167622196
4604	NC_010334	CAA	2	6	304976	304981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622196
4605	NC_010334	TAA	2	6	305112	305117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622196
4606	NC_010334	A	6	6	305119	305124	100 %	0 %	0 %	0 %	167622196
4607	NC_010334	TGCGC	2	10	305250	305259	0 %	20 %	40 %	40 %	167622196
4608	NC_010334	T	7	7	305263	305269	0 %	100 %	0 %	0 %	167622196
4609	NC_010334	AATGT	2	10	305288	305297	40 %	40 %	20 %	0 %	167622196
4610	NC_010334	GTCCA	2	10	305344	305353	20 %	20 %	20 %	40 %	167622196
4611	NC_010334	GTT	2	6	305380	305385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622196
4612	NC_010334	AGGCC	2	10	305391	305400	20 %	0 %	40 %	40 %	167622196
4613	NC_010334	ATT	2	6	305439	305444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622196
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4616	NC_010334	GGC	2	6	305505	305510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622196
4617	NC_010334	AGA	2	6	305528	305533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622196
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4619	NC_010334	ACC	2	6	305679	305684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622196
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4621	NC_010334	ATA	2	6	305781	305786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622196
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4735	NC_010334	GA	3	6	313193	313198	50 %	0 %	50 %	0 %	167622202
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4863	NC_010334	TCA	2	6	320658	320663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622208
4864	NC_010334	TGA	2	6	320700	320705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622208
4865	NC_010334	CAT	2	6	320749	320754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622208
4866	NC_010334	ATG	2	6	320813	320818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622208
4867	NC_010334	CAT	2	6	320821	320826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622208
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4870	NC_010334	GGT	3	9	320983	320991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622208
4871	NC_010334	TCGGT	2	10	320997	321006	0 %	40 %	40 %	20 %	167622208
4872	NC_010334	TCTA	2	8	321014	321021	25 %	50 %	0 %	25 %	167622208
4873	NC_010334	AGTA	2	8	321068	321075	50 %	25 %	25 %	0 %	167622208
4874	NC_010334	GAT	2	6	321188	321193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622209
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4877	NC_010334	TCA	2	6	321275	321280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622209
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4879	NC_010334	TCA	2	6	321353	321358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622209
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4882	NC_010334	GCA	2	6	321455	321460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622209
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4885	NC_010334	GTT	2	6	321639	321644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622209
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4887	NC_010334	GGT	2	6	321785	321790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622209
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4890	NC_010334	TGA	2	6	321877	321882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622209
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4899	NC_010334	GGC	2	6	322506	322511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622210
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4917	NC_010334	CCTC	2	8	323599	323606	0 %	25 %	0 %	75 %	167622211
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4924	NC_010334	TGA	2	6	324203	324208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622211
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4982	NC_010334	TGC	2	6	327217	327222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622213
4983	NC_010334	ACC	2	6	327276	327281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622213
4984	NC_010334	TATT	2	8	327460	327467	25 %	75 %	0 %	0 %	167622213
4985	NC_010334	CAC	2	6	327491	327496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622213
4986	NC_010334	CAT	2	6	327497	327502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622213
4987	NC_010334	CTT	2	6	327524	327529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622213
4988	NC_010334	CAT	2	6	327704	327709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622213
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4991	NC_010334	CAT	2	6	327806	327811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622213
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